MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_016790	TGT	2	6	137595	137600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256156
3003	NC_016790	GCC	2	6	137621	137626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256156
3004	NC_016790	GGAA	2	8	137658	137665	50 %	0 %	50 %	0 %	376256156
3005	NC_016790	GCGGG	2	10	137711	137720	0 %	0 %	80 %	20 %	376256156
3006	NC_016790	GTG	2	6	137752	137757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256156
3007	NC_016790	TGC	2	6	137852	137857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3008	NC_016790	CCA	2	6	137886	137891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256157
3009	NC_016790	CCA	2	6	137940	137945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256157
3010	NC_016790	CTC	2	6	137964	137969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256157
3011	NC_016790	TCT	2	6	137980	137985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256157
3012	NC_016790	CAG	2	6	138018	138023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3013	NC_016790	GGTG	2	8	138026	138033	0 %	25 %	75 %	0 %	376256157
3014	NC_016790	TAA	2	6	138056	138061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256157
3015	NC_016790	ATC	2	6	138096	138101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256157
3016	NC_016790	ACC	2	6	138118	138123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256157
3017	NC_016790	TGATC	2	10	138125	138134	20 %	40 %	20 %	20 %	376256157
3018	NC_016790	CTT	2	6	138185	138190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256157
3019	NC_016790	GT	3	6	138235	138240	0 %	50 %	50 %	0 %	376256157
3020	NC_016790	CGC	2	6	138266	138271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256157
3021	NC_016790	CTG	2	6	138426	138431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3022	NC_016790	TCA	2	6	138448	138453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256157
3023	NC_016790	CTG	2	6	138581	138586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3024	NC_016790	GCT	2	6	138590	138595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3025	NC_016790	CCA	2	6	138620	138625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256157
3026	NC_016790	AGC	2	6	138634	138639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256157
3027	NC_016790	ACGCCC	2	12	138640	138651	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	376256157
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3030	NC_016790	TCT	2	6	138695	138700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256157
3031	NC_016790	TTG	2	6	138716	138721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256157
3032	NC_016790	GTTG	2	8	138735	138742	0 %	50 %	50 %	0 %	376256157
3033	NC_016790	GAAGA	2	10	138802	138811	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_016790	GT	3	6	138874	138879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_016790	AGTG	2	8	138897	138904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_016790	A	6	6	138942	138947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_016790	TAA	2	6	138948	138953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_016790	AAGGGC	2	12	138993	139004	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3039	NC_016790	GGT	2	6	139015	139020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_016790	CAA	2	6	139134	139139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_016790	TTG	2	6	139148	139153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_016790	TG	3	6	139165	139170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_016790	GTG	2	6	139267	139272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_016790	TGC	2	6	139308	139313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_016790	CGC	2	6	139359	139364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_016790	A	6	6	139374	139379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016790	CCT	2	6	139450	139455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3049	NC_016790	GCA	2	6	139554	139559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3051	NC_016790	GCTC	2	8	139619	139626	0 %	25 %	25 %	50 %	376256158
3052	NC_016790	CGC	2	6	139636	139641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256158
3053	NC_016790	CT	4	8	139652	139659	0 %	50 %	0 %	50 %	376256158
3054	NC_016790	TAA	2	6	139738	139743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256158
3055	NC_016790	GGA	2	6	139970	139975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256158
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3061	NC_016790	GTT	2	6	140441	140446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256158
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3064	NC_016790	CAA	2	6	140578	140583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256158
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3070	NC_016790	CTG	2	6	140895	140900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256158
3071	NC_016790	GGT	2	6	140918	140923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256158
3072	NC_016790	TGC	2	6	141004	141009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256158
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3074	NC_016790	ATC	2	6	141101	141106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256158
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3077	NC_016790	GTC	2	6	141172	141177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_016790	GAAG	2	8	141207	141214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_016790	CTTC	2	8	141228	141235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3080	NC_016790	GGCCTT	2	12	141294	141305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_016790	GTC	2	6	141339	141344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256159
