MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 4934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016790	CCGC	2	8	1041	1048	0 %	0 %	25 %	75 %	376256019
2	NC_016790	GCAG	2	8	1341	1348	25 %	0 %	50 %	25 %	376256019
3	NC_016790	AGCG	2	8	2131	2138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016790	GATC	2	8	2264	2271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016790	GCCA	2	8	2491	2498	25 %	0 %	25 %	50 %	376256020
6	NC_016790	AAGC	2	8	3400	3407	50 %	0 %	25 %	25 %	376256020
7	NC_016790	ACCT	2	8	3444	3451	25 %	25 %	0 %	50 %	376256020
8	NC_016790	TCAT	2	8	4117	4124	25 %	50 %	0 %	25 %	376256021
9	NC_016790	TGCT	2	8	4282	4289	0 %	50 %	25 %	25 %	376256021
10	NC_016790	GGTG	2	8	4583	4590	0 %	25 %	75 %	0 %	376256021
11	NC_016790	CTTG	2	8	7152	7159	0 %	50 %	25 %	25 %	376256023
12	NC_016790	GGCG	2	8	8491	8498	0 %	0 %	75 %	25 %	376256026
13	NC_016790	CGCA	2	8	9876	9883	25 %	0 %	25 %	50 %	376256027
14	NC_016790	GCCC	2	8	10158	10165	0 %	0 %	25 %	75 %	376256027
15	NC_016790	CGTG	2	8	10184	10191	0 %	25 %	50 %	25 %	376256027
16	NC_016790	CCAC	2	8	10435	10442	25 %	0 %	0 %	75 %	376256027
17	NC_016790	GCAA	2	8	11275	11282	50 %	0 %	25 %	25 %	376256027
18	NC_016790	AGCC	2	8	13264	13271	25 %	0 %	25 %	50 %	376256030
19	NC_016790	CCAT	2	8	13724	13731	25 %	25 %	0 %	50 %	376256030
20	NC_016790	CAGG	2	8	14680	14687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016790	CCGG	2	8	14968	14975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016790	ACCG	2	8	15174	15181	25 %	0 %	25 %	50 %	376256031
23	NC_016790	CGGT	2	8	15512	15519	0 %	25 %	50 %	25 %	376256031
24	NC_016790	GGCG	2	8	15767	15774	0 %	0 %	75 %	25 %	376256032
25	NC_016790	GGGT	2	8	15935	15942	0 %	25 %	75 %	0 %	376256032
26	NC_016790	GCCC	2	8	16952	16959	0 %	0 %	25 %	75 %	376256032
27	NC_016790	ACCC	2	8	17330	17337	25 %	0 %	0 %	75 %	376256033
28	NC_016790	GCAG	2	8	17980	17987	25 %	0 %	50 %	25 %	376256033
29	NC_016790	GCCA	2	8	18107	18114	25 %	0 %	25 %	50 %	376256033
30	NC_016790	ACCT	2	8	18888	18895	25 %	25 %	0 %	50 %	376256033
31	NC_016790	GAAT	2	8	19111	19118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016790	TTTG	2	8	19226	19233	0 %	75 %	25 %	0 %	376256034
33	NC_016790	GCGT	2	8	19815	19822	0 %	25 %	50 %	25 %	376256035
34	NC_016790	GCAC	2	8	20339	20346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016790	GAGG	2	8	20452	20459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016790	ATTG	2	8	22005	22012	25 %	50 %	25 %	0 %	376256037
37	NC_016790	TTGG	2	8	22199	22206	0 %	50 %	50 %	0 %	376256037
38	NC_016790	TTCG	2	8	22452	22459	0 %	50 %	25 %	25 %	376256038
39	NC_016790	TGGG	2	8	22628	22635	0 %	25 %	75 %	0 %	376256038
40	NC_016790	GGTG	2	8	22966	22973	0 %	25 %	75 %	0 %	376256038
41	NC_016790	TGTT	2	8	23037	23044	0 %	75 %	25 %	0 %	376256038
42	NC_016790	CTCA	2	8	24050	24057	25 %	25 %	0 %	50 %	376256039
43	NC_016790	TGGC	2	8	24063	24070	0 %	25 %	50 %	25 %	376256039
44	NC_016790	TAAC	2	8	25715	25722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016790	TATC	2	8	25907	25914	25 %	50 %	0 %	25 %	376256043
46	NC_016790	GGTG	2	8	26207	26214	0 %	25 %	75 %	0 %	376256043
47	NC_016790	ATGG	2	8	26331	26338	25 %	25 %	50 %	0 %	376256043
