MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 1298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	ATATA	2	10	459	468	60 %	40 %	0 %	0 %	383311894
2	NC_017028	ACTAA	2	10	778	787	60 %	20 %	0 %	20 %	383311894
3	NC_017028	GTTTT	2	10	2305	2314	0 %	80 %	20 %	0 %	383311895
4	NC_017028	GCAAA	2	10	2361	2370	60 %	0 %	20 %	20 %	383311895
5	NC_017028	GATTA	2	10	5867	5876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017028	GCATC	2	10	6406	6415	20 %	20 %	20 %	40 %	383311900
7	NC_017028	TATTT	2	10	6459	6468	20 %	80 %	0 %	0 %	383311900
8	NC_017028	AAATA	2	10	7757	7766	80 %	20 %	0 %	0 %	383311900
9	NC_017028	AAAAG	2	10	7994	8003	80 %	0 %	20 %	0 %	383311900
10	NC_017028	TCACT	2	10	8836	8845	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017028	TTTTA	2	10	8894	8903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017028	AATTA	2	10	11546	11555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017028	AGAGC	2	10	11601	11610	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017028	TAAAG	2	10	11953	11962	60 %	20 %	20 %	0 %	383311905
15	NC_017028	AAAAT	2	10	14054	14063	80 %	20 %	0 %	0 %	383311906
16	NC_017028	TGTTC	2	10	14283	14292	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017028	AATAT	2	10	16106	16115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017028	TGAAT	2	10	16585	16594	40 %	40 %	20 %	0 %	383311908
19	NC_017028	TGTTA	2	10	16667	16676	20 %	60 %	20 %	0 %	383311908
20	NC_017028	ATGAA	2	10	16923	16932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017028	TGTTA	2	10	17000	17009	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017028	GGATT	2	10	17669	17678	20 %	40 %	40 %	0 %	383311910
23	NC_017028	TAAAT	2	10	18184	18193	60 %	40 %	0 %	0 %	383311910
24	NC_017028	TTTAA	2	10	18970	18979	40 %	60 %	0 %	0 %	383311910
25	NC_017028	TATTT	2	10	19160	19169	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
26	NC_017028	ATTTT	2	10	19296	19305	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
27	NC_017028	TACAT	2	10	19397	19406	40 %	40 %	0 %	20 %	383311911
28	NC_017028	GTCCG	2	10	20009	20018	0 %	20 %	40 %	40 %	383311911
29	NC_017028	TAAAA	2	10	22981	22990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017028	ATATT	2	10	23164	23173	40 %	60 %	0 %	0 %	383311915
31	NC_017028	ATATA	2	10	23230	23239	60 %	40 %	0 %	0 %	383311915
32	NC_017028	GCTAA	2	10	23999	24008	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017028	ATTTT	2	10	24170	24179	20 %	80 %	0 %	0 %	383311916
34	NC_017028	ATAGA	2	10	24307	24316	60 %	20 %	20 %	0 %	383311916
35	NC_017028	TAAAT	2	10	25791	25800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017028	TTTCT	2	10	26718	26727	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017028	TATTT	2	10	26976	26985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017028	TAAAA	2	10	27716	27725	80 %	20 %	0 %	0 %	383311921
39	NC_017028	ATTTT	2	10	29742	29751	20 %	80 %	0 %	0 %	383311922
40	NC_017028	ACTTA	2	10	31683	31692	40 %	40 %	0 %	20 %	383311925
41	NC_017028	TATAA	2	10	33596	33605	60 %	40 %	0 %	0 %	383311927
42	NC_017028	TTATT	2	10	33687	33696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017028	TTCTT	2	10	34366	34375	0 %	80 %	0 %	20 %	383311928
44	NC_017028	TTTTA	2	10	35145	35154	20 %	80 %	0 %	0 %	383311929
45	NC_017028	AGCTA	2	10	35879	35888	40 %	20 %	20 %	20 %	383311930
46	NC_017028	TTTTG	2	10	35985	35994	0 %	80 %	20 %	0 %	383311930
47	NC_017028	TATTT	2	10	36527	36536	20 %	80 %	0 %	0 %	383311930
48	NC_017028	CTTGG	2	10	38575	38584	0 %	40 %	40 %	20 %	383311931
49	NC_017028	AATTA	2	10	39392	39401	60 %	40 %	0 %	0 %	383311931
50	NC_017028	CACAG	2	10	40909	40918	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017028	TTCTA	2	10	42247	42256	20 %	60 %	0 %	20 %	383311934
52	NC_017028	CATAC	2	10	42402	42411	40 %	20 %	0 %	40 %	383311934
53	NC_017028	TTTTC	2	10	43727	43736	0 %	80 %	0 %	20 %	383311935
54	NC_017028	CCCCT	2	10	44052	44061	0 %	20 %	0 %	80 %	383311935
55	NC_017028	TACTT	2	10	45518	45527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017028	ATCAT	2	10	50898	50907	40 %	40 %	0 %	20 %	383311943
