MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 113656

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017079	CGG	2	6	229633	229638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761124
5002	NC_017079	CTG	2	6	229640	229645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761124
5003	NC_017079	GGCG	2	8	229726	229733	0 %	0 %	75 %	25 %	383761124
5004	NC_017079	CGT	2	6	229783	229788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761124
5005	NC_017079	TGC	2	6	229840	229845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761124
5006	NC_017079	AGCGT	2	10	229957	229966	20 %	20 %	40 %	20 %	383761124
5007	NC_017079	CGA	2	6	229983	229988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5008	NC_017079	GCA	2	6	230028	230033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5009	NC_017079	GCA	2	6	230076	230081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5010	NC_017079	CGA	2	6	230101	230106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5011	NC_017079	GGT	2	6	230123	230128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761125
5012	NC_017079	CTC	2	6	230162	230167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383761125
5013	NC_017079	CG	3	6	230223	230228	0 %	0 %	50 %	50 %	383761125
5014	NC_017079	CG	3	6	230230	230235	0 %	0 %	50 %	50 %	383761125
5015	NC_017079	ATC	2	6	230241	230246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761125
5016	NC_017079	GCC	2	6	230250	230255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761125
5017	NC_017079	AGA	2	6	230323	230328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383761125
5018	NC_017079	GCC	2	6	230424	230429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761125
5019	NC_017079	AGC	2	6	230463	230468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5020	NC_017079	GAT	2	6	230546	230551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761125
5021	NC_017079	TCG	2	6	230568	230573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5022	NC_017079	GGA	2	6	230594	230599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761125
5023	NC_017079	CT	4	8	230610	230617	0 %	50 %	0 %	50 %	383761125
5024	NC_017079	GCG	2	6	230654	230659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761125
5025	NC_017079	ATC	2	6	230678	230683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761125
5026	NC_017079	GCC	2	6	230724	230729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761125
5027	NC_017079	CGA	2	6	230848	230853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761125
5028	NC_017079	ATGG	2	8	230859	230866	25 %	25 %	50 %	0 %	383761125
5029	NC_017079	TCC	2	6	230883	230888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_017079	GC	3	6	231035	231040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_017079	TG	3	6	231113	231118	0 %	50 %	50 %	0 %	383761126
5032	NC_017079	CGAT	2	8	231160	231167	25 %	25 %	25 %	25 %	383761126
5033	NC_017079	TCG	2	6	231185	231190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5034	NC_017079	CCG	2	6	231200	231205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761126
5035	NC_017079	GCC	2	6	231211	231216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761126
5036	NC_017079	CGA	3	9	231284	231292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5037	NC_017079	CG	3	6	231294	231299	0 %	0 %	50 %	50 %	383761126
5038	NC_017079	T	6	6	231374	231379	0 %	100 %	0 %	0 %	383761126
5039	NC_017079	CCTGCG	2	12	231398	231409	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383761126
5040	NC_017079	TCA	2	6	231431	231436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761126
5041	NC_017079	AGGC	2	8	231449	231456	25 %	0 %	50 %	25 %	383761126
5042	NC_017079	CGT	2	6	231464	231469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5043	NC_017079	GCC	2	6	231486	231491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761126
5044	NC_017079	CGTT	2	8	231544	231551	0 %	50 %	25 %	25 %	383761126
5045	NC_017079	TCC	2	6	231571	231576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383761126
5046	NC_017079	CAT	2	6	231618	231623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761126
5047	NC_017079	ACG	2	6	231640	231645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5048	NC_017079	CGA	2	6	231704	231709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5049	NC_017079	TGC	2	6	231773	231778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5050	NC_017079	AGCC	2	8	231990	231997	25 %	0 %	25 %	50 %	383761126
5051	NC_017079	GCC	3	9	232040	232048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761126
5052	NC_017079	C	6	6	232060	232065	0 %	0 %	0 %	100 %	383761126
5053	NC_017079	CAG	2	6	232101	232106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5054	NC_017079	GA	3	6	232139	232144	50 %	0 %	50 %	0 %	383761126
5055	NC_017079	CG	3	6	232178	232183	0 %	0 %	50 %	50 %	383761126
5056	NC_017079	GCA	2	6	232244	232249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761126
5057	NC_017079	CAGG	2	8	232308	232315	25 %	0 %	50 %	25 %	383761126
5058	NC_017079	TTG	2	6	232342	232347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383761126
5059	NC_017079	AAT	2	6	232389	232394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383761126
5060	NC_017079	ATG	2	6	232397	232402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761126
5061	NC_017079	GTCAAA	2	12	232479	232490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5062	NC_017079	CGCA	2	8	232596	232603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_017079	GTA	2	6	232716	232721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017079	GTT	2	6	232732	232737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017079	GATT	2	8	232739	232746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017079	TCAA	2	8	232752	232759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_017079	AAAG	2	8	232761	232768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_017079	CTC	2	6	232879	232884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383761127
5069	NC_017079	ACC	2	6	232955	232960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761127
5070	NC_017079	GTG	2	6	233037	233042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761127
5071	NC_017079	CTGC	2	8	233100	233107	0 %	25 %	25 %	50 %	383761127
5072	NC_017079	CTG	2	6	233169	233174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761127
5073	NC_017079	CG	3	6	233244	233249	0 %	0 %	50 %	50 %	383761127
5074	NC_017079	GCAG	2	8	233253	233260	25 %	0 %	50 %	25 %	383761127
5075	NC_017079	GAT	2	6	233261	233266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761127
5076	NC_017079	ATC	2	6	233283	233288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761127
5077	NC_017079	ATC	2	6	233421	233426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761127
5078	NC_017079	CAT	3	9	233514	233522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761127
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5080	NC_017079	TGC	2	6	233581	233586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761127
5081	NC_017079	CTC	2	6	233597	233602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383761127
