MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 5093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016788	CCGC	2	8	1065	1072	0 %	0 %	25 %	75 %	376247368
2	NC_016788	GCAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	376247368
3	NC_016788	GATC	2	8	2288	2295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016788	GCCA	2	8	2515	2522	25 %	0 %	25 %	50 %	376247369
5	NC_016788	AAGC	2	8	3424	3431	50 %	0 %	25 %	25 %	376247369
6	NC_016788	ACCT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	376247369
7	NC_016788	TCAT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	376247370
8	NC_016788	TGCT	2	8	4305	4312	0 %	50 %	25 %	25 %	376247370
9	NC_016788	GGTG	2	8	4606	4613	0 %	25 %	75 %	0 %	376247370
10	NC_016788	TGGC	2	8	4973	4980	0 %	25 %	50 %	25 %	376247371
11	NC_016788	CTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	25 %	25 %	376247372
12	NC_016788	GGCG	2	8	8511	8518	0 %	0 %	75 %	25 %	376247375
13	NC_016788	CGCA	2	8	9897	9904	25 %	0 %	25 %	50 %	376247376
14	NC_016788	GCCC	2	8	10179	10186	0 %	0 %	25 %	75 %	376247376
15	NC_016788	CGTG	2	8	10205	10212	0 %	25 %	50 %	25 %	376247376
16	NC_016788	CCAC	2	8	10456	10463	25 %	0 %	0 %	75 %	376247376
17	NC_016788	CCGC	2	8	10540	10547	0 %	0 %	25 %	75 %	376247376
18	NC_016788	GCAA	2	8	11296	11303	50 %	0 %	25 %	25 %	376247376
19	NC_016788	AGCC	2	8	13277	13284	25 %	0 %	25 %	50 %	376247379
20	NC_016788	CCAT	2	8	13737	13744	25 %	25 %	0 %	50 %	376247379
21	NC_016788	CAGG	2	8	14693	14700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016788	CCGG	2	8	14982	14989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016788	ACCG	2	8	15188	15195	25 %	0 %	25 %	50 %	376247380
24	NC_016788	CGGT	2	8	15526	15533	0 %	25 %	50 %	25 %	376247380
25	NC_016788	GGCG	2	8	15781	15788	0 %	0 %	75 %	25 %	376247381
26	NC_016788	GGGT	2	8	15949	15956	0 %	25 %	75 %	0 %	376247381
27	NC_016788	ACCC	2	8	17344	17351	25 %	0 %	0 %	75 %	376247382
28	NC_016788	GCAG	2	8	17994	18001	25 %	0 %	50 %	25 %	376247382
29	NC_016788	ACCT	2	8	18902	18909	25 %	25 %	0 %	50 %	376247382
30	NC_016788	TTTG	2	8	19240	19247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016788	GCGT	2	8	19829	19836	0 %	25 %	50 %	25 %	376247383
32	NC_016788	GCAC	2	8	20353	20360	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016788	GAGG	2	8	20466	20473	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016788	ATTG	2	8	22019	22026	25 %	50 %	25 %	0 %	376247385
35	NC_016788	TTGG	2	8	22213	22220	0 %	50 %	50 %	0 %	376247385
36	NC_016788	TTCG	2	8	22466	22473	0 %	50 %	25 %	25 %	376247386
37	NC_016788	TGGG	2	8	22642	22649	0 %	25 %	75 %	0 %	376247386
38	NC_016788	GGTG	2	8	22980	22987	0 %	25 %	75 %	0 %	376247386
39	NC_016788	TGTT	2	8	23051	23058	0 %	75 %	25 %	0 %	376247386
40	NC_016788	CTCA	2	8	24064	24071	25 %	25 %	0 %	50 %	376247387
41	NC_016788	TGGC	2	8	24077	24084	0 %	25 %	50 %	25 %	376247387
42	NC_016788	TAAC	2	8	25729	25736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016788	TATC	2	8	25920	25927	25 %	50 %	0 %	25 %	376247391
44	NC_016788	GGTG	2	8	26220	26227	0 %	25 %	75 %	0 %	376247391
45	NC_016788	ATGG	2	8	26344	26351	25 %	25 %	50 %	0 %	376247391
