MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium sp. BNL1100 chromosome

Total Repeats: 99989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016791	GAT	2	6	235435	235440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259593
5002	NC_016791	TGA	2	6	235521	235526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259593
5003	NC_016791	GAG	2	6	235559	235564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259593
5004	NC_016791	CAT	2	6	235583	235588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259593
5005	NC_016791	AAG	2	6	235603	235608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259593
5006	NC_016791	TG	3	6	235631	235636	0 %	50 %	50 %	0 %	376259593
5007	NC_016791	ATT	2	6	235694	235699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259593
5008	NC_016791	TA	3	6	235756	235761	50 %	50 %	0 %	0 %	376259593
5009	NC_016791	ATA	2	6	235823	235828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259593
5010	NC_016791	TAA	2	6	235860	235865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259593
5011	NC_016791	A	6	6	235876	235881	100 %	0 %	0 %	0 %	376259593
5012	NC_016791	TAT	2	6	236018	236023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_016791	TGAT	2	8	236071	236078	25 %	50 %	25 %	0 %	376259594
5014	NC_016791	CTC	2	6	236223	236228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376259594
5015	NC_016791	GGAA	2	8	236286	236293	50 %	0 %	50 %	0 %	376259594
5016	NC_016791	GAG	2	6	236303	236308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259594
5017	NC_016791	ATA	2	6	236344	236349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259594
5018	NC_016791	AT	3	6	236385	236390	50 %	50 %	0 %	0 %	376259594
5019	NC_016791	T	7	7	236429	236435	0 %	100 %	0 %	0 %	376259594
5020	NC_016791	TAA	2	6	236471	236476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259594
5021	NC_016791	GAA	2	6	236547	236552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259594
5022	NC_016791	TTA	2	6	236587	236592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259594
5023	NC_016791	ATT	2	6	236596	236601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259594
5024	NC_016791	TCAT	2	8	236626	236633	25 %	50 %	0 %	25 %	376259594
5025	NC_016791	AGA	2	6	236699	236704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259594
5026	NC_016791	TTA	2	6	236740	236745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259594
5027	NC_016791	AAGG	2	8	236884	236891	50 %	0 %	50 %	0 %	376259594
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5029	NC_016791	GAAT	2	8	236929	236936	50 %	25 %	25 %	0 %	376259594
5030	NC_016791	TGT	2	6	236957	236962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259594
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5032	NC_016791	TAAT	2	8	237043	237050	50 %	50 %	0 %	0 %	376259594
5033	NC_016791	ATA	2	6	237099	237104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259594
5034	NC_016791	TAA	2	6	237107	237112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259594
5035	NC_016791	CA	3	6	237119	237124	50 %	0 %	0 %	50 %	376259594
5036	NC_016791	TAT	2	6	237154	237159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_016791	GT	3	6	237227	237232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_016791	TGTA	2	8	237285	237292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016791	AT	5	10	237302	237311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016791	A	6	6	237347	237352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016791	TA	3	6	237353	237358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016791	TATG	2	8	237367	237374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_016791	AT	4	8	237376	237383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016791	ATTTAA	2	12	237393	237404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016791	A	6	6	237423	237428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016791	TAC	2	6	237462	237467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_016791	A	6	6	237489	237494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016791	AAT	2	6	237501	237506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_016791	TAC	2	6	237549	237554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_016791	T	6	6	237572	237577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016791	ACAA	2	8	237606	237613	75 %	0 %	0 %	25 %	376259595
5052	NC_016791	ACCAG	2	10	237656	237665	40 %	0 %	20 %	40 %	376259595
5053	NC_016791	GAA	2	6	237690	237695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259595
5054	NC_016791	TGG	2	6	237718	237723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259595
5055	NC_016791	GAACA	2	10	237812	237821	60 %	0 %	20 %	20 %	376259595
5056	NC_016791	AGA	2	6	237842	237847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259595
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5058	NC_016791	TGA	2	6	237878	237883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259595
5059	NC_016791	GAA	2	6	237928	237933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259595
5060	NC_016791	ATGT	2	8	237936	237943	25 %	50 %	25 %	0 %	376259595
5061	NC_016791	GTT	3	9	238017	238025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259595
5062	NC_016791	AAT	2	6	238034	238039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259595
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5064	NC_016791	AGA	2	6	238190	238195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259595
