MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 113656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017079	CGA	2	6	185003	185008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761081
4003	NC_017079	AGG	2	6	185194	185199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017079	CGG	2	6	185224	185229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761082
4005	NC_017079	TCG	2	6	185292	185297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761082
4006	NC_017079	GCG	2	6	185402	185407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761082
4007	NC_017079	TACC	2	8	185425	185432	25 %	25 %	0 %	50 %	383761082
4008	NC_017079	GCA	2	6	185478	185483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761082
4009	NC_017079	GCG	2	6	185543	185548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761082
4010	NC_017079	ATC	2	6	185571	185576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761082
4011	NC_017079	CGA	2	6	185587	185592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761082
4012	NC_017079	CGC	2	6	185662	185667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761082
4013	NC_017079	ATCAC	2	10	185703	185712	40 %	20 %	0 %	40 %	383761082
4014	NC_017079	CAA	2	6	185746	185751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761082
4015	NC_017079	GGT	2	6	185779	185784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761082
4016	NC_017079	GGCA	2	8	185840	185847	25 %	0 %	50 %	25 %	383761082
4017	NC_017079	ACA	2	6	185928	185933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761082
4018	NC_017079	TGG	2	6	185967	185972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761082
4019	NC_017079	CGA	2	6	185983	185988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761082
4020	NC_017079	CCG	2	6	186043	186048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761082
4021	NC_017079	TGG	3	9	186152	186160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761082
4022	NC_017079	GCA	2	6	186331	186336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
4023	NC_017079	GCCC	2	8	186411	186418	0 %	0 %	25 %	75 %	383761083
4024	NC_017079	GCA	2	6	186451	186456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
4025	NC_017079	CAA	2	6	186507	186512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761083
4026	NC_017079	CGG	2	6	186515	186520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761083
4027	NC_017079	GC	3	6	186533	186538	0 %	0 %	50 %	50 %	383761083
4028	NC_017079	AAG	2	6	186628	186633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383761083
4029	NC_017079	GCC	2	6	186657	186662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761083
4030	NC_017079	GC	3	6	186682	186687	0 %	0 %	50 %	50 %	383761083
4031	NC_017079	GCG	2	6	186724	186729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761083
4032	NC_017079	GCC	2	6	186759	186764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761083
4033	NC_017079	TGA	2	6	186839	186844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761083
4034	NC_017079	CGA	2	6	186893	186898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
4035	NC_017079	A	6	6	187018	187023	100 %	0 %	0 %	0 %	383761083
4036	NC_017079	CTGC	2	8	187025	187032	0 %	25 %	25 %	50 %	383761083
4037	NC_017079	CGC	2	6	187055	187060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761083
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4040	NC_017079	ACG	2	6	187141	187146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
4041	NC_017079	GCA	2	6	187199	187204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
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4043	NC_017079	AGC	2	6	187219	187224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
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4045	NC_017079	GCC	2	6	187269	187274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761083
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4047	NC_017079	TCA	2	6	187346	187351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761083
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4049	NC_017079	GAC	2	6	187467	187472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761083
4050	NC_017079	GC	3	6	187473	187478	0 %	0 %	50 %	50 %	383761083
4051	NC_017079	T	6	6	187552	187557	0 %	100 %	0 %	0 %	383761084
4052	NC_017079	GAC	2	6	187567	187572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761084
4053	NC_017079	TCG	2	6	187617	187622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761084
4054	NC_017079	TCTT	2	8	187662	187669	0 %	75 %	0 %	25 %	383761084
4055	NC_017079	GC	3	6	187703	187708	0 %	0 %	50 %	50 %	383761084
4056	NC_017079	CAT	2	6	187733	187738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761084
4057	NC_017079	GC	3	6	187762	187767	0 %	0 %	50 %	50 %	383761084
4058	NC_017079	CCA	2	6	187768	187773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761084
4059	NC_017079	CGC	2	6	187861	187866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761084
4060	NC_017079	CG	3	6	187891	187896	0 %	0 %	50 %	50 %	383761084
4061	NC_017079	GTT	2	6	187912	187917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761084
4062	NC_017079	TGG	2	6	187981	187986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761084
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4064	NC_017079	GC	3	6	188260	188265	0 %	0 %	50 %	50 %	383761084
4065	NC_017079	TCG	2	6	188304	188309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761084
4066	NC_017079	CTCG	2	8	188318	188325	0 %	25 %	25 %	50 %	383761084
4067	NC_017079	CCGG	2	8	188349	188356	0 %	0 %	50 %	50 %	383761084
4068	NC_017079	TCG	2	6	188368	188373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761084
4069	NC_017079	GGCG	2	8	188380	188387	0 %	0 %	75 %	25 %	383761084
4070	NC_017079	CAT	2	6	188413	188418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761084
