MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 43583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016932	AGC	2	6	26971	26976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714315
502	NC_016932	TAA	2	6	27006	27011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714315
503	NC_016932	GAT	2	6	27061	27066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714315
504	NC_016932	CAT	2	6	27178	27183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714315
505	NC_016932	GAA	2	6	27189	27194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714315
506	NC_016932	ATC	2	6	27364	27369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714315
507	NC_016932	GTG	2	6	27398	27403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714315
508	NC_016932	CCG	2	6	27432	27437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714315
509	NC_016932	CAG	3	9	27448	27456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714315
510	NC_016932	TCA	2	6	27495	27500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714315
511	NC_016932	CGG	2	6	27569	27574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714316
512	NC_016932	AAG	2	6	27636	27641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714316
513	NC_016932	TGA	2	6	27650	27655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714316
514	NC_016932	TAC	2	6	27762	27767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714316
515	NC_016932	CTG	2	6	28061	28066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714316
516	NC_016932	ACC	2	6	28096	28101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714316
517	NC_016932	AGTGCT	2	12	28126	28137	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379714316
518	NC_016932	GAA	2	6	28153	28158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714316
519	NC_016932	AGC	2	6	28194	28199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714316
520	NC_016932	AATT	2	8	28205	28212	50 %	50 %	0 %	0 %	379714316
521	NC_016932	GA	3	6	28256	28261	50 %	0 %	50 %	0 %	379714316
522	NC_016932	AGG	2	6	28303	28308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714316
523	NC_016932	CA	3	6	28330	28335	50 %	0 %	0 %	50 %	379714316
524	NC_016932	TGG	2	6	28337	28342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714316
525	NC_016932	TGGA	2	8	28362	28369	25 %	25 %	50 %	0 %	379714316
526	NC_016932	CAG	2	6	28458	28463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714316
527	NC_016932	GCG	2	6	28482	28487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016932	GAA	2	6	28719	28724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
529	NC_016932	GGT	2	6	28770	28775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714317
530	NC_016932	GTT	2	6	28902	28907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714317
531	NC_016932	ACT	2	6	28968	28973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714317
532	NC_016932	AGA	2	6	29057	29062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
533	NC_016932	TGC	2	6	29066	29071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714317
534	NC_016932	CTGAT	2	10	29080	29089	20 %	40 %	20 %	20 %	379714317
535	NC_016932	GC	3	6	29105	29110	0 %	0 %	50 %	50 %	379714317
536	NC_016932	TCT	2	6	29152	29157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714317
537	NC_016932	GAAA	2	8	29180	29187	75 %	0 %	25 %	0 %	379714317
538	NC_016932	CTTC	2	8	29189	29196	0 %	50 %	0 %	50 %	379714317
539	NC_016932	AGAA	2	8	29221	29228	75 %	0 %	25 %	0 %	379714317
540	NC_016932	CAG	2	6	29287	29292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714317
541	NC_016932	CTT	2	6	29307	29312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714317
542	NC_016932	CAA	2	6	29345	29350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714317
543	NC_016932	TC	3	6	29352	29357	0 %	50 %	0 %	50 %	379714317
544	NC_016932	GCCC	2	8	29388	29395	0 %	0 %	25 %	75 %	379714317
545	NC_016932	TGA	2	6	29411	29416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714317
546	NC_016932	TCT	2	6	29470	29475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714317
547	NC_016932	GAA	2	6	29537	29542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
548	NC_016932	GAA	2	6	29555	29560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
549	NC_016932	GAC	2	6	29583	29588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714317
550	NC_016932	GAA	2	6	29634	29639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
551	NC_016932	AAG	2	6	29658	29663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714317
552	NC_016932	GCTA	2	8	29680	29687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
553	NC_016932	AG	3	6	29700	29705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016932	TAT	2	6	29723	29728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016932	CAT	2	6	29873	29878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714318
556	NC_016932	TAG	2	6	29921	29926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714318
557	NC_016932	ATG	2	6	29949	29954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714318
558	NC_016932	GGAGC	2	10	30029	30038	20 %	0 %	60 %	20 %	379714318
559	NC_016932	TA	3	6	30082	30087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016932	CGG	2	6	30256	30261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714319
561	NC_016932	TGAG	2	8	30324	30331	25 %	25 %	50 %	0 %	379714319
562	NC_016932	GCA	2	6	30357	30362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714319
563	NC_016932	TTG	2	6	30448	30453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714319
564	NC_016932	CAA	2	6	30490	30495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714319
565	NC_016932	GTAC	2	8	30525	30532	25 %	25 %	25 %	25 %	379714319
566	NC_016932	CAC	2	6	30593	30598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714319
567	NC_016932	TGA	2	6	30634	30639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714319
568	NC_016932	TTC	2	6	30722	30727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714319
569	NC_016932	CTT	2	6	30757	30762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714319
570	NC_016932	GC	3	6	30794	30799	0 %	0 %	50 %	50 %	379714319