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5070	NC_016791	TGA	2	6	238448	238453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259595
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5083	NC_016791	ATAA	2	8	239328	239335	75 %	25 %	0 %	0 %	376259595
5084	NC_016791	CTG	2	6	239341	239346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259595
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5089	NC_016791	AAT	3	9	239524	239532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_016791	TA	3	6	239551	239556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_016791	A	6	6	239717	239722	100 %	0 %	0 %	0 %	376259596
5099	NC_016791	AT	3	6	239746	239751	50 %	50 %	0 %	0 %	376259596
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5102	NC_016791	AG	3	6	239812	239817	50 %	0 %	50 %	0 %	376259596
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5111	NC_016791	AAT	3	9	240052	240060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259596
5112	NC_016791	T	6	6	240128	240133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016791	AAAT	2	8	240134	240141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016791	AAT	2	6	240155	240160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_016791	ATA	2	6	240163	240168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_016791	GCA	3	9	240244	240252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259597
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5123	NC_016791	GA	3	6	240345	240350	50 %	0 %	50 %	0 %	376259597
5124	NC_016791	ATGAA	2	10	240404	240413	60 %	20 %	20 %	0 %	376259597
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5127	NC_016791	GTT	2	6	240522	240527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259597
5128	NC_016791	GCA	2	6	240709	240714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259597
5129	NC_016791	ATGA	2	8	240745	240752	50 %	25 %	25 %	0 %	376259597
5130	NC_016791	CTG	2	6	240793	240798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259597
5131	NC_016791	ATGT	2	8	240809	240816	25 %	50 %	25 %	0 %	376259597
5132	NC_016791	A	6	6	240842	240847	100 %	0 %	0 %	0 %	376259597
5133	NC_016791	GTA	2	6	240850	240855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259597
5134	NC_016791	GCT	2	6	241006	241011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259597
5135	NC_016791	CAG	2	6	241125	241130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259597
5136	NC_016791	AG	3	6	241137	241142	50 %	0 %	50 %	0 %	376259597
5137	NC_016791	A	6	6	241154	241159	100 %	0 %	0 %	0 %	376259597
5138	NC_016791	CTT	2	6	241219	241224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259597
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5140	NC_016791	A	6	6	241388	241393	100 %	0 %	0 %	0 %	376259598
5141	NC_016791	TGA	2	6	241495	241500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259598
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5143	NC_016791	GGAAA	2	10	241553	241562	60 %	0 %	40 %	0 %	376259598
5144	NC_016791	ATT	2	6	241623	241628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259599
5145	NC_016791	TA	3	6	241630	241635	50 %	50 %	0 %	0 %	376259599
5146	NC_016791	GCT	3	9	241668	241676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259599
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5148	NC_016791	TGC	2	6	241757	241762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259599
5149	NC_016791	ATTCT	2	10	241819	241828	20 %	60 %	0 %	20 %	376259599
5150	NC_016791	AT	3	6	241862	241867	50 %	50 %	0 %	0 %	376259599
5151	NC_016791	ATA	3	9	241894	241902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259599
5152	NC_016791	GAG	2	6	241911	241916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259599
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5154	NC_016791	GA	3	6	242023	242028	50 %	0 %	50 %	0 %	376259599
5155	NC_016791	GTG	2	6	242063	242068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259599
5156	NC_016791	AAAG	2	8	242092	242099	75 %	0 %	25 %	0 %	376259599
5157	NC_016791	TGA	2	6	242156	242161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259599
5158	NC_016791	AGG	2	6	242278	242283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259599
5159	NC_016791	TAA	2	6	242338	242343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259599
5160	NC_016791	TAG	2	6	242405	242410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259599
5161	NC_016791	GAA	2	6	242498	242503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259599
5162	NC_016791	GTGG	2	8	242505	242512	0 %	25 %	75 %	0 %	376259599
5163	NC_016791	ATT	2	6	242513	242518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259599
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5165	NC_016791	TGA	2	6	242654	242659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259599
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5168	NC_016791	A	7	7	242824	242830	100 %	0 %	0 %	0 %	376259600
5169	NC_016791	ATT	2	6	242849	242854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259600
5170	NC_016791	CATGAC	2	12	242857	242868	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376259600
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5172	NC_016791	CA	3	6	242923	242928	50 %	0 %	0 %	50 %	376259600
5173	NC_016791	TGA	2	6	243027	243032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259600