46	NC_016788	ATAA	2	8	26532	26539	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016788	AGAT	2	8	27154	27161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016788	AGTG	2	8	27412	27419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016788	GAAG	2	8	27502	27509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016788	ATCC	2	8	27584	27591	25 %	25 %	0 %	50 %	376247392
51	NC_016788	CTTT	2	8	28495	28502	0 %	75 %	0 %	25 %	376247392
52	NC_016788	CGTG	2	8	28985	28992	0 %	25 %	50 %	25 %	376247392
53	NC_016788	CAAC	2	8	31154	31161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016788	CCGC	2	8	31475	31482	0 %	0 %	25 %	75 %	376247395
55	NC_016788	CCCA	2	8	32559	32566	25 %	0 %	0 %	75 %	376247396
56	NC_016788	CCCA	2	8	33199	33206	25 %	0 %	0 %	75 %	376247397
57	NC_016788	CCAT	2	8	33252	33259	25 %	25 %	0 %	50 %	376247397
58	NC_016788	AACA	2	8	33466	33473	75 %	0 %	0 %	25 %	376247397
59	NC_016788	GCCA	2	8	34301	34308	25 %	0 %	25 %	50 %	376247399
60	NC_016788	TAGG	2	8	34488	34495	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016788	TGAT	2	8	34912	34919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016788	GGTA	2	8	35627	35634	25 %	25 %	50 %	0 %	376247400
63	NC_016788	TTTC	2	8	36482	36489	0 %	75 %	0 %	25 %	376247401
64	NC_016788	TGGT	2	8	36769	36776	0 %	50 %	50 %	0 %	376247401
65	NC_016788	TGCC	2	8	37877	37884	0 %	25 %	25 %	50 %	376247401
66	NC_016788	GAAA	2	8	38508	38515	75 %	0 %	25 %	0 %	376247401
67	NC_016788	ACTT	2	8	38751	38758	25 %	50 %	0 %	25 %	376247401
68	NC_016788	GCCC	2	8	39765	39772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016788	TTAT	2	8	39967	39974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016788	TTCA	2	8	40286	40293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016788	AGGA	2	8	40408	40415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016788	TCGA	2	8	40879	40886	25 %	25 %	25 %	25 %	376247402
73	NC_016788	AGGA	2	8	42083	42090	50 %	0 %	50 %	0 %	376247402
74	NC_016788	CCTA	2	8	42164	42171	25 %	25 %	0 %	50 %	376247403
75	NC_016788	ATGT	2	8	43596	43603	25 %	50 %	25 %	0 %	376247404
76	NC_016788	TTGC	2	8	43993	44000	0 %	50 %	25 %	25 %	376247405
77	NC_016788	ACAG	2	8	44023	44030	50 %	0 %	25 %	25 %	376247405
78	NC_016788	AATT	2	8	44289	44296	50 %	50 %	0 %	0 %	376247405
79	NC_016788	AACC	2	8	44644	44651	50 %	0 %	0 %	50 %	376247406
80	NC_016788	CGAA	2	8	44710	44717	50 %	0 %	25 %	25 %	376247406
81	NC_016788	GCTG	2	8	44807	44814	0 %	25 %	50 %	25 %	376247406
82	NC_016788	AGTT	2	8	45013	45020	25 %	50 %	25 %	0 %	376247406
83	NC_016788	TCCT	2	8	45320	45327	0 %	50 %	0 %	50 %	376247407
84	NC_016788	GGTC	2	8	47056	47063	0 %	25 %	50 %	25 %	376247410
85	NC_016788	CCAG	2	8	47117	47124	25 %	0 %	25 %	50 %	376247410
86	NC_016788	CACG	2	8	47494	47501	25 %	0 %	25 %	50 %	376247410
87	NC_016788	GACG	2	8	49082	49089	25 %	0 %	50 %	25 %	376247411
88	NC_016788	GGCG	2	8	49592	49599	0 %	0 %	75 %	25 %	376247411
89	NC_016788	GATG	2	8	50034	50041	25 %	25 %	50 %	0 %	376247411
90	NC_016788	CTGC	2	8	50058	50065	0 %	25 %	25 %	50 %	376247411
91	NC_016788	GATC	2	8	51910	51917	25 %	25 %	25 %	25 %	376247412
92	NC_016788	CAAG	2	8	52862	52869	50 %	0 %	25 %	25 %	376247413
93	NC_016788	ATTT	2	8	53269	53276	25 %	75 %	0 %	0 %	376247413
94	NC_016788	ACCA	2	8	53753	53760	50 %	0 %	0 %	50 %	376247414
