MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC03 chromosome

Total Repeats: 50349

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016787	GCT	2	6	166990	166995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250341
3502	NC_016787	CAA	2	6	167037	167042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250341
3503	NC_016787	CTA	2	6	167096	167101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250341
3504	NC_016787	ACT	2	6	167102	167107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250341
3505	NC_016787	GTA	2	6	167120	167125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250341
3506	NC_016787	GCC	3	9	167168	167176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250341
3507	NC_016787	A	6	6	167212	167217	100 %	0 %	0 %	0 %	376250341
3508	NC_016787	ACG	2	6	167230	167235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250341
3509	NC_016787	CGT	2	6	167260	167265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250341
3510	NC_016787	GT	3	6	167280	167285	0 %	50 %	50 %	0 %	376250341
3511	NC_016787	AAG	2	6	167338	167343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250341
3512	NC_016787	AC	3	6	167381	167386	50 %	0 %	0 %	50 %	376250341
3513	NC_016787	GCT	2	6	167413	167418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250341
3514	NC_016787	CGGG	2	8	167482	167489	0 %	0 %	75 %	25 %	376250341
3515	NC_016787	TGA	2	6	167506	167511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250341
3516	NC_016787	TAC	2	6	167515	167520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250341
3517	NC_016787	G	7	7	167563	167569	0 %	0 %	100 %	0 %	376250341
3518	NC_016787	CGT	2	6	167646	167651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250341
3519	NC_016787	GAA	2	6	167655	167660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016787	TGTT	2	8	167680	167687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016787	GGTA	2	8	167896	167903	25 %	25 %	50 %	0 %	376250342
3522	NC_016787	GGTG	2	8	167912	167919	0 %	25 %	75 %	0 %	376250342
3523	NC_016787	GTT	2	6	168007	168012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250342
3524	NC_016787	TGG	2	6	168072	168077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376250342
3525	NC_016787	ATT	2	6	168083	168088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376250342
3526	NC_016787	GGA	2	6	168231	168236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376250342
3527	NC_016787	AGC	2	6	168329	168334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250342
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3529	NC_016787	GTT	2	6	168394	168399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016787	TGT	2	6	168400	168405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016787	GGT	2	6	168411	168416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016787	GGT	2	6	168431	168436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_016787	A	6	6	168459	168464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016787	GCG	2	6	168474	168479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_016787	TGA	2	6	168500	168505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016787	TAGCGT	2	12	168522	168533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3537	NC_016787	CTG	2	6	168607	168612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250343
3538	NC_016787	AGC	2	6	168674	168679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250343
3539	NC_016787	TAG	2	6	168891	168896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250344
3540	NC_016787	TCGG	2	8	168903	168910	0 %	25 %	50 %	25 %	376250344
3541	NC_016787	TAC	2	6	168954	168959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250344
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3543	NC_016787	AGC	2	6	169253	169258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250345
3544	NC_016787	CA	3	6	169265	169270	50 %	0 %	0 %	50 %	376250345
3545	NC_016787	TCC	2	6	169321	169326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376250345
3546	NC_016787	CCG	2	6	169344	169349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250345
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3549	NC_016787	CGC	2	6	169665	169670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376250345
3550	NC_016787	CG	3	6	169738	169743	0 %	0 %	50 %	50 %	376250345
3551	NC_016787	ACT	2	6	169865	169870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250346
3552	NC_016787	GCCG	2	8	169979	169986	0 %	0 %	50 %	50 %	376250346
3553	NC_016787	TTC	2	6	170008	170013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250346
3554	NC_016787	GTT	2	6	170085	170090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250346
3555	NC_016787	ATT	2	6	170333	170338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376250346
3556	NC_016787	AAC	2	6	170370	170375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250346
3557	NC_016787	TGCC	2	8	170395	170402	0 %	25 %	25 %	50 %	376250346
3558	NC_016787	GTT	2	6	170404	170409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250346
3559	NC_016787	GCT	2	6	170565	170570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250346
3560	NC_016787	CAA	2	6	170627	170632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250346
3561	NC_016787	GGC	2	6	170717	170722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376250346
3562	NC_016787	TAC	2	6	170734	170739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250346
3563	NC_016787	CAG	2	6	170744	170749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250346
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3565	NC_016787	CGA	2	6	170879	170884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250346
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3567	NC_016787	CA	3	6	170936	170941	50 %	0 %	0 %	50 %	376250346
