MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016791	TAA	2	6	67638	67643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259438
1503	NC_016791	AATA	2	8	67727	67734	75 %	25 %	0 %	0 %	376259438
1504	NC_016791	TGA	2	6	67748	67753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259438
1505	NC_016791	TTA	2	6	67863	67868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259438
1506	NC_016791	TCA	2	6	67873	67878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259438
1507	NC_016791	TG	3	6	67932	67937	0 %	50 %	50 %	0 %	376259438
1508	NC_016791	AT	3	6	68060	68065	50 %	50 %	0 %	0 %	376259438
1509	NC_016791	T	6	6	68081	68086	0 %	100 %	0 %	0 %	376259438
1510	NC_016791	ATGA	2	8	68209	68216	50 %	25 %	25 %	0 %	376259438
1511	NC_016791	GCT	2	6	68250	68255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259438
1512	NC_016791	T	6	6	68265	68270	0 %	100 %	0 %	0 %	376259438
1513	NC_016791	ATA	2	6	68331	68336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016791	TAA	2	6	68539	68544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259439
1515	NC_016791	TTA	2	6	68547	68552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259439
1516	NC_016791	T	6	6	68568	68573	0 %	100 %	0 %	0 %	376259439
1517	NC_016791	CT	3	6	68659	68664	0 %	50 %	0 %	50 %	376259439
1518	NC_016791	CGT	2	6	68683	68688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259439
1519	NC_016791	TCCA	2	8	68708	68715	25 %	25 %	0 %	50 %	376259439
1520	NC_016791	T	6	6	68720	68725	0 %	100 %	0 %	0 %	376259439
1521	NC_016791	CA	3	6	68813	68818	50 %	0 %	0 %	50 %	376259439
1522	NC_016791	GTC	2	6	68843	68848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259439
1523	NC_016791	CGA	2	6	68863	68868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259439
1524	NC_016791	AT	3	6	68902	68907	50 %	50 %	0 %	0 %	376259439
1525	NC_016791	TAT	2	6	68920	68925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259439
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1527	NC_016791	TAT	3	9	68960	68968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259439
1528	NC_016791	GAGG	2	8	68999	69006	25 %	0 %	75 %	0 %	376259439
1529	NC_016791	AT	3	6	69009	69014	50 %	50 %	0 %	0 %	376259439
1530	NC_016791	CTG	2	6	69125	69130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259439
1531	NC_016791	CAA	2	6	69151	69156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259439
1532	NC_016791	CAG	2	6	69182	69187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259439
1533	NC_016791	A	6	6	69385	69390	100 %	0 %	0 %	0 %	376259439
1534	NC_016791	TAA	2	6	69394	69399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259439
1535	NC_016791	TAT	2	6	69422	69427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259439
1536	NC_016791	TAAAC	2	10	69447	69456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_016791	TA	3	6	69488	69493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016791	TAT	2	6	69512	69517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016791	TA	3	6	69519	69524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016791	TA	3	6	69575	69580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016791	A	8	8	69589	69596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016791	A	6	6	69599	69604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016791	ATTT	2	8	69611	69618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016791	CAATT	2	10	69631	69640	40 %	40 %	0 %	20 %	376259440
1545	NC_016791	AGG	2	6	69696	69701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259440
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1547	NC_016791	A	7	7	69804	69810	100 %	0 %	0 %	0 %	376259440
1548	NC_016791	GTT	2	6	69876	69881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259440
1549	NC_016791	A	6	6	69906	69911	100 %	0 %	0 %	0 %	376259440
1550	NC_016791	CTT	2	6	69923	69928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259440
1551	NC_016791	TTC	2	6	69938	69943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259440
1552	NC_016791	TAAAA	2	10	69960	69969	80 %	20 %	0 %	0 %	376259440
1553	NC_016791	TTG	2	6	70020	70025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259440
1554	NC_016791	AT	4	8	70027	70034	50 %	50 %	0 %	0 %	376259440
1555	NC_016791	TGGT	2	8	70117	70124	0 %	50 %	50 %	0 %	376259440
1556	NC_016791	GCT	2	6	70125	70130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259440
1557	NC_016791	AAAT	2	8	70134	70141	75 %	25 %	0 %	0 %	376259440
1558	NC_016791	GTAG	2	8	70150	70157	25 %	25 %	50 %	0 %	376259440
1559	NC_016791	TATT	2	8	70174	70181	25 %	75 %	0 %	0 %	376259440
1560	NC_016791	T	7	7	70180	70186	0 %	100 %	0 %	0 %	376259440
