MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 1390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016790	CCGTG	2	10	3238	3247	0 %	20 %	40 %	40 %	376256020
2	NC_016790	AAAGA	2	10	3706	3715	80 %	0 %	20 %	0 %	376256021
3	NC_016790	CCACC	2	10	6198	6207	20 %	0 %	0 %	80 %	376256023
4	NC_016790	CGCAC	2	10	10515	10524	20 %	0 %	20 %	60 %	376256027
5	NC_016790	GAGTC	2	10	14059	14068	20 %	20 %	40 %	20 %	376256030
6	NC_016790	TCGAC	2	10	14701	14710	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016790	CCAGG	2	10	16526	16535	20 %	0 %	40 %	40 %	376256032
8	NC_016790	TGTGA	2	10	19396	19405	20 %	40 %	40 %	0 %	376256034
9	NC_016790	GATTC	2	10	23090	23099	20 %	40 %	20 %	20 %	376256038
10	NC_016790	TGCGC	2	10	23404	23413	0 %	20 %	40 %	40 %	376256039
11	NC_016790	GCGCT	2	10	24431	24440	0 %	20 %	40 %	40 %	376256040
12	NC_016790	AGCAC	2	10	30193	30202	40 %	0 %	20 %	40 %	376256046
13	NC_016790	TGGGG	2	10	32177	32186	0 %	20 %	80 %	0 %	376256048
14	NC_016790	CACCT	2	10	32988	32997	20 %	20 %	0 %	60 %	376256048
15	NC_016790	AATTG	2	10	35058	35067	40 %	40 %	20 %	0 %	376256051
16	NC_016790	CACGA	2	10	35824	35833	40 %	0 %	20 %	40 %	376256051
17	NC_016790	AGAAA	2	10	37659	37668	80 %	0 %	20 %	0 %	376256051
18	NC_016790	CATCA	2	10	38127	38136	40 %	20 %	0 %	40 %	376256052
19	NC_016790	CGGCA	2	10	38324	38333	20 %	0 %	40 %	40 %	376256052
20	NC_016790	GGTGT	2	10	38974	38983	0 %	40 %	60 %	0 %	376256053
21	NC_016790	CCCAG	2	10	39426	39435	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016790	CGGTG	2	10	40726	40735	0 %	20 %	60 %	20 %	376256056
23	NC_016790	GTGCT	2	10	42169	42178	0 %	40 %	40 %	20 %	376256059
24	NC_016790	GTTGC	2	10	42853	42862	0 %	40 %	40 %	20 %	376256059
25	NC_016790	GGGTT	2	10	42917	42926	0 %	40 %	60 %	0 %	376256059
26	NC_016790	TGGCG	2	10	44656	44665	0 %	20 %	60 %	20 %	376256060
27	NC_016790	GCGCA	2	10	44931	44940	20 %	0 %	40 %	40 %	376256060
28	NC_016790	CGCAG	2	10	47448	47457	20 %	0 %	40 %	40 %	376256062
29	NC_016790	GCCAC	2	10	47607	47616	20 %	0 %	20 %	60 %	376256062
30	NC_016790	TGAGG	2	10	49897	49906	20 %	20 %	60 %	0 %	376256063
31	NC_016790	TACGA	2	10	50498	50507	40 %	20 %	20 %	20 %	376256065
32	NC_016790	TTTTG	2	10	51728	51737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016790	GACTA	2	10	52968	52977	40 %	20 %	20 %	20 %	376256067
34	NC_016790	TTTGA	2	10	53073	53082	20 %	60 %	20 %	0 %	376256067
35	NC_016790	TTGTT	2	10	53544	53553	0 %	80 %	20 %	0 %	376256069
36	NC_016790	AAAGG	2	10	53867	53876	60 %	0 %	40 %	0 %	376256070
37	NC_016790	CAAGC	2	10	53961	53970	40 %	0 %	20 %	40 %	376256070
38	NC_016790	TGCCG	2	10	54596	54605	0 %	20 %	40 %	40 %	376256071
39	NC_016790	TCACC	2	10	56330	56339	20 %	20 %	0 %	60 %	376256072
40	NC_016790	CAAAC	2	10	56355	56364	60 %	0 %	0 %	40 %	376256072
41	NC_016790	AGGAG	2	10	59781	59790	40 %	0 %	60 %	0 %	376256077
42	NC_016790	ACCAA	2	10	59794	59803	60 %	0 %	0 %	40 %	376256077
