MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016788	CAG	2	6	185850	185855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247550
4002	NC_016788	GCG	2	6	185865	185870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247550
4003	NC_016788	CAC	2	6	185932	185937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247550
4004	NC_016788	GGA	2	6	186036	186041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247550
4005	NC_016788	TTG	2	6	186164	186169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_016788	TG	3	6	186208	186213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_016788	CGC	2	6	186237	186242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_016788	GAA	2	6	186246	186251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_016788	CG	3	6	186262	186267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_016788	TGT	2	6	186331	186336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247551
4011	NC_016788	GT	3	6	186340	186345	0 %	50 %	50 %	0 %	376247551
4012	NC_016788	GCC	2	6	186414	186419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247551
4013	NC_016788	TTA	2	6	186425	186430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247551
4014	NC_016788	GCT	2	6	186497	186502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247551
4015	NC_016788	CGT	2	6	186614	186619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247551
4016	NC_016788	GCT	2	6	186677	186682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247551
4017	NC_016788	GGTG	2	8	186710	186717	0 %	25 %	75 %	0 %	376247551
4018	NC_016788	TGG	2	6	186772	186777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247551
4019	NC_016788	GGT	2	6	186785	186790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247551
4020	NC_016788	TGACGC	2	12	186841	186852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376247551
4021	NC_016788	ATG	3	9	186879	186887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247551
4022	NC_016788	AAG	2	6	186916	186921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247551
4023	NC_016788	GGA	2	6	186938	186943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247551
4024	NC_016788	TGC	2	6	187027	187032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247551
4025	NC_016788	TG	3	6	187094	187099	0 %	50 %	50 %	0 %	376247551
4026	NC_016788	ATG	2	6	187111	187116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247551
4027	NC_016788	GAA	2	6	187181	187186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247551
4028	NC_016788	GCGG	2	8	187209	187216	0 %	0 %	75 %	25 %	376247551
4029	NC_016788	TGAT	2	8	187276	187283	25 %	50 %	25 %	0 %	376247551
4030	NC_016788	ACC	2	6	187494	187499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_016788	AAC	2	6	187503	187508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016788	CAT	2	6	187521	187526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4033	NC_016788	CA	3	6	187545	187550	50 %	0 %	0 %	50 %	376247552
4034	NC_016788	ACT	2	6	187619	187624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4035	NC_016788	ACG	3	9	187655	187663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247552
4036	NC_016788	ACC	2	6	187724	187729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247552
4037	NC_016788	CTA	2	6	187740	187745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4038	NC_016788	CAA	2	6	187780	187785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247552
4039	NC_016788	CGA	2	6	187797	187802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247552
4040	NC_016788	ATCACC	2	12	187813	187824	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	376247552
4041	NC_016788	ATC	2	6	187828	187833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4042	NC_016788	CTAC	2	8	187840	187847	25 %	25 %	0 %	50 %	376247552
4043	NC_016788	CTA	2	6	187851	187856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4044	NC_016788	ACCC	2	8	187893	187900	25 %	0 %	0 %	75 %	376247552
4045	NC_016788	CACC	2	8	187959	187966	25 %	0 %	0 %	75 %	376247552
4046	NC_016788	ACA	2	6	187982	187987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247552
4047	NC_016788	ACG	2	6	188018	188023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247552
4048	NC_016788	ACT	2	6	188076	188081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4049	NC_016788	ACC	2	6	188086	188091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247552
4050	NC_016788	TGA	2	6	188121	188126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247552
4051	NC_016788	ACT	2	6	188142	188147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4052	NC_016788	AGA	2	6	188151	188156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247552
4053	NC_016788	GTG	2	6	188167	188172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247552
4054	NC_016788	GT	3	6	188344	188349	0 %	50 %	50 %	0 %	376247552
4055	NC_016788	GTG	2	6	188379	188384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247552
4056	NC_016788	GAA	2	6	188401	188406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247552
4057	NC_016788	CAT	2	6	188458	188463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247552
4058	NC_016788	TCG	2	6	188481	188486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247552
4059	NC_016788	GGT	2	6	188509	188514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247552
4060	NC_016788	GTG	2	6	188515	188520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247552
4061	NC_016788	GGT	2	6	188544	188549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247552
4062	NC_016788	AGAAA	2	10	188598	188607	80 %	0 %	20 %	0 %	376247552
4063	NC_016788	A	6	6	188611	188616	100 %	0 %	0 %	0 %	376247552
4064	NC_016788	GC	4	8	188638	188645	0 %	0 %	50 %	50 %	376247553
4065	NC_016788	CG	3	6	188655	188660	0 %	0 %	50 %	50 %	376247553
4066	NC_016788	GGC	2	6	188750	188755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247553
