MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium diphtheriae HC01 chromosome

Total Repeats: 49319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_016786	CCGC	2	8	187679	187686	0 %	0 %	25 %	75 %	376244772
4003	NC_016786	GCA	2	6	187730	187735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244772
4004	NC_016786	GCA	2	6	187758	187763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244772
4005	NC_016786	CAA	2	6	187786	187791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244772
4006	NC_016786	CCA	2	6	187850	187855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244772
4007	NC_016786	CTC	2	6	187873	187878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376244772
4008	NC_016786	CACC	2	8	187992	187999	25 %	0 %	0 %	75 %	376244772
4009	NC_016786	TAA	2	6	188012	188017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376244772
4010	NC_016786	CAA	2	6	188107	188112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244772
4011	NC_016786	CAG	2	6	188130	188135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244772
4012	NC_016786	ACC	2	6	188149	188154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4013	NC_016786	CCG	2	6	188164	188169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244773
4014	NC_016786	ACG	2	6	188198	188203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244773
4015	NC_016786	AAC	3	9	188221	188229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244773
4016	NC_016786	CCA	2	6	188234	188239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4017	NC_016786	CCG	2	6	188264	188269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244773
4018	NC_016786	AC	3	6	188280	188285	50 %	0 %	0 %	50 %	376244773
4019	NC_016786	CTC	2	6	188298	188303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376244773
4020	NC_016786	CCA	2	6	188309	188314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4021	NC_016786	GCA	2	6	188317	188322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244773
4022	NC_016786	CAGC	2	8	188390	188397	25 %	0 %	25 %	50 %	376244773
4023	NC_016786	CAC	2	6	188417	188422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4024	NC_016786	TCG	2	6	188447	188452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244773
4025	NC_016786	CCA	2	6	188480	188485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4026	NC_016786	CAG	2	6	188504	188509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244773
4027	NC_016786	CAA	2	6	188567	188572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376244773
4028	NC_016786	ATT	2	6	188631	188636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376244773
4029	NC_016786	CCG	2	6	188681	188686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244773
4030	NC_016786	CCG	3	9	188744	188752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244773
4031	NC_016786	CCA	2	6	188873	188878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244773
4032	NC_016786	TGGGG	2	10	188909	188918	0 %	20 %	80 %	0 %	376244773
4033	NC_016786	CCT	2	6	188965	188970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376244773
4034	NC_016786	TCCTG	2	10	189018	189027	0 %	40 %	20 %	40 %	376244773
4035	NC_016786	GAG	2	6	189050	189055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244773
4036	NC_016786	AAAACA	2	12	189093	189104	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	376244773
4037	NC_016786	GGA	2	6	189143	189148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016786	TCC	2	6	189222	189227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_016786	AC	3	6	189267	189272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_016786	GTGG	2	8	189311	189318	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016786	TGG	3	9	189316	189324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_016786	GCA	2	6	189409	189414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_016786	GGT	2	6	189474	189479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_016786	CGT	2	6	189535	189540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_016786	ATG	2	6	189596	189601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244774
4046	NC_016786	CTCGT	2	10	189605	189614	0 %	40 %	20 %	40 %	376244774
4047	NC_016786	AGC	2	6	189704	189709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244774
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4050	NC_016786	TGG	2	6	189786	189791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244774
4051	NC_016786	CTG	2	6	189793	189798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244774
4052	NC_016786	CTG	2	6	189845	189850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244774
4053	NC_016786	TGG	3	9	189854	189862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244774
4054	NC_016786	CAT	2	6	189885	189890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244774
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4056	NC_016786	GGA	2	6	189954	189959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244774
4057	NC_016786	GAT	2	6	190032	190037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244774
4058	NC_016786	CGA	2	6	190254	190259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244774
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4060	NC_016786	CTT	2	6	190371	190376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244774
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4062	NC_016786	GCCA	2	8	190408	190415	25 %	0 %	25 %	50 %	376244774
4063	NC_016786	GCG	2	6	190516	190521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244774
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4071	NC_016786	ATTC	2	8	190900	190907	25 %	50 %	0 %	25 %	376244775
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4078	NC_016786	TGA	2	6	191250	191255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244775
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4092	NC_016786	CTG	2	6	191957	191962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244776