43	NC_016790	CGGTG	2	10	60998	61007	0 %	20 %	60 %	20 %	376256079
44	NC_016790	GACTG	2	10	63618	63627	20 %	20 %	40 %	20 %	376256083
45	NC_016790	TGCGG	2	10	63738	63747	0 %	20 %	60 %	20 %	376256083
46	NC_016790	GGAGT	2	10	65773	65782	20 %	20 %	60 %	0 %	376256086
47	NC_016790	GCCTA	2	10	68697	68706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016790	GCGCT	2	10	70185	70194	0 %	20 %	40 %	40 %	376256090
49	NC_016790	CGTTC	2	10	70936	70945	0 %	40 %	20 %	40 %	376256090
50	NC_016790	CCAAG	2	10	72871	72880	40 %	0 %	20 %	40 %	376256092
51	NC_016790	GCGTG	2	10	73970	73979	0 %	20 %	60 %	20 %	376256094
52	NC_016790	CTCAA	2	10	75227	75236	40 %	20 %	0 %	40 %	376256095
53	NC_016790	GCCCA	2	10	75428	75437	20 %	0 %	20 %	60 %	376256095
54	NC_016790	GCCGT	2	10	78610	78619	0 %	20 %	40 %	40 %	376256099
55	NC_016790	GAGCT	2	10	79319	79328	20 %	20 %	40 %	20 %	376256100
56	NC_016790	CATGA	2	10	80854	80863	40 %	20 %	20 %	20 %	376256100
57	NC_016790	CCGCA	2	10	81254	81263	20 %	0 %	20 %	60 %	376256101
58	NC_016790	AGCCA	2	10	81833	81842	40 %	0 %	20 %	40 %	376256102
59	NC_016790	GGCCA	2	10	88169	88178	20 %	0 %	40 %	40 %	376256107
60	NC_016790	TCCAC	2	10	88339	88348	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_016790	TCCGC	2	10	90944	90953	0 %	20 %	20 %	60 %	376256111
62	NC_016790	GTGGG	2	10	94167	94176	0 %	20 %	80 %	0 %	376256114
63	NC_016790	TGCAC	2	10	96586	96595	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016790	ACACC	2	10	96652	96661	40 %	0 %	0 %	60 %	376256118
65	NC_016790	TCGAA	2	10	98596	98605	40 %	20 %	20 %	20 %	376256120
66	NC_016790	GATCT	2	10	98857	98866	20 %	40 %	20 %	20 %	376256120
67	NC_016790	GTTTC	2	10	99600	99609	0 %	60 %	20 %	20 %	376256121
68	NC_016790	ACGGT	2	10	99960	99969	20 %	20 %	40 %	20 %	376256121
69	NC_016790	TGACC	2	10	101698	101707	20 %	20 %	20 %	40 %	376256125
70	NC_016790	CTGGG	2	10	101750	101759	0 %	20 %	60 %	20 %	376256125
71	NC_016790	GGCGG	2	10	103378	103387	0 %	0 %	80 %	20 %	376256126
72	NC_016790	CCACG	2	10	106361	106370	20 %	0 %	20 %	60 %	376256128
73	NC_016790	CCAGT	2	10	110025	110034	20 %	20 %	20 %	40 %	376256133
74	NC_016790	ACCAG	2	10	112316	112325	40 %	0 %	20 %	40 %	376256133
75	NC_016790	CCTGG	2	10	115467	115476	0 %	20 %	40 %	40 %	376256135
76	NC_016790	GCTGT	2	10	119154	119163	0 %	40 %	40 %	20 %	376256140
77	NC_016790	TCTGG	2	10	119226	119235	0 %	40 %	40 %	20 %	376256140
78	NC_016790	TTAGC	2	10	120489	120498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016790	TGGTC	2	10	120848	120857	0 %	40 %	40 %	20 %	376256142
80	NC_016790	GTTTG	2	10	122337	122346	0 %	60 %	40 %	0 %	376256143
81	NC_016790	GTGAT	2	10	122479	122488	20 %	40 %	40 %	0 %	376256144
82	NC_016790	GTTCG	2	10	127571	127580	0 %	40 %	40 %	20 %	376256149
83	NC_016790	CTGAT	2	10	128134	128143	20 %	40 %	20 %	20 %	376256149
84	NC_016790	GCGTG	2	10	128392	128401	0 %	20 %	60 %	20 %	376256150
85	NC_016790	GATTC	2	10	132253	132262	20 %	40 %	20 %	20 %	376256152
