MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017028	CTT	2	6	38385	38390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311931
1003	NC_017028	GAA	2	6	38394	38399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311931
1004	NC_017028	A	6	6	38498	38503	100 %	0 %	0 %	0 %	383311931
1005	NC_017028	CTTGG	2	10	38575	38584	0 %	40 %	40 %	20 %	383311931
1006	NC_017028	GCA	2	6	38638	38643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311931
1007	NC_017028	AAT	2	6	38684	38689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311931
1008	NC_017028	ATA	2	6	38704	38709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311931
1009	NC_017028	AGAT	2	8	38731	38738	50 %	25 %	25 %	0 %	383311931
1010	NC_017028	GAAGTA	2	12	38832	38843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383311931
1011	NC_017028	TAT	2	6	38870	38875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311931
1012	NC_017028	TCA	2	6	38969	38974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311931
1013	NC_017028	AT	3	6	38986	38991	50 %	50 %	0 %	0 %	383311931
1014	NC_017028	GAA	2	6	39102	39107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311931
1015	NC_017028	ATT	2	6	39138	39143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311931
1016	NC_017028	AGT	2	6	39245	39250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311931
1017	NC_017028	CTT	2	6	39265	39270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311931
1018	NC_017028	GCG	2	6	39280	39285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311931
1019	NC_017028	AGC	2	6	39347	39352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311931
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1021	NC_017028	GA	3	6	39404	39409	50 %	0 %	50 %	0 %	383311931
1022	NC_017028	TAA	2	6	39452	39457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311931
1023	NC_017028	TAA	2	6	39479	39484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311931
1024	NC_017028	A	6	6	39523	39528	100 %	0 %	0 %	0 %	383311931
1025	NC_017028	AAGC	2	8	39570	39577	50 %	0 %	25 %	25 %	383311931
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1027	NC_017028	A	6	6	39609	39614	100 %	0 %	0 %	0 %	383311931
1028	NC_017028	AGA	2	6	39674	39679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311931
1029	NC_017028	TA	3	6	39691	39696	50 %	50 %	0 %	0 %	383311931
1030	NC_017028	A	7	7	39779	39785	100 %	0 %	0 %	0 %	383311931
1031	NC_017028	CTTT	2	8	39786	39793	0 %	75 %	0 %	25 %	383311931
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1033	NC_017028	CAAG	2	8	39822	39829	50 %	0 %	25 %	25 %	383311931
1034	NC_017028	CTAA	2	8	39864	39871	50 %	25 %	0 %	25 %	383311931
1035	NC_017028	CAT	2	6	39927	39932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017028	AGC	2	6	39974	39979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017028	GGT	2	6	40059	40064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017028	GTT	2	6	40116	40121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311932
1039	NC_017028	GCT	2	6	40127	40132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311932
1040	NC_017028	CGG	2	6	40170	40175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311932
1041	NC_017028	CAA	2	6	40236	40241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311932
1042	NC_017028	ATG	2	6	40273	40278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311932
1043	NC_017028	TCT	2	6	40319	40324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311932
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1051	NC_017028	TAA	2	6	40629	40634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311932
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1054	NC_017028	CTG	2	6	40771	40776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311932
1055	NC_017028	ATA	2	6	40856	40861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311932
1056	NC_017028	ATC	2	6	40869	40874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017028	CACAG	2	10	40909	40918	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1058	NC_017028	TAT	2	6	40960	40965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311933
1059	NC_017028	CAC	2	6	40997	41002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311933
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1061	NC_017028	TGT	2	6	41050	41055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311933
1062	NC_017028	TGC	2	6	41113	41118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311933
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1064	NC_017028	TTC	2	6	41181	41186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311933
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1066	NC_017028	ATC	2	6	41310	41315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311933
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1072	NC_017028	T	6	6	41673	41678	0 %	100 %	0 %	0 %	383311933
1073	NC_017028	GATA	2	8	41682	41689	50 %	25 %	25 %	0 %	383311933
1074	NC_017028	T	7	7	41721	41727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_017028	T	7	7	41750	41756	0 %	100 %	0 %	0 %	383311934
1077	NC_017028	T	6	6	41773	41778	0 %	100 %	0 %	0 %	383311934
1078	NC_017028	TA	3	6	41842	41847	50 %	50 %	0 %	0 %	383311934
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1080	NC_017028	T	6	6	41901	41906	0 %	100 %	0 %	0 %	383311934
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1088	NC_017028	ATT	2	6	42109	42114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311934
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1090	NC_017028	T	6	6	42166	42171	0 %	100 %	0 %	0 %	383311934
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1092	NC_017028	TTCTA	2	10	42247	42256	20 %	60 %	0 %	20 %	383311934
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1095	NC_017028	GTA	2	6	42372	42377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311934
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1097	NC_017028	CATAC	2	10	42402	42411	40 %	20 %	0 %	40 %	383311934
1098	NC_017028	AAC	2	6	42417	42422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311934
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1100	NC_017028	C	6	6	42527	42532	0 %	0 %	0 %	100 %	383311934
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1107	NC_017028	T	6	6	42814	42819	0 %	100 %	0 %	0 %	383311934
1108	NC_017028	CTAT	2	8	42827	42834	25 %	50 %	0 %	25 %	383311934
1109	NC_017028	TATTGC	2	12	42855	42866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311934
1110	NC_017028	T	6	6	42886	42891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017028	AAG	2	6	42899	42904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017028	AAT	2	6	42910	42915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311935
1113	NC_017028	TAA	2	6	42932	42937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311935
1114	NC_017028	T	6	6	42984	42989	0 %	100 %	0 %	0 %	383311935
1115	NC_017028	TTG	2	6	43050	43055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311935
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1118	NC_017028	ATT	2	6	43113	43118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311935
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1120	NC_017028	ATA	3	9	43160	43168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311935
1121	NC_017028	A	7	7	43168	43174	100 %	0 %	0 %	0 %	383311935
1122	NC_017028	A	6	6	43179	43184	100 %	0 %	0 %	0 %	383311935
1123	NC_017028	T	6	6	43190	43195	0 %	100 %	0 %	0 %	383311935
1124	NC_017028	TTA	2	6	43228	43233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311935
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1127	NC_017028	ATTTAA	2	12	43290	43301	50 %	50 %	0 %	0 %	383311935
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