MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 60446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016791	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016791	TTG	2	6	110	115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016791	GTT	2	6	143	148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016791	ATT	2	6	284	289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016791	ATT	2	6	361	366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259381
6	NC_016791	CTG	2	6	459	464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259381
7	NC_016791	TAA	2	6	469	474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
8	NC_016791	TAA	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
9	NC_016791	GCA	2	6	686	691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259381
10	NC_016791	GGA	2	6	746	751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259381
11	NC_016791	TTC	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259381
12	NC_016791	GAT	2	6	878	883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259381
13	NC_016791	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
14	NC_016791	AGA	3	9	970	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
15	NC_016791	AAT	2	6	1021	1026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
16	NC_016791	TGA	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259381
17	NC_016791	TAA	2	6	1333	1338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259381
18	NC_016791	AAG	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
19	NC_016791	AAG	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259381
20	NC_016791	TTA	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016791	CTA	3	9	1831	1839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016791	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016791	ACT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259382
24	NC_016791	TTC	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259382
25	NC_016791	AAG	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
26	NC_016791	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
27	NC_016791	TAG	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
28	NC_016791	TTG	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
29	NC_016791	TGT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
30	NC_016791	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
31	NC_016791	GAA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
32	NC_016791	TTC	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259382
33	NC_016791	TGA	3	9	2513	2521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
34	NC_016791	GGT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259382
35	NC_016791	GTT	2	6	2649	2654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259382
36	NC_016791	GAA	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259382
37	NC_016791	TGA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259382
38	NC_016791	TAC	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259382
39	NC_016791	AAT	2	6	2949	2954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259382
40	NC_016791	ACG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016791	TTA	2	6	3045	3050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259383
42	NC_016791	AAT	2	6	3214	3219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259383
43	NC_016791	ATT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
44	NC_016791	TAA	2	6	3424	3429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259384
45	NC_016791	TAT	2	6	3507	3512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
46	NC_016791	AGA	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259384
47	NC_016791	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259384
48	NC_016791	TTG	2	6	3652	3657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259384
49	NC_016791	CAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259384
50	NC_016791	AAC	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259384
51	NC_016791	CTT	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259384
52	NC_016791	GCA	2	6	3813	3818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259384
53	NC_016791	ATT	2	6	3822	3827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259384
54	NC_016791	ATG	2	6	3949	3954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
55	NC_016791	ATA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259384
56	NC_016791	GAT	2	6	4050	4055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
57	NC_016791	CAG	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259384
58	NC_016791	GAT	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
59	NC_016791	GGA	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259384
60	NC_016791	AGT	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259384
61	NC_016791	TAA	2	6	4388	4393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016791	GGA	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016791	TGT	2	6	4455	4460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259385
64	NC_016791	TAT	2	6	4485	4490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259385
65	NC_016791	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259385
66	NC_016791	GAA	3	9	4546	4554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259385
67	NC_016791	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259385
68	NC_016791	GGA	2	6	4575	4580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259385
69	NC_016791	TAT	2	6	4596	4601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259385
70	NC_016791	ATC	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259385
71	NC_016791	ATG	2	6	4761	4766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
72	NC_016791	CAT	2	6	4853	4858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259386
73	NC_016791	TGA	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
74	NC_016791	AGT	2	6	5020	5025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
75	NC_016791	GTG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259386
76	NC_016791	TGT	2	6	5107	5112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
77	NC_016791	GAA	2	6	5225	5230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259386
78	NC_016791	TAC	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259386
79	NC_016791	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
80	NC_016791	TTG	2	6	5421	5426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
81	NC_016791	TAA	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
82	NC_016791	TAA	2	6	5557	5562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
83	NC_016791	CAA	2	6	5568	5573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259386
84	NC_016791	ATT	2	6	5651	5656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259386
85	NC_016791	TAA	2	6	5712	5717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259386
86	NC_016791	TTG	2	6	5790	5795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
87	NC_016791	AGA	2	6	5830	5835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259386
88	NC_016791	ATT	2	6	5855	5860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259386
89	NC_016791	AGC	2	6	5896	5901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259386
90	NC_016791	CAA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259386
91	NC_016791	TTG	2	6	6012	6017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259386
92	NC_016791	GGT	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259386
93	NC_016791	AGA	2	6	6059	6064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259386
94	NC_016791	TTA	2	6	6156	6161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259386
95	NC_016791	CCT	2	6	6338	6343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259386
96	NC_016791	AGA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259386
97	NC_016791	ATG	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
98	NC_016791	TGA	2	6	6565	6570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259386
99	NC_016791	ATA	2	6	6938	6943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259387
100	NC_016791	ACA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259387
101	NC_016791	CGG	2	6	6984	6989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376259387
102	NC_016791	ACA	2	6	7061	7066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259387
103	NC_016791	ATG	2	6	7110	7115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259387
104	NC_016791	TTA	3	9	7116	7124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259387
105	NC_016791	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259387
106	NC_016791	TAT	2	6	7291	7296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259387
107	NC_016791	TCC	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259387
108	NC_016791	GTT	2	6	7469	7474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259387
109	NC_016791	AGA	2	6	7519	7524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259387
110	NC_016791	AAT	2	6	7561	7566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259387
111	NC_016791	TAT	2	6	7612	7617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259387
112	NC_016791	ATG	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259387
113	NC_016791	GAA	2	6	7667	7672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259387
114	NC_016791	GGT	2	6	7693	7698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259387
115	NC_016791	GAA	2	6	7768	7773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259388
116	NC_016791	TGA	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259388
117	NC_016791	ACA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259388
118	NC_016791	TAT	2	6	7899	7904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259388
119	NC_016791	ATT	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259388
120	NC_016791	AGA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259388
121	NC_016791	GAA	2	6	8077	8082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259388
122	NC_016791	TTC	2	6	8093	8098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259388
123	NC_016791	TGC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259388
124	NC_016791	TAT	2	6	8217	8222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259388
125	NC_016791	TTA	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259388
126	NC_016791	GCT	2	6	8293	8298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259388
127	NC_016791	AAG	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259388
128	NC_016791	ATA	2	6	8369	8374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259388
129	NC_016791	AAC	2	6	8398	8403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259388
130	NC_016791	ATG	2	6	8510	8515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259388
131	NC_016791	ATA	2	6	8792	8797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259389
132	NC_016791	AGA	2	6	8829	8834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259389
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