MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 4132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	GCGCA	2	10	1809	1818	20 %	0 %	40 %	40 %	383760957
2	NC_017079	CGAAA	2	10	2551	2560	60 %	0 %	20 %	20 %	383760957
3	NC_017079	GCGCT	2	10	2945	2954	0 %	20 %	40 %	40 %	383760958
4	NC_017079	ATGAA	2	10	3554	3563	60 %	20 %	20 %	0 %	383760958
5	NC_017079	GCAGC	2	10	5087	5096	20 %	0 %	40 %	40 %	383760959
6	NC_017079	CTGTC	2	10	5496	5505	0 %	40 %	20 %	40 %	383760959
7	NC_017079	GGCTG	2	10	7667	7676	0 %	20 %	60 %	20 %	383760961
8	NC_017079	ATTCA	2	10	8101	8110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017079	GCGCC	2	10	9715	9724	0 %	0 %	40 %	60 %	383760963
10	NC_017079	GCGTC	2	10	9812	9821	0 %	20 %	40 %	40 %	383760963
11	NC_017079	TATCG	2	10	10761	10770	20 %	40 %	20 %	20 %	383760964
12	NC_017079	CCAGC	2	10	11442	11451	20 %	0 %	20 %	60 %	383760965
13	NC_017079	GCCGC	2	10	11988	11997	0 %	0 %	40 %	60 %	383760965
14	NC_017079	TGGGA	2	10	12055	12064	20 %	20 %	60 %	0 %	383760965
15	NC_017079	TGCGC	2	10	12627	12636	0 %	20 %	40 %	40 %	383760965
16	NC_017079	TGAGA	2	10	13219	13228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017079	CGATA	2	10	14495	14504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017079	TGACC	2	10	14841	14850	20 %	20 %	20 %	40 %	383760967
19	NC_017079	GCACT	2	10	15158	15167	20 %	20 %	20 %	40 %	383760967
20	NC_017079	TCAGC	2	10	16622	16631	20 %	20 %	20 %	40 %	383760969
21	NC_017079	ATTGT	2	10	21717	21726	20 %	60 %	20 %	0 %	383760972
22	NC_017079	GATGT	2	10	22911	22920	20 %	40 %	40 %	0 %	383760974
23	NC_017079	CCCTG	2	10	23069	23078	0 %	20 %	20 %	60 %	383760974
24	NC_017079	GCAAC	2	10	23196	23205	40 %	0 %	20 %	40 %	383760974
25	NC_017079	GGCAG	2	10	24160	24169	20 %	0 %	60 %	20 %	383760975
26	NC_017079	GAGCG	2	10	24220	24229	20 %	0 %	60 %	20 %	383760975
27	NC_017079	AGCGA	2	10	26565	26574	40 %	0 %	40 %	20 %	383760979
28	NC_017079	CAGCG	2	10	26932	26941	20 %	0 %	40 %	40 %	383760979
29	NC_017079	CGATG	2	10	26998	27007	20 %	20 %	40 %	20 %	383760979
30	NC_017079	CGCTG	2	10	27271	27280	0 %	20 %	40 %	40 %	383760979
31	NC_017079	GTGAT	2	10	27560	27569	20 %	40 %	40 %	0 %	383760979
32	NC_017079	CCGGC	2	10	29543	29552	0 %	0 %	40 %	60 %	383760981
33	NC_017079	CGAGC	2	10	30107	30116	20 %	0 %	40 %	40 %	383760982
34	NC_017079	AGGGA	2	10	30434	30443	40 %	0 %	60 %	0 %	383760983
35	NC_017079	ATTGA	2	10	31994	32003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017079	GGCGC	2	10	33349	33358	0 %	0 %	60 %	40 %	383760984
37	NC_017079	GATCC	2	10	33687	33696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017079	AGCGA	2	10	33716	33725	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017079	TGGCA	2	10	36150	36159	20 %	20 %	40 %	20 %	383760987
40	NC_017079	CAGGC	2	10	37367	37376	20 %	0 %	40 %	40 %	383760988
41	NC_017079	ATGAA	2	10	38543	38552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017079	GTCAG	2	10	38715	38724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017079	AGCGA	2	10	40082	40091	40 %	0 %	40 %	20 %	383760990
44	NC_017079	TGAGC	2	10	40345	40354	20 %	20 %	40 %	20 %	383760990
45	NC_017079	TGGTC	2	10	41207	41216	0 %	40 %	40 %	20 %	383760991
