MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae VA01 chromosome

Total Repeats: 48849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016790	TCG	2	6	231380	231385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5002	NC_016790	TTC	3	9	231484	231492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256241
5003	NC_016790	GGT	2	6	231493	231498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256241
5004	NC_016790	CTG	2	6	231532	231537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5005	NC_016790	TGA	2	6	231599	231604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256241
5006	NC_016790	GCA	2	6	231634	231639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5007	NC_016790	GCCG	2	8	231648	231655	0 %	0 %	50 %	50 %	376256241
5008	NC_016790	GCC	2	6	231670	231675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256241
5009	NC_016790	GCA	2	6	231839	231844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5010	NC_016790	CA	3	6	231903	231908	50 %	0 %	0 %	50 %	376256241
5011	NC_016790	TGG	2	6	231920	231925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256241
5012	NC_016790	CAA	2	6	231948	231953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256241
5013	NC_016790	TCG	2	6	231959	231964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5014	NC_016790	CTG	2	6	231973	231978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5015	NC_016790	CGA	2	6	232053	232058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5016	NC_016790	AGC	2	6	232140	232145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5017	NC_016790	CGC	2	6	232146	232151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256241
5018	NC_016790	TGG	3	9	232158	232166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256241
5019	NC_016790	GGT	2	6	232194	232199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256241
5020	NC_016790	CGG	2	6	232250	232255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256241
5021	NC_016790	ATG	2	6	232261	232266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256241
5022	NC_016790	TGC	2	6	232271	232276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256241
5023	NC_016790	CAT	2	6	232284	232289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256241
5024	NC_016790	ACA	2	6	232337	232342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256241
5025	NC_016790	CGG	2	6	232377	232382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256241
5026	NC_016790	TCAC	2	8	232402	232409	25 %	25 %	0 %	50 %	376256241
5027	NC_016790	CA	3	6	232440	232445	50 %	0 %	0 %	50 %	376256241
5028	NC_016790	GCC	2	6	232453	232458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256241
5029	NC_016790	TCA	2	6	232469	232474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256241
5030	NC_016790	GAAA	2	8	232518	232525	75 %	0 %	25 %	0 %	376256241
5031	NC_016790	CA	3	6	232542	232547	50 %	0 %	0 %	50 %	376256241
5032	NC_016790	GAA	2	6	232550	232555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256241
5033	NC_016790	A	6	6	232554	232559	100 %	0 %	0 %	0 %	376256242
5034	NC_016790	ACC	2	6	232593	232598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256242
5035	NC_016790	GCT	2	6	232606	232611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5036	NC_016790	ACG	3	9	232633	232641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5037	NC_016790	CGA	2	6	232694	232699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5038	NC_016790	CAAACC	2	12	232760	232771	50 %	0 %	0 %	50 %	376256242
5039	NC_016790	GAC	2	6	232800	232805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5040	NC_016790	ACG	2	6	232846	232851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5041	NC_016790	GTA	2	6	232872	232877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256242
5042	NC_016790	A	6	6	232877	232882	100 %	0 %	0 %	0 %	376256242
5043	NC_016790	GCC	2	6	233031	233036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256242
5044	NC_016790	GAA	2	6	233111	233116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256242
5045	NC_016790	ACT	2	6	233155	233160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256242
5046	NC_016790	GCC	2	6	233214	233219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256242
5047	NC_016790	CG	3	6	233325	233330	0 %	0 %	50 %	50 %	376256242
5048	NC_016790	TGC	2	6	233335	233340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5049	NC_016790	CAA	2	6	233447	233452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256242
5050	NC_016790	CTG	2	6	233521	233526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5051	NC_016790	CCA	2	6	233530	233535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256242
5052	NC_016790	GGCAAG	2	12	233538	233549	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	376256242
5053	NC_016790	GC	3	6	233621	233626	0 %	0 %	50 %	50 %	376256242
5054	NC_016790	AAG	2	6	233823	233828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256242
5055	NC_016790	GCA	2	6	233880	233885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5056	NC_016790	AGC	2	6	233935	233940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5057	NC_016790	TGC	2	6	233972	233977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256242
5058	NC_016790	AAG	2	6	234015	234020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256242
5059	NC_016790	AAG	2	6	234027	234032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256242
5060	NC_016790	TTA	2	6	234070	234075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256243
5061	NC_016790	TTC	2	6	234157	234162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256243
5062	NC_016790	CTT	2	6	234198	234203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256243
5063	NC_016790	CCT	2	6	234295	234300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256243
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5065	NC_016790	GAC	2	6	234442	234447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256243
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5068	NC_016790	AGC	2	6	234476	234481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5069	NC_016790	AGC	2	6	234485	234490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5070	NC_016790	TGG	2	6	234505	234510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256243
5071	NC_016790	TTG	2	6	234519	234524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256243
5072	NC_016790	TG	3	6	234529	234534	0 %	50 %	50 %	0 %	376256243