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4074	NC_017079	TCG	2	6	188598	188603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761084
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4077	NC_017079	AG	3	6	188687	188692	50 %	0 %	50 %	0 %	383761084
4078	NC_017079	CGT	2	6	188723	188728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761084
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4081	NC_017079	GAAG	2	8	189021	189028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_017079	GCT	2	6	189039	189044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761085
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4085	NC_017079	CAGCGT	2	12	189096	189107	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383761085
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4089	NC_017079	CAG	2	6	189296	189301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761085
4090	NC_017079	ACG	2	6	189314	189319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761085
4091	NC_017079	TGA	3	9	189323	189331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761085
4092	NC_017079	CCGA	2	8	189377	189384	25 %	0 %	25 %	50 %	383761085
4093	NC_017079	GAA	2	6	189423	189428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383761085
4094	NC_017079	CGAT	2	8	189430	189437	25 %	25 %	25 %	25 %	383761085
4095	NC_017079	CTC	2	6	189501	189506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_017079	TCAT	2	8	189510	189517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_017079	AG	3	6	189529	189534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017079	AAC	2	6	189546	189551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_017079	CA	3	6	189720	189725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_017079	AC	3	6	189733	189738	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_017079	TGA	2	6	189864	189869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761086
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4104	NC_017079	CGG	2	6	189920	189925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761086
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4106	NC_017079	TTG	2	6	189963	189968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761086
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4109	NC_017079	GCCA	2	8	190077	190084	25 %	0 %	25 %	50 %	383761086
4110	NC_017079	TGG	2	6	190105	190110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761086
4111	NC_017079	ACC	2	6	190188	190193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761086
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4113	NC_017079	ACG	2	6	190305	190310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761086
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4116	NC_017079	GCA	2	6	190507	190512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761086
4117	NC_017079	TGA	2	6	190558	190563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761086
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4119	NC_017079	CGT	3	9	190643	190651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761086
4120	NC_017079	ATCCT	2	10	190656	190665	20 %	40 %	0 %	40 %	383761086
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4245	NC_017079	GCT	2	6	196158	196163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761093
4246	NC_017079	CAGCGA	2	12	196191	196202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761093
4247	NC_017079	TGC	2	6	196208	196213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761093
4248	NC_017079	GCCGGC	2	12	196222	196233	0 %	0 %	50 %	50 %	383761093
4249	NC_017079	GC	3	6	196246	196251	0 %	0 %	50 %	50 %	383761093
4250	NC_017079	ATG	2	6	196261	196266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761093
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4252	NC_017079	GGC	2	6	196361	196366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761093
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4257	NC_017079	CCA	2	6	196581	196586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761093
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4259	NC_017079	TGCCCG	2	12	196649	196660	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383761093
4260	NC_017079	CGA	2	6	196767	196772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761093
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4288	NC_017079	TGG	2	6	198764	198769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4289	NC_017079	TGC	2	6	198805	198810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4350	NC_017079	AG	3	6	200885	200890	50 %	0 %	50 %	0 %	383761098
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4361	NC_017079	ACG	2	6	201381	201386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_017079	CGCT	2	8	201404	201411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4491	NC_017079	TTC	2	6	207099	207104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383761104
4492	NC_017079	GAG	2	6	207123	207128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761104
4493	NC_017079	CTT	2	6	207161	207166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383761104
4494	NC_017079	CGA	2	6	207168	207173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761104
4495	NC_017079	CAAGC	2	10	207179	207188	40 %	0 %	20 %	40 %	383761104
4496	NC_017079	CAT	2	6	207323	207328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761104
4497	NC_017079	TGC	2	6	207329	207334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761104
4498	NC_017079	CTG	2	6	207337	207342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761104
4499	NC_017079	ACC	2	6	207387	207392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761104
4500	NC_017079	ATC	2	6	207417	207422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761104

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