MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 4208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	TATT	2	8	72	79	25 %	75 %	0 %	0 %	383311893
2	NC_017028	ACAT	2	8	928	935	50 %	25 %	0 %	25 %	383311894
3	NC_017028	TAAA	2	8	987	994	75 %	25 %	0 %	0 %	383311894
4	NC_017028	TAAA	2	8	1161	1168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017028	TAAA	2	8	2044	2051	75 %	25 %	0 %	0 %	383311895
6	NC_017028	TTAG	2	8	2154	2161	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
7	NC_017028	ATAC	3	12	2262	2273	50 %	25 %	0 %	25 %	383311895
8	NC_017028	ATTG	2	8	2373	2380	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
9	NC_017028	GATT	2	8	2519	2526	25 %	50 %	25 %	0 %	383311895
10	NC_017028	TAAT	2	8	2569	2576	50 %	50 %	0 %	0 %	383311895
11	NC_017028	ATAA	2	8	2590	2597	75 %	25 %	0 %	0 %	383311895
12	NC_017028	ATTT	2	8	2653	2660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017028	ATGC	2	8	3276	3283	25 %	25 %	25 %	25 %	383311896
14	NC_017028	ATAG	2	8	3695	3702	50 %	25 %	25 %	0 %	383311897
15	NC_017028	TATT	2	8	3843	3850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017028	ATAA	2	8	3958	3965	75 %	25 %	0 %	0 %	383311898
17	NC_017028	ATTT	2	8	4442	4449	25 %	75 %	0 %	0 %	383311898
18	NC_017028	ACTT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017028	GTCA	2	8	5031	5038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017028	CTTA	2	8	5169	5176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017028	ATTT	2	8	5441	5448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017028	TAAT	2	8	6364	6371	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
23	NC_017028	GATT	2	8	6726	6733	25 %	50 %	25 %	0 %	383311900
24	NC_017028	TACC	2	8	7026	7033	25 %	25 %	0 %	50 %	383311900
25	NC_017028	CTTC	2	8	7071	7078	0 %	50 %	0 %	50 %	383311900
26	NC_017028	AATA	2	8	7433	7440	75 %	25 %	0 %	0 %	383311900
27	NC_017028	TTTA	2	8	7448	7455	25 %	75 %	0 %	0 %	383311900
28	NC_017028	TAGT	2	8	7609	7616	25 %	50 %	25 %	0 %	383311900
29	NC_017028	TTAA	2	8	7623	7630	50 %	50 %	0 %	0 %	383311900
30	NC_017028	ACCC	2	8	8480	8487	25 %	0 %	0 %	75 %	383311900
31	NC_017028	GTAG	2	8	8928	8935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017028	TAAA	2	8	8955	8962	75 %	25 %	0 %	0 %	383311901
33	NC_017028	CGAA	2	8	9079	9086	50 %	0 %	25 %	25 %	383311901
34	NC_017028	GAAC	2	8	9089	9096	50 %	0 %	25 %	25 %	383311901
35	NC_017028	TTTC	2	8	9454	9461	0 %	75 %	0 %	25 %	383311902
36	NC_017028	TAGC	2	8	9485	9492	25 %	25 %	25 %	25 %	383311902
37	NC_017028	ACCG	2	8	9589	9596	25 %	0 %	25 %	50 %	383311902
38	NC_017028	ACCT	2	8	9599	9606	25 %	25 %	0 %	50 %	383311902
39	NC_017028	GGAT	2	8	9642	9649	25 %	25 %	50 %	0 %	383311902
40	NC_017028	TGTA	2	8	10389	10396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017028	ATTA	2	8	10450	10457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017028	CATC	2	8	10749	10756	25 %	25 %	0 %	50 %	383311904
43	NC_017028	GCTT	2	8	10963	10970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017028	TGTT	2	8	11009	11016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017028	GTTT	2	8	11042	11049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017028	TTCC	2	8	11286	11293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017028	TAAT	2	8	11519	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017028	TATT	2	8	12275	12282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017028	TTAT	2	8	12498	12505	25 %	75 %	0 %	0 %	383311906
