MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 4188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	ATGTT	2	10	2462	2471	20 %	60 %	20 %	0 %	374294495
2	NC_016627	AAATC	2	10	2957	2966	60 %	20 %	0 %	20 %	374294495
3	NC_016627	TGCAA	2	10	6212	6221	40 %	20 %	20 %	20 %	374294499
4	NC_016627	AAACT	2	10	6460	6469	60 %	20 %	0 %	20 %	374294499
5	NC_016627	GTATA	2	10	7421	7430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016627	ATTTT	2	10	7506	7515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016627	AATAC	2	10	8242	8251	60 %	20 %	0 %	20 %	374294500
8	NC_016627	AATAT	2	10	9001	9010	60 %	40 %	0 %	0 %	374294501
9	NC_016627	TAAAG	2	10	9092	9101	60 %	20 %	20 %	0 %	374294501
10	NC_016627	ATTGC	2	10	10019	10028	20 %	40 %	20 %	20 %	374294502
11	NC_016627	TATTG	2	10	10591	10600	20 %	60 %	20 %	0 %	374294503
12	NC_016627	ATGCA	2	10	10953	10962	40 %	20 %	20 %	20 %	374294503
13	NC_016627	AGAAA	2	10	11612	11621	80 %	0 %	20 %	0 %	374294504
14	NC_016627	GATAA	2	10	11789	11798	60 %	20 %	20 %	0 %	374294504
15	NC_016627	ATATA	2	10	12859	12868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016627	TTTTC	2	10	14719	14728	0 %	80 %	0 %	20 %	374294505
17	NC_016627	TTACC	2	10	14961	14970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016627	TAATT	2	10	15139	15148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016627	CCTAT	2	10	16236	16245	20 %	40 %	0 %	40 %	374294506
20	NC_016627	CATTC	2	10	16567	16576	20 %	40 %	0 %	40 %	374294506
21	NC_016627	ATTTT	2	10	17042	17051	20 %	80 %	0 %	0 %	374294507
22	NC_016627	AAAGT	2	10	18155	18164	60 %	20 %	20 %	0 %	374294507
23	NC_016627	AATAC	2	10	19405	19414	60 %	20 %	0 %	20 %	374294507
24	NC_016627	TCTTA	2	10	21900	21909	20 %	60 %	0 %	20 %	374294508
25	NC_016627	TAAAA	2	10	22133	22142	80 %	20 %	0 %	0 %	374294508
26	NC_016627	TAATT	2	10	22169	22178	40 %	60 %	0 %	0 %	374294508
27	NC_016627	CAATT	2	10	23243	23252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016627	TGCCT	2	10	25655	25664	0 %	40 %	20 %	40 %	374294511
29	NC_016627	ATGAA	2	10	31101	31110	60 %	20 %	20 %	0 %	374294514
30	NC_016627	AATAT	2	10	32837	32846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016627	TATAT	2	10	32879	32888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016627	TTTTA	2	10	32943	32952	20 %	80 %	0 %	0 %	374294517
33	NC_016627	ATTAC	2	10	37442	37451	40 %	40 %	0 %	20 %	374294520
34	NC_016627	GATAA	2	10	37945	37954	60 %	20 %	20 %	0 %	374294521
35	NC_016627	AGGTA	2	10	38069	38078	40 %	20 %	40 %	0 %	374294521
36	NC_016627	TTTTA	2	10	39078	39087	20 %	80 %	0 %	0 %	374294523
37	NC_016627	GAATA	2	10	40964	40973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016627	ATTTT	2	10	41200	41209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016627	ATTAT	2	10	41889	41898	40 %	60 %	0 %	0 %	374294525
40	NC_016627	TATTT	2	10	43102	43111	20 %	80 %	0 %	0 %	374294527
41	NC_016627	AAGGG	2	10	44356	44365	40 %	0 %	60 %	0 %	374294528
42	NC_016627	TAGTT	2	10	46598	46607	20 %	60 %	20 %	0 %	374294530
43	NC_016627	TGAAA	2	10	46757	46766	60 %	20 %	20 %	0 %	374294530
44	NC_016627	ATATA	2	10	47462	47471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016627	AAAAT	2	10	52357	52366	80 %	20 %	0 %	0 %	374294534
46	NC_016627	TAAAA	2	10	53096	53105	80 %	20 %	0 %	0 %	374294534
47	NC_016627	GGTTG	2	10	54409	54418	0 %	40 %	60 %	0 %	374294535
