MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 43583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_016932	AGA	2	6	2306289	2306294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379716384
43502	NC_016932	TGT	2	6	2306308	2306313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379716384
43503	NC_016932	TCT	2	6	2306327	2306332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379716384
43504	NC_016932	GGT	2	6	2306382	2306387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379716384
43505	NC_016932	GATCAA	2	12	2306421	2306432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716384
43506	NC_016932	GGT	2	6	2306488	2306493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379716384
43507	NC_016932	CG	3	6	2306587	2306592	0 %	0 %	50 %	50 %	379716384
43508	NC_016932	GTC	2	6	2306632	2306637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379716384
43509	NC_016932	T	6	6	2306691	2306696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43510	NC_016932	CACC	2	8	2306794	2306801	25 %	0 %	0 %	75 %	379716385
43511	NC_016932	CGC	2	6	2306821	2306826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379716385
43512	NC_016932	T	6	6	2306842	2306847	0 %	100 %	0 %	0 %	379716385
43513	NC_016932	CTT	2	6	2306863	2306868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379716385
43514	NC_016932	CAA	2	6	2306977	2306982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379716385
43515	NC_016932	CAG	2	6	2307326	2307331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716385
43516	NC_016932	GGA	2	6	2307360	2307365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379716385
43517	NC_016932	GTT	2	6	2307395	2307400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379716385
43518	NC_016932	CCA	2	6	2307536	2307541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43519	NC_016932	GCC	2	6	2307560	2307565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43520	NC_016932	TG	3	6	2307570	2307575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43521	NC_016932	GAA	2	6	2307592	2307597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43522	NC_016932	ATT	2	6	2307599	2307604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379716386
43523	NC_016932	T	6	6	2307603	2307608	0 %	100 %	0 %	0 %	379716386
43524	NC_016932	CTT	2	6	2307615	2307620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379716386
43525	NC_016932	TTC	2	6	2307687	2307692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379716386
43526	NC_016932	TTA	2	6	2307712	2307717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379716386
43527	NC_016932	GCT	2	6	2307728	2307733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379716386
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43529	NC_016932	TGT	2	6	2307749	2307754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379716386
43530	NC_016932	CCA	2	6	2307758	2307763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379716386
43531	NC_016932	CAT	2	6	2307831	2307836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379716386
43532	NC_016932	TCA	2	6	2307842	2307847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379716386
43533	NC_016932	TGCATT	2	12	2307856	2307867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716386
43534	NC_016932	TAG	2	6	2307875	2307880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379716386
43535	NC_016932	GAT	2	6	2307960	2307965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379716386
43536	NC_016932	AT	3	6	2308054	2308059	50 %	50 %	0 %	0 %	379716386
43537	NC_016932	CAG	2	6	2308112	2308117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716386
43538	NC_016932	AGA	2	6	2308118	2308123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379716386
43539	NC_016932	TC	3	6	2308136	2308141	0 %	50 %	0 %	50 %	379716386
43540	NC_016932	CAT	2	6	2308308	2308313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379716386
43541	NC_016932	CTG	2	6	2308317	2308322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379716386
43542	NC_016932	CAG	2	6	2308440	2308445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716386
43543	NC_016932	ATA	2	6	2308447	2308452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379716386
43544	NC_016932	ACT	2	6	2308498	2308503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379716386
43545	NC_016932	TGG	2	6	2308574	2308579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43546	NC_016932	CG	3	6	2308670	2308675	0 %	0 %	50 %	50 %	379716387
43547	NC_016932	CAC	2	6	2308701	2308706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379716387
43548	NC_016932	AT	3	6	2308784	2308789	50 %	50 %	0 %	0 %	379716387
43549	NC_016932	CAG	2	6	2308816	2308821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716387
43550	NC_016932	ATT	3	9	2308858	2308866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379716387
43551	NC_016932	GA	3	6	2308900	2308905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43552	NC_016932	CTC	2	6	2308908	2308913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43553	NC_016932	AAG	2	6	2308924	2308929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379716388
43554	NC_016932	CGAA	2	8	2308942	2308949	50 %	0 %	25 %	25 %	379716388
43555	NC_016932	GCC	2	6	2308982	2308987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379716388
43556	NC_016932	GAC	2	6	2309002	2309007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716388
43557	NC_016932	CCT	2	6	2309132	2309137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379716388
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43560	NC_016932	CTG	2	6	2309243	2309248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379716388
43561	NC_016932	GAAG	2	8	2309261	2309268	50 %	0 %	50 %	0 %	379716388
43562	NC_016932	CGT	2	6	2309272	2309277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43563	NC_016932	AAG	2	6	2309289	2309294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43564	NC_016932	ACG	3	9	2309325	2309333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716389
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43566	NC_016932	CGA	2	6	2309398	2309403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379716389
43567	NC_016932	GTT	2	6	2309406	2309411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379716389
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43569	NC_016932	TG	3	6	2309460	2309465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43570	NC_016932	GAT	2	6	2309555	2309560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43571	NC_016932	CAC	2	6	2309578	2309583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43572	NC_016932	CA	3	6	2309632	2309637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43573	NC_016932	ATG	2	6	2309646	2309651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43574	NC_016932	GCG	2	6	2309682	2309687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43575	NC_016932	CAA	2	6	2309692	2309697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43576	NC_016932	CTAG	2	8	2309769	2309776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43577	NC_016932	GCT	2	6	2309837	2309842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43578	NC_016932	TC	3	6	2309867	2309872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43579	NC_016932	ACA	2	6	2309934	2309939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43580	NC_016932	CA	3	6	2309999	2310004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43581	NC_016932	AAC	2	6	2310225	2310230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43582	NC_016932	ATT	2	6	2310302	2310307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43583	NC_016932	GTT	3	9	2310379	2310387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.