50	NC_017028	TTGA	2	8	13996	14003	25 %	50 %	25 %	0 %	383311906
51	NC_017028	TAAT	2	8	14358	14365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017028	GAAG	2	8	14456	14463	50 %	0 %	50 %	0 %	383311907
53	NC_017028	AGCA	2	8	14709	14716	50 %	0 %	25 %	25 %	383311907
54	NC_017028	ATCA	2	8	14821	14828	50 %	25 %	0 %	25 %	383311907
55	NC_017028	CGGT	2	8	15045	15052	0 %	25 %	50 %	25 %	383311907
56	NC_017028	ATCT	2	8	15913	15920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017028	ATTT	2	8	15952	15959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017028	ATTT	2	8	16165	16172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017028	AAGC	2	8	16506	16513	50 %	0 %	25 %	25 %	383311908
60	NC_017028	AAGA	2	8	16549	16556	75 %	0 %	25 %	0 %	383311908
61	NC_017028	TAAT	2	8	16692	16699	50 %	50 %	0 %	0 %	383311908
62	NC_017028	ACAA	2	8	17178	17185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017028	TAGT	2	8	17472	17479	25 %	50 %	25 %	0 %	383311909
64	NC_017028	AAAG	2	8	18098	18105	75 %	0 %	25 %	0 %	383311910
65	NC_017028	GCGA	2	8	19036	19043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017028	GTAG	2	8	19184	19191	25 %	25 %	50 %	0 %	383311911
67	NC_017028	TTAT	2	8	19230	19237	25 %	75 %	0 %	0 %	383311911
68	NC_017028	TCGC	2	8	20194	20201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017028	TTTC	2	8	20308	20315	0 %	75 %	0 %	25 %	383311912
70	NC_017028	ATAA	2	8	20948	20955	75 %	25 %	0 %	0 %	383311912
71	NC_017028	GGTA	2	8	20996	21003	25 %	25 %	50 %	0 %	383311912
72	NC_017028	AAAT	2	8	21140	21147	75 %	25 %	0 %	0 %	383311912
73	NC_017028	AATG	2	8	21168	21175	50 %	25 %	25 %	0 %	383311912
74	NC_017028	GTAA	2	8	21377	21384	50 %	25 %	25 %	0 %	383311912
75	NC_017028	AGTA	2	8	21549	21556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017028	GATA	2	8	22320	22327	50 %	25 %	25 %	0 %	383311914
77	NC_017028	TCAT	2	8	22821	22828	25 %	50 %	0 %	25 %	383311914
78	NC_017028	AGTT	2	8	22877	22884	25 %	50 %	25 %	0 %	383311914
79	NC_017028	AATT	2	8	23806	23813	50 %	50 %	0 %	0 %	383311915
80	NC_017028	GAAA	2	8	24357	24364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017028	TAAA	2	8	24406	24413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017028	TGCA	2	8	24425	24432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017028	TAAA	2	8	25354	25361	75 %	25 %	0 %	0 %	383311919
84	NC_017028	TTAT	2	8	25412	25419	25 %	75 %	0 %	0 %	383311919
85	NC_017028	TAAA	2	8	25856	25863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017028	TAAA	2	8	27161	27168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017028	TGCT	2	8	28010	28017	0 %	50 %	25 %	25 %	383311921
88	NC_017028	CTAT	2	8	28370	28377	25 %	50 %	0 %	25 %	383311922
89	NC_017028	TTGC	2	8	28513	28520	0 %	50 %	25 %	25 %	383311922
90	NC_017028	ATTA	2	8	28597	28604	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
91	NC_017028	ATTA	2	8	28714	28721	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
92	NC_017028	ATTT	2	8	28743	28750	25 %	75 %	0 %	0 %	383311922
93	NC_017028	TATT	2	8	29786	29793	25 %	75 %	0 %	0 %	383311922
94	NC_017028	TAAT	2	8	29880	29887	50 %	50 %	0 %	0 %	383311922
