MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 1300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	383313192
2	NC_017031	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	383313197
3	NC_017031	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017031	ACGTA	2	10	14248	14257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017031	CAGTA	2	10	14631	14640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017031	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	383313207
7	NC_017031	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	383313209
8	NC_017031	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017031	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	383313212
10	NC_017031	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	383313212
11	NC_017031	TGGAT	2	10	23214	23223	20 %	40 %	40 %	0 %	383313220
12	NC_017031	TGCGT	2	10	24497	24506	0 %	40 %	40 %	20 %	383313221
13	NC_017031	CTGAT	2	10	28527	28536	20 %	40 %	20 %	20 %	383313225
14	NC_017031	GGAGC	2	10	29480	29489	20 %	0 %	60 %	20 %	383313226
15	NC_017031	TTGCT	2	10	30568	30577	0 %	60 %	20 %	20 %	383313227
16	NC_017031	TGAGG	2	10	37401	37410	20 %	20 %	60 %	0 %	383313231
17	NC_017031	CACAT	2	10	39585	39594	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017031	TGCGG	2	10	40517	40526	0 %	20 %	60 %	20 %	383313235
19	NC_017031	GCCTC	2	10	47294	47303	0 %	20 %	20 %	60 %	383313241
20	NC_017031	GAAGG	2	10	47308	47317	40 %	0 %	60 %	0 %	383313241
21	NC_017031	CAGTG	2	10	49239	49248	20 %	20 %	40 %	20 %	383313243
22	NC_017031	TGAGA	2	10	49581	49590	40 %	20 %	40 %	0 %	383313243
23	NC_017031	AGTGA	2	10	49631	49640	40 %	20 %	40 %	0 %	383313243
24	NC_017031	GCGGT	2	10	51780	51789	0 %	20 %	60 %	20 %	383313246
25	NC_017031	TTGGA	2	10	52666	52675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017031	TTGAT	2	10	52701	52710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017031	TGCAC	2	10	52795	52804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017031	CTGGC	2	10	53054	53063	0 %	20 %	40 %	40 %	383313248
29	NC_017031	GCAGC	2	10	53553	53562	20 %	0 %	40 %	40 %	383313248
30	NC_017031	GACTG	2	10	53569	53578	20 %	20 %	40 %	20 %	383313248
31	NC_017031	AAGGC	2	10	55809	55818	40 %	0 %	40 %	20 %	383313250
32	NC_017031	ATGGC	2	10	58668	58677	20 %	20 %	40 %	20 %	383313254
33	NC_017031	ATGTG	2	10	62837	62846	20 %	40 %	40 %	0 %	383313258
34	NC_017031	TCTGT	2	10	64657	64666	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017031	GCTGG	2	10	64998	65007	0 %	20 %	60 %	20 %	383313260
36	NC_017031	AGGGA	2	10	67606	67615	40 %	0 %	60 %	0 %	383313262
37	NC_017031	AAGAT	2	10	69413	69422	60 %	20 %	20 %	0 %	383313264
38	NC_017031	GGAGC	2	10	69520	69529	20 %	0 %	60 %	20 %	383313264
39	NC_017031	GGTCT	2	10	71234	71243	0 %	40 %	40 %	20 %	383313266
40	NC_017031	CATGT	2	10	71810	71819	20 %	40 %	20 %	20 %	383313267
41	NC_017031	CAGCG	2	10	72687	72696	20 %	0 %	40 %	40 %	383313268
42	NC_017031	CAGGC	2	10	73093	73102	20 %	0 %	40 %	40 %	383313268
43	NC_017031	ATGGC	2	10	73938	73947	20 %	20 %	40 %	20 %	383313269
44	NC_017031	AGGCA	2	10	75258	75267	40 %	0 %	40 %	20 %	383313270
45	NC_017031	TAATT	2	10	76504	76513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017031	GCTTT	2	10	81099	81108	0 %	60 %	20 %	20 %	383313277
47	NC_017031	TGACC	2	10	81355	81364	20 %	20 %	20 %	40 %	383313277
48	NC_017031	CGTTA	2	10	82097	82106	20 %	40 %	20 %	20 %	383313278
