MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016790	CGCT	2	8	160599	160606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_016790	CAA	2	6	160728	160733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256173
3503	NC_016790	GAT	2	6	160760	160765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256173
3504	NC_016790	CAA	2	6	160776	160781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256173
3505	NC_016790	CATGCA	2	12	160796	160807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376256173
3506	NC_016790	ACC	2	6	160813	160818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256173
3507	NC_016790	GCC	2	6	160897	160902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256173
3508	NC_016790	GTC	3	9	160938	160946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256173
3509	NC_016790	TCT	2	6	160970	160975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256173
3510	NC_016790	ATC	2	6	160998	161003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256173
3511	NC_016790	CAA	2	6	161037	161042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256173
3512	NC_016790	CGT	2	6	161052	161057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256173
3513	NC_016790	AC	3	6	161072	161077	50 %	0 %	0 %	50 %	376256173
3514	NC_016790	CAA	2	6	161084	161089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256173
3515	NC_016790	ACC	2	6	161118	161123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3516	NC_016790	CAG	2	6	161143	161148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3517	NC_016790	CAT	2	6	161170	161175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256174
3518	NC_016790	GTGA	2	8	161189	161196	25 %	25 %	50 %	0 %	376256174
3519	NC_016790	TCA	2	6	161247	161252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256174
3520	NC_016790	CGGAAC	2	12	161253	161264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3521	NC_016790	CCT	2	6	161281	161286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256174
3522	NC_016790	CCA	2	6	161290	161295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3523	NC_016790	CAC	2	6	161345	161350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3524	NC_016790	ACG	3	9	161357	161365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3525	NC_016790	CAC	2	6	161366	161371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3526	NC_016790	TCG	2	6	161386	161391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3527	NC_016790	TCA	2	6	161433	161438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256174
3528	NC_016790	CCA	2	6	161503	161508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3529	NC_016790	CCGC	2	8	161613	161620	0 %	0 %	25 %	75 %	376256174
3530	NC_016790	GCA	2	6	161664	161669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3531	NC_016790	ACCTGA	2	12	161697	161708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376256174
3532	NC_016790	CAA	2	6	161720	161725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256174
3533	NC_016790	CAC	2	6	161782	161787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256174
3534	NC_016790	CTC	2	6	161807	161812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256174
3535	NC_016790	TAA	2	6	161946	161951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256174
3536	NC_016790	CAG	2	6	162013	162018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3537	NC_016790	CAA	2	6	162041	162046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256174
3538	NC_016790	CAG	2	6	162064	162069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256174
3539	NC_016790	ACC	2	6	162083	162088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
3540	NC_016790	CCG	2	6	162098	162103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256175
3541	NC_016790	ACG	3	9	162132	162140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256175
3542	NC_016790	AAC	3	9	162155	162163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256175
3543	NC_016790	CCA	2	6	162168	162173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
3544	NC_016790	CCG	2	6	162198	162203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256175
3545	NC_016790	AC	3	6	162214	162219	50 %	0 %	0 %	50 %	376256175
3546	NC_016790	CTC	2	6	162232	162237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256175
3547	NC_016790	CCA	2	6	162243	162248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
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3549	NC_016790	CAGC	2	8	162324	162331	25 %	0 %	25 %	50 %	376256175
3550	NC_016790	CAC	2	6	162351	162356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
3551	NC_016790	TCG	2	6	162381	162386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256175
3552	NC_016790	CCA	2	6	162414	162419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
3553	NC_016790	CAG	2	6	162438	162443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256175
3554	NC_016790	CAA	2	6	162501	162506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256175
3555	NC_016790	ATT	2	6	162565	162570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256175
3556	NC_016790	CCG	2	6	162615	162620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256175
3557	NC_016790	GCA	3	9	162629	162637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256175
3558	NC_016790	CCG	3	9	162678	162686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256175
3559	NC_016790	CCA	2	6	162807	162812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256175
3560	NC_016790	TG	3	6	162841	162846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_016790	CCT	2	6	162899	162904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_016790	GAG	2	6	162984	162989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016790	AAAACA	2	12	163061	163072	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3564	NC_016790	GGA	2	6	163111	163116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_016790	TCC	2	6	163190	163195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_016790	AC	3	6	163235	163240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_016790	GTGG	2	8	163279	163286	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016790	TGG	3	9	163284	163292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016790	GCA	2	6	163377	163382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_016790	T	6	6	163425	163430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_016790	GGT	2	6	163440	163445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016790	CGT	2	6	163501	163506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016790	ATG	2	6	163562	163567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256176
