MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 19250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	CAT	2	6	213	218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
2	NC_017279	CAA	2	6	249	254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447321
3	NC_017279	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447321
4	NC_017279	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447321
5	NC_017279	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
6	NC_017279	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447321
7	NC_017279	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
8	NC_017279	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
9	NC_017279	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447321
10	NC_017279	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447321
11	NC_017279	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447321
12	NC_017279	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
13	NC_017279	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447321
14	NC_017279	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447321
15	NC_017279	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447321
16	NC_017279	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017279	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017279	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017279	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017279	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447322
21	NC_017279	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447322
22	NC_017279	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447322
23	NC_017279	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
24	NC_017279	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447322
25	NC_017279	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447322
26	NC_017279	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447322
27	NC_017279	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447322
28	NC_017279	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
29	NC_017279	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447322
30	NC_017279	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447322
31	NC_017279	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
32	NC_017279	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
33	NC_017279	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447323
34	NC_017279	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447323
35	NC_017279	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
36	NC_017279	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
37	NC_017279	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447323
38	NC_017279	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447323
39	NC_017279	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447323
40	NC_017279	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
41	NC_017279	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
42	NC_017279	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384447323
43	NC_017279	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384447323
44	NC_017279	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
45	NC_017279	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447323
46	NC_017279	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384447323
47	NC_017279	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447323
48	NC_017279	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
49	NC_017279	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
50	NC_017279	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
51	NC_017279	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
52	NC_017279	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447323
53	NC_017279	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447323
54	NC_017279	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447323
55	NC_017279	GAA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017279	TTC	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447324
57	NC_017279	TTC	3	9	4954	4962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447324
58	NC_017279	ATA	2	6	4982	4987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447324
59	NC_017279	GCT	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447324
60	NC_017279	CCT	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447325
61	NC_017279	ATA	2	6	5380	5385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447325
62	NC_017279	TTG	2	6	5391	5396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447325
63	NC_017279	CAT	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447325
64	NC_017279	ACC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384447325
65	NC_017279	CTC	2	6	5874	5879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447325
66	NC_017279	TTC	2	6	5896	5901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447325
67	NC_017279	ATA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447325
68	NC_017279	CAT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447325
69	NC_017279	TCT	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447325
70	NC_017279	TGG	2	6	6223	6228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447325
71	NC_017279	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447325
72	NC_017279	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447325
73	NC_017279	ATT	2	6	6596	6601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017279	TCA	2	6	6629	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017279	TTA	2	6	6647	6652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017279	ATT	2	6	6691	6696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017279	GTT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447326
78	NC_017279	TGA	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
79	NC_017279	TTG	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447326
80	NC_017279	TTG	2	6	7075	7080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447326
81	NC_017279	TAA	2	6	7104	7109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447326
82	NC_017279	TAC	2	6	7158	7163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447326
83	NC_017279	AAT	2	6	7234	7239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447326
84	NC_017279	ATG	2	6	7256	7261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
85	NC_017279	GCT	2	6	7282	7287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447326
86	NC_017279	AAG	2	6	7352	7357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447326
87	NC_017279	TGA	2	6	7545	7550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
88	NC_017279	ATG	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
89	NC_017279	TTG	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447326
90	NC_017279	AGT	2	6	7632	7637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
91	NC_017279	ATC	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447326
92	NC_017279	CTT	2	6	7739	7744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447326
93	NC_017279	TTA	2	6	7814	7819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447326
94	NC_017279	AAC	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447326
95	NC_017279	ACT	2	6	7888	7893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447326
96	NC_017279	ACA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447326
97	NC_017279	ATT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447326
98	NC_017279	GTA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447326
99	NC_017279	AAT	2	6	8168	8173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447327
100	NC_017279	CTT	2	6	8253	8258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447327
101	NC_017279	TGA	2	6	8289	8294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
102	NC_017279	GGT	2	6	8309	8314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447327
103	NC_017279	GAA	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
104	NC_017279	AGA	2	6	8467	8472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
105	NC_017279	TTC	2	6	8722	8727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447327
106	NC_017279	CTT	2	6	8753	8758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447327
107	NC_017279	ATA	2	6	9036	9041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447327
108	NC_017279	AGA	2	6	9076	9081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
