MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 19729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
2	NC_017281	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442355
3	NC_017281	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442355
4	NC_017281	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442355
5	NC_017281	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442355
6	NC_017281	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
7	NC_017281	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
8	NC_017281	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442355
9	NC_017281	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442355
10	NC_017281	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442355
11	NC_017281	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442355
12	NC_017281	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442355
13	NC_017281	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442355
14	NC_017281	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017281	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017281	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017281	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017281	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442356
19	NC_017281	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442356
20	NC_017281	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
21	NC_017281	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
22	NC_017281	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442356
23	NC_017281	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442356
24	NC_017281	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
25	NC_017281	TTA	2	6	2174	2179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
26	NC_017281	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442356
27	NC_017281	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
28	NC_017281	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442356
29	NC_017281	ATT	2	6	2527	2532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442356
30	NC_017281	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442356
31	NC_017281	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
32	NC_017281	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
33	NC_017281	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442357
34	NC_017281	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442357
35	NC_017281	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442357
36	NC_017281	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
37	NC_017281	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442357
38	NC_017281	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442357
39	NC_017281	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442357
40	NC_017281	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442357
41	NC_017281	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
42	NC_017281	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442357
43	NC_017281	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442357
44	NC_017281	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
45	NC_017281	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442357
46	NC_017281	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442357
47	NC_017281	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442357
48	NC_017281	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
49	NC_017281	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
50	NC_017281	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
51	NC_017281	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
52	NC_017281	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442357
53	NC_017281	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442357
54	NC_017281	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442357
55	NC_017281	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017281	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442358
57	NC_017281	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442358
58	NC_017281	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442358
59	NC_017281	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442358
60	NC_017281	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442359
61	NC_017281	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442359
62	NC_017281	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442359
63	NC_017281	CAT	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442359
64	NC_017281	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442359
65	NC_017281	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442359
66	NC_017281	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442359
67	NC_017281	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442359
68	NC_017281	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442359
69	NC_017281	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442359
70	NC_017281	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442359
71	NC_017281	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442359
72	NC_017281	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442359
73	NC_017281	ATT	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017281	TCA	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017281	TTA	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017281	ATT	2	6	6689	6694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017281	GTT	2	6	6740	6745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
78	NC_017281	TGA	2	6	6747	6752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
79	NC_017281	TTG	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
80	NC_017281	TTG	2	6	7073	7078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
81	NC_017281	TAA	2	6	7102	7107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442360
82	NC_017281	TAC	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442360
83	NC_017281	AAT	2	6	7232	7237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442360
84	NC_017281	ATG	2	6	7254	7259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
85	NC_017281	GCT	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442360
86	NC_017281	AAG	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442360
87	NC_017281	TGA	2	6	7543	7548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
88	NC_017281	ATG	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
89	NC_017281	TTG	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442360
90	NC_017281	AGT	2	6	7630	7635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
91	NC_017281	ATC	2	6	7715	7720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442360
92	NC_017281	CTT	2	6	7737	7742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442360
93	NC_017281	TTA	2	6	7812	7817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442360
94	NC_017281	AAC	2	6	7873	7878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442360
95	NC_017281	ACT	2	6	7886	7891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442360
96	NC_017281	ACA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442360
97	NC_017281	ATT	2	6	7969	7974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442360
98	NC_017281	GTA	2	6	7983	7988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442360
99	NC_017281	AAT	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442361
100	NC_017281	TGA	2	6	8287	8292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
101	NC_017281	GGT	2	6	8307	8312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442361
102	NC_017281	GAA	2	6	8322	8327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
103	NC_017281	AGA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
