MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 316 chromosome

Total Repeats: 43583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016932	GAT	2	6	286103	286108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714562
5502	NC_016932	CTT	2	6	286109	286114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714562
5503	NC_016932	GGT	2	6	286147	286152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714562
5504	NC_016932	GAA	2	6	286184	286189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714562
5505	NC_016932	CTG	2	6	286236	286241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5506	NC_016932	CGG	3	9	286273	286281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714562
5507	NC_016932	GGTG	2	8	286431	286438	0 %	25 %	75 %	0 %	379714562
5508	NC_016932	CCA	2	6	286479	286484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714562
5509	NC_016932	AGC	2	6	286486	286491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5510	NC_016932	CGT	2	6	286673	286678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5511	NC_016932	CGA	2	6	286717	286722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5512	NC_016932	GC	3	6	286882	286887	0 %	0 %	50 %	50 %	379714562
5513	NC_016932	GAT	2	6	286916	286921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714562
5514	NC_016932	AGGA	2	8	286965	286972	50 %	0 %	50 %	0 %	379714562
5515	NC_016932	GAA	2	6	287021	287026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714562
5516	NC_016932	TAT	2	6	287046	287051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714562
5517	NC_016932	GCC	3	9	287090	287098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714562
5518	NC_016932	AGT	2	6	287111	287116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714562
5519	NC_016932	GTTG	2	8	287119	287126	0 %	50 %	50 %	0 %	379714562
5520	NC_016932	GTG	2	6	287148	287153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714562
5521	NC_016932	GAT	2	6	287230	287235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714562
5522	NC_016932	GCTG	2	8	287299	287306	0 %	25 %	50 %	25 %	379714562
5523	NC_016932	GGA	2	6	287392	287397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714562
5524	NC_016932	GCGCTT	2	12	287456	287467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5525	NC_016932	GCA	2	6	287477	287482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5526	NC_016932	CTG	2	6	287594	287599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714562
5527	NC_016932	GGC	2	6	287608	287613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714562
5528	NC_016932	GAT	2	6	287635	287640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714562
5529	NC_016932	CTC	2	6	287643	287648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714562
5530	NC_016932	ATC	2	6	287672	287677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714562
5531	NC_016932	GTAG	2	8	287707	287714	25 %	25 %	50 %	0 %	379714562
5532	NC_016932	TCA	2	6	287757	287762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_016932	TGA	2	6	287773	287778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714563
5534	NC_016932	GCTT	2	8	287802	287809	0 %	50 %	25 %	25 %	379714563
5535	NC_016932	TGT	2	6	287824	287829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714563
5536	NC_016932	ATT	2	6	287832	287837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714563
5537	NC_016932	CGT	2	6	287901	287906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714563
5538	NC_016932	GCCG	2	8	287928	287935	0 %	0 %	50 %	50 %	379714563
5539	NC_016932	GCG	2	6	288038	288043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714563
5540	NC_016932	GCC	2	6	288096	288101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714563
5541	NC_016932	GGC	2	6	288312	288317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714563
5542	NC_016932	ATG	2	6	288348	288353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714563
5543	NC_016932	GCT	2	6	288651	288656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714563
5544	NC_016932	CG	3	6	288671	288676	0 %	0 %	50 %	50 %	379714563
5545	NC_016932	TGC	2	6	288691	288696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714563
5546	NC_016932	GAC	2	6	288732	288737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714563
5547	NC_016932	CGC	2	6	288788	288793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714563
5548	NC_016932	AT	3	6	288811	288816	50 %	50 %	0 %	0 %	379714563
5549	NC_016932	TCAT	2	8	288880	288887	25 %	50 %	0 %	25 %	379714563
5550	NC_016932	CTCG	2	8	288902	288909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5551	NC_016932	AAGG	2	8	288948	288955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_016932	CAT	2	6	288975	288980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379714564
5553	NC_016932	GCT	2	6	289006	289011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5554	NC_016932	GGC	2	6	289075	289080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714564
5555	NC_016932	GAG	2	6	289186	289191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714564
5556	NC_016932	CTT	2	6	289217	289222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714564
5557	NC_016932	TGA	2	6	289413	289418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714564
5558	NC_016932	TGT	2	6	289419	289424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714564
5559	NC_016932	TTC	2	6	289461	289466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714564
5560	NC_016932	GAT	2	6	289474	289479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714564
5561	NC_016932	GC	3	6	289488	289493	0 %	0 %	50 %	50 %	379714564
5562	NC_016932	AGA	2	6	289533	289538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714564
5563	NC_016932	A	6	6	289603	289608	100 %	0 %	0 %	0 %	379714564
5564	NC_016932	GGC	2	6	289645	289650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714564
5565	NC_016932	TTA	2	6	289712	289717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714564
5566	NC_016932	CGG	2	6	289805	289810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714564
5567	NC_016932	CTG	2	6	289813	289818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5568	NC_016932	TTG	2	6	289937	289942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714564
5569	NC_016932	AAG	2	6	289990	289995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714564
5570	NC_016932	CG	4	8	290067	290074	0 %	0 %	50 %	50 %	379714564
5571	NC_016932	AGACGA	2	12	290076	290087	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379714564
5572	NC_016932	CGA	2	6	290106	290111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5573	NC_016932	GACG	2	8	290134	290141	25 %	0 %	50 %	25 %	379714564
5574	NC_016932	TGC	2	6	290142	290147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5575	NC_016932	CGG	2	6	290181	290186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714564