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3091	NC_016790	AAG	2	6	141859	141864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256159
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3093	NC_016790	AGATC	2	10	141914	141923	40 %	20 %	20 %	20 %	376256159
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3099	NC_016790	TGG	2	6	142161	142166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256159
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3103	NC_016790	AACA	2	8	142247	142254	75 %	0 %	0 %	25 %	376256160
3104	NC_016790	CAA	2	6	142278	142283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256160
3105	NC_016790	CAAC	2	8	142344	142351	50 %	0 %	0 %	50 %	376256160
3106	NC_016790	TGG	2	6	142359	142364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256160
3107	NC_016790	CTG	2	6	142413	142418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256160
3108	NC_016790	ATC	2	6	142434	142439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256160
3109	NC_016790	ATC	2	6	142492	142497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256160
3110	NC_016790	A	7	7	142622	142628	100 %	0 %	0 %	0 %	376256160
3111	NC_016790	TGA	3	9	142633	142641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256160
3112	NC_016790	ACC	2	6	142696	142701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256160
3113	NC_016790	GGC	2	6	142709	142714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256160
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3115	NC_016790	CGC	2	6	142875	142880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256160
3116	NC_016790	C	6	6	142883	142888	0 %	0 %	0 %	100 %	376256160
3117	NC_016790	A	6	6	142925	142930	100 %	0 %	0 %	0 %	376256160
3118	NC_016790	TCG	2	6	142971	142976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256160
3119	NC_016790	AGC	3	9	142978	142986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256160
3120	NC_016790	GCT	2	6	143021	143026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256160
3121	NC_016790	CGCAAA	2	12	143030	143041	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	376256160
3122	NC_016790	AGT	2	6	143067	143072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256160
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3124	NC_016790	ATG	2	6	143142	143147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_016790	ATA	2	6	149437	149442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256162
3248	NC_016790	GTT	2	6	149445	149450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256162
3249	NC_016790	GA	3	6	149514	149519	50 %	0 %	50 %	0 %	376256162
3250	NC_016790	GTAC	2	8	149581	149588	25 %	25 %	25 %	25 %	376256162
3251	NC_016790	TGG	2	6	149593	149598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256162
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3254	NC_016790	AAG	2	6	149871	149876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256162
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3256	NC_016790	ACTT	2	8	149962	149969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3262	NC_016790	GTA	2	6	150592	150597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3271	NC_016790	TG	3	6	151053	151058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_016790	GCC	2	6	151151	151156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256165
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3279	NC_016790	ATCTG	2	10	151429	151438	20 %	40 %	20 %	20 %	376256165
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3281	NC_016790	TGT	2	6	151647	151652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3282	NC_016790	TGTA	2	8	151656	151663	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3283	NC_016790	AT	3	6	151676	151681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3284	NC_016790	A	6	6	151766	151771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3340	NC_016790	GGTC	2	8	153798	153805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3344	NC_016790	TGT	2	6	154007	154012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3345	NC_016790	AGT	2	6	154042	154047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3348	NC_016790	ATC	2	6	154271	154276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3355	NC_016790	GTG	2	6	154689	154694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
3356	NC_016790	GGA	2	6	154699	154704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256169
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3358	NC_016790	GGT	2	6	154877	154882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256169
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3366	NC_016790	CGG	2	6	155214	155219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256169
3367	NC_016790	CATTC	2	10	155275	155284	20 %	40 %	0 %	40 %	376256169
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3369	NC_016790	TGCGG	2	10	155389	155398	0 %	20 %	60 %	20 %	376256169
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3491	NC_016790	CGG	2	6	160184	160189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256172
3492	NC_016790	CGT	2	6	160265	160270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256172
3493	NC_016790	TCG	2	6	160285	160290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256172
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