48	NC_016627	AATTT	2	10	54900	54909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016627	TGTTT	2	10	56147	56156	0 %	80 %	20 %	0 %	374294536
50	NC_016627	AAATA	2	10	56911	56920	80 %	20 %	0 %	0 %	374294537
51	NC_016627	TAGTT	2	10	58917	58926	20 %	60 %	20 %	0 %	374294538
52	NC_016627	TTTAA	2	10	63162	63171	40 %	60 %	0 %	0 %	374294543
53	NC_016627	ATAAA	2	10	63724	63733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016627	AAAGG	2	10	64881	64890	60 %	0 %	40 %	0 %	374294544
55	NC_016627	GCATT	2	10	65302	65311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016627	GTATA	2	10	66469	66478	40 %	40 %	20 %	0 %	374294546
57	NC_016627	AATTT	2	10	68382	68391	40 %	60 %	0 %	0 %	374294547
58	NC_016627	CTTTT	2	10	68692	68701	0 %	80 %	0 %	20 %	374294547
59	NC_016627	TCCAT	2	10	71671	71680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016627	TTTCC	2	10	71948	71957	0 %	60 %	0 %	40 %	374294550
61	NC_016627	AGTAT	2	10	72176	72185	40 %	40 %	20 %	0 %	374294550
62	NC_016627	ATTTT	2	10	73248	73257	20 %	80 %	0 %	0 %	374294550
63	NC_016627	AATAA	2	10	73397	73406	80 %	20 %	0 %	0 %	374294550
64	NC_016627	TATTG	2	10	75959	75968	20 %	60 %	20 %	0 %	374294553
65	NC_016627	ATAAA	2	10	78460	78469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016627	ATTGC	2	10	80363	80372	20 %	40 %	20 %	20 %	374294557
67	NC_016627	CAGAA	2	10	81364	81373	60 %	0 %	20 %	20 %	374294558
68	NC_016627	TCCTT	2	10	82602	82611	0 %	60 %	0 %	40 %	374294560
69	NC_016627	AGTCG	2	10	84400	84409	20 %	20 %	40 %	20 %	374294562
70	NC_016627	ACAAA	2	10	85426	85435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016627	CAAAG	2	10	85526	85535	60 %	0 %	20 %	20 %	374294564
72	NC_016627	GCTGA	2	10	86077	86086	20 %	20 %	40 %	20 %	374294564
73	NC_016627	CCATT	2	10	86343	86352	20 %	40 %	0 %	40 %	374294564
74	NC_016627	CCATT	2	10	87965	87974	20 %	40 %	0 %	40 %	374294566
75	NC_016627	ATCTC	2	10	89466	89475	20 %	40 %	0 %	40 %	374294566
76	NC_016627	TGAGT	2	10	91066	91075	20 %	40 %	40 %	0 %	374294568
77	NC_016627	TATTG	2	10	95065	95074	20 %	60 %	20 %	0 %	374294570
78	NC_016627	TTCAT	2	10	95714	95723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016627	CAGGA	2	10	96641	96650	40 %	0 %	40 %	20 %	374294571
80	NC_016627	TAAAA	2	10	97547	97556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016627	TTTGC	2	10	97699	97708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016627	AAGAA	2	10	98637	98646	80 %	0 %	20 %	0 %	374294572
83	NC_016627	TATAA	2	10	99876	99885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016627	TATCG	2	10	102482	102491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016627	ATTCT	2	10	103277	103286	20 %	60 %	0 %	20 %	374294576
86	NC_016627	TTTAT	2	10	106106	106115	20 %	80 %	0 %	0 %	374294578
87	NC_016627	ATAAA	2	10	106646	106655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016627	CAATA	2	10	107980	107989	60 %	20 %	0 %	20 %	374294580
89	NC_016627	CAAGG	2	10	108105	108114	40 %	0 %	40 %	20 %	374294580
90	NC_016627	GGACA	2	10	108135	108144	40 %	0 %	40 %	20 %	374294580
91	NC_016627	CAAGA	2	10	110724	110733	60 %	0 %	20 %	20 %	374294583
92	NC_016627	ATTTT	2	10	112398	112407	20 %	80 %	0 %	0 %	374294585
93	NC_016627	AGATG	2	10	113259	113268	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016627	ATAAA	2	10	113276	113285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016627	CATAT	2	10	114328	114337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016627	TAATA	2	10	115133	115142	60 %	40 %	0 %	0 %	374294589