109	NC_017279	ATG	3	9	9089	9097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
110	NC_017279	CTG	2	6	9192	9197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447327
111	NC_017279	TAT	2	6	9266	9271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
112	NC_017279	GAT	2	6	9281	9286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
113	NC_017279	TGA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
114	NC_017279	AGA	2	6	9523	9528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
115	NC_017279	ATG	2	6	9567	9572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
116	NC_017279	GCT	2	6	9590	9595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447327
117	NC_017279	AAG	2	6	9612	9617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
118	NC_017279	AGC	2	6	9622	9627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384447327
119	NC_017279	ATT	2	6	9684	9689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
120	NC_017279	AAC	2	6	9693	9698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447327
121	NC_017279	TCC	2	6	9718	9723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447327
122	NC_017279	TTA	2	6	9788	9793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
123	NC_017279	GAA	2	6	9851	9856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
124	NC_017279	ATT	2	6	9915	9920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
125	NC_017279	AGA	2	6	9967	9972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
126	NC_017279	TAT	2	6	9994	9999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
127	NC_017279	ATC	2	6	10074	10079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
128	NC_017279	ATC	2	6	10115	10120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
129	NC_017279	GTG	2	6	10125	10130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447327
130	NC_017279	TCA	2	6	10144	10149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
131	NC_017279	TTA	2	6	10182	10187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
132	NC_017279	TCA	2	6	10272	10277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
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135	NC_017279	CAA	2	6	10594	10599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447327
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138	NC_017279	GGT	2	6	10838	10843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384447327
139	NC_017279	GAA	2	6	10850	10855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447327
140	NC_017279	ACT	2	6	10935	10940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
141	NC_017279	CCT	2	6	11081	11086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384447327
142	NC_017279	CAT	2	6	11087	11092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
143	NC_017279	TGC	2	6	11203	11208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447327
144	NC_017279	ATG	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
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147	NC_017279	ATG	2	6	11486	11491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
148	NC_017279	GAT	2	6	11573	11578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447327
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151	NC_017279	TAC	2	6	11823	11828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
152	NC_017279	ATT	2	6	12060	12065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447327
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155	NC_017279	ATC	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447327
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161	NC_017279	ATT	2	6	12897	12902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447328
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163	NC_017279	ATA	2	6	13008	13013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447328
164	NC_017279	GAA	2	6	13256	13261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447328
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180	NC_017279	AAT	2	6	13985	13990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447328
181	NC_017279	ATA	2	6	14067	14072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447328
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220	NC_017279	TTA	2	6	17545	17550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_017279	TCA	2	6	19351	19356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447334
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241	NC_017279	ATA	2	6	19507	19512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447334
242	NC_017279	GTT	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447334
243	NC_017279	CTG	2	6	19640	19645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447334
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245	NC_017279	ATA	2	6	19774	19779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447334
246	NC_017279	AGC	2	6	20026	20031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384447335
247	NC_017279	TAA	2	6	20259	20264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447335
248	NC_017279	ATA	2	6	20327	20332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447335
249	NC_017279	ATT	2	6	20380	20385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447335
250	NC_017279	CCA	2	6	20442	20447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384447335
251	NC_017279	AAT	2	6	20533	20538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447335
252	NC_017279	TCT	2	6	20594	20599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447335
253	NC_017279	TTC	3	9	20602	20610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447335
254	NC_017279	TCA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447335
255	NC_017279	GCT	2	6	20699	20704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447335
256	NC_017279	TCT	2	6	20777	20782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447335
257	NC_017279	TCT	2	6	20786	20791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447335
258	NC_017279	GAT	2	6	20974	20979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447335
259	NC_017279	ATC	2	6	21254	21259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447336
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261	NC_017279	AGA	3	9	21550	21558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384447336
262	NC_017279	TGA	2	6	21583	21588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447336
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265	NC_017279	TCT	2	6	21989	21994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447337
266	NC_017279	CTT	2	6	22101	22106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447337
267	NC_017279	TGT	2	6	22191	22196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447337
268	NC_017279	TCT	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447337
269	NC_017279	GAT	2	6	22453	22458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447337
270	NC_017279	CTT	2	6	22500	22505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447337
271	NC_017279	ATT	2	6	22516	22521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447337
272	NC_017279	TCA	2	6	22634	22639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447337
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275	NC_017279	ATG	2	6	22796	22801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447337
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281	NC_017279	CTG	2	6	23151	23156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384447337
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289	NC_017279	ACA	2	6	24073	24078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447339
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325	NC_017279	TAA	2	6	26423	26428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447341
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332	NC_017279	ATA	2	6	27068	27073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447341
333	NC_017279	ATA	2	6	27179	27184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447341
334	NC_017279	ATC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447341
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368	NC_017279	CGG	2	6	30788	30793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384447344
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374	NC_017279	AGT	2	6	31056	31061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447344
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