MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC02 chromosome

Total Repeats: 5162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016802	CCGC	2	8	1065	1072	0 %	0 %	25 %	75 %	376292119
2	NC_016802	GCAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	376292119
3	NC_016802	GGCA	2	8	1386	1393	25 %	0 %	50 %	25 %	376292119
4	NC_016802	ATCA	2	8	2289	2296	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016802	GCCA	2	8	2515	2522	25 %	0 %	25 %	50 %	376292120
6	NC_016802	AAGC	2	8	3424	3431	50 %	0 %	25 %	25 %	376292120
7	NC_016802	ACCT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	376292120
8	NC_016802	TCAT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	376292121
9	NC_016802	TGCT	2	8	4305	4312	0 %	50 %	25 %	25 %	376292121
10	NC_016802	GGTG	2	8	4606	4613	0 %	25 %	75 %	0 %	376292121
11	NC_016802	TGAC	2	8	6016	6023	25 %	25 %	25 %	25 %	376292123
12	NC_016802	CTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	25 %	25 %	376292123
13	NC_016802	GGCG	2	8	8525	8532	0 %	0 %	75 %	25 %	376292126
14	NC_016802	CGCA	2	8	9911	9918	25 %	0 %	25 %	50 %	376292127
15	NC_016802	GCCC	2	8	10193	10200	0 %	0 %	25 %	75 %	376292127
16	NC_016802	CGTG	2	8	10219	10226	0 %	25 %	50 %	25 %	376292127
17	NC_016802	CCAC	2	8	10470	10477	25 %	0 %	0 %	75 %	376292127
18	NC_016802	CCGC	2	8	10554	10561	0 %	0 %	25 %	75 %	376292127
19	NC_016802	GCAA	2	8	11310	11317	50 %	0 %	25 %	25 %	376292127
20	NC_016802	GAAT	2	8	11896	11903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016802	AGCC	2	8	13288	13295	25 %	0 %	25 %	50 %	376292130
22	NC_016802	CCAT	2	8	13748	13755	25 %	25 %	0 %	50 %	376292130
23	NC_016802	CGGC	2	8	13774	13781	0 %	0 %	50 %	50 %	376292130
24	NC_016802	CAGG	2	8	14704	14711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016802	CCGG	2	8	14993	15000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016802	ACCG	2	8	15199	15206	25 %	0 %	25 %	50 %	376292131
27	NC_016802	CGGT	2	8	15537	15544	0 %	25 %	50 %	25 %	376292131
28	NC_016802	GGCG	2	8	15792	15799	0 %	0 %	75 %	25 %	376292132
29	NC_016802	GGGT	2	8	15960	15967	0 %	25 %	75 %	0 %	376292132
30	NC_016802	ACCC	2	8	17355	17362	25 %	0 %	0 %	75 %	376292133
31	NC_016802	GCAG	2	8	18005	18012	25 %	0 %	50 %	25 %	376292133
32	NC_016802	GCCA	2	8	18132	18139	25 %	0 %	25 %	50 %	376292133
33	NC_016802	CAGC	2	8	18842	18849	25 %	0 %	25 %	50 %	376292133
34	NC_016802	ACCT	2	8	18913	18920	25 %	25 %	0 %	50 %	376292133
35	NC_016802	GCGT	2	8	19841	19848	0 %	25 %	50 %	25 %	376292134
36	NC_016802	GCAC	2	8	20364	20371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016802	ATTG	2	8	22137	22144	25 %	50 %	25 %	0 %	376292137
38	NC_016802	TTGG	2	8	22331	22338	0 %	50 %	50 %	0 %	376292137
39	NC_016802	TTCG	2	8	22584	22591	0 %	50 %	25 %	25 %	376292138
40	NC_016802	TGGG	2	8	22760	22767	0 %	25 %	75 %	0 %	376292138
41	NC_016802	GGTG	2	8	23098	23105	0 %	25 %	75 %	0 %	376292138
42	NC_016802	TGTT	2	8	23169	23176	0 %	75 %	25 %	0 %	376292138
43	NC_016802	CTCA	2	8	24182	24189	25 %	25 %	0 %	50 %	376292139
44	NC_016802	TGGC	2	8	24195	24202	0 %	25 %	50 %	25 %	376292139
45	NC_016802	TGCT	2	8	24610	24617	0 %	50 %	25 %	25 %	376292140
46	NC_016802	TTAA	2	8	25711	25718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016802	GTCT	2	8	26333	26340	0 %	50 %	25 %	25 %	376292143
48	NC_016802	GGTT	2	8	26557	26564	0 %	50 %	50 %	0 %	376292143