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4094	NC_016786	CG	3	6	192042	192047	0 %	0 %	50 %	50 %	376244776
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4101	NC_016786	ACCG	2	8	192335	192342	25 %	0 %	25 %	50 %	376244776
4102	NC_016786	TCC	2	6	192351	192356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376244776
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4104	NC_016786	ACG	2	6	192414	192419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244776
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4106	NC_016786	CAC	2	6	192498	192503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244776
4107	NC_016786	GCA	2	6	192506	192511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244776
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4109	NC_016786	CTG	3	9	192540	192548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244776
4110	NC_016786	TCCG	2	8	192596	192603	0 %	25 %	25 %	50 %	376244776
4111	NC_016786	GCC	2	6	192617	192622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244776
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4115	NC_016786	CG	3	6	192693	192698	0 %	0 %	50 %	50 %	376244776
4116	NC_016786	GTA	2	6	192938	192943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244776
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4118	NC_016786	CCTGCC	2	12	193055	193066	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	376244776
4119	NC_016786	TGCGCC	2	12	193084	193095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	376244776
4120	NC_016786	GGT	2	6	193100	193105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244776
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4230	NC_016786	GCA	2	6	198207	198212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244782
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4234	NC_016786	CCGCC	2	10	198399	198408	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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4237	NC_016786	GGT	2	6	198473	198478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_016786	AGT	2	6	198557	198562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4242	NC_016786	GCG	2	6	198777	198782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244783
4243	NC_016786	GTC	2	6	198810	198815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244783
4244	NC_016786	GGCG	2	8	198835	198842	0 %	0 %	75 %	25 %	376244783
4245	NC_016786	GCA	2	6	198873	198878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244783
4246	NC_016786	CGC	2	6	198967	198972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244783
4247	NC_016786	GAA	2	6	199002	199007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244783
4248	NC_016786	ACC	2	6	199070	199075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244783
4249	NC_016786	TGG	2	6	199260	199265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244783
4250	NC_016786	CCA	2	6	199296	199301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244783
4251	NC_016786	CTG	3	9	199507	199515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244783
4252	NC_016786	GAT	2	6	199556	199561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244783
4253	NC_016786	ATC	2	6	199626	199631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244783
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4256	NC_016786	CGA	2	6	199702	199707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244783
4257	NC_016786	CGAT	2	8	199792	199799	25 %	25 %	25 %	25 %	376244783
4258	NC_016786	GCA	2	6	199812	199817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244783
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4260	NC_016786	TAC	2	6	199859	199864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244783
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4262	NC_016786	CAG	2	6	200093	200098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244783
4263	NC_016786	GCG	2	6	200108	200113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244783
4264	NC_016786	CAC	2	6	200175	200180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244783
4265	NC_016786	GGA	2	6	200279	200284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244783
4266	NC_016786	CAC	2	6	200326	200331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244783
4267	NC_016786	TTG	2	6	200408	200413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_016786	TG	3	6	200452	200457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4269	NC_016786	CGC	2	6	200481	200486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4270	NC_016786	GAA	2	6	200490	200495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4271	NC_016786	CG	3	6	200506	200511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4272	NC_016786	TGT	2	6	200575	200580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244784
4273	NC_016786	GT	3	6	200584	200589	0 %	50 %	50 %	0 %	376244784
4274	NC_016786	TGC	2	6	200657	200662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244784
4275	NC_016786	TTA	2	6	200669	200674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376244784
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4278	NC_016786	GCT	2	6	200921	200926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244784
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4280	NC_016786	TGG	2	6	201016	201021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244784
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4288	NC_016786	TG	3	6	201338	201343	0 %	50 %	50 %	0 %	376244784
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4295	NC_016786	CAT	2	6	201764	201769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244785
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4297	NC_016786	ACT	2	6	201862	201867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244785
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4300	NC_016786	CTA	2	6	201983	201988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244785
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4322	NC_016786	TCG	2	6	202724	202729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244785
