MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_016791	AGG	2	6	43537	43542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259420
1003	NC_016791	CTG	2	6	43594	43599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259420
1004	NC_016791	TAA	2	6	43642	43647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259420
1005	NC_016791	GAA	2	6	43808	43813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259421
1006	NC_016791	ATA	2	6	43824	43829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259421
1007	NC_016791	AAG	2	6	43930	43935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259421
1008	NC_016791	GAT	2	6	43969	43974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259421
1009	NC_016791	TAC	2	6	44074	44079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259421
1010	NC_016791	CAT	2	6	44090	44095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259421
1011	NC_016791	TTTG	2	8	44116	44123	0 %	75 %	25 %	0 %	376259421
1012	NC_016791	T	6	6	44198	44203	0 %	100 %	0 %	0 %	376259421
1013	NC_016791	AT	3	6	44317	44322	50 %	50 %	0 %	0 %	376259421
1014	NC_016791	GAAG	2	8	44379	44386	50 %	0 %	50 %	0 %	376259421
1015	NC_016791	AGG	2	6	44428	44433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016791	TAAA	2	8	44437	44444	75 %	25 %	0 %	0 %	376259422
1017	NC_016791	TTA	2	6	44475	44480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259422
1018	NC_016791	AT	3	6	44482	44487	50 %	50 %	0 %	0 %	376259422
1019	NC_016791	GTT	2	6	44498	44503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259422
1020	NC_016791	AGG	2	6	44551	44556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259422
1021	NC_016791	TAT	2	6	44584	44589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259422
1022	NC_016791	A	6	6	44613	44618	100 %	0 %	0 %	0 %	376259422
1023	NC_016791	TA	3	6	44655	44660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016791	ATA	2	6	44669	44674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_016791	GAT	2	6	44694	44699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016791	TACATT	2	12	44757	44768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	376259423
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1029	NC_016791	GAA	2	6	44853	44858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259423
1030	NC_016791	TGC	2	6	44927	44932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259423
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1032	NC_016791	ATT	2	6	44984	44989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259423
1033	NC_016791	TGA	2	6	44991	44996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259423
1034	NC_016791	TGAT	2	8	45029	45036	25 %	50 %	25 %	0 %	376259423
1035	NC_016791	AGGG	2	8	45062	45069	25 %	0 %	75 %	0 %	376259423
1036	NC_016791	AG	3	6	45097	45102	50 %	0 %	50 %	0 %	376259423
1037	NC_016791	AATG	2	8	45120	45127	50 %	25 %	25 %	0 %	376259423
1038	NC_016791	CCT	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259423
1039	NC_016791	TGA	2	6	45189	45194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259423
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1050	NC_016791	ATT	2	6	45746	45751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016791	A	7	7	45805	45811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016791	ATA	2	6	45828	45833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016791	ATATT	2	10	45837	45846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016791	AT	3	6	45863	45868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016791	GGA	2	6	45878	45883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016791	TGA	2	6	45903	45908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259424
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1060	NC_016791	T	7	7	46091	46097	0 %	100 %	0 %	0 %	376259424
1061	NC_016791	GATAT	2	10	46109	46118	40 %	40 %	20 %	0 %	376259424
1062	NC_016791	CCTG	2	8	46257	46264	0 %	25 %	25 %	50 %	376259424
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1068	NC_016791	TAT	2	6	46689	46694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259424
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1074	NC_016791	T	7	7	46933	46939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016791	AAG	2	6	46944	46949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259425
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1098	NC_016791	CT	3	6	47916	47921	0 %	50 %	0 %	50 %	376259425
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1100	NC_016791	A	6	6	48003	48008	100 %	0 %	0 %	0 %	376259426
1101	NC_016791	ATC	3	9	48021	48029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259426
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1109	NC_016791	TAT	2	6	48464	48469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259426
1110	NC_016791	A	6	6	48576	48581	100 %	0 %	0 %	0 %	376259426
1111	NC_016791	ATTG	2	8	48588	48595	25 %	50 %	25 %	0 %	376259426
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1117	NC_016791	AT	3	6	48862	48867	50 %	50 %	0 %	0 %	376259426
1118	NC_016791	AGTAA	2	10	48938	48947	60 %	20 %	20 %	0 %	376259426
1119	NC_016791	TTAT	2	8	48989	48996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016791	ATA	3	9	49010	49018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016791	TTA	2	6	49019	49024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016791	TAA	2	6	49060	49065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016791	TACT	2	8	49121	49128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_016791	AGA	2	6	49169	49174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016791	ATATT	2	10	49189	49198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016791	TA	4	8	49222	49229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016791	TAAT	2	8	49283	49290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016791	AAAGGC	2	12	49291	49302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1129	NC_016791	TTTTAT	2	12	49327	49338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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