49	NC_016802	CTGG	2	8	26832	26839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016802	AAGG	2	8	27041	27048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016802	CAAT	2	8	27274	27281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016802	CTTG	2	8	27358	27365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016802	CGCA	2	8	27942	27949	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016802	TTGA	2	8	28036	28043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016802	GAAT	2	8	28295	28302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016802	TATC	2	8	28619	28626	25 %	50 %	0 %	25 %	376292146
57	NC_016802	GGTG	2	8	28919	28926	0 %	25 %	75 %	0 %	376292146
58	NC_016802	ATGG	2	8	29043	29050	25 %	25 %	50 %	0 %	376292146
59	NC_016802	ATAA	2	8	29231	29238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016802	AGAT	2	8	29851	29858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016802	AGTG	2	8	30108	30115	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016802	GAAG	2	8	30198	30205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016802	ATCC	2	8	30280	30287	25 %	25 %	0 %	50 %	376292148
64	NC_016802	TCCT	2	8	31189	31196	0 %	50 %	0 %	50 %	376292148
65	NC_016802	CGTG	2	8	31681	31688	0 %	25 %	50 %	25 %	376292148
66	NC_016802	CAAC	2	8	33850	33857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016802	CCGC	2	8	34171	34178	0 %	0 %	25 %	75 %	376292151
68	NC_016802	CCCA	2	8	35255	35262	25 %	0 %	0 %	75 %	376292152
69	NC_016802	CCCA	2	8	35895	35902	25 %	0 %	0 %	75 %	376292153
70	NC_016802	CCAT	2	8	35948	35955	25 %	25 %	0 %	50 %	376292153
71	NC_016802	AACA	2	8	36162	36169	75 %	0 %	0 %	25 %	376292153
72	NC_016802	CGCA	2	8	36198	36205	25 %	0 %	25 %	50 %	376292153
73	NC_016802	CAAT	2	8	36540	36547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016802	TAAT	2	8	36943	36950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016802	GGGT	2	8	36952	36959	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016802	TTAA	2	8	37012	37019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016802	GCTA	2	8	37449	37456	25 %	25 %	25 %	25 %	376292154
78	NC_016802	AATC	2	8	38913	38920	50 %	25 %	0 %	25 %	376292154
79	NC_016802	ATGG	2	8	39131	39138	25 %	25 %	50 %	0 %	376292154
80	NC_016802	TTGG	2	8	40036	40043	0 %	50 %	50 %	0 %	376292154
81	NC_016802	GAAC	2	8	40634	40641	50 %	0 %	25 %	25 %	376292155
82	NC_016802	GTTC	2	8	40803	40810	0 %	50 %	25 %	25 %	376292155
83	NC_016802	TGCG	2	8	40963	40970	0 %	25 %	50 %	25 %	376292155
84	NC_016802	TCCG	2	8	41062	41069	0 %	25 %	25 %	50 %	376292155
85	NC_016802	AGCA	2	8	41357	41364	50 %	0 %	25 %	25 %	376292156
86	NC_016802	ATTA	2	8	41469	41476	50 %	50 %	0 %	0 %	376292156
87	NC_016802	CGTT	2	8	42980	42987	0 %	50 %	25 %	25 %	376292157
88	NC_016802	ACCT	2	8	43822	43829	25 %	25 %	0 %	50 %	376292158
89	NC_016802	AAGG	2	8	44779	44786	50 %	0 %	50 %	0 %	376292160
90	NC_016802	GCCG	2	8	44806	44813	0 %	0 %	50 %	50 %	376292160
91	NC_016802	AAAT	2	8	45027	45034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016802	TTGT	2	8	45405	45412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016802	GGTC	2	8	46050	46057	0 %	25 %	50 %	25 %	376292162
94	NC_016802	CCAG	2	8	46111	46118	25 %	0 %	25 %	50 %	376292162
95	NC_016802	CACG	2	8	46488	46495	25 %	0 %	25 %	50 %	376292162
96	NC_016802	GACG	2	8	48088	48095	25 %	0 %	50 %	25 %	376292163
