MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016790	GCA	2	6	48310	48315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256062
1002	NC_016790	GCC	2	6	48383	48388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256062
1003	NC_016790	CGT	2	6	48513	48518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256062
1004	NC_016790	ATTT	2	8	48528	48535	25 %	75 %	0 %	0 %	376256062
1005	NC_016790	GA	3	6	48564	48569	50 %	0 %	50 %	0 %	376256063
1006	NC_016790	CGC	2	6	48599	48604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256063
1007	NC_016790	CTT	2	6	48644	48649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256063
1008	NC_016790	TATCCT	2	12	48652	48663	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	376256063
1009	NC_016790	GCT	3	9	48724	48732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1010	NC_016790	TCG	2	6	48738	48743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1011	NC_016790	GAATCC	2	12	48957	48968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376256063
1012	NC_016790	GGT	2	6	48971	48976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256063
1013	NC_016790	TAG	2	6	48981	48986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256063
1014	NC_016790	TTC	2	6	48990	48995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256063
1015	NC_016790	GAA	2	6	49002	49007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256063
1016	NC_016790	ACCA	2	8	49012	49019	50 %	0 %	0 %	50 %	376256063
1017	NC_016790	ACC	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256063
1018	NC_016790	CCA	2	6	49063	49068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256063
1019	NC_016790	GCG	2	6	49070	49075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256063
1020	NC_016790	CCT	2	6	49093	49098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256063
1021	NC_016790	TCCGGA	2	12	49107	49118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1022	NC_016790	CGC	2	6	49166	49171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256063
1023	NC_016790	TCC	2	6	49188	49193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256063
1024	NC_016790	CACC	2	8	49213	49220	25 %	0 %	0 %	75 %	376256063
1025	NC_016790	GCA	2	6	49248	49253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1026	NC_016790	ACA	2	6	49281	49286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256063
1027	NC_016790	CCA	2	6	49291	49296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256063
1028	NC_016790	CGAA	2	8	49322	49329	50 %	0 %	25 %	25 %	376256063
1029	NC_016790	CAAC	2	8	49339	49346	50 %	0 %	0 %	50 %	376256063
1030	NC_016790	AGC	2	6	49352	49357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1031	NC_016790	CTG	2	6	49373	49378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1032	NC_016790	GTC	2	6	49383	49388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1033	NC_016790	TCG	2	6	49393	49398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1034	NC_016790	ATCC	2	8	49420	49427	25 %	25 %	0 %	50 %	376256063
1035	NC_016790	CAA	2	6	49433	49438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256063
1036	NC_016790	ATCA	2	8	49460	49467	50 %	25 %	0 %	25 %	376256063
1037	NC_016790	GTG	2	6	49698	49703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256063
1038	NC_016790	CGT	2	6	49759	49764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256063
1039	NC_016790	CAA	2	6	49778	49783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256063
1040	NC_016790	TGTCGT	2	12	49792	49803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	376256063
1041	NC_016790	ATC	2	6	49836	49841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256063
1042	NC_016790	ACC	2	6	49871	49876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256063
1043	NC_016790	TGAGG	2	10	49897	49906	20 %	20 %	60 %	0 %	376256063
1044	NC_016790	ATT	2	6	49928	49933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256063
1045	NC_016790	CAAC	2	8	49989	49996	50 %	0 %	0 %	50 %	376256064
1046	NC_016790	CAG	2	6	50031	50036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1047	NC_016790	TCC	2	6	50099	50104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256064
1048	NC_016790	ATC	2	6	50158	50163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256064
1049	NC_016790	CAC	2	6	50167	50172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256064
1050	NC_016790	CAA	2	6	50259	50264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256064
1051	NC_016790	CTG	2	6	50266	50271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1052	NC_016790	CCA	2	6	50279	50284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256064
1053	NC_016790	CGA	2	6	50285	50290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1054	NC_016790	CTT	2	6	50296	50301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256064
1055	NC_016790	CGA	2	6	50317	50322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1056	NC_016790	GCG	2	6	50346	50351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256064
1057	NC_016790	CGT	2	6	50356	50361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1058	NC_016790	AGC	2	6	50365	50370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256064
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1060	NC_016790	CAA	2	6	50422	50427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256064
1061	NC_016790	CAA	2	6	50431	50436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256064
