MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 12009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	TTAT	2	8	253	260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	AGAA	2	8	961	968	75 %	0 %	25 %	0 %	376259381
3	NC_016791	AGAC	2	8	1069	1076	50 %	0 %	25 %	25 %	376259381
4	NC_016791	AGGT	2	8	1215	1222	25 %	25 %	50 %	0 %	376259381
5	NC_016791	GCTT	2	8	2620	2627	0 %	50 %	25 %	25 %	376259382
6	NC_016791	ATGA	2	8	2706	2713	50 %	25 %	25 %	0 %	376259382
7	NC_016791	AATA	2	8	3031	3038	75 %	25 %	0 %	0 %	376259383
8	NC_016791	ATTG	2	8	3245	3252	25 %	50 %	25 %	0 %	376259384
9	NC_016791	ATTT	2	8	3372	3379	25 %	75 %	0 %	0 %	376259384
10	NC_016791	TTTA	2	8	3611	3618	25 %	75 %	0 %	0 %	376259384
11	NC_016791	AAAG	2	8	4157	4164	75 %	0 %	25 %	0 %	376259384
12	NC_016791	AATA	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016791	ATTG	2	8	4701	4708	25 %	50 %	25 %	0 %	376259385
14	NC_016791	ATGA	2	8	4733	4740	50 %	25 %	25 %	0 %	376259386
15	NC_016791	ATTT	2	8	5468	5475	25 %	75 %	0 %	0 %	376259386
16	NC_016791	ACAA	2	8	5749	5756	75 %	0 %	0 %	25 %	376259386
17	NC_016791	ACAG	2	8	6390	6397	50 %	0 %	25 %	25 %	376259386
18	NC_016791	TGGA	2	8	6421	6428	25 %	25 %	50 %	0 %	376259386
19	NC_016791	ATGC	2	8	6626	6633	25 %	25 %	25 %	25 %	376259386
20	NC_016791	AAAT	2	8	6800	6807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	ATTG	2	8	7298	7305	25 %	50 %	25 %	0 %	376259387
22	NC_016791	GAAT	2	8	7752	7759	50 %	25 %	25 %	0 %	376259388
23	NC_016791	AACA	2	8	8014	8021	75 %	0 %	0 %	25 %	376259388
24	NC_016791	AAAT	2	8	8313	8320	75 %	25 %	0 %	0 %	376259388
25	NC_016791	AAAC	2	8	8424	8431	75 %	0 %	0 %	25 %	376259388
26	NC_016791	AGAA	2	8	8977	8984	75 %	0 %	25 %	0 %	376259389
27	NC_016791	AAAC	2	8	9216	9223	75 %	0 %	0 %	25 %	376259389
28	NC_016791	TTTA	2	8	9363	9370	25 %	75 %	0 %	0 %	376259390
29	NC_016791	GAAT	2	8	9891	9898	50 %	25 %	25 %	0 %	376259390
30	NC_016791	AATT	2	8	9990	9997	50 %	50 %	0 %	0 %	376259390
31	NC_016791	ATAG	2	8	10055	10062	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016791	TGCC	2	8	10510	10517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016791	TCTG	2	8	11109	11116	0 %	50 %	25 %	25 %	376259391
34	NC_016791	TAAT	2	8	11358	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016791	TAAT	2	8	11385	11392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016791	GGAT	2	8	11463	11470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016791	ATTA	2	8	11631	11638	50 %	50 %	0 %	0 %	376259392
38	NC_016791	ATTG	2	8	11913	11920	25 %	50 %	25 %	0 %	376259392
39	NC_016791	ACAA	2	8	11944	11951	75 %	0 %	0 %	25 %	376259392
40	NC_016791	ATTT	2	8	12077	12084	25 %	75 %	0 %	0 %	376259392
41	NC_016791	AGTA	2	8	12464	12471	50 %	25 %	25 %	0 %	376259393
42	NC_016791	ATAC	2	8	12974	12981	50 %	25 %	0 %	25 %	376259394
43	NC_016791	GATG	2	8	13672	13679	25 %	25 %	50 %	0 %	376259396
44	NC_016791	GCAT	2	8	14266	14273	25 %	25 %	25 %	25 %	376259396
45	NC_016791	ATGG	2	8	15614	15621	25 %	25 %	50 %	0 %	376259396
46	NC_016791	GAAA	2	8	16026	16033	75 %	0 %	25 %	0 %	376259396
47	NC_016791	TATC	2	8	17403	17410	25 %	50 %	0 %	25 %	376259397