5576	NC_016932	GCA	2	6	290224	290229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5577	NC_016932	TGC	2	6	290313	290318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5578	NC_016932	AGC	2	6	290322	290327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714564
5579	NC_016932	CTG	2	6	290410	290415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5580	NC_016932	TTC	2	6	290419	290424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714565
5581	NC_016932	CTG	2	6	290508	290513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5582	NC_016932	ACA	2	6	290546	290551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714565
5583	NC_016932	AGGCC	2	10	290577	290586	20 %	0 %	40 %	40 %	379714565
5584	NC_016932	TCC	2	6	290612	290617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714565
5585	NC_016932	GAG	2	6	290641	290646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714565
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5587	NC_016932	GCG	2	6	290723	290728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714565
5588	NC_016932	CGA	2	6	290766	290771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5589	NC_016932	GCA	2	6	290774	290779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5590	NC_016932	GCC	2	6	290806	290811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714565
5591	NC_016932	CAC	2	6	290857	290862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714565
5592	NC_016932	TAA	2	6	290970	290975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379714565
5593	NC_016932	GCA	2	6	291026	291031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5594	NC_016932	GAA	2	6	291050	291055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379714565
5595	NC_016932	CTG	2	6	291069	291074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714565
5596	NC_016932	CCA	2	6	291075	291080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714565
5597	NC_016932	TGCTT	2	10	291088	291097	0 %	60 %	20 %	20 %	379714565
5598	NC_016932	GT	3	6	291227	291232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_016932	GGT	2	6	291362	291367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714566
5600	NC_016932	GC	3	6	291382	291387	0 %	0 %	50 %	50 %	379714566
5601	NC_016932	GGA	2	6	291628	291633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714566
5602	NC_016932	GGCT	2	8	291681	291688	0 %	25 %	50 %	25 %	379714566
5603	NC_016932	GCC	2	6	291702	291707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714566
5604	NC_016932	ATT	2	6	291713	291718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714566
5605	NC_016932	GCT	2	6	291754	291759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714566
5606	NC_016932	CCG	2	6	291825	291830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714566
5607	NC_016932	GTG	2	6	291842	291847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714566
5608	NC_016932	ATG	2	6	291891	291896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714566
5609	NC_016932	GCAT	2	8	291905	291912	25 %	25 %	25 %	25 %	379714566
5610	NC_016932	CGG	2	6	291927	291932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379714566
5611	NC_016932	TGA	2	6	292026	292031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714566
5612	NC_016932	CCT	2	6	292044	292049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379714566
5613	NC_016932	GGTT	2	8	292055	292062	0 %	50 %	50 %	0 %	379714566
5614	NC_016932	ACC	2	6	292091	292096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379714566
5615	NC_016932	GGT	2	6	292115	292120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714566
5616	NC_016932	TGG	2	6	292138	292143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714566
5617	NC_016932	CT	3	6	292200	292205	0 %	50 %	0 %	50 %	379714566
5618	NC_016932	GCC	2	6	292226	292231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379714566
5619	NC_016932	GTGC	2	8	292277	292284	0 %	25 %	50 %	25 %	379714566
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5621	NC_016932	GC	3	6	292317	292322	0 %	0 %	50 %	50 %	379714566
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5743	NC_016932	GGA	2	6	297845	297850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379714573
5744	NC_016932	ATT	2	6	297883	297888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379714573
5745	NC_016932	AG	3	6	297964	297969	50 %	0 %	50 %	0 %	379714573
5746	NC_016932	TGC	2	6	298167	298172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714573
5747	NC_016932	TGC	2	6	298175	298180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714573
5748	NC_016932	TGGA	2	8	298193	298200	25 %	25 %	50 %	0 %	379714573
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5771	NC_016932	ATTAG	2	10	299900	299909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5781	NC_016932	GTA	2	6	300636	300641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379714575
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5864	NC_016932	CTT	2	6	305063	305068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379714580
5865	NC_016932	GCTG	2	8	305070	305077	0 %	25 %	50 %	25 %	379714580
5866	NC_016932	TGCGA	2	10	305089	305098	20 %	20 %	40 %	20 %	379714580
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5869	NC_016932	GT	3	6	305152	305157	0 %	50 %	50 %	0 %	379714581
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5872	NC_016932	TGGA	2	8	305319	305326	25 %	25 %	50 %	0 %	379714581
5873	NC_016932	TGC	2	6	305333	305338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714581
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5926	NC_016932	AGCGG	2	10	307922	307931	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5986	NC_016932	TGG	2	6	311522	311527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379714586
5987	NC_016932	AAC	3	9	311712	311720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379714586
5988	NC_016932	TC	4	8	311747	311754	0 %	50 %	0 %	50 %	379714586
5989	NC_016932	TTG	2	6	311761	311766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379714586
5990	NC_016932	CTG	2	6	311776	311781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714586
5991	NC_016932	TAAAAG	2	12	311802	311813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379714586
5992	NC_016932	AGCT	2	8	311888	311895	25 %	25 %	25 %	25 %	379714587
5993	NC_016932	CGT	2	6	312023	312028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714587
5994	NC_016932	GATGG	2	10	312060	312069	20 %	20 %	60 %	0 %	379714587
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5999	NC_016932	T	6	6	312401	312406	0 %	100 %	0 %	0 %	379714587
6000	NC_016932	TGC	2	6	312495	312500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379714587

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