95	NC_016788	CACC	2	8	53954	53961	25 %	0 %	0 %	75 %	376247414
96	NC_016788	CGAA	2	8	54063	54070	50 %	0 %	25 %	25 %	376247414
97	NC_016788	CAAC	2	8	54080	54087	50 %	0 %	0 %	50 %	376247414
98	NC_016788	ATCC	2	8	54161	54168	25 %	25 %	0 %	50 %	376247414
99	NC_016788	ATCA	2	8	54201	54208	50 %	25 %	0 %	25 %	376247414
100	NC_016788	CAAC	2	8	54730	54737	50 %	0 %	0 %	50 %	376247415
101	NC_016788	TCCG	2	8	55588	55595	0 %	25 %	25 %	50 %	376247416
102	NC_016788	TAGT	2	8	56626	56633	25 %	50 %	25 %	0 %	376247417
103	NC_016788	GAGG	2	8	56790	56797	25 %	0 %	75 %	0 %	376247417
104	NC_016788	GTAC	2	8	57034	57041	25 %	25 %	25 %	25 %	376247418
105	NC_016788	TATT	2	8	57325	57332	25 %	75 %	0 %	0 %	376247419
106	NC_016788	CATG	2	8	57652	57659	25 %	25 %	25 %	25 %	376247419
107	NC_016788	TGAG	2	8	57858	57865	25 %	25 %	50 %	0 %	376247420
108	NC_016788	GCAT	2	8	59391	59398	25 %	25 %	25 %	25 %	376247423
109	NC_016788	TGGG	2	8	59652	59659	0 %	25 %	75 %	0 %	376247423
110	NC_016788	TTGA	2	8	60647	60654	25 %	50 %	25 %	0 %	376247424
111	NC_016788	GGCC	2	8	61037	61044	0 %	0 %	50 %	50 %	376247424
112	NC_016788	CCAT	2	8	61778	61785	25 %	25 %	0 %	50 %	376247425
113	NC_016788	CGTT	2	8	62056	62063	0 %	50 %	25 %	25 %	376247426
114	NC_016788	ATAG	2	8	63026	63033	50 %	25 %	25 %	0 %	376247426
115	NC_016788	AAAT	2	8	63302	63309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016788	CACC	2	8	63367	63374	25 %	0 %	0 %	75 %	376247427
117	NC_016788	TAAT	2	8	63635	63642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016788	AAAT	2	8	63997	64004	75 %	25 %	0 %	0 %	376247429
119	NC_016788	CCAC	2	8	64080	64087	25 %	0 %	0 %	75 %	376247429
120	NC_016788	GCCA	2	8	64205	64212	25 %	0 %	25 %	50 %	376247429
121	NC_016788	AGCC	2	8	64274	64281	25 %	0 %	25 %	50 %	376247429
122	NC_016788	CCGG	2	8	64380	64387	0 %	0 %	50 %	50 %	376247429
123	NC_016788	ACCC	2	8	65036	65043	25 %	0 %	0 %	75 %	376247430
124	NC_016788	GCAT	2	8	65157	65164	25 %	25 %	25 %	25 %	376247430
125	NC_016788	AGCA	2	8	66385	66392	50 %	0 %	25 %	25 %	376247432
126	NC_016788	GCTG	2	8	66482	66489	0 %	25 %	50 %	25 %	376247432
127	NC_016788	GAAC	2	8	66910	66917	50 %	0 %	25 %	25 %	376247433
128	NC_016788	TCCA	2	8	67283	67290	25 %	25 %	0 %	50 %	376247434
129	NC_016788	GGTG	2	8	67619	67626	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016788	ACTC	2	8	68943	68950	25 %	25 %	0 %	50 %	376247435
131	NC_016788	ACCT	2	8	68968	68975	25 %	25 %	0 %	50 %	376247435
132	NC_016788	TGCT	2	8	69527	69534	0 %	50 %	25 %	25 %	376247436
133	NC_016788	CTTC	2	8	69756	69763	0 %	50 %	0 %	50 %	376247436
134	NC_016788	TGAC	2	8	71834	71841	25 %	25 %	25 %	25 %	376247439
135	NC_016788	AAAC	2	8	72127	72134	75 %	0 %	0 %	25 %	376247439
136	NC_016788	CCTA	2	8	72795	72802	25 %	25 %	0 %	50 %	376247439
137	NC_016788	ATTG	2	8	73273	73280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016788	TGCA	2	8	73576	73583	25 %	25 %	25 %	25 %	376247441
139	NC_016788	TTGG	2	8	75518	75525	0 %	50 %	50 %	0 %	376247442
140	NC_016788	CTGC	2	8	76647	76654	0 %	25 %	25 %	50 %	376247444
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142	NC_016788	GCGG	2	8	77567	77574	0 %	0 %	75 %	25 %	376247444
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