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4324	NC_016786	GTG	2	6	202758	202763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244785
4325	NC_016786	GGT	2	6	202787	202792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244785
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4327	NC_016786	A	6	6	202854	202859	100 %	0 %	0 %	0 %	376244785
4328	NC_016786	GC	4	8	202881	202888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4329	NC_016786	CG	3	6	202898	202903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4330	NC_016786	ACT	2	6	202993	202998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4331	NC_016786	CGAG	2	8	203030	203037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4332	NC_016786	CA	3	6	203069	203074	50 %	0 %	0 %	50 %	376244786
4333	NC_016786	CTG	2	6	203110	203115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244786
4334	NC_016786	ACCT	2	8	203152	203159	25 %	25 %	0 %	50 %	376244786
4335	NC_016786	AGA	2	6	203160	203165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244786
4336	NC_016786	TACC	2	8	203211	203218	25 %	25 %	0 %	50 %	376244786
4337	NC_016786	CTT	2	6	203295	203300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244786
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4351	NC_016786	TGC	2	6	203972	203977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244787
4352	NC_016786	CATCGG	2	12	204014	204025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	376244787
4353	NC_016786	ACCT	2	8	204180	204187	25 %	25 %	0 %	50 %	376244787
4354	NC_016786	CCG	2	6	204199	204204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244787
4355	NC_016786	CTAC	2	8	204253	204260	25 %	25 %	0 %	50 %	376244787
4356	NC_016786	AGA	3	9	204335	204343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244787
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4360	NC_016786	TTC	2	6	204519	204524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244787
4361	NC_016786	TGC	3	9	204595	204603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244787
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4364	NC_016786	ATC	2	6	204759	204764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244787
4365	NC_016786	GC	3	6	204781	204786	0 %	0 %	50 %	50 %	376244787
4366	NC_016786	ATC	2	6	204825	204830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376244787
4367	NC_016786	GCT	2	6	204851	204856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244787
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4369	NC_016786	TGA	2	6	204982	204987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244787
4370	NC_016786	CG	3	6	205071	205076	0 %	0 %	50 %	50 %	376244787
4371	NC_016786	CCAC	2	8	205133	205140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4372	NC_016786	CAA	2	6	205155	205160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4373	NC_016786	ACG	2	6	205175	205180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244788
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4385	NC_016786	CTGA	2	8	205552	205559	25 %	25 %	25 %	25 %	376244788
4386	NC_016786	CGA	2	6	205560	205565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244788
4387	NC_016786	TCG	2	6	205568	205573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244788
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4392	NC_016786	GAA	2	6	205801	205806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376244788
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4400	NC_016786	CCA	2	6	206140	206145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244789
4401	NC_016786	CGG	2	6	206173	206178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	376244789
4402	NC_016786	CTG	2	6	206186	206191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244789
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4428	NC_016786	AAC	2	6	207485	207490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4429	NC_016786	ACC	2	6	207564	207569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244790
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4463	NC_016786	TCG	2	6	209105	209110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244791
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4472	NC_016786	GAG	2	6	209287	209292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376244791
4473	NC_016786	CGAGG	2	10	209359	209368	20 %	0 %	60 %	20 %	376244791
4474	NC_016786	GCA	2	6	209425	209430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4475	NC_016786	ACG	2	6	209441	209446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4476	NC_016786	GTA	2	6	209519	209524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4477	NC_016786	GTA	2	6	209621	209626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376244792
4478	NC_016786	TTC	2	6	209641	209646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376244792
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4480	NC_016786	ACG	2	6	209712	209717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244792
4481	NC_016786	GTC	2	6	209720	209725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376244792
4482	NC_016786	GT	3	6	209726	209731	0 %	50 %	50 %	0 %	376244792
4483	NC_016786	ACC	2	6	209747	209752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244792
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4485	NC_016786	GCA	2	6	209771	209776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376244792
4486	NC_016786	TGT	2	6	209814	209819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376244792
4487	NC_016786	TGG	2	6	209850	209855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376244792
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4490	NC_016786	ACC	2	6	210077	210082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	376244792
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4493	NC_016786	GCC	2	6	210224	210229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376244792
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