MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 35946

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017028	GTC	2	6	19027	19032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017028	GCGA	2	8	19036	19043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_017028	TAG	2	6	19113	19118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017028	T	6	6	19131	19136	0 %	100 %	0 %	0 %	383311911
505	NC_017028	TATTT	2	10	19160	19169	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
506	NC_017028	GTAG	2	8	19184	19191	25 %	25 %	50 %	0 %	383311911
507	NC_017028	CTT	2	6	19204	19209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311911
508	NC_017028	TTAT	2	8	19230	19237	25 %	75 %	0 %	0 %	383311911
509	NC_017028	T	6	6	19237	19242	0 %	100 %	0 %	0 %	383311911
510	NC_017028	TTA	2	6	19275	19280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311911
511	NC_017028	ATTTT	2	10	19296	19305	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
512	NC_017028	T	6	6	19302	19307	0 %	100 %	0 %	0 %	383311911
513	NC_017028	TAT	2	6	19345	19350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311911
514	NC_017028	CAT	2	6	19363	19368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311911
515	NC_017028	TACAT	2	10	19397	19406	40 %	40 %	0 %	20 %	383311911
516	NC_017028	TGA	2	6	19449	19454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311911
517	NC_017028	TCA	2	6	19500	19505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311911
518	NC_017028	AGT	2	6	19535	19540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311911
519	NC_017028	A	6	6	19587	19592	100 %	0 %	0 %	0 %	383311911
520	NC_017028	AG	3	6	19634	19639	50 %	0 %	50 %	0 %	383311911
521	NC_017028	TTC	2	6	19667	19672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311911
522	NC_017028	CGA	2	6	19715	19720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311911
523	NC_017028	ACC	2	6	19742	19747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311911
524	NC_017028	TCC	2	6	19751	19756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383311911
525	NC_017028	ATT	2	6	19761	19766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311911
526	NC_017028	ATC	2	6	19778	19783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311911
527	NC_017028	AAT	2	6	19800	19805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311911
528	NC_017028	AT	3	6	19804	19809	50 %	50 %	0 %	0 %	383311911
529	NC_017028	CCA	2	6	19995	20000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311911
530	NC_017028	CAC	2	6	20002	20007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311911
531	NC_017028	GTCCG	2	10	20009	20018	0 %	20 %	40 %	40 %	383311911
532	NC_017028	CCG	2	6	20064	20069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311911
533	NC_017028	TA	4	8	20081	20088	50 %	50 %	0 %	0 %	383311911
534	NC_017028	TCA	2	6	20097	20102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311911
535	NC_017028	GAG	2	6	20134	20139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017028	TCA	2	6	20158	20163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017028	TCGC	2	8	20194	20201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
538	NC_017028	GAC	2	6	20205	20210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017028	CT	3	6	20240	20245	0 %	50 %	0 %	50 %	383311912
540	NC_017028	CTG	2	6	20277	20282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311912
541	NC_017028	T	6	6	20284	20289	0 %	100 %	0 %	0 %	383311912
542	NC_017028	TTTC	2	8	20308	20315	0 %	75 %	0 %	25 %	383311912
543	NC_017028	ATA	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311912
544	NC_017028	TC	3	6	20435	20440	0 %	50 %	0 %	50 %	383311912
545	NC_017028	TTG	2	6	20502	20507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311912
546	NC_017028	CTT	2	6	20533	20538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311912
547	NC_017028	TA	3	6	20581	20586	50 %	50 %	0 %	0 %	383311912
548	NC_017028	TTAGCT	2	12	20631	20642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311912
549	NC_017028	AT	3	6	20643	20648	50 %	50 %	0 %	0 %	383311912
550	NC_017028	TTA	2	6	20689	20694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311912
551	NC_017028	CCG	2	6	20709	20714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311912
552	NC_017028	TTA	2	6	20844	20849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311912
553	NC_017028	T	6	6	20856	20861	0 %	100 %	0 %	0 %	383311912
554	NC_017028	ATT	2	6	20862	20867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311912
555	NC_017028	CAT	2	6	20903	20908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311912
556	NC_017028	ATAA	2	8	20948	20955	75 %	25 %	0 %	0 %	383311912
557	NC_017028	GCG	2	6	20988	20993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311912
558	NC_017028	GGTA	2	8	20996	21003	25 %	25 %	50 %	0 %	383311912
559	NC_017028	ATA	2	6	21102	21107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311912
560	NC_017028	AAAT	2	8	21140	21147	75 %	25 %	0 %	0 %	383311912
561	NC_017028	AATG	2	8	21168	21175	50 %	25 %	25 %	0 %	383311912
562	NC_017028	ATT	2	6	21197	21202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311912
563	NC_017028	A	6	6	21255	21260	100 %	0 %	0 %	0 %	383311912
564	NC_017028	TA	3	6	21326	21331	50 %	50 %	0 %	0 %	383311912
565	NC_017028	TAG	2	6	21337	21342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311912
566	NC_017028	GTAA	2	8	21377	21384	50 %	25 %	25 %	0 %	383311912
567	NC_017028	ATT	3	9	21503	21511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311912
