MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 39798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017281	ATT	3	9	251623	251631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442614
6002	NC_017281	AGAA	2	8	251658	251665	75 %	0 %	25 %	0 %	384442614
6003	NC_017281	AG	3	6	251701	251706	50 %	0 %	50 %	0 %	384442614
6004	NC_017281	GCA	2	6	251731	251736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442614
6005	NC_017281	GTA	2	6	251782	251787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442614
6006	NC_017281	ACT	2	6	251803	251808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442614
6007	NC_017281	TGG	2	6	251996	252001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442614
6008	NC_017281	AAGT	2	8	252017	252024	50 %	25 %	25 %	0 %	384442614
6009	NC_017281	ATG	2	6	252124	252129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442614
6010	NC_017281	TAG	2	6	252152	252157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442614
6011	NC_017281	GGT	2	6	252178	252183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442614
6012	NC_017281	ATT	2	6	252306	252311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442614
6013	NC_017281	CAA	2	6	252313	252318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384442614
6014	NC_017281	GAA	2	6	252328	252333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442614
6015	NC_017281	T	6	6	252339	252344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017281	TAT	2	6	252383	252388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442615
6017	NC_017281	GGA	2	6	252389	252394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442615
6018	NC_017281	ATT	2	6	252459	252464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442615
6019	NC_017281	A	8	8	252469	252476	100 %	0 %	0 %	0 %	384442615
6020	NC_017281	CAAAT	2	10	252498	252507	60 %	20 %	0 %	20 %	384442615
6021	NC_017281	AGA	2	6	252538	252543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442615
6022	NC_017281	A	6	6	252671	252676	100 %	0 %	0 %	0 %	384442615
6023	NC_017281	AT	3	6	252725	252730	50 %	50 %	0 %	0 %	384442615
6024	NC_017281	TAA	2	6	252757	252762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442615
6025	NC_017281	CT	3	6	252780	252785	0 %	50 %	0 %	50 %	384442615
6026	NC_017281	TGA	2	6	252793	252798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442615
6027	NC_017281	GT	3	6	252802	252807	0 %	50 %	50 %	0 %	384442615
6028	NC_017281	T	6	6	252807	252812	0 %	100 %	0 %	0 %	384442615
6029	NC_017281	TA	3	6	252818	252823	50 %	50 %	0 %	0 %	384442615
6030	NC_017281	ATA	2	6	252939	252944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442615
6031	NC_017281	TTTTC	2	10	252945	252954	0 %	80 %	0 %	20 %	384442615
6032	NC_017281	ATG	2	6	252987	252992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442615
6033	NC_017281	TTAT	2	8	253048	253055	25 %	75 %	0 %	0 %	384442615
6034	NC_017281	GTA	2	6	253058	253063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442615
6035	NC_017281	ATT	2	6	253118	253123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_017281	AAAT	2	8	253162	253169	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017281	A	6	6	253195	253200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017281	TAT	2	6	253218	253223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017281	T	6	6	253250	253255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017281	ATT	2	6	253415	253420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442616
6041	NC_017281	GTA	2	6	253465	253470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442616
6042	NC_017281	CAT	2	6	253494	253499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442616
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6044	NC_017281	AAAG	2	8	253546	253553	75 %	0 %	25 %	0 %	384442616
6045	NC_017281	TAT	2	6	253563	253568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442616
6046	NC_017281	A	6	6	253570	253575	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6047	NC_017281	A	6	6	253577	253582	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6048	NC_017281	A	6	6	253699	253704	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6049	NC_017281	A	7	7	253738	253744	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6050	NC_017281	ATG	2	6	253784	253789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442616
6051	NC_017281	TGA	2	6	253826	253831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442616
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6053	NC_017281	GCTTTA	2	12	253912	253923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384442616
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6055	NC_017281	CTT	2	6	254129	254134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442616
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6059	NC_017281	TGAT	2	8	254375	254382	25 %	50 %	25 %	0 %	384442616
6060	NC_017281	GGTGA	2	10	254467	254476	20 %	20 %	60 %	0 %	384442616
6061	NC_017281	AAAG	2	8	254497	254504	75 %	0 %	25 %	0 %	384442616
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6067	NC_017281	A	8	8	255014	255021	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6068	NC_017281	TGA	2	6	255023	255028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442616
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6076	NC_017281	TTA	2	6	255380	255385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442616
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6078	NC_017281	A	6	6	255408	255413	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
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6090	NC_017281	A	6	6	255770	255775	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
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6095	NC_017281	AAG	2	6	256052	256057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442616
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6098	NC_017281	A	7	7	256252	256258	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6099	NC_017281	A	7	7	256459	256465	100 %	0 %	0 %	0 %	384442616
6100	NC_017281	ATT	2	6	256477	256482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442616
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6102	NC_017281	TAC	2	6	256625	256630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442617
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6105	NC_017281	A	7	7	256782	256788	100 %	0 %	0 %	0 %	384442617
6106	NC_017281	TTTA	2	8	256794	256801	25 %	75 %	0 %	0 %	384442617
6107	NC_017281	AAT	2	6	256806	256811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442617
6108	NC_017281	T	6	6	256850	256855	0 %	100 %	0 %	0 %	384442617
