MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC04 chromosome

Total Repeats: 50523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_016788	ACG	2	6	254176	254181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5503	NC_016788	GTT	2	6	254214	254219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247612
5504	NC_016788	GAT	2	6	254280	254285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247612
5505	NC_016788	GGT	2	6	254355	254360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247612
5506	NC_016788	CGC	2	6	254381	254386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247612
5507	NC_016788	AGC	2	6	254419	254424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5508	NC_016788	GAT	2	6	254436	254441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247612
5509	NC_016788	CCA	2	6	254533	254538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247612
5510	NC_016788	GAT	2	6	254559	254564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247612
5511	NC_016788	GGC	2	6	254586	254591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247612
5512	NC_016788	GA	3	6	254595	254600	50 %	0 %	50 %	0 %	376247612
5513	NC_016788	TTC	2	6	254655	254660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376247612
5514	NC_016788	TCG	2	6	254683	254688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5515	NC_016788	GCG	2	6	254757	254762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247612
5516	NC_016788	GCC	2	6	254793	254798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247612
5517	NC_016788	GGT	2	6	254817	254822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247612
5518	NC_016788	CCA	2	6	254841	254846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247612
5519	NC_016788	TGT	2	6	254924	254929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247612
5520	NC_016788	GCA	2	6	254983	254988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5521	NC_016788	TGC	2	6	255039	255044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5522	NC_016788	GAT	3	9	255072	255080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247612
5523	NC_016788	GC	3	6	255082	255087	0 %	0 %	50 %	50 %	376247612
5524	NC_016788	ACG	2	6	255145	255150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247612
5525	NC_016788	CT	3	6	255157	255162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5526	NC_016788	TTA	2	6	255187	255192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016788	GAAAA	2	10	255212	255221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016788	ATG	2	6	255270	255275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247613
5529	NC_016788	TGC	2	6	255384	255389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5530	NC_016788	CGT	2	6	255400	255405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5531	NC_016788	TAG	2	6	255406	255411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247613
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5533	NC_016788	GAT	2	6	255467	255472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247613
5534	NC_016788	GCC	2	6	255560	255565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247613
5535	NC_016788	TGC	2	6	255571	255576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5536	NC_016788	CACCG	2	10	255587	255596	20 %	0 %	20 %	60 %	376247613
5537	NC_016788	AGC	2	6	255621	255626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247613
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5539	NC_016788	GTC	2	6	255710	255715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5540	NC_016788	GCG	3	9	255726	255734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247613
5541	NC_016788	GTA	2	6	255755	255760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247613
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5543	NC_016788	CGT	3	9	255895	255903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5544	NC_016788	ACG	2	6	255982	255987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5545	NC_016788	TGC	2	6	256024	256029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
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5549	NC_016788	GTA	2	6	256249	256254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247613
5550	NC_016788	CGT	2	6	256276	256281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
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5552	NC_016788	GGC	2	6	256553	256558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247613
5553	NC_016788	GAC	2	6	256625	256630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5554	NC_016788	TCG	2	6	256686	256691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247613
5555	NC_016788	GT	3	6	256755	256760	0 %	50 %	50 %	0 %	376247613
5556	NC_016788	GCCAC	2	10	256770	256779	20 %	0 %	20 %	60 %	376247613
5557	NC_016788	GC	3	6	256913	256918	0 %	0 %	50 %	50 %	376247613
5558	NC_016788	GTGGG	2	10	256924	256933	0 %	20 %	80 %	0 %	376247613
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5570	NC_016788	TGG	2	6	257260	257265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247613
5571	NC_016788	ACACC	2	10	257380	257389	40 %	0 %	0 %	60 %	376247614
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5574	NC_016788	ACG	2	6	257512	257517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
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5579	NC_016788	GCCTC	2	10	257620	257629	0 %	20 %	20 %	60 %	376247614
5580	NC_016788	GAC	2	6	257637	257642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
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5583	NC_016788	CG	3	6	257691	257696	0 %	0 %	50 %	50 %	376247614
5584	NC_016788	GAC	2	6	257700	257705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