95	NC_017028	AAGC	2	8	30539	30546	50 %	0 %	25 %	25 %	383311923
96	NC_017028	CCAA	2	8	30654	30661	50 %	0 %	0 %	50 %	383311923
97	NC_017028	ATGC	2	8	30834	30841	25 %	25 %	25 %	25 %	383311923
98	NC_017028	GAAA	2	8	31060	31067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017028	TCTT	2	8	31319	31326	0 %	75 %	0 %	25 %	383311924
100	NC_017028	AATA	2	8	31549	31556	75 %	25 %	0 %	0 %	383311925
101	NC_017028	GGCA	2	8	33179	33186	25 %	0 %	50 %	25 %	383311927
102	NC_017028	CGAA	2	8	33280	33287	50 %	0 %	25 %	25 %	383311927
103	NC_017028	TTGC	2	8	33770	33777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017028	CTAT	2	8	33843	33850	25 %	50 %	0 %	25 %	383311928
105	NC_017028	CTTT	2	8	33952	33959	0 %	75 %	0 %	25 %	383311928
106	NC_017028	TTCT	2	8	34248	34255	0 %	75 %	0 %	25 %	383311928
107	NC_017028	TATT	2	8	34421	34428	25 %	75 %	0 %	0 %	383311928
108	NC_017028	AGCA	2	8	34674	34681	50 %	0 %	25 %	25 %	383311928
109	NC_017028	AAAT	2	8	34749	34756	75 %	25 %	0 %	0 %	383311928
110	NC_017028	ATTT	2	8	34801	34808	25 %	75 %	0 %	0 %	383311929
111	NC_017028	ATAA	2	8	34845	34852	75 %	25 %	0 %	0 %	383311929
112	NC_017028	GCAT	2	8	35001	35008	25 %	25 %	25 %	25 %	383311929
113	NC_017028	ATTT	2	8	35129	35136	25 %	75 %	0 %	0 %	383311929
114	NC_017028	ATCT	2	8	35600	35607	25 %	50 %	0 %	25 %	383311930
115	NC_017028	ATTT	2	8	35620	35627	25 %	75 %	0 %	0 %	383311930
116	NC_017028	TGTT	2	8	35752	35759	0 %	75 %	25 %	0 %	383311930
117	NC_017028	TCTT	2	8	36167	36174	0 %	75 %	0 %	25 %	383311930
118	NC_017028	ATAA	2	8	36903	36910	75 %	25 %	0 %	0 %	383311930
119	NC_017028	GAAA	2	8	36992	36999	75 %	0 %	25 %	0 %	383311930
120	NC_017028	ATAA	2	8	37062	37069	75 %	25 %	0 %	0 %	383311930
121	NC_017028	ATTT	2	8	37070	37077	25 %	75 %	0 %	0 %	383311930
122	NC_017028	ACTT	2	8	37317	37324	25 %	50 %	0 %	25 %	383311931
123	NC_017028	TGTT	2	8	37390	37397	0 %	75 %	25 %	0 %	383311931
124	NC_017028	AAAC	2	8	37744	37751	75 %	0 %	0 %	25 %	383311931
125	NC_017028	ATTT	2	8	38023	38030	25 %	75 %	0 %	0 %	383311931
126	NC_017028	TAAT	2	8	38038	38045	50 %	50 %	0 %	0 %	383311931
127	NC_017028	AGAT	2	8	38731	38738	50 %	25 %	25 %	0 %	383311931
128	NC_017028	AAGC	2	8	39570	39577	50 %	0 %	25 %	25 %	383311931
129	NC_017028	CTTT	2	8	39786	39793	0 %	75 %	0 %	25 %	383311931
130	NC_017028	CAAG	2	8	39822	39829	50 %	0 %	25 %	25 %	383311931
131	NC_017028	CTAA	2	8	39864	39871	50 %	25 %	0 %	25 %	383311931
132	NC_017028	TTGA	2	8	40365	40372	25 %	50 %	25 %	0 %	383311932
133	NC_017028	TCCT	2	8	40707	40714	0 %	50 %	0 %	50 %	383311932
134	NC_017028	CTTG	2	8	41509	41516	0 %	50 %	25 %	25 %	383311933
135	NC_017028	GATA	2	8	41682	41689	50 %	25 %	25 %	0 %	383311933
136	NC_017028	ATTA	2	8	42007	42014	50 %	50 %	0 %	0 %	383311934
137	NC_017028	TCCT	2	8	42469	42476	0 %	50 %	0 %	50 %	383311934
138	NC_017028	CTAT	2	8	42827	42834	25 %	50 %	0 %	25 %	383311934
139	NC_017028	TTTA	2	8	43674	43681	25 %	75 %	0 %	0 %	383311935
140	NC_017028	TTCT	2	8	44391	44398	0 %	75 %	0 %	25 %	383311935
141	NC_017028	AATA	3	12	45235	45246	75 %	25 %	0 %	0 %	383311936
142	NC_017028	AAGC	2	8	46300	46307	50 %	0 %	25 %	25 %	383311938
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144	NC_017028	TCAC	2	8	46646	46653	25 %	25 %	0 %	50 %	383311939
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