MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016788	GC	3	6	161863	161868	0 %	0 %	50 %	50 %	376247529
3502	NC_016788	CGC	2	6	161959	161964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247529
3503	NC_016788	CG	3	6	162032	162037	0 %	0 %	50 %	50 %	376247529
3504	NC_016788	ACT	2	6	162159	162164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247530
3505	NC_016788	GCCG	2	8	162273	162280	0 %	0 %	50 %	50 %	376247530
3506	NC_016788	TTC	2	6	162302	162307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247530
3507	NC_016788	GTT	2	6	162379	162384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247530
3508	NC_016788	ATT	2	6	162627	162632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247530
3509	NC_016788	AAC	2	6	162664	162669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247530
3510	NC_016788	TGCC	2	8	162689	162696	0 %	25 %	25 %	50 %	376247530
3511	NC_016788	GTT	2	6	162698	162703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247530
3512	NC_016788	GCT	2	6	162859	162864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3513	NC_016788	CAA	2	6	162921	162926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247530
3514	NC_016788	GGC	2	6	163011	163016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247530
3515	NC_016788	TAC	2	6	163028	163033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247530
3516	NC_016788	CAG	2	6	163038	163043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3517	NC_016788	ACA	2	6	163157	163162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247530
3518	NC_016788	CGA	2	6	163173	163178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247530
3519	NC_016788	AAG	2	6	163211	163216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247530
3520	NC_016788	CA	3	6	163230	163235	50 %	0 %	0 %	50 %	376247530
3521	NC_016788	ATT	2	6	163372	163377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247530
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3523	NC_016788	ACC	2	6	163514	163519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_016788	AC	3	6	163585	163590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_016788	ACCCC	2	10	163678	163687	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3526	NC_016788	ACC	2	6	163702	163707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_016788	AAACAC	2	12	163710	163721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3529	NC_016788	CA	4	8	163836	163843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_016788	AC	3	6	163852	163857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_016788	AAC	2	6	163863	163868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_016788	GGC	2	6	163937	163942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_016788	AGCA	2	8	163955	163962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_016788	CAC	2	6	163980	163985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_016788	TGA	2	6	163989	163994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016788	TCG	2	6	164199	164204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_016788	ATT	2	6	164234	164239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016788	GTC	2	6	164296	164301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_016788	TGG	2	6	164328	164333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016788	CAA	2	6	164344	164349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_016788	ATA	2	6	164364	164369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016788	TG	4	8	164457	164464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016788	CG	3	6	164497	164502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_016788	GCT	2	6	164575	164580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247531
3545	NC_016788	AGT	2	6	164655	164660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247531
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3549	NC_016788	TTG	2	6	164898	164903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016788	CGC	2	6	164912	164917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_016788	TTGA	2	8	164944	164951	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_016788	TGT	2	6	164962	164967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_016788	AGT	2	6	165007	165012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_016788	ACT	2	6	165087	165092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_016788	TGC	2	6	165108	165113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_016788	GAAA	2	8	165130	165137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016788	TCC	2	6	165189	165194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247532
3558	NC_016788	AGGA	2	8	165200	165207	50 %	0 %	50 %	0 %	376247532
3559	NC_016788	ACT	2	6	165409	165414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247532
3560	NC_016788	CAA	2	6	165415	165420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247532
3561	NC_016788	GTT	2	6	165429	165434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247532
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3563	NC_016788	AATTA	2	10	165513	165522	60 %	40 %	0 %	0 %	376247532
3564	NC_016788	AGC	2	6	165560	165565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247532
3565	NC_016788	CGC	2	6	165680	165685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247533
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3570	NC_016788	GC	3	6	165827	165832	0 %	0 %	50 %	50 %	376247533
3571	NC_016788	CT	3	6	165847	165852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_016788	AAT	2	6	165916	165921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_016788	GCC	2	6	165926	165931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_016788	AGT	2	6	165978	165983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_016788	ATC	2	6	166180	166185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3581	NC_016788	GCTG	2	8	166446	166453	0 %	25 %	50 %	25 %	376247534
3582	NC_016788	GTG	2	6	166483	166488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247534
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3584	NC_016788	TGA	2	6	166586	166591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247534
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3592	NC_016788	CTG	2	6	166906	166911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247534
3593	NC_016788	ACT	2	6	167030	167035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247534
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3595	NC_016788	GCT	2	6	167067	167072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247534
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3597	NC_016788	GGT	2	6	167127	167132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247534
3598	NC_016788	ATC	2	6	167152	167157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247534
3599	NC_016788	TGCGG	2	10	167298	167307	0 %	20 %	60 %	20 %	376247534
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3601	NC_016788	GTGG	2	8	167355	167362	0 %	25 %	75 %	0 %	376247534
3602	NC_016788	CG	3	6	167374	167379	0 %	0 %	50 %	50 %	376247534
3603	NC_016788	GTG	2	6	167386	167391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247534
3604	NC_016788	CGT	2	6	167403	167408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247534
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3606	NC_016788	CG	3	6	167611	167616	0 %	0 %	50 %	50 %	376247534
3607	NC_016788	GGC	3	9	167646	167654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247534
3608	NC_016788	GCG	2	6	167659	167664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247534
3609	NC_016788	ATT	2	6	167674	167679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376247534
3610	NC_016788	GGA	2	6	167733	167738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376247534
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3612	NC_016788	GTT	2	6	167754	167759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247534
3613	NC_016788	GTC	2	6	167772	167777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247534
3614	NC_016788	AGA	2	6	167781	167786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247534
3615	NC_016788	AGC	2	6	167798	167803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247534
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3619	NC_016788	GGCG	2	8	167910	167917	0 %	0 %	75 %	25 %	376247534
3620	NC_016788	TGG	2	6	167942	167947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247534
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3623	NC_016788	GCA	2	6	167981	167986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247534
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3861	NC_016788	CCTGCT	2	12	178472	178483	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	376247543
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3863	NC_016788	AGCCA	2	10	178616	178625	40 %	0 %	20 %	40 %	376247543
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3986	NC_016788	CCT	2	6	184745	184750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247550
3987	NC_016788	CGC	2	6	184826	184831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247550
3988	NC_016788	TGG	2	6	185017	185022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247550
3989	NC_016788	CCA	2	6	185053	185058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247550
3990	NC_016788	CTG	3	9	185264	185272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247550
3991	NC_016788	GAT	2	6	185313	185318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247550
3992	NC_016788	ATC	2	6	185383	185388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247550
3993	NC_016788	TGA	3	9	185408	185416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247550
3994	NC_016788	CGA	2	6	185447	185452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247550
3995	NC_016788	CGA	2	6	185459	185464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247550
3996	NC_016788	CGAT	2	8	185549	185556	25 %	25 %	25 %	25 %	376247550
3997	NC_016788	GCA	2	6	185569	185574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247550
3998	NC_016788	TGC	2	6	185595	185600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247550
3999	NC_016788	TAC	2	6	185616	185621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247550
4000	NC_016788	AAGTCG	2	12	185785	185796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	376247550

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