MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 1193

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	GAAAA	2	10	1390	1399	80 %	0 %	20 %	0 %	383787663
2	NC_017096	AAAAG	2	10	1823	1832	80 %	0 %	20 %	0 %	383787664
3	NC_017096	GCACT	2	10	2071	2080	20 %	20 %	20 %	40 %	383787664
4	NC_017096	GGCAA	2	10	2446	2455	40 %	0 %	40 %	20 %	383787664
5	NC_017096	GAGAG	2	10	3744	3753	40 %	0 %	60 %	0 %	383787666
6	NC_017096	AGTTG	2	10	4052	4061	20 %	40 %	40 %	0 %	383787666
7	NC_017096	TTTTC	2	10	5054	5063	0 %	80 %	0 %	20 %	383787667
8	NC_017096	CTTTG	2	10	6085	6094	0 %	60 %	20 %	20 %	383787668
9	NC_017096	GAAAT	2	10	7065	7074	60 %	20 %	20 %	0 %	383787671
10	NC_017096	TTACA	2	10	8432	8441	40 %	40 %	0 %	20 %	383787672
11	NC_017096	AAGGC	2	10	9501	9510	40 %	0 %	40 %	20 %	383787672
12	NC_017096	AGGGC	2	10	9960	9969	20 %	0 %	60 %	20 %	383787672
13	NC_017096	TAAAC	2	10	11389	11398	60 %	20 %	0 %	20 %	383787673
14	NC_017096	CGTTT	2	10	13089	13098	0 %	60 %	20 %	20 %	383787674
15	NC_017096	TCATT	2	10	13453	13462	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017096	AAGTG	2	10	14173	14182	40 %	20 %	40 %	0 %	383787676
17	NC_017096	TTATG	2	10	16177	16186	20 %	60 %	20 %	0 %	383787678
18	NC_017096	GCTGT	2	10	17187	17196	0 %	40 %	40 %	20 %	383787678
19	NC_017096	AATGA	2	10	17363	17372	60 %	20 %	20 %	0 %	383787679
20	NC_017096	GAAAG	2	10	21598	21607	60 %	0 %	40 %	0 %	383787682
21	NC_017096	AAATT	2	10	24459	24468	60 %	40 %	0 %	0 %	383787685
22	NC_017096	AAATC	2	10	28081	28090	60 %	20 %	0 %	20 %	383787688
23	NC_017096	ACGCA	2	10	28809	28818	40 %	0 %	20 %	40 %	383787689
24	NC_017096	CTAAA	2	10	29745	29754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017096	CAAAC	2	10	35441	35450	60 %	0 %	0 %	40 %	383787693
26	NC_017096	GTGTT	2	10	37192	37201	0 %	60 %	40 %	0 %	383787695
27	NC_017096	AAAAG	2	10	37389	37398	80 %	0 %	20 %	0 %	383787695
28	NC_017096	ATTAT	2	10	38664	38673	40 %	60 %	0 %	0 %	383787696
29	NC_017096	ATATT	2	10	39722	39731	40 %	60 %	0 %	0 %	383787698
30	NC_017096	GGTTG	2	10	40495	40504	0 %	40 %	60 %	0 %	383787698
31	NC_017096	AACAA	2	10	42666	42675	80 %	0 %	0 %	20 %	383787700
32	NC_017096	ATGGA	2	10	42793	42802	40 %	20 %	40 %	0 %	383787700
33	NC_017096	TTATC	2	10	43661	43670	20 %	60 %	0 %	20 %	383787700
34	NC_017096	AAAAG	2	10	45932	45941	80 %	0 %	20 %	0 %	383787701
35	NC_017096	CATCG	2	10	46875	46884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017096	GAAAA	2	10	48907	48916	80 %	0 %	20 %	0 %	383787708
37	NC_017096	CTTTA	2	10	49158	49167	20 %	60 %	0 %	20 %	383787709
38	NC_017096	TAAGT	2	10	49265	49274	40 %	40 %	20 %	0 %	383787709
39	NC_017096	ACTTG	2	10	49592	49601	20 %	40 %	20 %	20 %	383787709
40	NC_017096	TTTAT	2	10	51367	51376	20 %	80 %	0 %	0 %	383787712
41	NC_017096	AATAT	2	10	52287	52296	60 %	40 %	0 %	0 %	383787713
42	NC_017096	TTGTA	2	10	52892	52901	20 %	60 %	20 %	0 %	383787714
43	NC_017096	AGTAT	2	10	52923	52932	40 %	40 %	20 %	0 %	383787714
44	NC_017096	AAAAG	2	10	54928	54937	80 %	0 %	20 %	0 %	383787715
45	NC_017096	TAAAA	2	10	56475	56484	80 %	20 %	0 %	0 %	383787717
46	NC_017096	TAAAG	2	10	56746	56755	60 %	20 %	20 %	0 %	383787717