49	NC_017031	TGCTG	2	10	82731	82740	0 %	40 %	40 %	20 %	383313278
50	NC_017031	TGGCC	2	10	84722	84731	0 %	20 %	40 %	40 %	383313279
51	NC_017031	GCGAC	2	10	85526	85535	20 %	0 %	40 %	40 %	383313279
52	NC_017031	TGGGA	2	10	88941	88950	20 %	20 %	60 %	0 %	383313285
53	NC_017031	GATCG	2	10	90040	90049	20 %	20 %	40 %	20 %	383313287
54	NC_017031	CAAAA	2	10	90772	90781	80 %	0 %	0 %	20 %	383313288
55	NC_017031	AACAA	2	10	93613	93622	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017031	TGCAA	2	10	96620	96629	40 %	20 %	20 %	20 %	383313293
57	NC_017031	TGCAG	2	10	96840	96849	20 %	20 %	40 %	20 %	383313293
58	NC_017031	AGGTC	2	10	99276	99285	20 %	20 %	40 %	20 %	383313296
59	NC_017031	ACCAA	2	10	101135	101144	60 %	0 %	0 %	40 %	383313296
60	NC_017031	TCATC	2	10	102398	102407	20 %	40 %	0 %	40 %	383313297
61	NC_017031	TGCAC	2	10	104213	104222	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017031	ACCTG	2	10	104428	104437	20 %	20 %	20 %	40 %	383313298
63	NC_017031	CGGTG	2	10	104637	104646	0 %	20 %	60 %	20 %	383313298
64	NC_017031	CGGCG	2	10	107256	107265	0 %	0 %	60 %	40 %	383313301
65	NC_017031	CGCGG	2	10	107316	107325	0 %	0 %	60 %	40 %	383313302
66	NC_017031	CAGCG	2	10	107852	107861	20 %	0 %	40 %	40 %	383313303
67	NC_017031	GGATC	2	10	118415	118424	20 %	20 %	40 %	20 %	383313313
68	NC_017031	TGTTT	2	10	120887	120896	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017031	CGGGA	2	10	125531	125540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017031	GACTG	2	10	127792	127801	20 %	20 %	40 %	20 %	383313319
71	NC_017031	TTGGT	2	10	129101	129110	0 %	60 %	40 %	0 %	383313319
72	NC_017031	TTAAG	2	10	130883	130892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017031	GTGCG	2	10	131423	131432	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017031	GTGGC	2	10	133160	133169	0 %	20 %	60 %	20 %	383313321
75	NC_017031	CGCGT	2	10	133477	133486	0 %	20 %	40 %	40 %	383313322
76	NC_017031	GGGGC	2	10	133605	133614	0 %	0 %	80 %	20 %	383313322
77	NC_017031	AGACG	2	10	135410	135419	40 %	0 %	40 %	20 %	383313324
78	NC_017031	GGGGC	2	10	135628	135637	0 %	0 %	80 %	20 %	383313325
79	NC_017031	ACGGT	2	10	136782	136791	20 %	20 %	40 %	20 %	383313326
80	NC_017031	CGATC	2	10	137055	137064	20 %	20 %	20 %	40 %	383313326
81	NC_017031	TGGCC	2	10	137262	137271	0 %	20 %	40 %	40 %	383313326
82	NC_017031	TGGTG	2	10	137640	137649	0 %	40 %	60 %	0 %	383313326
83	NC_017031	GGAGT	2	10	138112	138121	20 %	20 %	60 %	0 %	383313326
84	NC_017031	ATTGC	2	10	142046	142055	20 %	40 %	20 %	20 %	383313329
85	NC_017031	AAAAC	2	10	144872	144881	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017031	TCACT	2	10	145917	145926	20 %	40 %	0 %	40 %	383313334
87	NC_017031	ATTTC	2	10	146534	146543	20 %	60 %	0 %	20 %	383313334
88	NC_017031	AATGG	2	10	150234	150243	40 %	20 %	40 %	0 %	383313337
89	NC_017031	GTGAG	2	10	151217	151226	20 %	20 %	60 %	0 %	383313339
90	NC_017031	CTGAA	2	10	152015	152024	40 %	20 %	20 %	20 %	383313339
91	NC_017031	CCAGC	2	10	153307	153316	20 %	0 %	20 %	60 %	383313340
92	NC_017031	TTGCC	2	10	153817	153826	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017031	GTACC	2	10	155776	155785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017031	TACGC	2	10	156333	156342	20 %	20 %	20 %	40 %	383313342
95	NC_017031	GCGAC	2	10	159827	159836	20 %	0 %	40 %	40 %	383313347
96	NC_017031	GGTTG	2	10	161103	161112	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017031	CCTTG	2	10	161479	161488	0 %	40 %	20 %	40 %	383313348
