MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corallococcus coralloides DSM 2259 chromosome

Total Repeats: 195145

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017030	CCT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017030	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
3	NC_017030	CTT	2	6	263	268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452025
4	NC_017030	GTC	3	9	357	365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
5	NC_017030	CGT	2	6	376	381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
6	NC_017030	GCC	2	6	392	397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
7	NC_017030	CGT	2	6	467	472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
8	NC_017030	CGC	4	12	494	505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
9	NC_017030	CGG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452025
10	NC_017030	CCG	2	6	710	715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
11	NC_017030	TGC	2	6	739	744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
12	NC_017030	CGA	2	6	749	754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452025
13	NC_017030	GAG	2	6	777	782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
14	NC_017030	TTC	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452025
15	NC_017030	CAA	2	6	827	832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452025
16	NC_017030	GGA	2	6	881	886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
17	NC_017030	TCC	2	6	961	966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383452025
18	NC_017030	AGA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452025
19	NC_017030	AGG	2	6	982	987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
20	NC_017030	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452025
21	NC_017030	GGA	2	6	1112	1117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
22	NC_017030	TGC	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452025
23	NC_017030	AGG	2	6	1228	1233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452025
24	NC_017030	CAA	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452025
25	NC_017030	CCG	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452025
26	NC_017030	CGG	2	6	1436	1441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452025
27	NC_017030	CCG	2	6	1526	1531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452026
28	NC_017030	CCA	2	6	1556	1561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452026
29	NC_017030	GCG	2	6	1590	1595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452026
30	NC_017030	TCT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452026
31	NC_017030	GTC	4	12	1635	1646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452026
32	NC_017030	CCA	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452026
33	NC_017030	CAG	2	6	1797	1802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452026
34	NC_017030	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452026
35	NC_017030	GAC	2	6	1845	1850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452026
36	NC_017030	TCC	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017030	GCC	2	6	1955	1960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017030	CGG	2	6	2148	2153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
39	NC_017030	ACC	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
40	NC_017030	GGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452027
41	NC_017030	CGG	2	6	2233	2238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
42	NC_017030	CGG	2	6	2411	2416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452027
43	NC_017030	CCA	2	6	2474	2479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
44	NC_017030	GTG	2	6	2701	2706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452027
45	NC_017030	CAC	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452027
46	NC_017030	CGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452027
47	NC_017030	TGA	2	6	2934	2939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452028
48	NC_017030	TCT	2	6	2985	2990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452028
49	NC_017030	TGG	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452028
50	NC_017030	CGA	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452028
51	NC_017030	CGG	2	6	3323	3328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
52	NC_017030	GCC	2	6	3440	3445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452028
53	NC_017030	GGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452028
54	NC_017030	GGC	2	6	3467	3472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
55	NC_017030	GCT	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452028
56	NC_017030	GCG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452028
57	NC_017030	CAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383452029
58	NC_017030	CAG	3	9	3704	3712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
59	NC_017030	CAG	2	6	3725	3730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
60	NC_017030	CGG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
61	NC_017030	GCG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
62	NC_017030	CCA	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452029
63	NC_017030	CGC	2	6	3826	3831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
64	NC_017030	TTG	2	6	3909	3914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383452029
65	NC_017030	GGC	2	6	3948	3953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
66	NC_017030	GAA	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
67	NC_017030	CCG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
68	NC_017030	GCG	2	6	4090	4095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
69	NC_017030	GAA	2	6	4133	4138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
70	NC_017030	AGC	2	6	4164	4169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
71	NC_017030	TCG	2	6	4192	4197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452029
72	NC_017030	GCG	3	9	4221	4229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452029
73	NC_017030	AGC	3	9	4242	4250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452029
74	NC_017030	AGA	2	6	4402	4407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452029
75	NC_017030	GCC	2	6	4430	4435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452029
76	NC_017030	CTG	2	6	4469	4474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452029
77	NC_017030	GGA	2	6	4613	4618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017030	CGC	2	6	4642	4647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
79	NC_017030	GTG	2	6	4799	4804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452030
80	NC_017030	ACG	2	6	4836	4841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
81	NC_017030	ATG	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452030
82	NC_017030	GAC	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
83	NC_017030	CAC	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452030
84	NC_017030	ACT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383452030
85	NC_017030	CTG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452030
86	NC_017030	CTG	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452030
87	NC_017030	AGG	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452030
88	NC_017030	GAA	2	6	5110	5115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452030
89	NC_017030	GCC	2	6	5121	5126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
90	NC_017030	CGC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
91	NC_017030	TTC	2	6	5267	5272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452030
92	NC_017030	TGG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452030
93	NC_017030	ACG	2	6	5442	5447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
94	NC_017030	CGG	2	6	5520	5525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452030
95	NC_017030	GCC	2	6	5562	5567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
96	NC_017030	CCG	2	6	5572	5577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
97	NC_017030	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
98	NC_017030	TCT	2	6	5646	5651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452030
99	NC_017030	CAC	2	6	5680	5685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452030
100	NC_017030	GAA	2	6	5695	5700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452030
101	NC_017030	AGG	2	6	5748	5753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452030
102	NC_017030	GGC	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452030
103	NC_017030	GCA	2	6	5823	5828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
104	NC_017030	ACG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452030
105	NC_017030	TGC	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452030