3574	NC_016790	AGC	2	6	163670	163675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256176
3575	NC_016790	CTG	2	6	163693	163698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256176
3576	NC_016790	TGG	2	6	163752	163757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256176
3577	NC_016790	CTG	2	6	163759	163764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256176
3578	NC_016790	CTGC	2	8	163807	163814	0 %	25 %	25 %	50 %	376256176
3579	NC_016790	TGG	3	9	163820	163828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256176
3580	NC_016790	CAT	2	6	163851	163856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256176
3581	NC_016790	AAT	2	6	163891	163896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256176
3582	NC_016790	GGA	2	6	163920	163925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256176
3583	NC_016790	GAT	2	6	163998	164003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256176
3584	NC_016790	CGA	2	6	164220	164225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256176
3585	NC_016790	GT	3	6	164330	164335	0 %	50 %	50 %	0 %	376256176
3586	NC_016790	CTT	2	6	164337	164342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256176
3587	NC_016790	TCC	2	6	164347	164352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256176
3588	NC_016790	GCCA	2	8	164374	164381	25 %	0 %	25 %	50 %	376256176
3589	NC_016790	GCG	2	6	164482	164487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256176
3590	NC_016790	TTG	2	6	164488	164493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256176
3591	NC_016790	GGC	2	6	164575	164580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256176
3592	NC_016790	CG	3	6	164618	164623	0 %	0 %	50 %	50 %	376256176
3593	NC_016790	TGG	2	6	164624	164629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256176
3594	NC_016790	AGG	2	6	164639	164644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256176
3595	NC_016790	TTC	2	6	164670	164675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256176
3596	NC_016790	CGT	2	6	164723	164728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256176
3597	NC_016790	ATGG	2	8	164758	164765	25 %	25 %	50 %	0 %	376256176
3598	NC_016790	ATTC	2	8	164866	164873	25 %	50 %	0 %	25 %	376256177
3599	NC_016790	CCA	2	6	164930	164935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256177
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3601	NC_016790	GGGT	2	8	165020	165027	0 %	25 %	75 %	0 %	376256177
3602	NC_016790	GTT	2	6	165045	165050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256177
3603	NC_016790	ACG	2	6	165074	165079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256177
3604	NC_016790	TG	3	6	165189	165194	0 %	50 %	50 %	0 %	376256177
3605	NC_016790	TGA	2	6	165216	165221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256177
3606	NC_016790	CGT	2	6	165516	165521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
3607	NC_016790	GC	3	6	165536	165541	0 %	0 %	50 %	50 %	376256178
3608	NC_016790	CGC	2	6	165649	165654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256178
3609	NC_016790	CCG	2	6	165711	165716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256178
3610	NC_016790	TCA	2	6	165735	165740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256178
3611	NC_016790	CGA	2	6	165742	165747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256178
3612	NC_016790	TCG	2	6	165792	165797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
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3614	NC_016790	CAC	2	6	165878	165883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256178
3615	NC_016790	CTG	2	6	165896	165901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
3616	NC_016790	CGG	3	9	165994	166002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256178
3617	NC_016790	CG	3	6	166008	166013	0 %	0 %	50 %	50 %	376256178
3618	NC_016790	TGC	2	6	166086	166091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
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3622	NC_016790	CCT	2	6	166222	166227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256178
3623	NC_016790	ACCG	2	8	166301	166308	25 %	0 %	25 %	50 %	376256178
3624	NC_016790	TCC	2	6	166317	166322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256178
3625	NC_016790	CA	3	6	166333	166338	50 %	0 %	0 %	50 %	376256178
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3632	NC_016790	CTG	3	9	166506	166514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256178
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3654	NC_016790	CCG	2	6	167524	167529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3723	NC_016790	CCA	2	6	171024	171029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256183
3724	NC_016790	TG	3	6	171053	171058	0 %	50 %	50 %	0 %	376256183
3725	NC_016790	GC	5	10	171069	171078	0 %	0 %	50 %	50 %	376256183
3726	NC_016790	GTTGC	2	10	171114	171123	0 %	40 %	40 %	20 %	376256183
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3729	NC_016790	CTGC	2	8	171223	171230	0 %	25 %	25 %	50 %	376256183
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3733	NC_016790	GGC	2	6	171531	171536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256183
3734	NC_016790	TCG	2	6	171537	171542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256183
3735	NC_016790	CTGC	2	8	171615	171622	0 %	25 %	25 %	50 %	376256183
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3988	NC_016790	GCCCA	2	10	184352	184361	20 %	0 %	20 %	60 %	376256193
3989	NC_016790	TCG	2	6	184364	184369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256193
3990	NC_016790	GCG	2	6	184378	184383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256193
3991	NC_016790	CGT	2	6	184386	184391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256193
3992	NC_016790	CG	3	6	184394	184399	0 %	0 %	50 %	50 %	376256193
3993	NC_016790	ACC	2	6	184445	184450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256193
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3997	NC_016790	CGAGG	2	10	184618	184627	20 %	0 %	60 %	20 %	376256193
3998	NC_016790	GCA	2	6	184684	184689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3999	NC_016790	ACG	2	6	184700	184705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_016790	GTA	2	6	184757	184762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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