1062	NC_016790	GCA	2	6	50445	50450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256064
1063	NC_016790	A	7	7	50450	50456	100 %	0 %	0 %	0 %	376256064
1064	NC_016790	TACGA	2	10	50498	50507	40 %	20 %	20 %	20 %	376256065
1065	NC_016790	TCC	2	6	50547	50552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256065
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1071	NC_016790	CGA	2	6	50744	50749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256065
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1085	NC_016790	TAT	2	6	51292	51297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256065
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1088	NC_016790	TAG	2	6	51537	51542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_016790	TTTTG	2	10	51728	51737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_016790	CAC	2	6	51768	51773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1097	NC_016790	TAGT	2	8	51870	51877	25 %	50 %	25 %	0 %	376256066
1098	NC_016790	GC	3	6	51909	51914	0 %	0 %	50 %	50 %	376256066
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1101	NC_016790	GAGG	2	8	52034	52041	25 %	0 %	75 %	0 %	376256066
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1103	NC_016790	T	6	6	52154	52159	0 %	100 %	0 %	0 %	376256066
1104	NC_016790	GCT	2	6	52201	52206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1106	NC_016790	GTAC	2	8	52278	52285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_016790	GT	4	8	52298	52305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016790	GGT	2	6	52319	52324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016790	TTC	2	6	52342	52347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016790	TGA	2	6	52354	52359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016790	AAC	2	6	52392	52397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016790	TTA	2	6	52435	52440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016790	AGT	2	6	52465	52470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016790	CTT	2	6	52489	52494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_016790	TGC	2	6	52515	52520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_016790	ACT	2	6	52545	52550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_016790	ACT	2	6	52558	52563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016790	TATT	2	8	52572	52579	25 %	75 %	0 %	0 %	376256067
1119	NC_016790	CTG	2	6	52616	52621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256067
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1121	NC_016790	ATG	2	6	52729	52734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256067
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1123	NC_016790	CATG	2	8	52899	52906	25 %	25 %	25 %	25 %	376256067
1124	NC_016790	GAG	2	6	52944	52949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256067
1125	NC_016790	GACTA	2	10	52968	52977	40 %	20 %	20 %	20 %	376256067
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1254	NC_016790	GGTGCG	2	12	59152	59163	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	376256077
1255	NC_016790	GA	3	6	59166	59171	50 %	0 %	50 %	0 %	376256077
1256	NC_016790	GCC	2	6	59237	59242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256077
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1258	NC_016790	GCA	2	6	59315	59320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256077
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1260	NC_016790	GGC	2	6	59440	59445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256077
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1262	NC_016790	CGG	2	6	59466	59471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256077
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1266	NC_016790	GC	3	6	59595	59600	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
1267	NC_016790	GCA	2	6	59603	59608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256077
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1269	NC_016790	CCGG	2	8	59663	59670	0 %	0 %	50 %	50 %	376256077
1270	NC_016790	CCA	2	6	59755	59760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256077
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1283	NC_016790	AGC	2	6	60398	60403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256078
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1337	NC_016790	ACC	2	6	62948	62953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1367	NC_016790	CTC	2	6	65034	65039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256084
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1369	NC_016790	AG	3	6	65097	65102	50 %	0 %	50 %	0 %	376256084
1370	NC_016790	TCC	2	6	65125	65130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256084
1371	NC_016790	CGA	2	6	65405	65410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256084
1372	NC_016790	TTC	2	6	65445	65450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256084
1373	NC_016790	TTA	2	6	65504	65509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1374	NC_016790	ACT	2	6	65516	65521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256085
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1376	NC_016790	TCT	3	9	65531	65539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256085
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1378	NC_016790	CCT	2	6	65624	65629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256085
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