6109	NC_017281	TGA	2	6	256910	256915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442617
6110	NC_017281	ATA	2	6	256941	256946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442617
6111	NC_017281	TGA	2	6	256949	256954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442617
6112	NC_017281	TTAA	2	8	257021	257028	50 %	50 %	0 %	0 %	384442617
6113	NC_017281	TAA	2	6	257082	257087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442618
6114	NC_017281	TGATT	2	10	257123	257132	20 %	60 %	20 %	0 %	384442618
6115	NC_017281	T	6	6	257166	257171	0 %	100 %	0 %	0 %	384442618
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6120	NC_017281	CCTTAG	2	12	257384	257395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384442618
6121	NC_017281	T	6	6	257482	257487	0 %	100 %	0 %	0 %	384442618
6122	NC_017281	A	6	6	257546	257551	100 %	0 %	0 %	0 %	384442618
6123	NC_017281	AAG	2	6	257606	257611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384442618
6124	NC_017281	CAT	2	6	257738	257743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442618
6125	NC_017281	T	7	7	257743	257749	0 %	100 %	0 %	0 %	384442618
6126	NC_017281	A	6	6	257753	257758	100 %	0 %	0 %	0 %	384442618
6127	NC_017281	GAG	2	6	257759	257764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384442618
6128	NC_017281	GCT	2	6	257776	257781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442618
6129	NC_017281	TTC	2	6	257805	257810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442618
6130	NC_017281	T	9	9	257825	257833	0 %	100 %	0 %	0 %	384442618
6131	NC_017281	TTTAA	2	10	257836	257845	40 %	60 %	0 %	0 %	384442618
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6134	NC_017281	TAT	2	6	258014	258019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442619
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6138	NC_017281	ATG	2	6	258260	258265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442619
6139	NC_017281	ACC	2	6	258332	258337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384442619
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6141	NC_017281	A	6	6	258486	258491	100 %	0 %	0 %	0 %	384442619
6142	NC_017281	CCAT	2	8	258579	258586	25 %	25 %	0 %	50 %	384442619
6143	NC_017281	GGT	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384442620
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6146	NC_017281	TCC	2	6	258802	258807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384442620
6147	NC_017281	AT	3	6	258842	258847	50 %	50 %	0 %	0 %	384442620
6148	NC_017281	TGA	2	6	258987	258992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442620
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6154	NC_017281	ATCC	2	8	259339	259346	25 %	25 %	0 %	50 %	384442621
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6159	NC_017281	T	6	6	259544	259549	0 %	100 %	0 %	0 %	384442621
6160	NC_017281	CAT	2	6	259604	259609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442621
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6182	NC_017281	TGT	2	6	260864	260869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384442621
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6197	NC_017281	GCA	2	6	261657	261662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442622
6198	NC_017281	CCAT	2	8	261672	261679	25 %	25 %	0 %	50 %	384442622
6199	NC_017281	TTC	2	6	261752	261757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442622
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6201	NC_017281	CAT	2	6	261818	261823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442622
6202	NC_017281	TCA	2	6	261855	261860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442622
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6206	NC_017281	CCTTA	2	10	262295	262304	20 %	40 %	0 %	40 %	384442622
6207	NC_017281	CATTT	2	10	262379	262388	20 %	60 %	0 %	20 %	384442622
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6211	NC_017281	TTGAT	2	10	262534	262543	20 %	60 %	20 %	0 %	384442623
6212	NC_017281	TGA	2	6	262549	262554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384442623
6213	NC_017281	T	7	7	262604	262610	0 %	100 %	0 %	0 %	384442623
6214	NC_017281	A	6	6	262640	262645	100 %	0 %	0 %	0 %	384442623
6215	NC_017281	T	8	8	262648	262655	0 %	100 %	0 %	0 %	384442623
6216	NC_017281	TTTTGA	2	12	262657	262668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384442623
6217	NC_017281	TAA	2	6	262697	262702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442623
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6219	NC_017281	AAT	2	6	262730	262735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442623
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6221	NC_017281	A	7	7	262777	262783	100 %	0 %	0 %	0 %	384442623
6222	NC_017281	ATT	2	6	262812	262817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442623
6223	NC_017281	ATT	2	6	262827	262832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442623
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6226	NC_017281	AAGA	2	8	262907	262914	75 %	0 %	25 %	0 %	384442623
6227	NC_017281	TTC	2	6	262965	262970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442623
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6229	NC_017281	CTTT	2	8	263112	263119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6230	NC_017281	GTA	2	6	263162	263167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_017281	ATC	2	6	263256	263261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442624
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6234	NC_017281	T	7	7	263268	263274	0 %	100 %	0 %	0 %	384442624
6235	NC_017281	CTA	2	6	263345	263350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442624
6236	NC_017281	CTTT	2	8	263362	263369	0 %	75 %	0 %	25 %	384442624
6237	NC_017281	GATC	2	8	263438	263445	25 %	25 %	25 %	25 %	384442624
6238	NC_017281	GCTT	2	8	263500	263507	0 %	50 %	25 %	25 %	384442624
6239	NC_017281	GCA	2	6	263515	263520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384442624
6240	NC_017281	TTTC	2	8	263534	263541	0 %	75 %	0 %	25 %	384442624
6241	NC_017281	CTT	2	6	263554	263559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442624
6242	NC_017281	A	6	6	263739	263744	100 %	0 %	0 %	0 %	384442625
6243	NC_017281	A	6	6	263756	263761	100 %	0 %	0 %	0 %	384442625
6244	NC_017281	CTT	2	6	263842	263847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442625
6245	NC_017281	A	6	6	263863	263868	100 %	0 %	0 %	0 %	384442625
6246	NC_017281	GCT	2	6	263970	263975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384442625
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