86	NC_016790	CAATT	2	10	135341	135350	40 %	40 %	0 %	20 %	376256154
87	NC_016790	TGCGG	2	10	135527	135536	0 %	20 %	60 %	20 %	376256154
88	NC_016790	ACTCC	2	10	135733	135742	20 %	20 %	0 %	60 %	376256154
89	NC_016790	TGGGG	2	10	135891	135900	0 %	20 %	80 %	0 %	376256154
90	NC_016790	GCGGG	2	10	137711	137720	0 %	0 %	80 %	20 %	376256156
91	NC_016790	TGATC	2	10	138125	138134	20 %	40 %	20 %	20 %	376256157
92	NC_016790	GAAGA	2	10	138802	138811	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016790	AGATC	2	10	141914	141923	40 %	20 %	20 %	20 %	376256159
94	NC_016790	TGGCG	2	10	143497	143506	0 %	20 %	60 %	20 %	376256161
95	NC_016790	CAGTT	2	10	144432	144441	20 %	40 %	20 %	20 %	376256161
96	NC_016790	GTGGA	2	10	144739	144748	20 %	20 %	60 %	0 %	376256161
97	NC_016790	GGCTG	2	10	145454	145463	0 %	20 %	60 %	20 %	376256161
98	NC_016790	ATTTT	2	10	146747	146756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016790	TATTT	2	10	146905	146914	20 %	80 %	0 %	0 %	376256162
100	NC_016790	TGGAA	2	10	147307	147316	40 %	20 %	40 %	0 %	376256162
101	NC_016790	GGCTG	2	10	147993	148002	0 %	20 %	60 %	20 %	376256162
102	NC_016790	ATCTG	2	10	151429	151438	20 %	40 %	20 %	20 %	376256165
103	NC_016790	ACCAC	2	10	153382	153391	40 %	0 %	0 %	60 %	376256168
104	NC_016790	CATTC	2	10	155275	155284	20 %	40 %	0 %	40 %	376256169
105	NC_016790	TGCGG	2	10	155389	155398	0 %	20 %	60 %	20 %	376256169
106	NC_016790	TGGGT	2	10	157751	157760	0 %	40 %	60 %	0 %	376256170
107	NC_016790	GCGCT	2	10	158665	158674	0 %	20 %	40 %	40 %	376256171
108	NC_016790	AGCCA	2	10	166772	166781	40 %	0 %	20 %	40 %	376256178
109	NC_016790	GCAGA	2	10	167840	167849	40 %	0 %	40 %	20 %	376256179
110	NC_016790	TTGCC	2	10	170697	170706	0 %	40 %	20 %	40 %	376256183
111	NC_016790	GTTGC	2	10	171114	171123	0 %	40 %	40 %	20 %	376256183
112	NC_016790	CCGCC	2	10	172372	172381	0 %	0 %	20 %	80 %	376256184
113	NC_016790	AGAAA	2	10	176802	176811	80 %	0 %	20 %	0 %	376256187
114	NC_016790	TTGGG	2	10	177809	177818	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016790	AGCCA	2	10	178107	178116	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016790	ACCCC	2	10	181464	181473	20 %	0 %	0 %	80 %	376256191
117	NC_016790	GGTGC	2	10	182066	182075	0 %	20 %	60 %	20 %	376256191
118	NC_016790	CCACG	2	10	183836	183845	20 %	0 %	20 %	60 %	376256193
119	NC_016790	GCCCA	2	10	184352	184361	20 %	0 %	20 %	60 %	376256193
120	NC_016790	CGAGG	2	10	184618	184627	20 %	0 %	60 %	20 %	376256193
121	NC_016790	GCACC	2	10	188565	188574	20 %	0 %	20 %	60 %	376256196
122	NC_016790	AAGAC	2	10	189174	189183	60 %	0 %	20 %	20 %	376256196
123	NC_016790	CGCTG	2	10	199005	199014	0 %	20 %	40 %	40 %	376256204
124	NC_016790	ACTGA	2	10	202304	202313	40 %	20 %	20 %	20 %	376256209
125	NC_016790	GCCAC	2	10	202332	202341	20 %	0 %	20 %	60 %	376256209
126	NC_016790	CGCCA	2	10	202806	202815	20 %	0 %	20 %	60 %	376256210