5073	NC_016790	TGC	2	6	234541	234546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5074	NC_016790	GGT	2	6	234565	234570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256243
5075	NC_016790	CA	3	6	234580	234585	50 %	0 %	0 %	50 %	376256243
5076	NC_016790	TGC	2	6	234589	234594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5077	NC_016790	CCTC	2	8	234595	234602	0 %	25 %	0 %	75 %	376256243
5078	NC_016790	TGC	2	6	234640	234645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5079	NC_016790	TCA	2	6	234646	234651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256243
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5084	NC_016790	GGC	2	6	234890	234895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256243
5085	NC_016790	TGG	2	6	234913	234918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256243
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5087	NC_016790	CCA	2	6	235018	235023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256243
5088	NC_016790	GTG	2	6	235026	235031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256243
5089	NC_016790	ATT	2	6	235050	235055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376256243
5090	NC_016790	GCG	2	6	235056	235061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256243
5091	NC_016790	CGCAG	2	10	235095	235104	20 %	0 %	40 %	40 %	376256243
5092	NC_016790	TCC	2	6	235327	235332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256243
5093	NC_016790	ACC	2	6	235368	235373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256243
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5099	NC_016790	CCA	2	6	235511	235516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256243
5100	NC_016790	TGC	2	6	235519	235524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256243
5101	NC_016790	ACC	2	6	235530	235535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256243
5102	NC_016790	CCG	2	6	235537	235542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256243
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5104	NC_016790	CACT	2	8	235661	235668	25 %	25 %	0 %	50 %	376256243
5105	NC_016790	TGT	2	6	235705	235710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256243
5106	NC_016790	TGG	2	6	235714	235719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256243
5107	NC_016790	AAT	2	6	235792	235797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256243
5108	NC_016790	TGG	2	6	235809	235814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256244
5109	NC_016790	CCGC	2	8	235887	235894	0 %	0 %	25 %	75 %	376256244
5110	NC_016790	GAGT	2	8	235965	235972	25 %	25 %	50 %	0 %	376256244
5111	NC_016790	CCT	2	6	236051	236056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256244
5112	NC_016790	CCG	2	6	236066	236071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256244
5113	NC_016790	ACCA	2	8	236121	236128	50 %	0 %	0 %	50 %	376256244
5114	NC_016790	CCG	2	6	236135	236140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256244
5115	NC_016790	GAAG	2	8	236237	236244	50 %	0 %	50 %	0 %	376256244
5116	NC_016790	GAA	2	6	236255	236260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376256244
5117	NC_016790	GCT	2	6	236272	236277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256244
5118	NC_016790	TTG	2	6	236308	236313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256244
5119	NC_016790	GC	3	6	236316	236321	0 %	0 %	50 %	50 %	376256244
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5121	NC_016790	GAGGGG	2	12	236491	236502	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	376256244
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5243	NC_016790	GCC	2	6	241073	241078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256246
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5362	NC_016790	ATC	2	6	246038	246043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256249
5363	NC_016790	ATCGCC	2	12	246110	246121	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376256249
5364	NC_016790	CGGCAT	2	12	246130	246141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376256249
5365	NC_016790	TCG	2	6	246213	246218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256249
5366	NC_016790	CAC	2	6	246308	246313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256249
5367	NC_016790	CGA	2	6	246316	246321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256249
5368	NC_016790	CTAA	2	8	246475	246482	50 %	25 %	0 %	25 %	376256249
5369	NC_016790	CTAA	2	8	246487	246494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5370	NC_016790	TCA	2	6	246542	246547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256250
5371	NC_016790	TCA	2	6	246575	246580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256250
5372	NC_016790	GC	3	6	246610	246615	0 %	0 %	50 %	50 %	376256250
5373	NC_016790	CGC	2	6	246678	246683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256250
5374	NC_016790	ACC	2	6	246729	246734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5375	NC_016790	CCA	2	6	246746	246751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5376	NC_016790	GCG	2	6	246820	246825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256250
5377	NC_016790	CAGC	2	8	246875	246882	25 %	0 %	25 %	50 %	376256250
5378	NC_016790	GCA	2	6	246883	246888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256250
5379	NC_016790	TAA	2	6	246905	246910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376256250
5380	NC_016790	TTG	2	6	246916	246921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376256250
5381	NC_016790	CCA	2	6	246935	246940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5382	NC_016790	CTC	2	6	246963	246968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256250
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5384	NC_016790	CTC	2	6	247071	247076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256250
5385	NC_016790	GC	3	6	247081	247086	0 %	0 %	50 %	50 %	376256250
5386	NC_016790	CAT	2	6	247155	247160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256250
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5390	NC_016790	GTG	2	6	247392	247397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256250
5391	NC_016790	CAA	2	6	247410	247415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256250
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5393	NC_016790	ACG	2	6	247503	247508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256250