47	NC_017096	ATTTT	2	10	58774	58783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017096	TCTCT	2	10	59063	59072	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017096	GGATT	2	10	59222	59231	20 %	40 %	40 %	0 %	383787719
50	NC_017096	AACAG	2	10	60597	60606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017096	AATTT	2	10	60621	60630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017096	GAAAA	2	10	61990	61999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017096	AAAGG	2	10	62784	62793	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017096	CATTA	2	10	63832	63841	40 %	40 %	0 %	20 %	383787727
55	NC_017096	GAAAA	2	10	64304	64313	80 %	0 %	20 %	0 %	383787727
56	NC_017096	ATTTT	2	10	64855	64864	20 %	80 %	0 %	0 %	383787727
57	NC_017096	ATTTA	2	10	65143	65152	40 %	60 %	0 %	0 %	383787728
58	NC_017096	TCTTT	2	10	65949	65958	0 %	80 %	0 %	20 %	383787731
59	NC_017096	TGGAT	2	10	66615	66624	20 %	40 %	40 %	0 %	383787733
60	NC_017096	ATTAT	2	10	66728	66737	40 %	60 %	0 %	0 %	383787733
61	NC_017096	GAAAA	2	10	69701	69710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017096	TTTAT	2	10	70271	70280	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017096	TTTTG	2	10	70500	70509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017096	TTTAT	2	10	74866	74875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017096	ATGTT	2	10	75579	75588	20 %	60 %	20 %	0 %	383787747
66	NC_017096	TGGTA	2	10	78895	78904	20 %	40 %	40 %	0 %	383787751
67	NC_017096	ATTTT	2	10	79204	79213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017096	TTTAT	2	10	79356	79365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017096	AAGAT	2	10	80630	80639	60 %	20 %	20 %	0 %	383787752
70	NC_017096	TAATG	2	10	81138	81147	40 %	40 %	20 %	0 %	383787753
71	NC_017096	AAGTA	2	10	82639	82648	60 %	20 %	20 %	0 %	383787754
72	NC_017096	AAAAG	2	10	84739	84748	80 %	0 %	20 %	0 %	383787756
73	NC_017096	TCAAA	2	10	84780	84789	60 %	20 %	0 %	20 %	383787756
74	NC_017096	GAGAA	2	10	86015	86024	60 %	0 %	40 %	0 %	383787758
75	NC_017096	GAGAA	2	10	86564	86573	60 %	0 %	40 %	0 %	383787758
76	NC_017096	TTAAA	2	10	86945	86954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017096	ACTTT	2	10	91577	91586	20 %	60 %	0 %	20 %	383787765
78	NC_017096	ATATA	2	10	92394	92403	60 %	40 %	0 %	0 %	383787765
79	NC_017096	TACTT	2	10	92746	92755	20 %	60 %	0 %	20 %	383787766
80	NC_017096	TTCTT	2	10	93418	93427	0 %	80 %	0 %	20 %	383787766
81	NC_017096	ATTTA	2	10	93788	93797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017096	GCCAA	2	10	97019	97028	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017096	AGTTG	2	10	97830	97839	20 %	40 %	40 %	0 %	383787771
84	NC_017096	TTTTA	2	10	98316	98325	20 %	80 %	0 %	0 %	383787771
85	NC_017096	TCGCG	2	10	98935	98944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017096	GAAGA	2	10	100573	100582	60 %	0 %	40 %	0 %	383787773
87	NC_017096	CTTAT	2	10	101167	101176	20 %	60 %	0 %	20 %	383787774
88	NC_017096	TTTGG	2	10	102039	102048	0 %	60 %	40 %	0 %	383787775
89	NC_017096	TCATC	2	10	102902	102911	20 %	40 %	0 %	40 %	383787776
90	NC_017096	ATCTA	2	10	108540	108549	40 %	40 %	0 %	20 %	383787783
91	NC_017096	GTGAA	2	10	109222	109231	40 %	20 %	40 %	0 %	383787784
92	NC_017096	CGTAA	2	10	109781	109790	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017096	AAATT	2	10	111106	111115	60 %	40 %	0 %	0 %	383787787