48	NC_016790	ATAA	2	8	26521	26528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016790	AGAT	2	8	27143	27150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016790	AGTG	2	8	27403	27410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016790	GAAG	2	8	27493	27500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016790	ATCC	2	8	27575	27582	25 %	25 %	0 %	50 %	376256044
53	NC_016790	TCCT	2	8	28484	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	376256044
54	NC_016790	CGTG	2	8	28976	28983	0 %	25 %	50 %	25 %	376256044
55	NC_016790	CAAC	2	8	31145	31152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016790	CCCA	2	8	32550	32557	25 %	0 %	0 %	75 %	376256048
57	NC_016790	CTAC	2	8	32680	32687	25 %	25 %	0 %	50 %	376256048
58	NC_016790	CCCA	2	8	33190	33197	25 %	0 %	0 %	75 %	376256049
59	NC_016790	CCAT	2	8	33243	33250	25 %	25 %	0 %	50 %	376256049
60	NC_016790	AACA	2	8	33457	33464	75 %	0 %	0 %	25 %	376256049
61	NC_016790	CGCA	2	8	33493	33500	25 %	0 %	25 %	50 %	376256049
62	NC_016790	CCAC	2	8	34019	34026	25 %	0 %	0 %	75 %	376256050
63	NC_016790	AATG	2	8	34096	34103	50 %	25 %	25 %	0 %	376256050
64	NC_016790	GGAA	2	8	34522	34529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016790	TAAT	2	8	34613	34620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016790	TTAA	2	8	34682	34689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016790	GCTA	2	8	35119	35126	25 %	25 %	25 %	25 %	376256051
68	NC_016790	AATC	2	8	36583	36590	50 %	25 %	0 %	25 %	376256051
69	NC_016790	ATGG	2	8	36801	36808	25 %	25 %	50 %	0 %	376256051
70	NC_016790	GAAC	2	8	38304	38311	50 %	0 %	25 %	25 %	376256052
71	NC_016790	GTTC	2	8	38473	38480	0 %	50 %	25 %	25 %	376256052
72	NC_016790	TGCG	2	8	38633	38640	0 %	25 %	50 %	25 %	376256052
73	NC_016790	TCCG	2	8	38732	38739	0 %	25 %	25 %	50 %	376256052
74	NC_016790	AGCA	2	8	39027	39034	50 %	0 %	25 %	25 %	376256053
75	NC_016790	ATTA	2	8	39139	39146	50 %	50 %	0 %	0 %	376256053
76	NC_016790	CACC	2	8	39628	39635	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_016790	ACCT	2	8	40054	40061	25 %	25 %	0 %	50 %	376256054
78	NC_016790	AAGG	2	8	41012	41019	50 %	0 %	50 %	0 %	376256056
79	NC_016790	GCCG	2	8	41039	41046	0 %	0 %	50 %	50 %	376256056
80	NC_016790	AAAT	2	8	41260	41267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016790	TTGT	2	8	41639	41646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016790	CTAA	2	8	41732	41739	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016790	GGTC	2	8	42285	42292	0 %	25 %	50 %	25 %	376256059
84	NC_016790	CCAG	2	8	42346	42353	25 %	0 %	25 %	50 %	376256059
85	NC_016790	CACG	2	8	42723	42730	25 %	0 %	25 %	50 %	376256059
86	NC_016790	GGCG	2	8	44851	44858	0 %	0 %	75 %	25 %	376256060
87	NC_016790	GATG	2	8	45293	45300	25 %	25 %	50 %	0 %	376256060
88	NC_016790	CTGC	2	8	45317	45324	0 %	25 %	25 %	50 %	376256060
89	NC_016790	CAAG	2	8	48121	48128	50 %	0 %	25 %	25 %	376256062
90	NC_016790	ATTT	2	8	48528	48535	25 %	75 %	0 %	0 %	376256062
91	NC_016790	ACCA	2	8	49012	49019	50 %	0 %	0 %	50 %	376256063
92	NC_016790	CACC	2	8	49213	49220	25 %	0 %	0 %	75 %	376256063
93	NC_016790	CGAA	2	8	49322	49329	50 %	0 %	25 %	25 %	376256063
94	NC_016790	CAAC	2	8	49339	49346	50 %	0 %	0 %	50 %	376256063