568	NC_017028	AGTA	2	8	21549	21556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017028	T	8	8	21601	21608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017028	TAA	2	6	21688	21693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311913
571	NC_017028	TA	4	8	21741	21748	50 %	50 %	0 %	0 %	383311913
572	NC_017028	TGT	2	6	21749	21754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311913
573	NC_017028	CTT	2	6	21768	21773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311913
574	NC_017028	CCT	2	6	21791	21796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383311913
575	NC_017028	CTT	2	6	21810	21815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311913
576	NC_017028	ATT	2	6	21837	21842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017028	CTA	2	6	21883	21888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_017028	AAT	2	6	21919	21924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017028	CTT	2	6	21966	21971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_017028	TAT	2	6	21973	21978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017028	T	6	6	21988	21993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017028	TTA	2	6	22016	22021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017028	GAT	2	6	22096	22101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017028	AT	3	6	22113	22118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017028	ATT	2	6	22141	22146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017028	AAG	2	6	22196	22201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311914
587	NC_017028	TAT	2	6	22204	22209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311914
588	NC_017028	GATA	2	8	22320	22327	50 %	25 %	25 %	0 %	383311914
589	NC_017028	ATA	2	6	22343	22348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311914
590	NC_017028	T	6	6	22377	22382	0 %	100 %	0 %	0 %	383311914
591	NC_017028	AAT	2	6	22418	22423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311914
592	NC_017028	TAA	2	6	22435	22440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311914
593	NC_017028	CTT	2	6	22480	22485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311914
594	NC_017028	AGG	2	6	22508	22513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311914
595	NC_017028	T	6	6	22548	22553	0 %	100 %	0 %	0 %	383311914
596	NC_017028	TAG	2	6	22702	22707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311914
597	NC_017028	TAG	2	6	22739	22744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311914
598	NC_017028	TTC	2	6	22757	22762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311914
599	NC_017028	ATT	2	6	22766	22771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311914
600	NC_017028	TAT	2	6	22804	22809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311914
601	NC_017028	TCAT	2	8	22821	22828	25 %	50 %	0 %	25 %	383311914
602	NC_017028	AGTT	2	8	22877	22884	25 %	50 %	25 %	0 %	383311914
603	NC_017028	TAT	2	6	22888	22893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311914
604	NC_017028	AAT	2	6	22927	22932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311914
605	NC_017028	TAT	2	6	22966	22971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311914
606	NC_017028	TAAAA	2	10	22981	22990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_017028	ATC	2	6	23048	23053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311915
608	NC_017028	CTT	2	6	23055	23060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311915
609	NC_017028	ATG	2	6	23119	23124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311915
610	NC_017028	ATT	2	6	23127	23132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311915
611	NC_017028	ATATT	2	10	23164	23173	40 %	60 %	0 %	0 %	383311915
612	NC_017028	GCA	3	9	23208	23216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311915
613	NC_017028	ATATA	2	10	23230	23239	60 %	40 %	0 %	0 %	383311915
614	NC_017028	GAT	2	6	23247	23252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311915
615	NC_017028	CAT	2	6	23304	23309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311915
616	NC_017028	CAT	2	6	23337	23342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311915
617	NC_017028	A	6	6	23345	23350	100 %	0 %	0 %	0 %	383311915
618	NC_017028	TCA	2	6	23367	23372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311915
619	NC_017028	ATA	2	6	23437	23442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311915
620	NC_017028	TAA	2	6	23518	23523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311915
621	NC_017028	AAT	2	6	23547	23552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311915
622	NC_017028	A	6	6	23578	23583	100 %	0 %	0 %	0 %	383311915
623	NC_017028	GGC	2	6	23601	23606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311915
624	NC_017028	AAG	2	6	23608	23613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311915
625	NC_017028	ATT	2	6	23639	23644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311915
626	NC_017028	GTA	2	6	23653	23658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311915
627	NC_017028	TGG	2	6	23665	23670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311915
628	NC_017028	AATT	2	8	23806	23813	50 %	50 %	0 %	0 %	383311915
629	NC_017028	TA	3	6	23951	23956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017028	A	6	6	23993	23998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_017028	AGA	2	6	24012	24017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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