4067	NC_016788	CAC	2	6	188766	188771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247553
4068	NC_016788	AGGC	2	8	188826	188833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_016788	GCG	2	6	188896	188901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_016788	GCT	2	6	188921	188926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_016788	TTG	2	6	188930	188935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_016788	GTA	2	6	188936	188941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_016788	TGT	2	6	188952	188957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_016788	GCG	2	6	188959	188964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_016788	GTC	3	9	188969	188977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016788	GCC	2	6	188998	189003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_016788	GCG	2	6	189081	189086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_016788	TGA	2	6	189115	189120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_016788	ATT	2	6	189150	189155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_016788	CTT	2	6	189182	189187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_016788	AAC	2	6	189193	189198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_016788	CGGG	2	8	189209	189216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_016788	TG	3	6	189241	189246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_016788	TCA	2	6	189269	189274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_016788	TCT	2	6	189428	189433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_016788	AGC	2	6	189437	189442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_016788	GAT	2	6	189498	189503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_016788	CTGC	2	8	189552	189559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_016788	CATT	2	8	189568	189575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_016788	TTGGG	2	10	189605	189614	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_016788	GC	3	6	189866	189871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_016788	CCA	2	6	189872	189877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_016788	GCCA	2	8	189890	189897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4094	NC_016788	AGCCA	2	10	189903	189912	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4095	NC_016788	CGAG	2	8	190085	190092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_016788	CA	3	6	190124	190129	50 %	0 %	0 %	50 %	376247554
4097	NC_016788	CTG	2	6	190165	190170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247554
4098	NC_016788	ACCT	2	8	190207	190214	25 %	25 %	0 %	50 %	376247554
4099	NC_016788	AGA	2	6	190215	190220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247554
4100	NC_016788	TACC	2	8	190266	190273	25 %	25 %	0 %	50 %	376247554
4101	NC_016788	CTT	2	6	190350	190355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247554
4102	NC_016788	ATC	2	6	190423	190428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247554
4103	NC_016788	GCA	2	6	190432	190437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247554
4104	NC_016788	CTG	2	6	190513	190518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247554
4105	NC_016788	AAG	2	6	190552	190557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247554
4106	NC_016788	TCC	2	6	190579	190584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247554
4107	NC_016788	ATA	2	6	190604	190609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376247554
4108	NC_016788	GCA	2	6	190663	190668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247554
4109	NC_016788	CGC	2	6	190680	190685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247554
4110	NC_016788	GCAC	2	8	190744	190751	25 %	0 %	25 %	50 %	376247554
4111	NC_016788	ATG	2	6	190786	190791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247554
4112	NC_016788	GGC	2	6	190859	190864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247555
4113	NC_016788	CTG	2	6	190875	190880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247555
4114	NC_016788	ATC	2	6	191001	191006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247555
4115	NC_016788	GTT	2	6	191019	191024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247555
4116	NC_016788	TGC	2	6	191027	191032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247555
4117	NC_016788	CATCGG	2	12	191069	191080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376247555
4118	NC_016788	ACCT	2	8	191235	191242	25 %	25 %	0 %	50 %	376247555
4119	NC_016788	CCG	2	6	191254	191259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247555
4120	NC_016788	CTAC	2	8	191308	191315	25 %	25 %	0 %	50 %	376247555
4121	NC_016788	AGA	3	9	191390	191398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247555
4122	NC_016788	CCT	2	6	191401	191406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247555
4123	NC_016788	TGT	2	6	191420	191425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247555
4124	NC_016788	GTAC	2	8	191534	191541	25 %	25 %	25 %	25 %	376247555
4125	NC_016788	TTC	2	6	191574	191579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247555
4126	NC_016788	TGC	3	9	191650	191658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247555
4127	NC_016788	TGA	2	6	191710	191715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247555
4128	NC_016788	TGA	2	6	191773	191778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247555
4129	NC_016788	ATC	2	6	191814	191819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247555
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4131	NC_016788	ATC	2	6	191880	191885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247555
4132	NC_016788	TGA	2	6	192037	192042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247555
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4240	NC_016788	GTTC	2	8	197330	197337	0 %	50 %	25 %	25 %	376247560