95	NC_016790	ATCC	2	8	49420	49427	25 %	25 %	0 %	50 %	376256063
96	NC_016790	ATCA	2	8	49460	49467	50 %	25 %	0 %	25 %	376256063
97	NC_016790	CAAC	2	8	49989	49996	50 %	0 %	0 %	50 %	376256064
98	NC_016790	TCCG	2	8	50847	50854	0 %	25 %	25 %	50 %	376256065
99	NC_016790	TAGT	2	8	51870	51877	25 %	50 %	25 %	0 %	376256066
100	NC_016790	GAGG	2	8	52034	52041	25 %	0 %	75 %	0 %	376256066
101	NC_016790	GTAC	2	8	52278	52285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016790	TATT	2	8	52572	52579	25 %	75 %	0 %	0 %	376256067
103	NC_016790	ATGT	2	8	52639	52646	25 %	50 %	25 %	0 %	376256067
104	NC_016790	CATG	2	8	52899	52906	25 %	25 %	25 %	25 %	376256067
105	NC_016790	TGAG	2	8	53105	53112	25 %	25 %	50 %	0 %	376256068
106	NC_016790	TAGG	2	8	53163	53170	25 %	25 %	50 %	0 %	376256068
107	NC_016790	GCAT	2	8	54640	54647	25 %	25 %	25 %	25 %	376256071
108	NC_016790	TGGG	2	8	54901	54908	0 %	25 %	75 %	0 %	376256071
109	NC_016790	TTGA	2	8	55896	55903	25 %	50 %	25 %	0 %	376256072
110	NC_016790	ACAA	2	8	56583	56590	75 %	0 %	0 %	25 %	376256073
111	NC_016790	CCAT	2	8	57027	57034	25 %	25 %	0 %	50 %	376256073
112	NC_016790	CGTT	2	8	57305	57312	0 %	50 %	25 %	25 %	376256074
113	NC_016790	ATAG	2	8	58275	58282	50 %	25 %	25 %	0 %	376256074
114	NC_016790	CACC	2	8	58616	58623	25 %	0 %	0 %	75 %	376256075
115	NC_016790	TAAT	2	8	58884	58891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016790	AAAT	2	8	59280	59287	75 %	25 %	0 %	0 %	376256077
117	NC_016790	CCAC	2	8	59363	59370	25 %	0 %	0 %	75 %	376256077
118	NC_016790	GCCA	2	8	59488	59495	25 %	0 %	25 %	50 %	376256077
119	NC_016790	AGCC	2	8	59557	59564	25 %	0 %	25 %	50 %	376256077
120	NC_016790	CCGG	2	8	59663	59670	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
121	NC_016790	ACCC	2	8	60319	60326	25 %	0 %	0 %	75 %	376256078
122	NC_016790	GCAT	2	8	60440	60447	25 %	25 %	25 %	25 %	376256078
123	NC_016790	AGCA	2	8	61668	61675	50 %	0 %	25 %	25 %	376256080
124	NC_016790	GCTG	2	8	61768	61775	0 %	25 %	50 %	25 %	376256080
125	NC_016790	GAAC	2	8	62196	62203	50 %	0 %	25 %	25 %	376256081
126	NC_016790	CTGC	2	8	62323	62330	0 %	25 %	25 %	50 %	376256081
127	NC_016790	ACTC	2	8	64229	64236	25 %	25 %	0 %	50 %	376256083
128	NC_016790	ACCT	2	8	64254	64261	25 %	25 %	0 %	50 %	376256083
129	NC_016790	TGCT	2	8	64813	64820	0 %	50 %	25 %	25 %	376256084
130	NC_016790	CTTC	2	8	65042	65049	0 %	50 %	0 %	50 %	376256084
131	NC_016790	TGAC	2	8	67120	67127	25 %	25 %	25 %	25 %	376256087
132	NC_016790	GCCT	2	8	68080	68087	0 %	25 %	25 %	50 %	376256087
133	NC_016790	ATTG	2	8	68524	68531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016790	TGCA	2	8	68827	68834	25 %	25 %	25 %	25 %	376256089
135	NC_016790	TTGG	2	8	70769	70776	0 %	50 %	50 %	0 %	376256090
136	NC_016790	CTGC	2	8	71898	71905	0 %	25 %	25 %	50 %	376256092
137	NC_016790	GCAG	2	8	71939	71946	25 %	0 %	50 %	25 %	376256092
138	NC_016790	GGGA	2	8	72075	72082	25 %	0 %	75 %	0 %	376256092
139	NC_016790	GCGG	2	8	72818	72825	0 %	0 %	75 %	25 %	376256092
140	NC_016790	GTAA	2	8	73739	73746	50 %	25 %	25 %	0 %	376256093
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142	NC_016790	CACC	2	8	75246	75253	25 %	0 %	0 %	75 %	376256095
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