94	NC_017096	GGCAG	2	10	112782	112791	20 %	0 %	60 %	20 %	383787789
95	NC_017096	GGTAT	2	10	113510	113519	20 %	40 %	40 %	0 %	383787790
96	NC_017096	GTTAA	2	10	114100	114109	40 %	40 %	20 %	0 %	383787791
97	NC_017096	TTTCA	2	10	116931	116940	20 %	60 %	0 %	20 %	383787795
98	NC_017096	AACAT	2	10	117320	117329	60 %	20 %	0 %	20 %	383787795
99	NC_017096	GAAAT	2	10	117787	117796	60 %	20 %	20 %	0 %	383787796
100	NC_017096	CTTTC	2	10	118341	118350	0 %	60 %	0 %	40 %	383787797
101	NC_017096	TTCCA	2	10	118353	118362	20 %	40 %	0 %	40 %	383787797
102	NC_017096	GTCCT	2	10	119809	119818	0 %	40 %	20 %	40 %	383787797
103	NC_017096	ATTTT	2	10	120533	120542	20 %	80 %	0 %	0 %	383787798
104	NC_017096	TTGTT	2	10	121450	121459	0 %	80 %	20 %	0 %	383787798
105	NC_017096	TGTGT	2	10	122288	122297	0 %	60 %	40 %	0 %	383787799
106	NC_017096	AAGGC	2	10	127915	127924	40 %	0 %	40 %	20 %	383787803
107	NC_017096	ATTTT	2	10	127937	127946	20 %	80 %	0 %	0 %	383787803
108	NC_017096	CAAAC	2	10	131387	131396	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017096	CATTC	2	10	132200	132209	20 %	40 %	0 %	40 %	383787809
110	NC_017096	ATGCT	2	10	132229	132238	20 %	40 %	20 %	20 %	383787809
111	NC_017096	CTTTT	2	10	132347	132356	0 %	80 %	0 %	20 %	383787810
112	NC_017096	GGAAG	2	10	133238	133247	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017096	AAAAC	2	10	133737	133746	80 %	0 %	0 %	20 %	383787812
114	NC_017096	TGGAG	2	10	135762	135771	20 %	20 %	60 %	0 %	383787813
115	NC_017096	CAAAC	2	10	136435	136444	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017096	GTTTT	2	10	137825	137834	0 %	80 %	20 %	0 %	383787815
117	NC_017096	TTTCT	2	10	138067	138076	0 %	80 %	0 %	20 %	383787815
118	NC_017096	TTTTC	2	10	139011	139020	0 %	80 %	0 %	20 %	383787816
119	NC_017096	TGGCT	2	10	139148	139157	0 %	40 %	40 %	20 %	383787816
120	NC_017096	AAGGA	2	10	139735	139744	60 %	0 %	40 %	0 %	383787817
121	NC_017096	CTTAT	2	10	143935	143944	20 %	60 %	0 %	20 %	383787819
122	NC_017096	GAAAA	2	10	144515	144524	80 %	0 %	20 %	0 %	383787819
123	NC_017096	TAAGA	2	10	146344	146353	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017096	ATATT	2	10	147046	147055	40 %	60 %	0 %	0 %	383787822
125	NC_017096	AATAA	2	10	147854	147863	80 %	20 %	0 %	0 %	383787822
126	NC_017096	AACAA	2	10	148208	148217	80 %	0 %	0 %	20 %	383787822
127	NC_017096	CTTTA	2	10	150197	150206	20 %	60 %	0 %	20 %	383787824
128	NC_017096	TTGTT	2	10	150968	150977	0 %	80 %	20 %	0 %	383787824
129	NC_017096	TTCTT	2	10	151621	151630	0 %	80 %	0 %	20 %	383787825
130	NC_017096	TCAGT	2	10	154875	154884	20 %	40 %	20 %	20 %	383787827
131	NC_017096	AGGAA	2	10	158130	158139	60 %	0 %	40 %	0 %	383787832
132	NC_017096	AGGCA	2	10	158323	158332	40 %	0 %	40 %	20 %	383787832
133	NC_017096	TAATT	2	10	158431	158440	40 %	60 %	0 %	0 %	383787832
134	NC_017096	AATTA	2	10	160718	160727	60 %	40 %	0 %	0 %	383787834
135	NC_017096	AGTAA	2	10	162581	162590	60 %	20 %	20 %	0 %	383787836
136	NC_017096	GAGAA	2	10	162615	162624	60 %	0 %	40 %	0 %	383787836
137	NC_017096	AATTT	2	10	162890	162899	40 %	60 %	0 %	0 %	383787836
138	NC_017096	AAGAA	2	10	168235	168244	80 %	0 %	20 %	0 %	383787841
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