MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 113656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017079	GC	3	6	24003	24008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_017079	GAAGTC	2	12	24038	24049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383760975
503	NC_017079	GGCC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	383760975
504	NC_017079	GGT	2	6	24088	24093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760975
505	NC_017079	GGCAG	2	10	24160	24169	20 %	0 %	60 %	20 %	383760975
506	NC_017079	AT	3	6	24199	24204	50 %	50 %	0 %	0 %	383760975
507	NC_017079	GCT	2	6	24205	24210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760975
508	NC_017079	GAGCG	2	10	24220	24229	20 %	0 %	60 %	20 %	383760975
509	NC_017079	GAT	2	6	24232	24237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760975
510	NC_017079	TCG	2	6	24270	24275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760975
511	NC_017079	TGT	2	6	24307	24312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760975
512	NC_017079	AGCA	2	8	24478	24485	50 %	0 %	25 %	25 %	383760975
513	NC_017079	GCT	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760975
514	NC_017079	GGC	2	6	24584	24589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760975
515	NC_017079	AGG	2	6	24603	24608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760975
516	NC_017079	AGC	2	6	24668	24673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760975
517	NC_017079	GCC	2	6	24702	24707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760975
518	NC_017079	CGG	2	6	24709	24714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760975
519	NC_017079	GGC	2	6	24722	24727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760975
520	NC_017079	CGC	2	6	24752	24757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760975
521	NC_017079	GTG	2	6	24803	24808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760975
522	NC_017079	AG	4	8	24864	24871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017079	GAG	2	6	24874	24879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017079	GAG	2	6	24888	24893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017079	GTT	2	6	25054	25059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760976
526	NC_017079	GCG	2	6	25086	25091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760976
527	NC_017079	TCC	2	6	25101	25106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760976
528	NC_017079	CGT	2	6	25138	25143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760976
529	NC_017079	CGG	3	9	25201	25209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760976
530	NC_017079	TCA	2	6	25237	25242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760976
531	NC_017079	GCCA	2	8	25258	25265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_017079	GGC	2	6	25393	25398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017079	GCC	2	6	25407	25412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_017079	AGC	3	9	25613	25621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760977
535	NC_017079	GCC	2	6	25702	25707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760977
536	NC_017079	TGC	2	6	25731	25736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760977
537	NC_017079	GC	3	6	25760	25765	0 %	0 %	50 %	50 %	383760977
538	NC_017079	CTTC	2	8	25821	25828	0 %	50 %	0 %	50 %	383760977
539	NC_017079	CAG	2	6	25987	25992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760977
540	NC_017079	TAT	2	6	26085	26090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760977
541	NC_017079	ACC	2	6	26162	26167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760977
542	NC_017079	GATG	2	8	26246	26253	25 %	25 %	50 %	0 %	383760977
543	NC_017079	CT	4	8	26290	26297	0 %	50 %	0 %	50 %	383760978
544	NC_017079	GCT	2	6	26387	26392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760978
545	NC_017079	AGCGA	2	10	26565	26574	40 %	0 %	40 %	20 %	383760979
546	NC_017079	GCA	2	6	26689	26694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760979
547	NC_017079	CCT	2	6	26811	26816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760979
548	NC_017079	TCA	2	6	26827	26832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760979
549	NC_017079	CGA	2	6	26839	26844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760979
550	NC_017079	CGC	2	6	26860	26865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760979
551	NC_017079	CAGCG	2	10	26932	26941	20 %	0 %	40 %	40 %	383760979
552	NC_017079	GTT	2	6	26992	26997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760979
553	NC_017079	CGATG	2	10	26998	27007	20 %	20 %	40 %	20 %	383760979
554	NC_017079	TAT	2	6	27025	27030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760979
555	NC_017079	GTG	2	6	27032	27037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760979
556	NC_017079	GTGG	2	8	27041	27048	0 %	25 %	75 %	0 %	383760979
557	NC_017079	GCG	2	6	27068	27073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760979
558	NC_017079	CG	3	6	27072	27077	0 %	0 %	50 %	50 %	383760979
559	NC_017079	CCTG	2	8	27103	27110	0 %	25 %	25 %	50 %	383760979
560	NC_017079	GCG	2	6	27118	27123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760979
561	NC_017079	ACG	2	6	27141	27146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760979
562	NC_017079	CGC	2	6	27185	27190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760979
563	NC_017079	GGCG	2	8	27242	27249	0 %	0 %	75 %	25 %	383760979
564	NC_017079	CGCTG	2	10	27271	27280	0 %	20 %	40 %	40 %	383760979
565	NC_017079	GCC	2	6	27289	27294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760979
566	NC_017079	CAG	2	6	27319	27324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760979
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568	NC_017079	GTCC	2	8	27458	27465	0 %	25 %	25 %	50 %	383760979
569	NC_017079	GCT	2	6	27505	27510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760979
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571	NC_017079	GTGAT	2	10	27560	27569	20 %	40 %	40 %	0 %	383760979
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573	NC_017079	CGAT	2	8	27747	27754	25 %	25 %	25 %	25 %	383760980
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576	NC_017079	CAG	2	6	27824	27829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760980
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578	NC_017079	CGGT	2	8	27894	27901	0 %	25 %	50 %	25 %	383760980
579	NC_017079	GCC	2	6	28022	28027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760980
580	NC_017079	CGC	2	6	28028	28033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760980
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595	NC_017079	CG	3	6	28798	28803	0 %	0 %	50 %	50 %	383760980
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597	NC_017079	TTA	2	6	28818	28823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760980
598	NC_017079	GCC	2	6	28847	28852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760980
599	NC_017079	GCT	2	6	28966	28971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760980
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601	NC_017079	CGC	2	6	29019	29024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_017079	T	7	7	29029	29035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017079	TCA	2	6	29063	29068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760981
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606	NC_017079	TCC	2	6	29167	29172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760981
607	NC_017079	GCGT	2	8	29206	29213	0 %	25 %	50 %	25 %	383760981
608	NC_017079	GCG	2	6	29214	29219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760981
609	NC_017079	TCA	2	6	29290	29295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760981
610	NC_017079	ACG	3	9	29305	29313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760981
611	NC_017079	GAC	2	6	29346	29351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760981
612	NC_017079	GCG	2	6	29513	29518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760981
613	NC_017079	CCGGC	2	10	29543	29552	0 %	0 %	40 %	60 %	383760981
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615	NC_017079	GCC	2	6	29602	29607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760981
616	NC_017079	GAC	2	6	29729	29734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760981
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618	NC_017079	CCT	2	6	29747	29752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760981
619	NC_017079	GC	3	6	29881	29886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017079	CGA	2	6	29917	29922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760982
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623	NC_017079	CCT	2	6	30028	30033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760982
624	NC_017079	CA	3	6	30050	30055	50 %	0 %	0 %	50 %	383760982
625	NC_017079	CGAGC	2	10	30107	30116	20 %	0 %	40 %	40 %	383760982
626	NC_017079	CTC	2	6	30225	30230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760983
627	NC_017079	CGC	3	9	30283	30291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760983
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