57	NC_017028	TAGAA	2	10	51208	51217	60 %	20 %	20 %	0 %	383311944
58	NC_017028	ATTTT	2	10	51930	51939	20 %	80 %	0 %	0 %	383311946
59	NC_017028	ATATA	2	10	52337	52346	60 %	40 %	0 %	0 %	383311946
60	NC_017028	GGAGC	2	10	53935	53944	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017028	TAAAT	2	10	54031	54040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017028	CGATG	2	10	54114	54123	20 %	20 %	40 %	20 %	383311950
63	NC_017028	GATTT	2	10	54964	54973	20 %	60 %	20 %	0 %	383311951
64	NC_017028	CTTGC	2	10	55277	55286	0 %	40 %	20 %	40 %	383311951
65	NC_017028	GTTTT	2	10	55686	55695	0 %	80 %	20 %	0 %	383311952
66	NC_017028	ATAAC	2	10	56671	56680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017028	TAGTA	2	10	57040	57049	40 %	40 %	20 %	0 %	383311954
68	NC_017028	ATTTT	2	10	57975	57984	20 %	80 %	0 %	0 %	383311954
69	NC_017028	TTTAT	2	10	58797	58806	20 %	80 %	0 %	0 %	383311956
70	NC_017028	TTTTA	2	10	58940	58949	20 %	80 %	0 %	0 %	383311956
71	NC_017028	ATTTA	2	10	59300	59309	40 %	60 %	0 %	0 %	383311956
72	NC_017028	TGCTT	2	10	59442	59451	0 %	60 %	20 %	20 %	383311956
73	NC_017028	TATAT	2	10	60066	60075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017028	ATATA	2	10	60093	60102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017028	AATAA	2	10	60589	60598	80 %	20 %	0 %	0 %	383311957
76	NC_017028	AATTT	2	10	60803	60812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017028	ATAAA	2	10	60938	60947	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017028	GCTTT	2	10	61008	61017	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017028	TCTGT	2	10	62230	62239	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017028	GGATT	2	10	63530	63539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017028	AAGCA	2	10	64045	64054	60 %	0 %	20 %	20 %	383311958
82	NC_017028	ATATC	2	10	65187	65196	40 %	40 %	0 %	20 %	383311960
83	NC_017028	CATGC	2	10	65368	65377	20 %	20 %	20 %	40 %	383311960
84	NC_017028	AGAGA	2	10	65902	65911	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017028	GCCAA	2	10	66214	66223	40 %	0 %	20 %	40 %	383311961
86	NC_017028	ACTAT	2	10	67321	67330	40 %	40 %	0 %	20 %	383311963
87	NC_017028	AACCT	2	10	67714	67723	40 %	20 %	0 %	40 %	383311963
88	NC_017028	ATTTA	2	10	69911	69920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017028	ATTTA	2	10	71038	71047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017028	AATTT	2	10	74137	74146	40 %	60 %	0 %	0 %	383311970
91	NC_017028	CTACT	2	10	76698	76707	20 %	40 %	0 %	40 %	383311975
92	NC_017028	ATAGA	2	10	77302	77311	60 %	20 %	20 %	0 %	383311975
93	NC_017028	TTCTT	2	10	77379	77388	0 %	80 %	0 %	20 %	383311975
94	NC_017028	CTTTC	2	10	77477	77486	0 %	60 %	0 %	40 %	383311976
95	NC_017028	CACTC	2	10	77581	77590	20 %	20 %	0 %	60 %	383311976
96	NC_017028	TATTT	2	10	77897	77906	20 %	80 %	0 %	0 %	383311976
97	NC_017028	TAACG	2	10	79993	80002	40 %	20 %	20 %	20 %	383311978
98	NC_017028	TTTTA	2	10	81440	81449	20 %	80 %	0 %	0 %	383311980
99	NC_017028	ATTTA	2	10	81793	81802	40 %	60 %	0 %	0 %	383311980
100	NC_017028	GGTCA	2	10	83040	83049	20 %	20 %	40 %	20 %	383311981
101	NC_017028	TAAAT	2	10	83749	83758	60 %	40 %	0 %	0 %	383311981
102	NC_017028	GTAGT	2	10	84075	84084	20 %	40 %	40 %	0 %	383311981
103	NC_017028	AATAC	2	10	86225	86234	60 %	20 %	0 %	20 %	383311984
104	NC_017028	ATCCA	2	10	86722	86731	40 %	20 %	0 %	40 %	383311985
105	NC_017028	TACTT	2	10	88219	88228	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017028	AATTA	2	10	88357	88366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017028	AGAAT	2	10	90095	90104	60 %	20 %	20 %	0 %	383311989
108	NC_017028	GAATT	2	10	90446	90455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017028	TAGCA	2	10	90934	90943	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017028	ATCTT	2	10	91840	91849	20 %	60 %	0 %	20 %	383311991
111	NC_017028	ATAAA	2	10	92188	92197	80 %	20 %	0 %	0 %	383311992
112	NC_017028	CTCTT	2	10	92761	92770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017028	GAAAC	2	10	94660	94669	60 %	0 %	20 %	20 %	383311993