104	NC_017281	TTC	2	6	8720	8725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442361
105	NC_017281	CTT	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442361
106	NC_017281	ATA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442361
107	NC_017281	AGA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
108	NC_017281	ATG	3	9	9087	9095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
109	NC_017281	CTG	2	6	9190	9195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442361
110	NC_017281	TAT	2	6	9264	9269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
111	NC_017281	GAT	2	6	9279	9284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
112	NC_017281	TGA	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
113	NC_017281	AGA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
114	NC_017281	ATG	2	6	9565	9570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
115	NC_017281	GCT	2	6	9588	9593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442361
116	NC_017281	AAG	2	6	9610	9615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
117	NC_017281	AGC	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442361
118	NC_017281	ATT	2	6	9682	9687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
119	NC_017281	AAC	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442361
120	NC_017281	TCC	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442361
121	NC_017281	TTA	2	6	9786	9791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
122	NC_017281	TGA	2	6	9797	9802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
123	NC_017281	GAA	2	6	9849	9854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
124	NC_017281	ATT	2	6	9913	9918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
125	NC_017281	AGA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
126	NC_017281	TAT	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
127	NC_017281	ATC	2	6	10072	10077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
128	NC_017281	TTA	2	6	10111	10116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
129	NC_017281	GTG	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442361
130	NC_017281	TCA	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
131	NC_017281	TTA	2	6	10180	10185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
132	NC_017281	TCA	2	6	10270	10275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
133	NC_017281	AGA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
134	NC_017281	AGA	2	6	10538	10543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
135	NC_017281	CAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442361
136	NC_017281	TAG	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
137	NC_017281	AAG	2	6	10771	10776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
138	NC_017281	GAA	2	6	10848	10853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
139	NC_017281	ACT	2	6	10933	10938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
140	NC_017281	CCT	2	6	11079	11084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442361
141	NC_017281	CAT	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
142	NC_017281	TGC	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442361
143	NC_017281	ATG	2	6	11251	11256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
144	NC_017281	AGC	2	6	11417	11422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442361
145	NC_017281	GAA	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
146	NC_017281	ATG	2	6	11484	11489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
147	NC_017281	GAT	2	6	11571	11576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
148	NC_017281	GAG	2	6	11604	11609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442361
149	NC_017281	GAT	2	6	11649	11654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442361
150	NC_017281	TAC	2	6	11821	11826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442361
151	NC_017281	ATT	2	6	12058	12063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442361
152	NC_017281	GTG	2	6	12079	12084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442361
153	NC_017281	GAA	2	6	12129	12134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442361
154	NC_017281	GCT	2	6	12327	12332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442361
155	NC_017281	GTT	2	6	12348	12353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442361
156	NC_017281	AGC	2	6	12602	12607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442361
157	NC_017281	TGA	2	6	12814	12819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442362
158	NC_017281	AAG	2	6	12898	12903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442362
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160	NC_017281	AAG	2	6	13187	13192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442362
161	NC_017281	CAG	2	6	13319	13324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442362
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163	NC_017281	AAG	2	6	13625	13630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442362
164	NC_017281	TAC	2	6	13667	13672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442362
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166	NC_017281	AAG	2	6	13804	13809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442362
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169	NC_017281	GTT	2	6	14022	14027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442362
170	NC_017281	AAT	2	6	14083	14088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442362
171	NC_017281	TCA	2	6	14219	14224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442363
172	NC_017281	CAT	2	6	14333	14338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442363
173	NC_017281	AAG	2	6	14341	14346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442363
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178	NC_017281	CAT	3	9	14559	14567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442363
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181	NC_017281	ATC	2	6	14765	14770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442364
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194	NC_017281	TAA	2	6	15707	15712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_017281	CTG	2	6	17756	17761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_017281	CTG	2	6	21034	21039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442371
257	NC_017281	ACA	2	6	21141	21146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442371
258	NC_017281	TAC	2	6	21155	21160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442371
259	NC_017281	CTG	2	6	21268	21273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442371
260	NC_017281	AGC	2	6	21287	21292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442371
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264	NC_017281	TTG	2	6	22024	22029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442373
265	NC_017281	TGT	2	6	22092	22097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442373
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270	NC_017281	ATC	2	6	22486	22491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442373
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280	NC_017281	AGA	2	6	22945	22950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442373
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307	NC_017281	ATA	2	6	25295	25300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442375
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318	NC_017281	ATT	2	6	26399	26404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
319	NC_017281	TAA	2	6	26433	26438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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