5394	NC_016790	GCC	2	6	247522	247527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256250
5395	NC_016790	CAC	2	6	247566	247571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5396	NC_016790	CAC	2	6	247580	247585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5397	NC_016790	CAC	2	6	247674	247679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5398	NC_016790	CGC	2	6	247689	247694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256250
5399	NC_016790	CCA	2	6	247804	247809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256250
5400	NC_016790	AGGT	2	8	247848	247855	25 %	25 %	50 %	0 %	376256250
5401	NC_016790	AAC	2	6	247912	247917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376256250
5402	NC_016790	GC	3	6	248002	248007	0 %	0 %	50 %	50 %	376256250
5403	NC_016790	ACT	2	6	248026	248031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376256251
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5405	NC_016790	CCG	2	6	248147	248152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256251
5406	NC_016790	CG	4	8	248151	248158	0 %	0 %	50 %	50 %	376256251
5407	NC_016790	CGCA	2	8	248160	248167	25 %	0 %	25 %	50 %	376256251
5408	NC_016790	AC	3	6	248191	248196	50 %	0 %	0 %	50 %	376256251
5409	NC_016790	CGC	3	9	248253	248261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256251
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5411	NC_016790	ACG	2	6	248327	248332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256251
5412	NC_016790	TCC	2	6	248345	248350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376256251
5413	NC_016790	ATG	2	6	248386	248391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256251
5414	NC_016790	GAC	2	6	248395	248400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256251
5415	NC_016790	GTC	2	6	248401	248406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256251
5416	NC_016790	CGC	2	6	248412	248417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256251
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5430	NC_016790	ACC	2	6	249023	249028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376256251
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5440	NC_016790	GCC	2	6	249383	249388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5441	NC_016790	GGC	2	6	249449	249454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5442	NC_016790	AGA	2	6	249472	249477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5443	NC_016790	TTG	2	6	249528	249533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5444	NC_016790	A	6	6	249590	249595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5445	NC_016790	GGA	2	6	249611	249616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5446	NC_016790	CATG	2	8	249642	249649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5447	NC_016790	GACA	2	8	249666	249673	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5448	NC_016790	GAG	2	6	249676	249681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5449	NC_016790	TGC	2	6	249691	249696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5451	NC_016790	AGCT	2	8	249778	249785	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5452	NC_016790	CCA	2	6	249825	249830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5453	NC_016790	AGA	2	6	249850	249855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5454	NC_016790	TCAT	2	8	249977	249984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5455	NC_016790	AAC	2	6	249995	250000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5456	NC_016790	TGA	2	6	250030	250035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5459	NC_016790	GAA	2	6	250211	250216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5460	NC_016790	GAA	2	6	250250	250255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5461	NC_016790	ATAG	2	8	250334	250341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5463	NC_016790	TA	3	6	250488	250493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5464	NC_016790	ATG	2	6	250520	250525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_016790	TG	3	6	250846	250851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5473	NC_016790	CTGC	2	8	250874	250881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5474	NC_016790	CA	3	6	250899	250904	50 %	0 %	0 %	50 %	376256253
5475	NC_016790	GAG	2	6	250922	250927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256253
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5480	NC_016790	CGC	2	6	250996	251001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376256253
5481	NC_016790	GGT	2	6	251002	251007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256253
5482	NC_016790	TCG	2	6	251040	251045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256253
5483	NC_016790	ACG	2	6	251051	251056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256253
5484	NC_016790	GCT	2	6	251181	251186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376256253
5485	NC_016790	GCG	2	6	251219	251224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376256253
5486	NC_016790	TTTTGT	2	12	251263	251274	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	376256253
5487	NC_016790	ATG	2	6	251277	251282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256253
5488	NC_016790	TTC	2	6	251288	251293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376256253
5489	NC_016790	GAG	2	6	251303	251308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376256253
5490	NC_016790	TGA	2	6	251314	251319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376256253
5491	NC_016790	GAGCCG	2	12	251340	251351	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	376256253
5492	NC_016790	TGCT	2	8	251370	251377	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5493	NC_016790	TGG	3	9	251383	251391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5494	NC_016790	GCT	2	6	251409	251414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5495	NC_016790	GCA	2	6	251478	251483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376256254
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5497	NC_016790	T	6	6	251673	251678	0 %	100 %	0 %	0 %	376256255
5498	NC_016790	GTTGGG	2	12	251750	251761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376256255
5499	NC_016790	CTT	2	6	251800	251805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_016790	TCT	2	6	251871	251876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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