MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016791	GCT	2	6	137720	137725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3003	NC_016791	AGA	2	6	137743	137748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259512
3004	NC_016791	AAG	2	6	137756	137761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259512
3005	NC_016791	CTG	2	6	137814	137819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3006	NC_016791	GTT	2	6	137843	137848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259512
3007	NC_016791	TGC	2	6	137893	137898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3008	NC_016791	CTTCT	2	10	137918	137927	0 %	60 %	0 %	40 %	376259512
3009	NC_016791	GTT	2	6	137945	137950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259512
3010	NC_016791	TA	3	6	137971	137976	50 %	50 %	0 %	0 %	376259512
3011	NC_016791	AG	3	6	137984	137989	50 %	0 %	50 %	0 %	376259512
3012	NC_016791	AG	3	6	138042	138047	50 %	0 %	50 %	0 %	376259512
3013	NC_016791	GCT	2	6	138098	138103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3014	NC_016791	TGC	2	6	138211	138216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3015	NC_016791	TGT	2	6	138217	138222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259512
3016	NC_016791	TAA	2	6	138256	138261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259512
3017	NC_016791	AAAT	2	8	138315	138322	75 %	25 %	0 %	0 %	376259512
3018	NC_016791	ATGAA	2	10	138324	138333	60 %	20 %	20 %	0 %	376259512
3019	NC_016791	GCT	2	6	138338	138343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3020	NC_016791	TTG	2	6	138363	138368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259512
3021	NC_016791	GAA	2	6	138374	138379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259512
3022	NC_016791	GCA	3	9	138437	138445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3023	NC_016791	AGC	2	6	138454	138459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259512
3024	NC_016791	TAA	2	6	138519	138524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_016791	T	6	6	138532	138537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_016791	TTAA	2	8	138585	138592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016791	ATTG	2	8	138621	138628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_016791	ATG	2	6	138649	138654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_016791	TTA	2	6	138749	138754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_016791	AGA	2	6	138937	138942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259513
3031	NC_016791	AT	3	6	138972	138977	50 %	50 %	0 %	0 %	376259513
3032	NC_016791	AGC	2	6	138991	138996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259513
3033	NC_016791	TCT	2	6	139009	139014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259513
3034	NC_016791	AAT	2	6	139039	139044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259513
3035	NC_016791	ATT	2	6	139070	139075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259513
3036	NC_016791	GAAAA	2	10	139142	139151	80 %	0 %	20 %	0 %	376259513
3037	NC_016791	TGG	2	6	139176	139181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259513
3038	NC_016791	CGT	2	6	139236	139241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259513
3039	NC_016791	GTA	2	6	139316	139321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259513
3040	NC_016791	TCT	2	6	139456	139461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259513
3041	NC_016791	TAG	2	6	139509	139514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259513
3042	NC_016791	ATAA	2	8	139535	139542	75 %	25 %	0 %	0 %	376259513
3043	NC_016791	TGAT	2	8	139572	139579	25 %	50 %	25 %	0 %	376259513
3044	NC_016791	TAG	2	6	139620	139625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259513
3045	NC_016791	AG	3	6	139801	139806	50 %	0 %	50 %	0 %	376259513
3046	NC_016791	ACA	2	6	139817	139822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259513
3047	NC_016791	ATGAA	2	10	139890	139899	60 %	20 %	20 %	0 %	376259513
3048	NC_016791	AAAG	2	8	139940	139947	75 %	0 %	25 %	0 %	376259513
3049	NC_016791	TTA	2	6	139959	139964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259513
3050	NC_016791	TAA	2	6	140004	140009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259513
3051	NC_016791	A	6	6	140073	140078	100 %	0 %	0 %	0 %	376259513
3052	NC_016791	ATG	2	6	140130	140135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259513
3053	NC_016791	AT	3	6	140149	140154	50 %	50 %	0 %	0 %	376259513
3054	NC_016791	ATG	2	6	140352	140357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259513
3055	NC_016791	A	6	6	140370	140375	100 %	0 %	0 %	0 %	376259513
3056	NC_016791	TAAAA	2	10	140442	140451	80 %	20 %	0 %	0 %	376259513
3057	NC_016791	GAT	2	6	140466	140471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_016791	GAC	2	6	140509	140514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259514
3059	NC_016791	ACAG	2	8	140735	140742	50 %	0 %	25 %	25 %	376259514
3060	NC_016791	ATT	2	6	141018	141023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259514
3061	NC_016791	GAG	2	6	141067	141072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259514
3062	NC_016791	GAT	2	6	141100	141105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259514