48	NC_016791	TTTC	2	8	17789	17796	0 %	75 %	0 %	25 %	376259397
49	NC_016791	ATTT	2	8	17976	17983	25 %	75 %	0 %	0 %	376259397
50	NC_016791	TACA	2	8	18088	18095	50 %	25 %	0 %	25 %	376259397
51	NC_016791	GACA	2	8	18144	18151	50 %	0 %	25 %	25 %	376259397
52	NC_016791	TATT	2	8	18483	18490	25 %	75 %	0 %	0 %	376259397
53	NC_016791	ATGA	2	8	18682	18689	50 %	25 %	25 %	0 %	376259398
54	NC_016791	AATT	2	8	18819	18826	50 %	50 %	0 %	0 %	376259398
55	NC_016791	GAAG	2	8	18955	18962	50 %	0 %	50 %	0 %	376259398
56	NC_016791	TTGC	2	8	19009	19016	0 %	50 %	25 %	25 %	376259398
57	NC_016791	ATAA	2	8	19543	19550	75 %	25 %	0 %	0 %	376259398
58	NC_016791	TAAA	2	8	19679	19686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016791	TCAT	2	8	21437	21444	25 %	50 %	0 %	25 %	376259399
60	NC_016791	TGCA	2	8	21553	21560	25 %	25 %	25 %	25 %	376259399
61	NC_016791	CCCT	2	8	21628	21635	0 %	25 %	0 %	75 %	376259399
62	NC_016791	TTCC	2	8	21738	21745	0 %	50 %	0 %	50 %	376259399
63	NC_016791	TTAT	2	8	22169	22176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016791	TGTA	2	8	22809	22816	25 %	50 %	25 %	0 %	376259401
65	NC_016791	CTGC	2	8	23304	23311	0 %	25 %	25 %	50 %	376259402
66	NC_016791	GAAA	2	8	23473	23480	75 %	0 %	25 %	0 %	376259402
67	NC_016791	CTTC	2	8	23656	23663	0 %	50 %	0 %	50 %	376259402
68	NC_016791	AACT	2	8	24212	24219	50 %	25 %	0 %	25 %	376259402
69	NC_016791	TTCT	2	8	24509	24516	0 %	75 %	0 %	25 %	376259402
70	NC_016791	TATT	2	8	24765	24772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016791	TAAA	2	8	24859	24866	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016791	GATA	2	8	25562	25569	50 %	25 %	25 %	0 %	376259403
73	NC_016791	ATAA	2	8	25686	25693	75 %	25 %	0 %	0 %	376259403
74	NC_016791	ATAA	2	8	25747	25754	75 %	25 %	0 %	0 %	376259404
75	NC_016791	AATT	2	8	25774	25781	50 %	50 %	0 %	0 %	376259404
76	NC_016791	TCAA	2	8	25997	26004	50 %	25 %	0 %	25 %	376259404
77	NC_016791	TTCT	2	8	26403	26410	0 %	75 %	0 %	25 %	376259404
78	NC_016791	GAAA	2	8	27072	27079	75 %	0 %	25 %	0 %	376259405
79	NC_016791	CTTG	2	8	27951	27958	0 %	50 %	25 %	25 %	376259405
80	NC_016791	TTTA	2	8	28221	28228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016791	TTTA	2	8	28283	28290	25 %	75 %	0 %	0 %	376259406
82	NC_016791	AGAT	2	8	28387	28394	50 %	25 %	25 %	0 %	376259406
83	NC_016791	AATT	2	8	29004	29011	50 %	50 %	0 %	0 %	376259406
84	NC_016791	CTGT	2	8	29285	29292	0 %	50 %	25 %	25 %	376259407
85	NC_016791	AAGT	2	8	29412	29419	50 %	25 %	25 %	0 %	376259407
86	NC_016791	ATTT	2	8	29568	29575	25 %	75 %	0 %	0 %	376259408
87	NC_016791	AGGA	2	8	29795	29802	50 %	0 %	50 %	0 %	376259408
88	NC_016791	CAAG	2	8	29855	29862	50 %	0 %	25 %	25 %	376259408
89	NC_016791	AGAA	2	8	30208	30215	75 %	0 %	25 %	0 %	376259408
90	NC_016791	AAGA	2	8	30354	30361	75 %	0 %	25 %	0 %	376259408
91	NC_016791	CTAT	2	8	30475	30482	25 %	50 %	0 %	25 %	376259409
92	NC_016791	TACA	2	8	30525	30532	50 %	25 %	0 %	25 %	376259409
93	NC_016791	GAAG	2	8	31380	31387	50 %	0 %	50 %	0 %	376259409
94	NC_016791	AGAA	2	8	31866	31873	75 %	0 %	25 %	0 %	376259409
95	NC_016791	GCAA	2	8	32173	32180	50 %	0 %	25 %	25 %	376259410