127	NC_016790	CAAAC	2	10	203512	203521	60 %	0 %	0 %	40 %	376256211
128	NC_016790	CACAA	2	10	206122	206131	60 %	0 %	0 %	40 %	376256212
129	NC_016790	AAACC	2	10	206821	206830	60 %	0 %	0 %	40 %	376256212
130	NC_016790	TGACC	2	10	211573	211582	20 %	20 %	20 %	40 %	376256216
131	NC_016790	GTGCC	2	10	212977	212986	0 %	20 %	40 %	40 %	376256217
132	NC_016790	GATCA	2	10	214510	214519	40 %	20 %	20 %	20 %	376256220
133	NC_016790	GCGCT	2	10	214633	214642	0 %	20 %	40 %	40 %	376256220
134	NC_016790	GACCT	2	10	215918	215927	20 %	20 %	20 %	40 %	376256223
135	NC_016790	TGGTC	2	10	217789	217798	0 %	40 %	40 %	20 %	376256225
136	NC_016790	CACGA	2	10	217970	217979	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016790	GGCGA	2	10	219439	219448	20 %	0 %	60 %	20 %	376256227
138	NC_016790	GGCGC	2	10	219631	219640	0 %	0 %	60 %	40 %	376256227
139	NC_016790	AGGGG	2	10	220078	220087	20 %	0 %	80 %	0 %	376256227
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143	NC_016790	CGCAG	2	10	235095	235104	20 %	0 %	40 %	40 %	376256243
144	NC_016790	GGTGA	2	10	236725	236734	20 %	20 %	60 %	0 %	376256244
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148	NC_016790	GAAAA	2	10	243415	243424	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016790	CACCG	2	10	243790	243799	20 %	0 %	20 %	60 %	376256248
150	NC_016790	GTTGG	2	10	244291	244300	0 %	40 %	60 %	0 %	376256248
151	NC_016790	GCCAC	2	10	244973	244982	20 %	0 %	20 %	60 %	376256248
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159	NC_016790	TTTGG	2	10	252741	252750	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016790	CTTTT	2	10	255099	255108	0 %	80 %	0 %	20 %	376256262
162	NC_016790	CAATC	2	10	256301	256310	40 %	20 %	0 %	40 %	376256264
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164	NC_016790	TCGCT	2	10	259820	259829	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_016790	CATCG	2	10	260472	260481	20 %	20 %	20 %	40 %	376256269
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169	NC_016790	CAAGC	2	10	263419	263428	40 %	0 %	20 %	40 %	376256269
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235	NC_016790	TTCGA	2	10	361934	361943	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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251	NC_016790	GGCAA	2	10	397789	397798	40 %	0 %	40 %	20 %	376256402
252	NC_016790	TTATG	2	10	399013	399022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_016790	TCATC	2	10	404673	404682	20 %	40 %	0 %	40 %	376256408
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262	NC_016790	CCATT	2	10	422953	422962	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
263	NC_016790	ACGCG	2	10	424041	424050	20 %	0 %	40 %	40 %	376256422
264	NC_016790	GGCTG	2	10	424156	424165	0 %	20 %	60 %	20 %	376256422
265	NC_016790	GGGGT	2	10	430861	430870	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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