97	NC_016627	GATAT	2	10	115893	115902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016627	GTACG	2	10	118160	118169	20 %	20 %	40 %	20 %	374294593
99	NC_016627	TTACT	2	10	118574	118583	20 %	60 %	0 %	20 %	374294593
100	NC_016627	CCTTC	2	10	119411	119420	0 %	40 %	0 %	60 %	374294594
101	NC_016627	TTCAG	2	10	119726	119735	20 %	40 %	20 %	20 %	374294594
102	NC_016627	TCATT	2	10	119757	119766	20 %	60 %	0 %	20 %	374294594
103	NC_016627	TTAAG	2	10	120593	120602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016627	GAAGC	2	10	122790	122799	40 %	0 %	40 %	20 %	374294598
105	NC_016627	TATTT	2	10	122860	122869	20 %	80 %	0 %	0 %	374294598
106	NC_016627	ATCCA	2	10	123086	123095	40 %	20 %	0 %	40 %	374294598
107	NC_016627	TTATA	2	10	123415	123424	40 %	60 %	0 %	0 %	374294599
108	NC_016627	CGGTT	2	10	124094	124103	0 %	40 %	40 %	20 %	374294599
109	NC_016627	AATTT	2	10	126173	126182	40 %	60 %	0 %	0 %	374294601
110	NC_016627	TACAA	2	10	127714	127723	60 %	20 %	0 %	20 %	374294602
111	NC_016627	GTATA	2	10	130151	130160	40 %	40 %	20 %	0 %	374294603
112	NC_016627	GAAAA	2	10	138581	138590	80 %	0 %	20 %	0 %	374294610
113	NC_016627	GAAAT	2	10	138706	138715	60 %	20 %	20 %	0 %	374294610
114	NC_016627	GACTT	2	10	139300	139309	20 %	40 %	20 %	20 %	374294611
115	NC_016627	GTATT	2	10	140348	140357	20 %	60 %	20 %	0 %	374294612
116	NC_016627	GGAAG	2	10	140587	140596	40 %	0 %	60 %	0 %	374294612
117	NC_016627	ACTTA	2	10	141285	141294	40 %	40 %	0 %	20 %	374294612
118	NC_016627	GCAAA	2	10	144020	144029	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016627	TTGAT	2	10	144067	144076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016627	TTCAT	2	10	144154	144163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016627	AAGCA	2	10	147331	147340	60 %	0 %	20 %	20 %	374294618
122	NC_016627	AAAAT	2	10	147737	147746	80 %	20 %	0 %	0 %	374294618
123	NC_016627	GTGAT	2	10	149394	149403	20 %	40 %	40 %	0 %	374294619
124	NC_016627	GATGT	2	10	150291	150300	20 %	40 %	40 %	0 %	374294620
125	NC_016627	GAAAA	2	10	152466	152475	80 %	0 %	20 %	0 %	374294621
126	NC_016627	AAGAC	2	10	153300	153309	60 %	0 %	20 %	20 %	374294622
127	NC_016627	GAAAA	2	10	154366	154375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016627	GTTAT	2	10	155335	155344	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016627	AAAGA	2	10	155506	155515	80 %	0 %	20 %	0 %	374294624
130	NC_016627	AATAA	2	10	156720	156729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016627	ATTTA	2	10	156783	156792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016627	ATTAT	2	10	157370	157379	40 %	60 %	0 %	0 %	374294625
133	NC_016627	ATTAT	2	10	159253	159262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016627	AATTT	2	10	160563	160572	40 %	60 %	0 %	0 %	374294628
135	NC_016627	TTTCT	2	10	161103	161112	0 %	80 %	0 %	20 %	374294629
136	NC_016627	AATGA	2	10	162401	162410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016627	AATCA	2	10	162450	162459	60 %	20 %	0 %	20 %	374294631
138	NC_016627	ATGTA	2	10	162823	162832	40 %	40 %	20 %	0 %	374294631
139	NC_016627	ATAGA	2	10	163153	163162	60 %	20 %	20 %	0 %	374294631
140	NC_016627	CAACC	2	10	163951	163960	40 %	0 %	0 %	60 %	374294633
141	NC_016627	GATTA	2	10	163969	163978	40 %	40 %	20 %	0 %	374294633
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