46	NC_017079	ATGGC	2	10	41299	41308	20 %	20 %	40 %	20 %	383760991
47	NC_017079	GACCT	2	10	41496	41505	20 %	20 %	20 %	40 %	383760991
48	NC_017079	GGGCT	2	10	42550	42559	0 %	20 %	60 %	20 %	383760992
49	NC_017079	GCGCC	2	10	42735	42744	0 %	0 %	40 %	60 %	383760992
50	NC_017079	TGCGC	2	10	44539	44548	0 %	20 %	40 %	40 %	383760993
51	NC_017079	CGGCG	2	10	48712	48721	0 %	0 %	60 %	40 %	383760998
52	NC_017079	AGGCG	2	10	50322	50331	20 %	0 %	60 %	20 %	383761000
53	NC_017079	TCCCG	2	10	51241	51250	0 %	20 %	20 %	60 %	383761001
54	NC_017079	TCGAT	2	10	53901	53910	20 %	40 %	20 %	20 %	383761003
55	NC_017079	GCTCA	2	10	53920	53929	20 %	20 %	20 %	40 %	383761003
56	NC_017079	GCAAT	2	10	54699	54708	40 %	20 %	20 %	20 %	383761003
57	NC_017079	ATTGA	2	10	54849	54858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017079	GCCTC	2	10	58456	58465	0 %	20 %	20 %	60 %	383761007
59	NC_017079	AAAGG	2	10	58505	58514	60 %	0 %	40 %	0 %	383761007
60	NC_017079	CCTGG	2	10	59130	59139	0 %	20 %	40 %	40 %	383761009
61	NC_017079	CGCAG	2	10	59663	59672	20 %	0 %	40 %	40 %	383761009
62	NC_017079	TCTCT	2	10	60625	60634	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017079	TGGGC	2	10	62247	62256	0 %	20 %	60 %	20 %	383761011
64	NC_017079	GAGGC	2	10	63289	63298	20 %	0 %	60 %	20 %	383761011
65	NC_017079	GATAC	2	10	63628	63637	40 %	20 %	20 %	20 %	383761011
66	NC_017079	CCGCG	2	10	64101	64110	0 %	0 %	40 %	60 %	383761011
67	NC_017079	TCGCC	2	10	64260	64269	0 %	20 %	20 %	60 %	383761011
68	NC_017079	AAGCG	2	10	67973	67982	40 %	0 %	40 %	20 %	383761012
69	NC_017079	ACGAT	2	10	69566	69575	40 %	20 %	20 %	20 %	383761012
70	NC_017079	AACGC	2	10	69652	69661	40 %	0 %	20 %	40 %	383761012
71	NC_017079	CCAGG	2	10	71081	71090	20 %	0 %	40 %	40 %	383761012
72	NC_017079	CGGTT	2	10	72000	72009	0 %	40 %	40 %	20 %	383761013
73	NC_017079	GAAGA	2	10	72695	72704	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017079	AGGCA	2	10	72883	72892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017079	GGAAA	2	10	72963	72972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017079	TTTTA	2	10	73162	73171	20 %	80 %	0 %	0 %	383761014
77	NC_017079	CAACC	2	10	73988	73997	40 %	0 %	0 %	60 %	383761014
78	NC_017079	CAGGC	2	10	74374	74383	20 %	0 %	40 %	40 %	383761015
79	NC_017079	TGCCG	2	10	76844	76853	0 %	20 %	40 %	40 %	383761018
80	NC_017079	GATCG	2	10	77236	77245	20 %	20 %	40 %	20 %	383761019
81	NC_017079	CCAGG	2	10	79198	79207	20 %	0 %	40 %	40 %	383761020
82	NC_017079	CGCGC	2	10	81547	81556	0 %	0 %	40 %	60 %	383761021
83	NC_017079	GCGCA	2	10	82338	82347	20 %	0 %	40 %	40 %	383761022
84	NC_017079	TGCGC	2	10	82754	82763	0 %	20 %	40 %	40 %	383761022
85	NC_017079	GATCG	2	10	83502	83511	20 %	20 %	40 %	20 %	383761023
86	NC_017079	GGCTT	2	10	85047	85056	0 %	40 %	40 %	20 %	383761023
87	NC_017079	TGCCG	2	10	85393	85402	0 %	20 %	40 %	40 %	383761024
88	NC_017079	TCGTC	2	10	85869	85878	0 %	40 %	20 %	40 %	383761024
89	NC_017079	CAGCG	2	10	90336	90345	20 %	0 %	40 %	40 %	383761029
90	NC_017079	GATCG	2	10	90912	90921	20 %	20 %	40 %	20 %	383761029
91	NC_017079	AACAA	2	10	91494	91503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017079	TCGAT	2	10	91630	91639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017079	CGCTG	2	10	92915	92924	0 %	20 %	40 %	40 %	383761031
