MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016790	GCG	2	6	23704	23709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256039
502	NC_016790	GCT	2	6	23729	23734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256039
503	NC_016790	GATGTG	2	12	23753	23764	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	376256039
504	NC_016790	TGG	2	6	23782	23787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256039
505	NC_016790	GTG	2	6	23798	23803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256039
506	NC_016790	ATT	2	6	23840	23845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256039
507	NC_016790	GCT	2	6	23861	23866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256039
508	NC_016790	GGC	2	6	23905	23910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256039
509	NC_016790	GTT	2	6	23933	23938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256039
510	NC_016790	TTA	2	6	23940	23945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256039
511	NC_016790	CAT	2	6	23957	23962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256039
512	NC_016790	GCA	2	6	24027	24032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256039
513	NC_016790	GAG	2	6	24044	24049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256039
514	NC_016790	CTCA	2	8	24050	24057	25 %	25 %	0 %	50 %	376256039
515	NC_016790	TGGC	2	8	24063	24070	0 %	25 %	50 %	25 %	376256039
516	NC_016790	GTC	2	6	24163	24168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
517	NC_016790	GCT	2	6	24189	24194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
518	NC_016790	AGT	2	6	24209	24214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256040
519	NC_016790	TCG	2	6	24218	24223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
520	NC_016790	TG	3	6	24251	24256	0 %	50 %	50 %	0 %	376256040
521	NC_016790	TTC	2	6	24274	24279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256040
522	NC_016790	GTG	2	6	24315	24320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256040
523	NC_016790	GCCGGA	2	12	24334	24345	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	376256040
524	NC_016790	GCG	2	6	24371	24376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256040
525	NC_016790	TGC	2	6	24382	24387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
526	NC_016790	TAC	2	6	24391	24396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256040
527	NC_016790	AGC	2	6	24408	24413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256040
528	NC_016790	GCGCT	2	10	24431	24440	0 %	20 %	40 %	40 %	376256040
529	NC_016790	TCT	2	6	24441	24446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256040
530	NC_016790	T	6	6	24529	24534	0 %	100 %	0 %	0 %	376256040
531	NC_016790	CGG	2	6	24543	24548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256040
532	NC_016790	CGG	2	6	24642	24647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256040
533	NC_016790	CTG	2	6	24651	24656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
534	NC_016790	CGT	2	6	24669	24674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256040
535	NC_016790	TTG	2	6	24713	24718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256040
536	NC_016790	GCC	2	6	24722	24727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256040
537	NC_016790	TGG	2	6	24753	24758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256040
538	NC_016790	ATG	2	6	24837	24842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256041
539	NC_016790	GTG	2	6	24889	24894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256041
540	NC_016790	GTT	2	6	24908	24913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256041
541	NC_016790	GGC	2	6	25092	25097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256041
542	NC_016790	TGA	2	6	25115	25120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256041
543	NC_016790	AAC	2	6	25233	25238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256041
544	NC_016790	CAC	2	6	25239	25244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256041
545	NC_016790	GTT	2	6	25284	25289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256041
546	NC_016790	ACG	2	6	25403	25408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016790	GGT	2	6	25466	25471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256042
548	NC_016790	GTT	2	6	25525	25530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256042
549	NC_016790	GTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256042
550	NC_016790	AGA	2	6	25552	25557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256042
551	NC_016790	ATC	2	6	25562	25567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256042
552	NC_016790	TCA	2	6	25584	25589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256042
553	NC_016790	GTA	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256042
554	NC_016790	GAA	2	6	25637	25642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256042
555	NC_016790	CCA	2	6	25698	25703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_016790	TAAC	2	8	25715	25722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
557	NC_016790	GTG	2	6	25821	25826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256043
558	NC_016790	TGA	2	6	25837	25842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256043
559	NC_016790	GC	3	6	25891	25896	0 %	0 %	50 %	50 %	376256043
560	NC_016790	TATC	2	8	25907	25914	25 %	50 %	0 %	25 %	376256043
561	NC_016790	TGT	2	6	25922	25927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256043
562	NC_016790	TGG	2	6	26026	26031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256043
563	NC_016790	CA	3	6	26057	26062	50 %	0 %	0 %	50 %	376256043