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5586	NC_016788	ACT	2	6	257798	257803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247614
5587	NC_016788	ACG	2	6	257818	257823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5588	NC_016788	ATC	2	6	257835	257840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247614
5589	NC_016788	ATCGCC	2	12	257907	257918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	376247614
5590	NC_016788	CGGCAT	2	12	257927	257938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5591	NC_016788	TCG	2	6	258010	258015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247614
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5593	NC_016788	CGA	2	6	258113	258118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247614
5594	NC_016788	CTAA	2	8	258272	258279	50 %	25 %	0 %	25 %	376247614
5595	NC_016788	CTAA	2	8	258284	258291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_016788	TCA	2	6	258339	258344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5597	NC_016788	TCA	2	6	258372	258377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5598	NC_016788	GC	3	6	258407	258412	0 %	0 %	50 %	50 %	376247615
5599	NC_016788	CGC	2	6	258475	258480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5600	NC_016788	ACC	2	6	258526	258531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5601	NC_016788	CCA	2	6	258543	258548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5602	NC_016788	GCG	2	6	258617	258622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247615
5603	NC_016788	CAGC	2	8	258672	258679	25 %	0 %	25 %	50 %	376247615
5604	NC_016788	GCA	2	6	258680	258685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5605	NC_016788	TAA	2	6	258702	258707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376247615
5606	NC_016788	TTG	2	6	258713	258718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376247615
5607	NC_016788	CCA	2	6	258732	258737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
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5610	NC_016788	CTC	2	6	258868	258873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376247615
5611	NC_016788	GC	3	6	258878	258883	0 %	0 %	50 %	50 %	376247615
5612	NC_016788	CAT	2	6	258952	258957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376247615
5613	NC_016788	CGT	2	6	258996	259001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5614	NC_016788	CCA	2	6	259074	259079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5615	NC_016788	GTG	2	6	259097	259102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247615
5616	NC_016788	GTG	2	6	259189	259194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376247615
5617	NC_016788	CAA	2	6	259207	259212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247615
5618	NC_016788	CGG	2	6	259273	259278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247615
5619	NC_016788	ACG	2	6	259300	259305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247615
5620	NC_016788	GCC	2	6	259319	259324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
5621	NC_016788	CAC	2	6	259363	259368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5622	NC_016788	CAC	2	6	259377	259382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5623	NC_016788	CAC	2	6	259471	259476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247615
5624	NC_016788	CGC	2	6	259486	259491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376247615
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5633	NC_016788	CGCA	2	8	259957	259964	25 %	0 %	25 %	50 %	376247616
5634	NC_016788	AC	3	6	259988	259993	50 %	0 %	0 %	50 %	376247616
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5666	NC_016788	GCC	2	6	261180	261185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5672	NC_016788	CATG	2	8	261439	261446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5673	NC_016788	GACA	2	8	261463	261470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5674	NC_016788	GAG	2	6	261473	261478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5681	NC_016788	AAC	2	6	261792	261797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5682	NC_016788	TGA	2	6	261827	261832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5699	NC_016788	CTGC	2	8	262671	262678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5732	NC_016788	CCAGT	2	10	264082	264091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5734	NC_016788	CAGA	2	8	264129	264136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5735	NC_016788	GAA	2	6	264195	264200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5736	NC_016788	GATTT	2	10	264220	264229	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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5743	NC_016788	TGT	2	6	264518	264523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5991	NC_016788	TGC	2	6	276401	276406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5992	NC_016788	ATG	2	6	276431	276436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376247635
5993	NC_016788	GAA	2	6	276472	276477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376247635
5994	NC_016788	CAC	2	6	276515	276520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376247635
5995	NC_016788	CT	3	6	276554	276559	0 %	50 %	0 %	50 %	376247635
5996	NC_016788	AAC	2	6	276641	276646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376247635
5997	NC_016788	ACG	2	6	276705	276710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376247635
5998	NC_016788	ACGC	2	8	276742	276749	25 %	0 %	25 %	50 %	376247635
5999	NC_016788	AATTC	2	10	276870	276879	40 %	40 %	0 %	20 %	376247635
6000	NC_016788	GCG	3	9	276897	276905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376247635

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