MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017020	GATA	2	8	20176	20183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017020	TGT	2	6	20201	20206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017020	TAG	2	6	20268	20273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017020	AGC	2	6	20300	20305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_017020	CAA	2	6	20333	20338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_017020	CGA	2	6	20432	20437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327274
507	NC_017020	TAG	2	6	20490	20495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327274
508	NC_017020	GGA	2	6	20542	20547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327274
509	NC_017020	TGC	2	6	20556	20561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327274
510	NC_017020	TTTAAT	2	12	20566	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327274
511	NC_017020	T	6	6	20614	20619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017020	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017020	TAAA	2	8	20742	20749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017020	ATC	2	6	20757	20762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017020	A	7	7	20783	20789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017020	A	6	6	20860	20865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017020	TAT	2	6	20880	20885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327275
518	NC_017020	AGG	2	6	20902	20907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327275
519	NC_017020	AAT	2	6	20963	20968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327275
520	NC_017020	A	6	6	21033	21038	100 %	0 %	0 %	0 %	383327275
521	NC_017020	AAGA	2	8	21043	21050	75 %	0 %	25 %	0 %	383327275
522	NC_017020	AGA	2	6	21060	21065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017020	ATT	2	6	21175	21180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327276
524	NC_017020	TCA	2	6	21287	21292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
525	NC_017020	AT	3	6	21293	21298	50 %	50 %	0 %	0 %	383327276
526	NC_017020	TAGC	2	8	21363	21370	25 %	25 %	25 %	25 %	383327276
527	NC_017020	AATGTA	2	12	21424	21435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327276
528	NC_017020	TAC	2	6	21459	21464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
529	NC_017020	CAT	2	6	21538	21543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
530	NC_017020	T	8	8	21554	21561	0 %	100 %	0 %	0 %	383327276
531	NC_017020	TCA	3	9	21569	21577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
532	NC_017020	CAA	2	6	21594	21599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327276
533	NC_017020	AAT	2	6	21647	21652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327276
534	NC_017020	TAC	2	6	21697	21702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
535	NC_017020	TCTT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
536	NC_017020	TGT	2	6	21741	21746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327276
537	NC_017020	ATA	2	6	21777	21782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327276
538	NC_017020	GCA	2	6	21783	21788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327276
539	NC_017020	AGT	2	6	21883	21888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327276
540	NC_017020	AATA	2	8	21912	21919	75 %	25 %	0 %	0 %	383327276
541	NC_017020	TCTT	2	8	21933	21940	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
542	NC_017020	AAT	2	6	22017	22022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327276
543	NC_017020	AGC	2	6	22039	22044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327276
544	NC_017020	TCA	2	6	22076	22081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327276
545	NC_017020	TGT	2	6	22127	22132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327276
546	NC_017020	TAT	2	6	22287	22292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327277
547	NC_017020	AT	3	6	22310	22315	50 %	50 %	0 %	0 %	383327277
548	NC_017020	TCA	2	6	22358	22363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327277
549	NC_017020	GCT	2	6	22371	22376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327277
550	NC_017020	ATG	2	6	22390	22395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327277
551	NC_017020	TGT	2	6	22417	22422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327277
552	NC_017020	AGA	2	6	22453	22458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327277
553	NC_017020	A	6	6	22592	22597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017020	AGT	2	6	22772	22777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017020	TACT	2	8	22876	22883	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
556	NC_017020	ACTCC	2	10	22884	22893	20 %	20 %	0 %	60 %	383327278
557	NC_017020	ATG	2	6	22929	22934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327278
558	NC_017020	TA	3	6	23009	23014	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
559	NC_017020	AAT	2	6	23063	23068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327278
560	NC_017020	T	6	6	23115	23120	0 %	100 %	0 %	0 %	383327278
561	NC_017020	CAG	2	6	23180	23185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327278
562	NC_017020	TTG	2	6	23188	23193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327278
563	NC_017020	TTGT	2	8	23205	23212	0 %	75 %	25 %	0 %	383327278
564	NC_017020	GCA	2	6	23275	23280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327278
565	NC_017020	CTC	2	6	23339	23344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327278
566	NC_017020	AAAG	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	383327278
567	NC_017020	T	6	6	23441	23446	0 %	100 %	0 %	0 %	383327278
568	NC_017020	CCT	2	6	23474	23479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327278
569	NC_017020	GCT	2	6	23501	23506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
570	NC_017020	CTT	2	6	23609	23614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327278
571	NC_017020	ATCT	2	8	23645	23652	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
572	NC_017020	GTA	2	6	23672	23677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327278
573	NC_017020	CAA	2	6	23720	23725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327278
574	NC_017020	ATCTT	2	10	23761	23770	20 %	60 %	0 %	20 %	383327278
575	NC_017020	CAG	2	6	23861	23866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327278
576	NC_017020	TGC	2	6	23870	23875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
577	NC_017020	TAC	2	6	23889	23894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
578	NC_017020	CTA	2	6	23945	23950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
579	NC_017020	TGC	3	9	23963	23971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
580	NC_017020	ACGCA	2	10	24109	24118	40 %	0 %	20 %	40 %	383327278
581	NC_017020	TAG	2	6	24129	24134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327278
582	NC_017020	TA	3	6	24158	24163	50 %	50 %	0 %	0 %	383327278
583	NC_017020	TAT	2	6	24176	24181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327278
584	NC_017020	CAT	2	6	24186	24191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
585	NC_017020	GCT	2	6	24247	24252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
586	NC_017020	TTA	2	6	24289	24294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327278
587	NC_017020	TTG	2	6	24302	24307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327278
588	NC_017020	ACT	2	6	24330	24335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