1561	NC_016791	CCT	2	6	70222	70227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_016791	T	6	6	70257	70262	0 %	100 %	0 %	0 %	376259441
1563	NC_016791	CAT	3	9	70289	70297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259441
1564	NC_016791	GTAT	2	8	70306	70313	25 %	50 %	25 %	0 %	376259441
1565	NC_016791	TC	3	6	70356	70361	0 %	50 %	0 %	50 %	376259441
1566	NC_016791	TCCA	2	8	70372	70379	25 %	25 %	0 %	50 %	376259441
1567	NC_016791	TTC	2	6	70476	70481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259441
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1569	NC_016791	CAT	2	6	70538	70543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259441
1570	NC_016791	TAGCCA	2	12	70610	70621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376259441
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1572	NC_016791	ATA	2	6	70672	70677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259441
1573	NC_016791	TAT	2	6	70704	70709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259442
1574	NC_016791	GACA	2	8	70717	70724	50 %	0 %	25 %	25 %	376259442
1575	NC_016791	TAG	2	6	70732	70737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259442
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1579	NC_016791	CT	3	6	70823	70828	0 %	50 %	0 %	50 %	376259442
1580	NC_016791	ACA	2	6	70955	70960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376259442
1581	NC_016791	ACC	2	6	70994	70999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376259442
1582	NC_016791	ATAA	2	8	71016	71023	75 %	25 %	0 %	0 %	376259442
1583	NC_016791	TCC	2	6	71025	71030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_016791	ATGATA	2	12	71040	71051	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016791	ATA	2	6	71071	71076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016791	AAT	2	6	71098	71103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016791	TAG	2	6	71109	71114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016791	AC	3	6	71160	71165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_016791	AAAT	2	8	71194	71201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_016791	TCAGC	2	10	71368	71377	20 %	20 %	20 %	40 %	376259443
1594	NC_016791	GAAAGA	2	12	71399	71410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259443
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1599	NC_016791	AGAA	2	8	71493	71500	75 %	0 %	25 %	0 %	376259443
1600	NC_016791	ATA	2	6	71536	71541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259443
1601	NC_016791	AAG	2	6	71542	71547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259443
1602	NC_016791	TAG	2	6	71551	71556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259443
1603	NC_016791	TCA	2	6	71704	71709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259444
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1607	NC_016791	GGATGA	2	12	71966	71977	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	376259444
1608	NC_016791	TAT	2	6	71999	72004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016791	T	6	6	72026	72031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016791	AGG	2	6	72067	72072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016791	AG	3	6	72094	72099	50 %	0 %	50 %	0 %	376259445
1612	NC_016791	AGA	2	6	72105	72110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259445
1613	NC_016791	GGC	2	6	72147	72152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376259445
1614	NC_016791	ATGAGA	2	12	72153	72164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	376259445
1615	NC_016791	TTC	2	6	72268	72273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259445
1616	NC_016791	AGA	2	6	72276	72281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259445
1617	NC_016791	AG	3	6	72331	72336	50 %	0 %	50 %	0 %	376259445
1618	NC_016791	CTG	2	6	72364	72369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259445
1619	NC_016791	A	6	6	72379	72384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016791	A	6	6	72407	72412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016791	TAA	2	6	72448	72453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016791	T	7	7	72555	72561	0 %	100 %	0 %	0 %	376259446
1623	NC_016791	T	6	6	72623	72628	0 %	100 %	0 %	0 %	376259446
1624	NC_016791	TAT	2	6	72630	72635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259446
1625	NC_016791	CA	3	6	72654	72659	50 %	0 %	0 %	50 %	376259446
1626	NC_016791	T	6	6	72799	72804	0 %	100 %	0 %	0 %	376259446
1627	NC_016791	GCCT	2	8	72806	72813	0 %	25 %	25 %	50 %	376259446
1628	NC_016791	TTC	2	6	72837	72842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259446
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