97	NC_016802	GGCG	2	8	48607	48614	0 %	0 %	75 %	25 %	376292163
98	NC_016802	GATG	2	8	49049	49056	25 %	25 %	50 %	0 %	376292163
99	NC_016802	CTGC	2	8	49073	49080	0 %	25 %	25 %	50 %	376292163
100	NC_016802	AGCC	2	8	49721	49728	25 %	0 %	25 %	50 %	376292164
101	NC_016802	CAAG	2	8	51877	51884	50 %	0 %	25 %	25 %	376292165
102	NC_016802	ATTT	2	8	52284	52291	25 %	75 %	0 %	0 %	376292165
103	NC_016802	ACCA	2	8	52768	52775	50 %	0 %	0 %	50 %	376292166
104	NC_016802	CACC	2	8	52969	52976	25 %	0 %	0 %	75 %	376292166
105	NC_016802	CGAA	2	8	53078	53085	50 %	0 %	25 %	25 %	376292166
106	NC_016802	CAAC	2	8	53095	53102	50 %	0 %	0 %	50 %	376292166
107	NC_016802	ATCC	2	8	53176	53183	25 %	25 %	0 %	50 %	376292166
108	NC_016802	ATCA	2	8	53216	53223	50 %	25 %	0 %	25 %	376292166
109	NC_016802	CAAC	2	8	53745	53752	50 %	0 %	0 %	50 %	376292167
110	NC_016802	TCCG	2	8	54603	54610	0 %	25 %	25 %	50 %	376292168
111	NC_016802	CTTG	2	8	55589	55596	0 %	50 %	25 %	25 %	376292169
112	NC_016802	TCGG	2	8	56114	56121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016802	GCCC	2	8	56823	56830	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_016802	CGCT	2	8	57163	57170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016802	CGGC	2	8	57572	57579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016802	CAGC	2	8	57689	57696	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016802	CCAG	2	8	57737	57744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016802	TGGC	2	8	58210	58217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016802	GCGG	2	8	58943	58950	0 %	0 %	75 %	25 %	376292172
120	NC_016802	GCGG	2	8	60234	60241	0 %	0 %	75 %	25 %	376292173
121	NC_016802	GTGC	2	8	61235	61242	0 %	25 %	50 %	25 %	376292174
122	NC_016802	CCAC	2	8	61335	61342	25 %	0 %	0 %	75 %	376292174
123	NC_016802	TCCA	2	8	61995	62002	25 %	25 %	0 %	50 %	376292175
124	NC_016802	GGGC	2	8	62843	62850	0 %	0 %	75 %	25 %	376292175
125	NC_016802	GTGC	2	8	63237	63244	0 %	25 %	50 %	25 %	376292176
126	NC_016802	CAAC	2	8	63468	63475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016802	TGAT	2	8	63706	63713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016802	CGGC	2	8	63951	63958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016802	GACG	2	8	64004	64011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016802	GGCC	2	8	64962	64969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016802	GGCA	2	8	65934	65941	25 %	0 %	50 %	25 %	376292180
132	NC_016802	GCTT	2	8	66317	66324	0 %	50 %	25 %	25 %	376292181
133	NC_016802	TTCT	2	8	66397	66404	0 %	75 %	0 %	25 %	376292181
134	NC_016802	GTTT	2	8	67245	67252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016802	GATG	2	8	67487	67494	25 %	25 %	50 %	0 %	376292182
136	NC_016802	TTCG	2	8	67581	67588	0 %	50 %	25 %	25 %	376292182
137	NC_016802	TGAT	2	8	68067	68074	25 %	50 %	25 %	0 %	376292182
138	NC_016802	TGAT	2	8	68418	68425	25 %	50 %	25 %	0 %	376292182
139	NC_016802	TCCG	2	8	69071	69078	0 %	25 %	25 %	50 %	376292183
140	NC_016802	CTGC	2	8	70729	70736	0 %	25 %	25 %	50 %	376292184
141	NC_016802	CGGG	2	8	70781	70788	0 %	0 %	75 %	25 %	376292184
142	NC_016802	TGGT	2	8	71000	71007	0 %	50 %	50 %	0 %	376292185
143	NC_016802	CCGT	2	8	71081	71088	0 %	25 %	25 %	50 %	376292185
144	NC_016802	CGTC	2	8	71592	71599	0 %	25 %	25 %	50 %	376292185
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