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3570	NC_016787	ACC	2	6	171220	171225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_016787	AC	3	6	171291	171296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_016787	ACCCC	2	10	171384	171393	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3573	NC_016787	ACC	2	6	171408	171413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_016787	AAACAC	2	12	171416	171427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_016787	CCA	2	6	171522	171527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_016787	CA	4	8	171542	171549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_016787	AC	3	6	171558	171563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3578	NC_016787	AAC	2	6	171569	171574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_016787	GGC	2	6	171643	171648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3581	NC_016787	CAC	2	6	171686	171691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_016787	TGA	2	6	171695	171700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016787	TCG	2	6	171905	171910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_016787	ATT	2	6	171940	171945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_016787	GTC	2	6	172002	172007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_016787	TGG	2	6	172034	172039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016787	CAA	2	6	172050	172055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_016787	ATA	2	6	172070	172075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016787	TG	4	8	172163	172170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_016787	CG	3	6	172203	172208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_016787	GCT	2	6	172281	172286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250347
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3595	NC_016787	ATGTG	2	10	172496	172505	20 %	40 %	40 %	0 %	376250347
3596	NC_016787	TTG	2	6	172604	172609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_016787	CGC	2	6	172618	172623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_016787	TTGA	2	8	172650	172657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016787	TGT	2	6	172668	172673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016787	AGT	2	6	172713	172718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016787	ACT	2	6	172793	172798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_016787	TGC	2	6	172814	172819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_016787	GAAA	2	8	172836	172843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016787	TCC	2	6	172895	172900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376250348
3605	NC_016787	AGGA	2	8	172906	172913	50 %	0 %	50 %	0 %	376250348
3606	NC_016787	ACT	2	6	173115	173120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376250348
3607	NC_016787	CAA	2	6	173121	173126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376250348
3608	NC_016787	GTT	2	6	173135	173140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376250348
3609	NC_016787	CCA	2	6	173194	173199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376250348
3610	NC_016787	AATTA	2	10	173219	173228	60 %	40 %	0 %	0 %	376250348
3611	NC_016787	AGC	2	6	173266	173271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250348
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3613	NC_016787	GT	3	6	173404	173409	0 %	50 %	50 %	0 %	376250349
3614	NC_016787	AGA	2	6	173494	173499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376250349
3615	NC_016787	GCT	2	6	173519	173524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250349
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3618	NC_016787	CT	3	6	173553	173558	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_016787	AAT	2	6	173622	173627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_016787	GCC	2	6	173632	173637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_016787	AGT	2	6	173684	173689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016787	ACT	2	6	173764	173769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_016787	CCGC	2	8	173774	173781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3624	NC_016787	ATC	2	6	173887	173892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3868	NC_016787	GT	3	6	183863	183868	0 %	50 %	50 %	0 %	376250357
3869	NC_016787	CTT	2	6	183870	183875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376250357
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3880	NC_016787	ATTC	2	8	184399	184406	25 %	50 %	0 %	25 %	376250358
3881	NC_016787	CGA	2	6	184449	184454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250358
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3897	NC_016787	TCG	2	6	185325	185330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250359
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3972	NC_016787	GCTTCG	2	12	188518	188529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376250362
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3984	NC_016787	GT	3	6	188887	188892	0 %	50 %	50 %	0 %	376250362
3985	NC_016787	CAAAAG	2	12	188903	188914	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	376250362
3986	NC_016787	CGA	2	6	188917	188922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376250362
3987	NC_016787	GTTGC	2	10	188947	188956	0 %	40 %	40 %	20 %	376250362
3988	NC_016787	AGTTGC	2	12	188970	188981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	376250362
3989	NC_016787	GAT	2	6	188982	188987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376250362
3990	NC_016787	GAGT	2	8	188993	189000	25 %	25 %	50 %	0 %	376250362
3991	NC_016787	TG	3	6	189065	189070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_016787	GAA	2	6	189087	189092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_016787	AT	3	6	189097	189102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_016787	T	6	6	189106	189111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_016787	T	6	6	189250	189255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_016787	GCT	2	6	189300	189305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_016787	GTT	2	6	189347	189352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3999	NC_016787	GCT	2	6	189373	189378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_016787	GAA	2	6	189401	189406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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