114	NC_017028	TTTCT	2	10	95100	95109	0 %	80 %	0 %	20 %	383311993
115	NC_017028	TTGTT	2	10	96373	96382	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017028	TTACG	2	10	97500	97509	20 %	40 %	20 %	20 %	383311996
117	NC_017028	GTTTG	2	10	97671	97680	0 %	60 %	40 %	0 %	383311996
118	NC_017028	CCTCT	2	10	97722	97731	0 %	40 %	0 %	60 %	383311996
119	NC_017028	ACTTA	2	10	98392	98401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017028	TATGG	2	10	99253	99262	20 %	40 %	40 %	0 %	383311998
121	NC_017028	ATATA	2	10	102035	102044	60 %	40 %	0 %	0 %	383312003
122	NC_017028	ACTAA	2	10	103712	103721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017028	ACTCA	2	10	106124	106133	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017028	ATAAA	2	10	107831	107840	80 %	20 %	0 %	0 %	383312011
125	NC_017028	GACAA	2	10	107962	107971	60 %	0 %	20 %	20 %	383312012
126	NC_017028	TAGCA	2	10	110394	110403	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017028	ACAAA	2	10	113090	113099	80 %	0 %	0 %	20 %	383312018
128	NC_017028	TGATC	2	10	114964	114973	20 %	40 %	20 %	20 %	383312020
129	NC_017028	TAATA	2	10	115184	115193	60 %	40 %	0 %	0 %	383312020
130	NC_017028	TTGTA	2	10	117401	117410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017028	AGGTA	2	10	118989	118998	40 %	20 %	40 %	0 %	383312023
132	NC_017028	TCTTT	2	10	119489	119498	0 %	80 %	0 %	20 %	383312023
133	NC_017028	TCTGC	2	10	120670	120679	0 %	40 %	20 %	40 %	383312023
134	NC_017028	CTTTG	2	10	120982	120991	0 %	60 %	20 %	20 %	383312023
135	NC_017028	TTGAT	2	10	121908	121917	20 %	60 %	20 %	0 %	383312023
136	NC_017028	TTCTT	2	10	122504	122513	0 %	80 %	0 %	20 %	383312023
137	NC_017028	TTTAT	2	10	122770	122779	20 %	80 %	0 %	0 %	383312023
138	NC_017028	CTTGA	2	10	122824	122833	20 %	40 %	20 %	20 %	383312023
139	NC_017028	TAAAT	2	10	126657	126666	60 %	40 %	0 %	0 %	383312026
140	NC_017028	AATTT	2	10	128090	128099	40 %	60 %	0 %	0 %	383312028
141	NC_017028	AGTTA	2	10	128311	128320	40 %	40 %	20 %	0 %	383312028
142	NC_017028	ATTAA	2	10	129489	129498	60 %	40 %	0 %	0 %	383312029
143	NC_017028	TTTAT	2	10	131323	131332	20 %	80 %	0 %	0 %	383312030
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145	NC_017028	TTTCT	2	10	135291	135300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017028	CATTA	2	10	136349	136358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_017028	TCGGT	2	10	144813	144822	0 %	40 %	40 %	20 %	383312044
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252	NC_017028	TATTT	2	10	263262	263271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017028	GAGAG	2	10	263459	263468	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_017028	TTTAT	2	10	288288	288297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017028	TTATC	2	10	288334	288343	20 %	60 %	0 %	20 %	383312164
263	NC_017028	AAAAC	2	10	291151	291160	80 %	0 %	0 %	20 %	383312168
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266	NC_017028	AATTA	2	10	292300	292309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_017028	TAAAT	2	10	292317	292326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017028	TAAAA	2	10	292352	292361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017028	AGACA	2	10	292414	292423	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_017028	ATTAT	2	10	294612	294621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017028	TTAAA	2	10	295004	295013	60 %	40 %	0 %	0 %	383312171
272	NC_017028	GTGCG	2	10	295653	295662	0 %	20 %	60 %	20 %	383312171
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274	NC_017028	CCTTG	2	10	296195	296204	0 %	40 %	20 %	40 %	383312171
275	NC_017028	ATTTA	2	10	297098	297107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017028	ATATA	2	10	297445	297454	60 %	40 %	0 %	0 %	383312172
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284	NC_017028	ATTTA	2	10	309246	309255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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