5082	NC_017079	TGAC	2	8	233736	233743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_017079	ACT	2	6	233773	233778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_017079	ACT	2	6	233789	233794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_017079	GGA	2	6	233805	233810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017079	GCC	2	6	233894	233899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761128
5087	NC_017079	CGG	2	6	233916	233921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
5088	NC_017079	CCA	2	6	233940	233945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383761128
5089	NC_017079	GTG	2	6	233959	233964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761128
5090	NC_017079	TCGA	2	8	233971	233978	25 %	25 %	25 %	25 %	383761128
5091	NC_017079	CGCATC	2	12	234004	234015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383761128
5092	NC_017079	CAG	2	6	234098	234103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761128
5093	NC_017079	CGG	2	6	234132	234137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
5094	NC_017079	GGC	4	12	234145	234156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
5095	NC_017079	GGC	2	6	234169	234174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
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5097	NC_017079	TGGA	2	8	234217	234224	25 %	25 %	50 %	0 %	383761128
5098	NC_017079	GAC	2	6	234319	234324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761128
5099	NC_017079	CG	3	6	234428	234433	0 %	0 %	50 %	50 %	383761128
5100	NC_017079	CGA	2	6	234453	234458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761128
5101	NC_017079	CG	3	6	234473	234478	0 %	0 %	50 %	50 %	383761128
5102	NC_017079	TCA	2	6	234545	234550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761128
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5104	NC_017079	AC	3	6	234676	234681	50 %	0 %	0 %	50 %	383761128
5105	NC_017079	CGG	2	6	234698	234703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
5106	NC_017079	CAT	2	6	234711	234716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761128
5107	NC_017079	CG	3	6	234726	234731	0 %	0 %	50 %	50 %	383761128
5108	NC_017079	CAAAGA	2	12	234747	234758	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383761128
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5110	NC_017079	CAA	2	6	234861	234866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761128
5111	NC_017079	TGGA	2	8	234916	234923	25 %	25 %	50 %	0 %	383761128
5112	NC_017079	TCG	2	6	234950	234955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761128
5113	NC_017079	CG	5	10	234976	234985	0 %	0 %	50 %	50 %	383761128
5114	NC_017079	GGC	2	6	234987	234992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
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5116	NC_017079	GGA	2	6	235083	235088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383761128
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5118	NC_017079	CGG	2	6	235122	235127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761128
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5122	NC_017079	CAT	2	6	235311	235316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761128
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5132	NC_017079	TGA	2	6	235818	235823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5234	NC_017079	GGT	2	6	240590	240595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383761132
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5237	NC_017079	CAT	2	6	240671	240676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761132
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5239	NC_017079	TCA	2	6	240739	240744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761132
5240	NC_017079	CGGCG	2	10	240808	240817	0 %	0 %	60 %	40 %	383761132
5241	NC_017079	TGCC	2	8	241043	241050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5242	NC_017079	ACG	2	6	241073	241078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_017079	GCT	2	6	241208	241213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5244	NC_017079	CCTG	2	8	241308	241315	0 %	25 %	25 %	50 %	383761133
5245	NC_017079	GGCT	2	8	241327	241334	0 %	25 %	50 %	25 %	383761133
5246	NC_017079	CGAA	2	8	241343	241350	50 %	0 %	25 %	25 %	383761133
5247	NC_017079	CGC	2	6	241364	241369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761133
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5250	NC_017079	CGT	2	6	241521	241526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761133
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5254	NC_017079	T	6	6	241864	241869	0 %	100 %	0 %	0 %	383761133
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5266	NC_017079	TCG	2	6	242687	242692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383761134
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5344	NC_017079	CGG	2	6	245995	246000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761137
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5348	NC_017079	A	6	6	246186	246191	100 %	0 %	0 %	0 %	383761137
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5351	NC_017079	TC	3	6	246266	246271	0 %	50 %	0 %	50 %	383761137
5352	NC_017079	C	6	6	246271	246276	0 %	0 %	0 %	100 %	383761137
5353	NC_017079	GC	3	6	246278	246283	0 %	0 %	50 %	50 %	383761137
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5356	NC_017079	ATG	2	6	246397	246402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761138
5357	NC_017079	CTT	2	6	246404	246409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383761138
5358	NC_017079	CGA	2	6	246471	246476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383761138
5359	NC_017079	GGC	2	6	246514	246519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761138
5360	NC_017079	CAGC	2	8	246525	246532	25 %	0 %	25 %	50 %	383761138
5361	NC_017079	CGG	2	6	246687	246692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761138
5362	NC_017079	ATC	2	6	246736	246741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383761138
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5364	NC_017079	CGGCG	2	10	246783	246792	0 %	0 %	60 %	40 %	383761138
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5489	NC_017079	GC	5	10	251819	251828	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5490	NC_017079	GC	3	6	251877	251882	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5491	NC_017079	GAA	2	6	251946	251951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383761142
5492	NC_017079	TCT	2	6	251963	251968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383761142
5493	NC_017079	GC	3	6	251987	251992	0 %	0 %	50 %	50 %	383761142
5494	NC_017079	GGC	2	6	252020	252025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383761142
5495	NC_017079	GCCTG	2	10	252129	252138	0 %	20 %	40 %	40 %	383761142
5496	NC_017079	CGC	2	6	252197	252202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383761142
5497	NC_017079	TGA	2	6	252212	252217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383761142
5498	NC_017079	ACA	2	6	252218	252223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383761142
5499	NC_017079	G	6	6	252256	252261	0 %	0 %	100 %	0 %	383761142
5500	NC_017079	GGCG	2	8	252361	252368	0 %	0 %	75 %	25 %	383761142

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