3063	NC_016791	TTG	2	6	141176	141181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259514
3064	NC_016791	AAC	2	6	141238	141243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259514
3065	NC_016791	TTC	2	6	141313	141318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259514
3066	NC_016791	GAAA	2	8	141322	141329	75 %	0 %	25 %	0 %	376259514
3067	NC_016791	TCA	2	6	141352	141357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259514
3068	NC_016791	AT	3	6	141417	141422	50 %	50 %	0 %	0 %	376259514
3069	NC_016791	AT	3	6	141587	141592	50 %	50 %	0 %	0 %	376259515
3070	NC_016791	CAGT	2	8	141640	141647	25 %	25 %	25 %	25 %	376259515
3071	NC_016791	GTT	2	6	141683	141688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259515
3072	NC_016791	GAT	2	6	141701	141706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259515
3073	NC_016791	TGC	2	6	141763	141768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259515
3074	NC_016791	ATG	2	6	141852	141857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259515
3075	NC_016791	GTT	2	6	141926	141931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259515
3076	NC_016791	TAC	2	6	141937	141942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259515
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3078	NC_016791	ATA	2	6	142122	142127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259515
3079	NC_016791	AAT	2	6	142205	142210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259515
3080	NC_016791	TTA	2	6	142239	142244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259515
3081	NC_016791	CAGA	2	8	142245	142252	50 %	0 %	25 %	25 %	376259515
3082	NC_016791	AAG	2	6	142260	142265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259515
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3084	NC_016791	TGG	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259515
3085	NC_016791	T	6	6	142444	142449	0 %	100 %	0 %	0 %	376259515
3086	NC_016791	TGCT	2	8	142521	142528	0 %	50 %	25 %	25 %	376259515
3087	NC_016791	A	6	6	142749	142754	100 %	0 %	0 %	0 %	376259515
3088	NC_016791	CAG	2	6	142799	142804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259515
3089	NC_016791	A	7	7	142886	142892	100 %	0 %	0 %	0 %	376259515
3090	NC_016791	TTA	2	6	142893	142898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259515
3091	NC_016791	TAA	3	9	142912	142920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259515
3092	NC_016791	CGG	2	6	142924	142929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376259515
3093	NC_016791	TGA	2	6	143053	143058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259515
3094	NC_016791	AAC	2	6	143081	143086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259515
3095	NC_016791	TGGA	2	8	143167	143174	25 %	25 %	50 %	0 %	376259515
3096	NC_016791	ATC	2	6	143187	143192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259515
3097	NC_016791	ATATGA	2	12	143215	143226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	376259515
3098	NC_016791	GACAG	2	10	143273	143282	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
3099	NC_016791	GGAAC	2	10	143286	143295	40 %	0 %	40 %	20 %	376259515
3100	NC_016791	GAA	2	6	143360	143365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259515
3101	NC_016791	CTG	3	9	143366	143374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259515
3102	NC_016791	CCA	2	6	143380	143385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376259515
3103	NC_016791	AT	3	6	143431	143436	50 %	50 %	0 %	0 %	376259515
3104	NC_016791	ACA	2	6	143439	143444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259515
3105	NC_016791	AGA	2	6	143470	143475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259515
3106	NC_016791	ATTA	2	8	143476	143483	50 %	50 %	0 %	0 %	376259515
3107	NC_016791	GAA	2	6	143516	143521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259515
3108	NC_016791	GA	3	6	143578	143583	50 %	0 %	50 %	0 %	376259515
3109	NC_016791	TAA	2	6	143586	143591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259515
3110	NC_016791	TGA	2	6	143623	143628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259515
3111	NC_016791	AT	3	6	143642	143647	50 %	50 %	0 %	0 %	376259515
3112	NC_016791	GGC	2	6	143662	143667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_016791	TGGT	2	8	143684	143691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_016791	TGGA	2	8	143742	143749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_016791	TAA	2	6	143868	143873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_016791	TA	3	6	143934	143939	50 %	50 %	0 %	0 %	376259516
3117	NC_016791	ACG	2	6	144045	144050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259516
3118	NC_016791	TAT	2	6	144062	144067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259516
3119	NC_016791	AC	3	6	144137	144142	50 %	0 %	0 %	50 %	376259516
3120	NC_016791	GTT	2	6	144158	144163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259516
3121	NC_016791	A	6	6	144164	144169	100 %	0 %	0 %	0 %	376259516
3122	NC_016791	TAA	2	6	144178	144183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259516
3123	NC_016791	ATG	2	6	144210	144215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259516
3124	NC_016791	A	6	6	144237	144242	100 %	0 %	0 %	0 %	376259516
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