MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016791	CAT	2	6	257656	257661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259614
5502	NC_016791	TCC	2	6	257679	257684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259614
5503	NC_016791	AT	3	6	257712	257717	50 %	50 %	0 %	0 %	376259614
5504	NC_016791	TTC	2	6	257720	257725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259614
5505	NC_016791	ATA	2	6	257788	257793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259614
5506	NC_016791	TTA	2	6	257817	257822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259614
5507	NC_016791	TAA	2	6	257834	257839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259614
5508	NC_016791	GTC	2	6	257840	257845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259614
5509	NC_016791	ATATA	2	10	257925	257934	60 %	40 %	0 %	0 %	376259614
5510	NC_016791	ATA	2	6	258000	258005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016791	T	7	7	258016	258022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_016791	TA	3	6	258048	258053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016791	AAC	2	6	258064	258069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_016791	AGT	2	6	258076	258081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016791	AAT	2	6	258085	258090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016791	TAA	2	6	258111	258116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016791	AGG	2	6	258119	258124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_016791	GAA	2	6	258220	258225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259615
5519	NC_016791	TTG	2	6	258232	258237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259615
5520	NC_016791	ACG	2	6	258283	258288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259615
5521	NC_016791	AGG	2	6	258314	258319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259615
5522	NC_016791	TCTG	2	8	258414	258421	0 %	50 %	25 %	25 %	376259615
5523	NC_016791	AGA	2	6	258456	258461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259615
5524	NC_016791	GGA	2	6	258492	258497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259615
5525	NC_016791	AAT	2	6	258509	258514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259615
5526	NC_016791	AT	3	6	258592	258597	50 %	50 %	0 %	0 %	376259616
5527	NC_016791	ACT	2	6	258635	258640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259616
5528	NC_016791	A	6	6	258666	258671	100 %	0 %	0 %	0 %	376259616
5529	NC_016791	AAG	2	6	258786	258791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259616
5530	NC_016791	TGA	2	6	258918	258923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259616
5531	NC_016791	CGA	2	6	258964	258969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259616
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5533	NC_016791	CTT	2	6	259007	259012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259616
5534	NC_016791	AGA	2	6	259033	259038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259616
5535	NC_016791	TAT	2	6	259053	259058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259616
5536	NC_016791	CA	3	6	259063	259068	50 %	0 %	0 %	50 %	376259616
5537	NC_016791	ATTAC	2	10	259098	259107	40 %	40 %	0 %	20 %	376259616
5538	NC_016791	TTA	2	6	259110	259115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259616
5539	NC_016791	TTAA	2	8	259259	259266	50 %	50 %	0 %	0 %	376259616
5540	NC_016791	TAA	2	6	259399	259404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259617
5541	NC_016791	TA	3	6	259410	259415	50 %	50 %	0 %	0 %	376259617
5542	NC_016791	TAA	3	9	259447	259455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259617
5543	NC_016791	TGTATG	2	12	259494	259505	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	376259617
5544	NC_016791	TCT	2	6	259571	259576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259617
5545	NC_016791	T	6	6	259614	259619	0 %	100 %	0 %	0 %	376259617
5546	NC_016791	AAT	2	6	259634	259639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259617
5547	NC_016791	CTTT	2	8	259750	259757	0 %	75 %	0 %	25 %	376259617
5548	NC_016791	AAT	2	6	259911	259916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259617
5549	NC_016791	TTTG	2	8	259943	259950	0 %	75 %	25 %	0 %	376259617
5550	NC_016791	A	6	6	259987	259992	100 %	0 %	0 %	0 %	376259617
5551	NC_016791	AATAA	2	10	260008	260017	80 %	20 %	0 %	0 %	376259617
5552	NC_016791	AAT	2	6	260043	260048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_016791	CT	3	6	260133	260138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_016791	GAA	2	6	260193	260198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016791	A	6	6	260210	260215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_016791	TCT	3	9	260340	260348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016791	TACAA	2	10	260375	260384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5558	NC_016791	GTGC	2	8	260388	260395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5559	NC_016791	GAA	2	6	260405	260410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_016791	A	6	6	260464	260469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016791	CAT	2	6	260470	260475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_016791	AT	3	6	260485	260490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_016791	A	7	7	260494	260500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_016791	ATT	2	6	260514	260519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_016791	TAT	2	6	260557	260562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_016791	TTG	2	6	260564	260569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_016791	T	6	6	260616	260621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_016791	TAA	2	6	260633	260638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_016791	AAT	2	6	260660	260665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259618
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5571	NC_016791	TTTTA	2	10	260696	260705	20 %	80 %	0 %	0 %	376259618
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5574	NC_016791	A	6	6	260844	260849	100 %	0 %	0 %	0 %	376259618
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5581	NC_016791	TGGA	2	8	261109	261116	25 %	25 %	50 %	0 %	376259618
5582	NC_016791	GCA	2	6	261147	261152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259618
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5585	NC_016791	ATT	2	6	261413	261418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259618
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5591	NC_016791	GGT	2	6	261943	261948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_016791	A	6	6	261959	261964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_016791	GAAT	2	8	262036	262043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_016791	AAAAT	2	10	262074	262083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_016791	T	6	6	262133	262138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_016791	CAA	2	6	262208	262213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_016791	CGA	2	6	262223	262228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_016791	CTT	2	6	262270	262275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_016791	TAC	2	6	262284	262289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_016791	A	7	7	262314	262320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5602	NC_016791	AAT	2	6	262368	262373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016791	AT	3	6	262390	262395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_016791	AGT	2	6	262500	262505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259619
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5606	NC_016791	AGTA	2	8	262562	262569	50 %	25 %	25 %	0 %	376259619
5607	NC_016791	AAT	2	6	262638	262643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259619
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5609	NC_016791	TA	3	6	262731	262736	50 %	50 %	0 %	0 %	376259619
5610	NC_016791	GTC	2	6	262767	262772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259619
5611	NC_016791	C	6	6	262870	262875	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5612	NC_016791	TC	3	6	262876	262881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_016791	AT	3	6	262888	262893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_016791	T	7	7	262932	262938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_016791	A	6	6	262939	262944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_016791	TTATT	2	10	262945	262954	20 %	80 %	0 %	0 %	376259620
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5625	NC_016791	TTG	2	6	263613	263618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259620
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