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5177	NC_016791	ATGGC	2	10	243106	243115	20 %	20 %	40 %	20 %	376259600
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5179	NC_016791	ATG	2	6	243160	243165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259600
5180	NC_016791	T	6	6	243174	243179	0 %	100 %	0 %	0 %	376259600
5181	NC_016791	AGC	2	6	243229	243234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259600
5182	NC_016791	TGAA	2	8	243245	243252	50 %	25 %	25 %	0 %	376259600
5183	NC_016791	ATT	2	6	243275	243280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376259600
5184	NC_016791	CAG	2	6	243300	243305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259600
5185	NC_016791	TGT	2	6	243385	243390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259600
5186	NC_016791	TGC	2	6	243466	243471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259600
5187	NC_016791	GTA	2	6	243516	243521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_016791	AAT	2	6	243532	243537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259601
5189	NC_016791	AT	3	6	243659	243664	50 %	50 %	0 %	0 %	376259601
5190	NC_016791	AT	3	6	243732	243737	50 %	50 %	0 %	0 %	376259601
5191	NC_016791	GACG	2	8	243751	243758	25 %	0 %	50 %	25 %	376259601
5192	NC_016791	ACTT	2	8	243841	243848	25 %	50 %	0 %	25 %	376259601
5193	NC_016791	TGCAA	2	10	243901	243910	40 %	20 %	20 %	20 %	376259601
5194	NC_016791	AGG	2	6	243917	243922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259601
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5196	NC_016791	CTG	2	6	244015	244020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259601
5197	NC_016791	GAAA	2	8	244022	244029	75 %	0 %	25 %	0 %	376259601
5198	NC_016791	CTT	2	6	244127	244132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259601
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5201	NC_016791	GCTG	2	8	244204	244211	0 %	25 %	50 %	25 %	376259601
5202	NC_016791	TCAC	2	8	244224	244231	25 %	25 %	0 %	50 %	376259601
5203	NC_016791	TGA	2	6	244263	244268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259601
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5207	NC_016791	GGA	2	6	244611	244616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376259601
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5209	NC_016791	TGG	2	6	244651	244656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376259601
5210	NC_016791	AAGG	2	8	244669	244676	50 %	0 %	50 %	0 %	376259601
5211	NC_016791	TTG	2	6	244817	244822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259601
5212	NC_016791	AG	3	6	244826	244831	50 %	0 %	50 %	0 %	376259601
5213	NC_016791	TGA	3	9	244839	244847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259601
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5216	NC_016791	CAGC	2	8	245009	245016	25 %	0 %	25 %	50 %	376259602
5217	NC_016791	CATA	2	8	245059	245066	50 %	25 %	0 %	25 %	376259602
5218	NC_016791	AT	3	6	245135	245140	50 %	50 %	0 %	0 %	376259602
5219	NC_016791	GAA	2	6	245307	245312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376259602
5220	NC_016791	ATG	2	6	245346	245351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259602
5221	NC_016791	GCA	2	6	245372	245377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376259602
5222	NC_016791	TGC	2	6	245385	245390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259602
5223	NC_016791	GGAA	2	8	245403	245410	50 %	0 %	50 %	0 %	376259602
5224	NC_016791	CAT	2	6	245417	245422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376259602
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5229	NC_016791	T	6	6	245679	245684	0 %	100 %	0 %	0 %	376259602
5230	NC_016791	AT	3	6	245685	245690	50 %	50 %	0 %	0 %	376259602
5231	NC_016791	TGC	2	6	245760	245765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259602
5232	NC_016791	T	6	6	245822	245827	0 %	100 %	0 %	0 %	376259602
5233	NC_016791	T	6	6	245844	245849	0 %	100 %	0 %	0 %	376259602
5234	NC_016791	TAA	2	6	245900	245905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259602
5235	NC_016791	AAT	2	6	245953	245958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376259602
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5237	NC_016791	TCTG	2	8	246116	246123	0 %	50 %	25 %	25 %	376259602
5238	NC_016791	TTC	2	6	246129	246134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259602
5239	NC_016791	T	6	6	246206	246211	0 %	100 %	0 %	0 %	376259602
5240	NC_016791	CTG	2	6	246250	246255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376259602
5241	NC_016791	CCA	2	6	246283	246288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376259602
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5243	NC_016791	G	6	6	246380	246385	0 %	0 %	100 %	0 %	376259602
5244	NC_016791	CCG	2	6	246412	246417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376259602
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5246	NC_016791	ATG	2	6	246520	246525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259602
5247	NC_016791	TAG	2	6	246540	246545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376259602
5248	NC_016791	TGT	2	6	246557	246562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376259602
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5250	NC_016791	TCT	2	6	246619	246624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376259602
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