571	NC_016932	AGA	2	6	30830	30835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714319
572	NC_016932	GTG	2	6	30852	30857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714319
573	NC_016932	T	7	7	30858	30864	0 %	100 %	0 %	0 %	379714319
574	NC_016932	TGA	2	6	30895	30900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714319
575	NC_016932	GCT	2	6	30958	30963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714319
576	NC_016932	TGC	2	6	31033	31038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714319
577	NC_016932	GCC	2	6	31067	31072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714319
578	NC_016932	TTGCT	2	10	31117	31126	0 %	60 %	20 %	20 %	379714319
579	NC_016932	GATC	2	8	31134	31141	25 %	25 %	25 %	25 %	379714319
580	NC_016932	TTC	2	6	31142	31147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714319
581	NC_016932	GTG	2	6	31257	31262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714319
582	NC_016932	AGC	2	6	31310	31315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714319
583	NC_016932	GCA	2	6	31434	31439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714319
584	NC_016932	GGA	2	6	31533	31538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714319
585	NC_016932	GA	3	6	31626	31631	50 %	0 %	50 %	0 %	379714319
586	NC_016932	TGG	2	6	31675	31680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714319
587	NC_016932	CGT	2	6	31681	31686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714319
588	NC_016932	GC	3	6	31690	31695	0 %	0 %	50 %	50 %	379714319
589	NC_016932	ATC	2	6	31740	31745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714319
590	NC_016932	CGT	2	6	31783	31788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714319
591	NC_016932	TCT	2	6	31857	31862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714319
592	NC_016932	CGCT	2	8	31928	31935	0 %	25 %	25 %	50 %	379714319
593	NC_016932	CAA	2	6	31960	31965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714319
594	NC_016932	CCT	2	6	32177	32182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714320
595	NC_016932	TGA	2	6	32264	32269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714320
596	NC_016932	GGAA	2	8	32272	32279	50 %	0 %	50 %	0 %	379714320
597	NC_016932	GGC	2	6	32333	32338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714320
598	NC_016932	AAC	2	6	32344	32349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714320
599	NC_016932	TTC	2	6	32428	32433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714320
600	NC_016932	ACT	2	6	32488	32493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714320
601	NC_016932	TCC	2	6	32506	32511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714320
602	NC_016932	CAA	2	6	32512	32517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714320
603	NC_016932	TGGC	2	8	32534	32541	0 %	25 %	50 %	25 %	379714320
604	NC_016932	TGC	2	6	32566	32571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
605	NC_016932	GAG	2	6	32572	32577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714320
606	NC_016932	TCC	2	6	32627	32632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714320
607	NC_016932	TTG	2	6	32640	32645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714320
608	NC_016932	GTG	2	6	32732	32737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714320
609	NC_016932	GGTT	2	8	32779	32786	0 %	50 %	50 %	0 %	379714320
610	NC_016932	CTG	2	6	32797	32802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
611	NC_016932	CTGA	2	8	32811	32818	25 %	25 %	25 %	25 %	379714320
612	NC_016932	AGT	2	6	32845	32850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714320
613	NC_016932	GTG	2	6	32964	32969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714320
614	NC_016932	GCC	3	9	33167	33175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714320
615	NC_016932	AGG	2	6	33224	33229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714320
616	NC_016932	AAT	2	6	33271	33276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714320
617	NC_016932	GCC	2	6	33290	33295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714320
618	NC_016932	GA	3	6	33358	33363	50 %	0 %	50 %	0 %	379714320
619	NC_016932	CAC	2	6	33366	33371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714320
620	NC_016932	GAT	2	6	33460	33465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714320
621	NC_016932	GTC	2	6	33571	33576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
622	NC_016932	GCC	2	6	33598	33603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714320
623	NC_016932	GTC	2	6	33631	33636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714320
624	NC_016932	GC	3	6	33703	33708	0 %	0 %	50 %	50 %	379714321
625	NC_016932	GCT	2	6	33714	33719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714321
626	NC_016932	GCT	2	6	33723	33728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714321
627	NC_016932	GGC	2	6	33752	33757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714321
628	NC_016932	ACC	2	6	33764	33769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714321
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632	NC_016932	ACC	2	6	33804	33809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714321
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728	NC_016932	GAG	2	6	38515	38520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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748	NC_016932	TACT	2	8	39581	39588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
749	NC_016932	GCA	2	6	39617	39622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_016932	TAG	2	6	39657	39662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
751	NC_016932	AAGA	2	8	39663	39670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
752	NC_016932	ATT	2	6	39876	39881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_016932	CAC	2	6	39886	39891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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755	NC_016932	T	6	6	40043	40048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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