564	NC_016790	TTC	2	6	26088	26093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256043
565	NC_016790	ATT	2	6	26113	26118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256043
566	NC_016790	CTG	2	6	26181	26186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256043
567	NC_016790	GGTG	2	8	26207	26214	0 %	25 %	75 %	0 %	376256043
568	NC_016790	ATGG	2	8	26331	26338	25 %	25 %	50 %	0 %	376256043
569	NC_016790	TG	3	6	26379	26384	0 %	50 %	50 %	0 %	376256043
570	NC_016790	ACT	2	6	26412	26417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256043
571	NC_016790	TAA	2	6	26423	26428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256043
572	NC_016790	T	9	9	26486	26494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016790	CA	3	6	26509	26514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_016790	ATAA	2	8	26521	26528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016790	CAG	2	6	26538	26543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_016790	CTG	2	6	26567	26572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_016790	TGG	2	6	26648	26653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016790	CCA	2	6	26702	26707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_016790	CAG	2	6	26764	26769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016790	TG	3	6	26794	26799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_016790	TGA	2	6	26812	26817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016790	TG	3	6	26827	26832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016790	GAA	2	6	26890	26895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016790	TTC	2	6	26964	26969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_016790	GTG	2	6	27009	27014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016790	TGG	2	6	27044	27049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016790	TGT	2	6	27066	27071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016790	AGAT	2	8	27143	27150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016790	AAG	2	6	27165	27170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016790	CCA	2	6	27195	27200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_016790	T	6	6	27225	27230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016790	GTG	3	9	27233	27241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016790	G	7	7	27241	27247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016790	GGT	2	6	27280	27285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016790	GTT	2	6	27344	27349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016790	GGC	2	6	27371	27376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016790	AGTG	2	8	27403	27410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016790	GAAG	2	8	27493	27500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016790	AG	3	6	27499	27504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016790	ATCC	2	8	27575	27582	25 %	25 %	0 %	50 %	376256044
601	NC_016790	GC	3	6	27736	27741	0 %	0 %	50 %	50 %	376256044
602	NC_016790	GAA	2	6	27770	27775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256044
603	NC_016790	TGA	2	6	27802	27807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256044
604	NC_016790	CGT	2	6	27824	27829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256044
605	NC_016790	ATT	2	6	27926	27931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256044
606	NC_016790	AAC	2	6	28022	28027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256044
607	NC_016790	ACC	2	6	28032	28037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256044
608	NC_016790	ATT	2	6	28055	28060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256044
609	NC_016790	GAA	2	6	28127	28132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256044
610	NC_016790	GAT	2	6	28196	28201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256044
611	NC_016790	CAC	2	6	28207	28212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256044
612	NC_016790	AGA	2	6	28297	28302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256044
613	NC_016790	GT	3	6	28380	28385	0 %	50 %	50 %	0 %	376256044
614	NC_016790	ACC	2	6	28406	28411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256044
615	NC_016790	GTG	2	6	28437	28442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256044
616	NC_016790	CAT	2	6	28447	28452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256044
617	NC_016790	TCCT	2	8	28484	28491	0 %	50 %	0 %	50 %	376256044
618	NC_016790	TGA	2	6	28504	28509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256044
619	NC_016790	ACG	2	6	28533	28538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256044
620	NC_016790	ATG	2	6	28590	28595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256044
621	NC_016790	TCG	2	6	28636	28641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256044
622	NC_016790	GCT	2	6	28820	28825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256044
623	NC_016790	GGT	2	6	28838	28843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256044
624	NC_016790	CGTG	2	8	28976	28983	0 %	25 %	50 %	25 %	376256044
625	NC_016790	CGG	2	6	29088	29093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256044
626	NC_016790	TG	3	6	29124	29129	0 %	50 %	50 %	0 %	376256044
627	NC_016790	GGC	2	6	29216	29221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256044
628	NC_016790	GGC	2	6	29239	29244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256044
629	NC_016790	GAG	2	6	29252	29257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256044
630	NC_016790	TGC	2	6	29302	29307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256044
631	NC_016790	GC	4	8	29403	29410	0 %	0 %	50 %	50 %	376256045
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