94	NC_017079	GCATC	2	10	93417	93426	20 %	20 %	20 %	40 %	383761032
95	NC_017079	GTCGA	2	10	93828	93837	20 %	20 %	40 %	20 %	383761032
96	NC_017079	ACAGA	2	10	94881	94890	60 %	0 %	20 %	20 %	383761032
97	NC_017079	TGCGC	2	10	95657	95666	0 %	20 %	40 %	40 %	383761032
98	NC_017079	ATTCA	2	10	96356	96365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017079	GGGGC	2	10	96467	96476	0 %	0 %	80 %	20 %	383761033
100	NC_017079	TGGCG	2	10	98053	98062	0 %	20 %	60 %	20 %	383761034
101	NC_017079	CGAGC	2	10	99874	99883	20 %	0 %	40 %	40 %	383761034
102	NC_017079	CGGCG	2	10	100876	100885	0 %	0 %	60 %	40 %	383761034
103	NC_017079	GCAAC	2	10	101106	101115	40 %	0 %	20 %	40 %	383761034
104	NC_017079	CGCTG	2	10	101893	101902	0 %	20 %	40 %	40 %	383761034
105	NC_017079	GCCCG	2	10	104116	104125	0 %	0 %	40 %	60 %	383761034
106	NC_017079	TCGGC	2	10	106290	106299	0 %	20 %	40 %	40 %	383761034
107	NC_017079	GAAGA	2	10	108161	108170	60 %	0 %	40 %	0 %	383761034
108	NC_017079	CGTTC	2	10	108427	108436	0 %	40 %	20 %	40 %	383761034
109	NC_017079	AGCGT	2	10	111308	111317	20 %	20 %	40 %	20 %	383761034
110	NC_017079	CAGGC	2	10	113635	113644	20 %	0 %	40 %	40 %	383761034
111	NC_017079	CTGCA	2	10	113998	114007	20 %	20 %	20 %	40 %	383761034
112	NC_017079	AGCAT	2	10	115055	115064	40 %	20 %	20 %	20 %	383761034
113	NC_017079	CGCAA	2	10	116392	116401	40 %	0 %	20 %	40 %	383761035
114	NC_017079	GAAGG	2	10	117294	117303	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017079	TCACC	2	10	117934	117943	20 %	20 %	0 %	60 %	383761036
116	NC_017079	GACCA	2	10	118509	118518	40 %	0 %	20 %	40 %	383761037
117	NC_017079	GGAAA	2	10	118815	118824	60 %	0 %	40 %	0 %	383761037
118	NC_017079	CAAAC	2	10	119458	119467	60 %	0 %	0 %	40 %	383761038
119	NC_017079	TTGTT	2	10	121530	121539	0 %	80 %	20 %	0 %	383761040
120	NC_017079	TCATC	2	10	122063	122072	20 %	40 %	0 %	40 %	383761040
121	NC_017079	GCGAT	2	10	122386	122395	20 %	20 %	40 %	20 %	383761040
122	NC_017079	CGCGG	2	10	124773	124782	0 %	0 %	60 %	40 %	383761042
123	NC_017079	CCCTC	2	10	126390	126399	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_017079	GTCCT	2	10	127547	127556	0 %	40 %	20 %	40 %	383761046
125	NC_017079	ACGGC	2	10	128899	128908	20 %	0 %	40 %	40 %	383761047
126	NC_017079	CAGGC	2	10	129719	129728	20 %	0 %	40 %	40 %	383761047
127	NC_017079	TGCCG	2	10	132611	132620	0 %	20 %	40 %	40 %	383761049
128	NC_017079	TCGAT	2	10	135967	135976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017079	AAAGC	2	10	136324	136333	60 %	0 %	20 %	20 %	383761052
130	NC_017079	GCCTG	2	10	136609	136618	0 %	20 %	40 %	40 %	383761052
131	NC_017079	AACGT	2	10	137811	137820	40 %	20 %	20 %	20 %	383761052
132	NC_017079	GCGCA	2	10	138534	138543	20 %	0 %	40 %	40 %	383761053
133	NC_017079	TTGCT	2	10	138620	138629	0 %	60 %	20 %	20 %	383761053
134	NC_017079	GGCAT	2	10	140702	140711	20 %	20 %	40 %	20 %	383761055
135	NC_017079	AGCCG	2	10	140997	141006	20 %	0 %	40 %	40 %	383761055
136	NC_017079	CTCCA	2	10	142344	142353	20 %	20 %	0 %	60 %	383761056
137	NC_017079	CCAAC	2	10	146746	146755	40 %	0 %	0 %	60 %	383761057
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