589	NC_017020	CTT	2	6	24404	24409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327278
590	NC_017020	CTA	2	6	24442	24447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
591	NC_017020	GCT	2	6	24510	24515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
592	NC_017020	CCT	2	6	24532	24537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327278
593	NC_017020	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	383327278
594	NC_017020	ACT	2	6	24579	24584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
595	NC_017020	TGC	2	6	24659	24664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327278
596	NC_017020	CTT	2	6	24707	24712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327278
597	NC_017020	TGAA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	25 %	0 %	383327278
598	NC_017020	CTA	2	6	24773	24778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
599	NC_017020	ATT	2	6	24822	24827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327278
600	NC_017020	TCA	2	6	24856	24861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
601	NC_017020	CTAA	2	8	24862	24869	50 %	25 %	0 %	25 %	383327278
602	NC_017020	CTGC	2	8	24905	24912	0 %	25 %	25 %	50 %	383327278
603	NC_017020	ACT	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327278
604	NC_017020	CTTCT	2	10	24936	24945	0 %	60 %	0 %	40 %	383327278
605	NC_017020	TTA	2	6	24949	24954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327278
606	NC_017020	CTT	2	6	24983	24988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327278
607	NC_017020	ATCATT	2	12	25026	25037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383327279
608	NC_017020	CTC	2	6	25063	25068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327279
609	NC_017020	GCT	2	6	25080	25085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327279
610	NC_017020	GCG	2	6	25117	25122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383327279
611	NC_017020	TTAC	2	8	25127	25134	25 %	50 %	0 %	25 %	383327279
612	NC_017020	CT	3	6	25256	25261	0 %	50 %	0 %	50 %	383327279
613	NC_017020	ATA	2	6	25262	25267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327279
614	NC_017020	AAT	2	6	25299	25304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327279
615	NC_017020	AAT	2	6	25310	25315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327279
616	NC_017020	CTC	2	6	25342	25347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327279
617	NC_017020	TAT	2	6	25416	25421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327279
618	NC_017020	AATTAT	2	12	25425	25436	50 %	50 %	0 %	0 %	383327279
619	NC_017020	TAT	2	6	25571	25576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017020	AT	3	6	25584	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017020	ATA	2	6	25597	25602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017020	GAT	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017020	GCA	2	6	25682	25687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_017020	ATT	2	6	25690	25695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017020	TCA	2	6	25737	25742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017020	CTC	2	6	25783	25788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_017020	GAT	2	6	25793	25798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017020	TAT	2	6	25816	25821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017020	ACT	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017020	CAT	2	6	25875	25880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017020	CTT	2	6	25902	25907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017020	ATC	2	6	25949	25954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_017020	CT	3	6	26080	26085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
634	NC_017020	TGA	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017020	ACC	2	6	26164	26169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_017020	TAT	2	6	26193	26198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017020	CTTTA	2	10	26254	26263	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
638	NC_017020	TTC	2	6	26272	26277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017020	CT	3	6	26335	26340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
640	NC_017020	T	6	6	26343	26348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_017020	TCC	2	6	26417	26422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_017020	AT	4	8	26476	26483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_017020	TCA	2	6	26787	26792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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648	NC_017020	C	6	6	26806	26811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
649	NC_017020	GCT	2	6	26815	26820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_017020	CT	3	6	26830	26835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
651	NC_017020	CTC	2	6	26863	26868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_017020	TC	3	6	26867	26872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
653	NC_017020	TCGT	2	8	26900	26907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
654	NC_017020	ATC	2	6	26944	26949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_017020	ATG	2	6	26991	26996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_017020	TTGC	2	8	27100	27107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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664	NC_017020	TTC	2	6	27431	27436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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666	NC_017020	TAT	2	6	27460	27465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_017020	CTT	2	6	28070	28075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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759	NC_017020	CAA	2	6	31041	31046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
760	NC_017020	AAT	2	6	31074	31079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
761	NC_017020	TAC	2	6	31107	31112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
762	NC_017020	CAG	2	6	31217	31222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
763	NC_017020	AGA	2	6	31404	31409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_017020	ATTA	2	8	31441	31448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
765	NC_017020	TTA	2	6	31473	31478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
766	NC_017020	AT	3	6	31480	31485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
767	NC_017020	CAA	2	6	31601	31606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_017020	A	6	6	31610	31615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
769	NC_017020	TTA	2	6	31652	31657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_017020	CAGGAA	2	12	31667	31678	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
771	NC_017020	ACA	2	6	31714	31719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
772	NC_017020	A	7	7	31719	31725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_017020	AGC	2	6	31758	31763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
774	NC_017020	ACT	2	6	31798	31803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
775	NC_017020	TGG	2	6	31836	31841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
776	NC_017020	AT	3	6	31910	31915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
777	NC_017020	ATT	2	6	31929	31934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_017020	GCC	2	6	31944	31949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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