MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	GCAA	2	8	230	237	50 %	0 %	25 %	25 %	383327285
2	NC_017021	AAGC	2	8	652	659	50 %	0 %	25 %	25 %	383327286
3	NC_017021	ACAG	2	8	856	863	50 %	0 %	25 %	25 %	383327286
4	NC_017021	TGTT	2	8	1512	1519	0 %	75 %	25 %	0 %	383327287
5	NC_017021	GGAG	2	8	1673	1680	25 %	0 %	75 %	0 %	383327287
6	NC_017021	TAAC	2	8	2085	2092	50 %	25 %	0 %	25 %	383327287
7	NC_017021	CCAT	2	8	2263	2270	25 %	25 %	0 %	50 %	383327287
8	NC_017021	ATAG	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	383327288
9	NC_017021	TTCT	2	8	2825	2832	0 %	75 %	0 %	25 %	383327288
10	NC_017021	TGTA	2	8	2960	2967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017021	TAAT	2	8	3542	3549	50 %	50 %	0 %	0 %	383327290
12	NC_017021	AAGA	2	8	4156	4163	75 %	0 %	25 %	0 %	383327292
13	NC_017021	TGAT	2	8	4230	4237	25 %	50 %	25 %	0 %	383327293
14	NC_017021	CTTT	2	8	4986	4993	0 %	75 %	0 %	25 %	383327293
15	NC_017021	TACT	2	8	6283	6290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017021	TTGT	2	8	6611	6618	0 %	75 %	25 %	0 %	383327294
17	NC_017021	AAAG	2	8	6803	6810	75 %	0 %	25 %	0 %	383327295
18	NC_017021	ATCT	2	8	7087	7094	25 %	50 %	0 %	25 %	383327296
19	NC_017021	TGCT	2	8	7643	7650	0 %	50 %	25 %	25 %	383327298
20	NC_017021	TGCT	2	8	7720	7727	0 %	50 %	25 %	25 %	383327298
21	NC_017021	CTAA	2	8	7841	7848	50 %	25 %	0 %	25 %	383327298
22	NC_017021	ATTG	2	8	8450	8457	25 %	50 %	25 %	0 %	383327299
23	NC_017021	TCAA	2	8	8806	8813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017021	AATT	2	8	8932	8939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017021	AGAT	2	8	8971	8978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017021	AGTA	2	8	9202	9209	50 %	25 %	25 %	0 %	383327300
27	NC_017021	TAAA	2	8	9482	9489	75 %	25 %	0 %	0 %	383327301
28	NC_017021	TATT	2	8	9634	9641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017021	TTCA	2	8	9715	9722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017021	GTAT	2	8	9959	9966	25 %	50 %	25 %	0 %	383327302
31	NC_017021	TATC	2	8	10158	10165	25 %	50 %	0 %	25 %	383327302
32	NC_017021	ATTT	2	8	10533	10540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017021	AAAT	2	8	10584	10591	75 %	25 %	0 %	0 %	383327303
34	NC_017021	ATAG	2	8	10795	10802	50 %	25 %	25 %	0 %	383327303
35	NC_017021	GCTC	2	8	10894	10901	0 %	25 %	25 %	50 %	383327303
36	NC_017021	ACTA	2	8	11370	11377	50 %	25 %	0 %	25 %	383327304
37	NC_017021	TCTA	2	8	11478	11485	25 %	50 %	0 %	25 %	383327304
38	NC_017021	TTAA	2	8	13113	13120	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
39	NC_017021	TAGG	2	8	13204	13211	25 %	25 %	50 %	0 %	383327305
40	NC_017021	TGTT	2	8	13315	13322	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017021	ATTT	2	8	13552	13559	25 %	75 %	0 %	0 %	383327306
42	NC_017021	TATT	2	8	13749	13756	25 %	75 %	0 %	0 %	383327306
43	NC_017021	TTTA	2	8	14470	14477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017021	AAAG	2	8	14807	14814	75 %	0 %	25 %	0 %	383327309
45	NC_017021	ATTT	2	8	14934	14941	25 %	75 %	0 %	0 %	383327310
46	NC_017021	TTAT	2	8	15231	15238	25 %	75 %	0 %	0 %	383327311
47	NC_017021	AATT	2	8	15492	15499	50 %	50 %	0 %	0 %	383327312
48	NC_017021	TCCT	2	8	15705	15712	0 %	50 %	0 %	50 %	383327312
49	NC_017021	TTCT	2	8	15850	15857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017021	TTTA	2	8	16076	16083	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017021	TATC	2	8	16186	16193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017021	TCTT	2	8	16675	16682	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017021	ATTT	2	8	17025	17032	25 %	75 %	0 %	0 %	383327313
54	NC_017021	CTTT	2	8	17152	17159	0 %	75 %	0 %	25 %	383327313
55	NC_017021	ACAA	2	8	17625	17632	75 %	0 %	0 %	25 %	383327314
56	NC_017021	ATTT	2	8	18124	18131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017021	ATTA	2	8	18341	18348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017021	CCTT	2	8	18931	18938	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
59	NC_017021	TCGC	2	8	19133	19140	0 %	25 %	25 %	50 %	383327316
60	NC_017021	AAGT	2	8	19328	19335	50 %	25 %	25 %	0 %	383327316
61	NC_017021	TTGA	2	8	19753	19760	25 %	50 %	25 %	0 %	383327316
62	NC_017021	TGTT	2	8	19982	19989	0 %	75 %	25 %	0 %	383327316
63	NC_017021	GGTA	2	8	20435	20442	25 %	25 %	50 %	0 %	383327316
64	NC_017021	AACA	2	8	20660	20667	75 %	0 %	0 %	25 %	383327316
65	NC_017021	GCAG	2	8	20709	20716	25 %	0 %	50 %	25 %	383327316
66	NC_017021	AAGA	2	8	20755	20762	75 %	0 %	25 %	0 %	383327316
67	NC_017021	ATGA	2	8	20854	20861	50 %	25 %	25 %	0 %	383327316
68	NC_017021	ATTT	2	8	21038	21045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017021	TATT	2	8	21141	21148	25 %	75 %	0 %	0 %	383327317
70	NC_017021	CTTT	2	8	21152	21159	0 %	75 %	0 %	25 %	383327317
71	NC_017021	TTCT	2	8	21513	21520	0 %	75 %	0 %	25 %	383327318
72	NC_017021	TTTG	2	8	21616	21623	0 %	75 %	25 %	0 %	383327318
73	NC_017021	TATT	2	8	21758	21765	25 %	75 %	0 %	0 %	383327319
74	NC_017021	ATAA	2	8	22678	22685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017021	AGTC	2	8	22735	22742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.