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4246	NC_016788	TGC	2	6	197532	197537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247560
4247	NC_016788	TCC	2	6	197546	197551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247560
4248	NC_016788	ACG	2	6	197664	197669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247560
4249	NC_016788	CCCA	2	8	197712	197719	25 %	0 %	0 %	75 %	376247560
4250	NC_016788	CCAT	2	8	197844	197851	25 %	25 %	0 %	50 %	376247560
4251	NC_016788	GAG	2	6	197914	197919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_016788	TAT	2	6	198077	198082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_016788	A	6	6	198236	198241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_016788	AAGA	2	8	198244	198251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_016788	TGG	2	6	198331	198336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247561
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4257	NC_016788	CTG	2	6	198379	198384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247561
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4262	NC_016788	GAA	2	6	198810	198815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247561
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4282	NC_016788	GAA	2	6	199768	199773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247561
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4311	NC_016788	AGG	2	6	201540	201545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4313	NC_016788	TGT	2	6	201597	201602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4315	NC_016788	TCT	2	6	201650	201655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4318	NC_016788	GAAA	2	8	201752	201759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4319	NC_016788	TGACCA	2	12	201768	201779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376247562
4320	NC_016788	TTC	2	6	201869	201874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247562
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4332	NC_016788	CAC	2	6	202165	202170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247562
4333	NC_016788	GGT	2	6	202186	202191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247562
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4349	NC_016788	CGG	3	9	203065	203073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247563
4350	NC_016788	AGC	2	6	203136	203141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247563
4351	NC_016788	GC	3	6	203147	203152	0 %	0 %	50 %	50 %	376247563
4352	NC_016788	GGA	2	6	203153	203158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247563
4353	NC_016788	GTAG	2	8	203194	203201	25 %	25 %	50 %	0 %	376247563
4354	NC_016788	TCG	2	6	203217	203222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247563
4355	NC_016788	GCG	2	6	203298	203303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247563
4356	NC_016788	AGGGCT	2	12	203325	203336	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	376247563
4357	NC_016788	ATC	3	9	203345	203353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247563
4358	NC_016788	TTCATG	2	12	203367	203378	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	376247563
4359	NC_016788	A	7	7	203419	203425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_016788	AGG	2	6	203493	203498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_016788	AGC	2	6	203552	203557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247564
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4363	NC_016788	CGG	2	6	203576	203581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247564
4364	NC_016788	ACA	2	6	203926	203931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247564
4365	NC_016788	CTT	2	6	203939	203944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247564
4366	NC_016788	ACCT	2	8	204072	204079	25 %	25 %	0 %	50 %	376247564
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4368	NC_016788	GCCA	2	8	204163	204170	25 %	0 %	25 %	50 %	376247564
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4480	NC_016788	CA	3	6	208386	208391	50 %	0 %	0 %	50 %	376247567
4481	NC_016788	GCC	2	6	208417	208422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247567
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4483	NC_016788	CA	3	6	208501	208506	50 %	0 %	0 %	50 %	376247567
4484	NC_016788	CAT	2	6	208513	208518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247567
4485	NC_016788	ATA	2	6	208527	208532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376247567
4486	NC_016788	CAG	2	6	208537	208542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247567
4487	NC_016788	GTAACC	2	12	208609	208620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	376247567
4488	NC_016788	TCC	2	6	208685	208690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4489	NC_016788	CTT	2	6	208756	208761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247568
4490	NC_016788	CTC	2	6	208762	208767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247568
4491	NC_016788	AAG	2	6	208856	208861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247568
4492	NC_016788	CAG	2	6	208891	208896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247568
4493	NC_016788	CAG	2	6	208920	208925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247568
4494	NC_016788	CCA	2	6	209000	209005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247568
4495	NC_016788	AAC	2	6	209096	209101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247568
4496	NC_016788	AGC	2	6	209107	209112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247568
4497	NC_016788	CAAC	2	8	209143	209150	50 %	0 %	0 %	50 %	376247568
4498	NC_016788	AGCC	2	8	209172	209179	25 %	0 %	25 %	50 %	376247568
4499	NC_016788	AGC	2	6	209188	209193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247568
4500	NC_016788	TGC	2	6	209228	209233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247568

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