106	NC_017030	CCG	2	6	5988	5993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452030
107	NC_017030	AGG	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452030
108	NC_017030	CCG	2	6	6045	6050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
109	NC_017030	CTC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383452031
110	NC_017030	CCA	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452031
111	NC_017030	AGC	3	9	6185	6193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452031
112	NC_017030	GCC	2	6	6207	6212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
113	NC_017030	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452031
114	NC_017030	CGC	2	6	6318	6323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
115	NC_017030	CGC	2	6	6342	6347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
116	NC_017030	TGC	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452031
117	NC_017030	CAC	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452031
118	NC_017030	CTG	2	6	6529	6534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452031
119	NC_017030	CGT	2	6	6540	6545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452031
120	NC_017030	GCG	2	6	6579	6584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452031
121	NC_017030	AAG	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452031
122	NC_017030	CAG	2	6	6592	6597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452031
123	NC_017030	GCA	2	6	6642	6647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452031
124	NC_017030	CTA	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383452031
125	NC_017030	ACC	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452031
126	NC_017030	CGG	2	6	6699	6704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452031
127	NC_017030	GAA	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452031
128	NC_017030	GAA	2	6	6759	6764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452031
129	NC_017030	CGC	3	9	6777	6785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
130	NC_017030	TCA	2	6	6788	6793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383452031
131	NC_017030	CAG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452031
132	NC_017030	GAA	2	6	6834	6839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452031
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136	NC_017030	CGC	3	9	6899	6907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452031
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157	NC_017030	CGT	2	6	7791	7796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452032
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161	NC_017030	CAC	2	6	7964	7969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
162	NC_017030	AAC	2	6	8065	8070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_017030	GAC	2	6	8085	8090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017030	TCC	2	6	8092	8097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_017030	CTC	2	6	8153	8158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_017030	CCT	2	6	8192	8197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_017030	CTC	2	6	8228	8233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_017030	CGC	2	6	8295	8300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_017030	GAG	2	6	8342	8347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017030	TGA	2	6	8363	8368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452033
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172	NC_017030	TGG	2	6	8414	8419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452033
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176	NC_017030	TGG	2	6	8495	8500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452033
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220	NC_017030	GTG	2	6	10935	10940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_017030	TTC	2	6	12053	12058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
243	NC_017030	CTT	2	6	12090	12095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452035
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248	NC_017030	CTG	2	6	12490	12495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452035
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251	NC_017030	TCC	2	6	12591	12596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383452035
252	NC_017030	GCC	2	6	12606	12611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452035
253	NC_017030	TCG	2	6	12639	12644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452035
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256	NC_017030	CCG	2	6	12883	12888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452036
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260	NC_017030	TCC	2	6	12919	12924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383452036
261	NC_017030	CAG	2	6	12942	12947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452036
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382	NC_017030	GAC	2	6	19705	19710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452044
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384	NC_017030	CGG	2	6	19750	19755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452044
385	NC_017030	ACC	2	6	19789	19794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452044
386	NC_017030	GCA	2	6	19845	19850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452044
387	NC_017030	AGG	2	6	19892	19897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452044
388	NC_017030	ACC	2	6	19913	19918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452044
389	NC_017030	GCT	2	6	19986	19991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452044
390	NC_017030	GGA	4	12	20013	20024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452044
391	NC_017030	GTG	2	6	20129	20134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452045
392	NC_017030	GCT	2	6	20317	20322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452045
393	NC_017030	GAA	2	6	20350	20355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452045
394	NC_017030	CCG	2	6	20364	20369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452045
395	NC_017030	GTC	2	6	20420	20425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452045
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401	NC_017030	GCC	2	6	20621	20626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452045
402	NC_017030	TCG	3	9	20645	20653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383452045
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404	NC_017030	CAC	2	6	20728	20733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452045
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406	NC_017030	GAA	2	6	20758	20763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383452045
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409	NC_017030	TGG	2	6	20874	20879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452045
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413	NC_017030	GCC	2	6	21038	21043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383452045
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417	NC_017030	CGA	2	6	21144	21149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452045
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419	NC_017030	GCA	2	6	21410	21415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_017030	TGC	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_017030	GGC	2	6	21582	21587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452046
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454	NC_017030	GGA	2	6	23260	23265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383452046
455	NC_017030	CGG	2	6	23295	23300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452046
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472	NC_017030	CAG	2	6	23923	23928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452047
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484	NC_017030	ACC	2	6	24479	24484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452048
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494	NC_017030	GGT	2	6	25112	25117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383452049
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496	NC_017030	GAT	2	6	25170	25175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383452049
497	NC_017030	GGC	2	6	25190	25195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383452049
498	NC_017030	AGC	2	6	25246	25251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383452049
499	NC_017030	CCA	2	6	25253	25258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383452049
500	NC_017030	TTC	2	6	25348	25353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383452049

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