96	NC_016791	AAAG	2	8	34067	34074	75 %	0 %	25 %	0 %	376259411
97	NC_016791	GAAA	2	8	34741	34748	75 %	0 %	25 %	0 %	376259412
98	NC_016791	ATCG	2	8	35624	35631	25 %	25 %	25 %	25 %	376259413
99	NC_016791	TTAT	2	8	35697	35704	25 %	75 %	0 %	0 %	376259413
100	NC_016791	TGAA	2	8	36264	36271	50 %	25 %	25 %	0 %	376259413
101	NC_016791	CGGT	2	8	36588	36595	0 %	25 %	50 %	25 %	376259413
102	NC_016791	TTTA	2	8	36628	36635	25 %	75 %	0 %	0 %	376259413
103	NC_016791	ACAG	2	8	37079	37086	50 %	0 %	25 %	25 %	376259413
104	NC_016791	TTAT	3	12	37679	37690	25 %	75 %	0 %	0 %	376259414
105	NC_016791	TGGA	2	8	37931	37938	25 %	25 %	50 %	0 %	376259414
106	NC_016791	GGGT	2	8	37945	37952	0 %	25 %	75 %	0 %	376259414
107	NC_016791	AGTA	2	8	37957	37964	50 %	25 %	25 %	0 %	376259414
108	NC_016791	AGTA	2	8	38106	38113	50 %	25 %	25 %	0 %	376259414
109	NC_016791	AATG	2	8	39283	39290	50 %	25 %	25 %	0 %	376259415
110	NC_016791	GTTT	2	8	39332	39339	0 %	75 %	25 %	0 %	376259415
111	NC_016791	CCCT	2	8	39988	39995	0 %	25 %	0 %	75 %	376259416
112	NC_016791	CAGG	2	8	41826	41833	25 %	0 %	50 %	25 %	376259417
113	NC_016791	TGGA	2	8	41897	41904	25 %	25 %	50 %	0 %	376259417
114	NC_016791	CGAA	2	8	42227	42234	50 %	0 %	25 %	25 %	376259418
115	NC_016791	CCAA	2	8	42261	42268	50 %	0 %	0 %	50 %	376259418
116	NC_016791	TATT	2	8	42280	42287	25 %	75 %	0 %	0 %	376259418
117	NC_016791	AAAT	2	8	42591	42598	75 %	25 %	0 %	0 %	376259418
118	NC_016791	ATTT	2	8	42962	42969	25 %	75 %	0 %	0 %	376259419
119	NC_016791	AGGT	2	8	43444	43451	25 %	25 %	50 %	0 %	376259420
120	NC_016791	TTTG	2	8	44116	44123	0 %	75 %	25 %	0 %	376259421
121	NC_016791	GAAG	2	8	44379	44386	50 %	0 %	50 %	0 %	376259421
122	NC_016791	TAAA	2	8	44437	44444	75 %	25 %	0 %	0 %	376259422
123	NC_016791	TGAT	2	8	45029	45036	25 %	50 %	25 %	0 %	376259423
124	NC_016791	AGGG	2	8	45062	45069	25 %	0 %	75 %	0 %	376259423
125	NC_016791	AATG	2	8	45120	45127	50 %	25 %	25 %	0 %	376259423
126	NC_016791	CCTG	2	8	46257	46264	0 %	25 %	25 %	50 %	376259424
127	NC_016791	AGCA	2	8	46619	46626	50 %	0 %	25 %	25 %	376259424
128	NC_016791	AAAT	2	8	47559	47566	75 %	25 %	0 %	0 %	376259425
129	NC_016791	ATTG	2	8	48588	48595	25 %	50 %	25 %	0 %	376259426
130	NC_016791	TTAT	2	8	48989	48996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016791	TACT	2	8	49121	49128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016791	TAAT	2	8	49283	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016791	TTTA	2	8	49340	49347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016791	GCAG	2	8	49561	49568	25 %	0 %	50 %	25 %	376259427
135	NC_016791	GAAC	2	8	49841	49848	50 %	0 %	25 %	25 %	376259427
136	NC_016791	TGGT	2	8	50493	50500	0 %	50 %	50 %	0 %	376259427
137	NC_016791	GTAC	2	8	51134	51141	25 %	25 %	25 %	25 %	376259427
138	NC_016791	ATTA	2	8	51174	51181	50 %	50 %	0 %	0 %	376259427
139	NC_016791	CTTT	2	8	51231	51238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016791	TTAA	2	8	51294	51301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016791	ATGA	2	8	51431	51438	50 %	25 %	25 %	0 %	376259428
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