MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_2

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017029	AC	3	6	42	47	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017029	CT	4	8	93	100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017029	AT	3	6	321	326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017029	TA	3	6	526	531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017029	TA	3	6	864	869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017029	TA	3	6	1200	1205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017029	AG	3	6	1226	1231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017029	TA	3	6	1271	1276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017029	GA	3	6	1603	1608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017029	CA	3	6	1850	1855	50 %	0 %	0 %	50 %	381214375
11	NC_017029	AT	3	6	2048	2053	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
12	NC_017029	AT	4	8	2093	2100	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
13	NC_017029	CA	3	6	2333	2338	50 %	0 %	0 %	50 %	381214375
14	NC_017029	AT	3	6	2772	2777	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
15	NC_017029	AT	3	6	2919	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
16	NC_017029	CT	3	6	3112	3117	0 %	50 %	0 %	50 %	381214375
17	NC_017029	TA	3	6	3202	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
18	NC_017029	AT	3	6	5137	5142	50 %	50 %	0 %	0 %	381214376
19	NC_017029	CT	3	6	5327	5332	0 %	50 %	0 %	50 %	381214376
20	NC_017029	AT	3	6	6018	6023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017029	GT	3	6	6029	6034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017029	TA	3	6	6429	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	381214378
23	NC_017029	AT	4	8	6740	6747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017029	TA	3	6	6751	6756	50 %	50 %	0 %	0 %	381214379
25	NC_017029	CT	3	6	7111	7116	0 %	50 %	0 %	50 %	381214380
26	NC_017029	AT	3	6	7294	7299	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
27	NC_017029	AT	3	6	7367	7372	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
28	NC_017029	AT	3	6	7668	7673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017029	AT	3	6	7720	7725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017029	TG	3	6	7775	7780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017029	AT	3	6	8134	8139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017029	AT	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
33	NC_017029	AT	3	6	9199	9204	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
34	NC_017029	TA	3	6	9349	9354	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
35	NC_017029	TA	3	6	9399	9404	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
36	NC_017029	AT	3	6	9447	9452	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
37	NC_017029	AT	3	6	9652	9657	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
38	NC_017029	TA	3	6	9775	9780	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
39	NC_017029	GA	3	6	10232	10237	50 %	0 %	50 %	0 %	381214382
40	NC_017029	AG	3	6	10552	10557	50 %	0 %	50 %	0 %	381214382
41	NC_017029	TA	3	6	10739	10744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017029	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	381214383
43	NC_017029	AT	3	6	11145	11150	50 %	50 %	0 %	0 %	381214384
44	NC_017029	GA	3	6	11275	11280	50 %	0 %	50 %	0 %	381214384
45	NC_017029	AT	3	6	11447	11452	50 %	50 %	0 %	0 %	381214385
46	NC_017029	AT	3	6	11534	11539	50 %	50 %	0 %	0 %	381214385
47	NC_017029	CT	3	6	11725	11730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017029	AT	3	6	12033	12038	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
49	NC_017029	AT	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
50	NC_017029	AT	3	6	12652	12657	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
51	NC_017029	TG	3	6	13110	13115	0 %	50 %	50 %	0 %	381214386
52	NC_017029	TC	3	6	13682	13687	0 %	50 %	0 %	50 %	381214387
53	NC_017029	AT	3	6	14182	14187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017029	TA	3	6	14530	14535	50 %	50 %	0 %	0 %	381214388
55	NC_017029	AT	3	6	15229	15234	50 %	50 %	0 %	0 %	381214389
56	NC_017029	AT	3	6	16246	16251	50 %	50 %	0 %	0 %	381214390
57	NC_017029	AG	3	6	16705	16710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017029	TG	3	6	17415	17420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017029	AT	4	8	17745	17752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017029	TA	3	6	17835	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	381214394
61	NC_017029	TG	3	6	18051	18056	0 %	50 %	50 %	0 %	381214395

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.