98	NC_017031	GCATA	2	10	163203	163212	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017031	TGTGC	2	10	164426	164435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017031	CGGTG	2	10	165448	165457	0 %	20 %	60 %	20 %	383313351
101	NC_017031	CATGG	2	10	167580	167589	20 %	20 %	40 %	20 %	383313353
102	NC_017031	CAGAT	2	10	167936	167945	40 %	20 %	20 %	20 %	383313353
103	NC_017031	GGATG	2	10	168834	168843	20 %	20 %	60 %	0 %	383313353
104	NC_017031	GGGAC	2	10	171460	171469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017031	CACTT	2	10	171640	171649	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017031	AAACT	2	10	172518	172527	60 %	20 %	0 %	20 %	383313355
107	NC_017031	ACCGG	2	10	172913	172922	20 %	0 %	40 %	40 %	383313355
108	NC_017031	ATTGA	2	10	178722	178731	40 %	40 %	20 %	0 %	383313359
109	NC_017031	GTGGA	2	10	181131	181140	20 %	20 %	60 %	0 %	383313360
110	NC_017031	TTAAG	2	10	184463	184472	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017031	TGACC	2	10	185381	185390	20 %	20 %	20 %	40 %	383313363
112	NC_017031	AGGTG	2	10	186334	186343	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017031	TTGCA	2	10	186667	186676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017031	GTTTG	2	10	188606	188615	0 %	60 %	40 %	0 %	383313368
115	NC_017031	CGGAT	2	10	189546	189555	20 %	20 %	40 %	20 %	383313369
116	NC_017031	AGCGC	2	10	190704	190713	20 %	0 %	40 %	40 %	383313370
117	NC_017031	GCAGT	2	10	192191	192200	20 %	20 %	40 %	20 %	383313371
118	NC_017031	CAATG	2	10	192463	192472	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017031	TAACG	2	10	193438	193447	40 %	20 %	20 %	20 %	383313372
120	NC_017031	AAGCC	2	10	194765	194774	40 %	0 %	20 %	40 %	383313373
121	NC_017031	GGCCC	2	10	196837	196846	0 %	0 %	40 %	60 %	383313376
122	NC_017031	GAATT	2	10	200402	200411	40 %	40 %	20 %	0 %	383313381
123	NC_017031	CAAGG	2	10	201291	201300	40 %	0 %	40 %	20 %	383313381
124	NC_017031	GATGG	2	10	203740	203749	20 %	20 %	60 %	0 %	383313382
125	NC_017031	TGGCG	2	10	204474	204483	0 %	20 %	60 %	20 %	383313383
126	NC_017031	TGCCA	2	10	206497	206506	20 %	20 %	20 %	40 %	383313384
127	NC_017031	AAATA	2	10	206599	206608	80 %	20 %	0 %	0 %	383313384
128	NC_017031	ATTCT	2	10	207195	207204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017031	CAGGC	2	10	212012	212021	20 %	0 %	40 %	40 %	383313387
130	NC_017031	TTGTA	2	10	212421	212430	20 %	60 %	20 %	0 %	383313388
131	NC_017031	GCGAC	2	10	216937	216946	20 %	0 %	40 %	40 %	383313393
132	NC_017031	AGATC	2	10	216962	216971	40 %	20 %	20 %	20 %	383313393
133	NC_017031	CAAGG	2	10	217876	217885	40 %	0 %	40 %	20 %	383313394
134	NC_017031	AGAAA	2	10	218605	218614	80 %	0 %	20 %	0 %	383313395
135	NC_017031	CGGGG	2	10	224639	224648	0 %	0 %	80 %	20 %	383313402
136	NC_017031	GAAAA	2	10	224778	224787	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017031	CGAGA	2	10	225419	225428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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268	NC_017031	GCATC	2	10	452670	452679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
269	NC_017031	CGCAA	2	10	452849	452858	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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380	NC_017031	TGACA	2	10	624075	624084	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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