MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 109861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016627	TCT	2	6	58596	58601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294538
1502	NC_016627	TTTTCA	2	12	58614	58625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374294538
1503	NC_016627	CTG	2	6	58628	58633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294538
1504	NC_016627	ATT	2	6	58637	58642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294538
1505	NC_016627	ATT	2	6	58722	58727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294538
1506	NC_016627	TA	3	6	58826	58831	50 %	50 %	0 %	0 %	374294538
1507	NC_016627	ATTG	2	8	58865	58872	25 %	50 %	25 %	0 %	374294538
1508	NC_016627	TCA	2	6	58875	58880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294538
1509	NC_016627	TAGTT	2	10	58917	58926	20 %	60 %	20 %	0 %	374294538
1510	NC_016627	CAT	2	6	58930	58935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294538
1511	NC_016627	T	6	6	59013	59018	0 %	100 %	0 %	0 %	374294538
1512	NC_016627	TGC	2	6	59032	59037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294538
1513	NC_016627	A	6	6	59060	59065	100 %	0 %	0 %	0 %	374294538
1514	NC_016627	AAT	2	6	59088	59093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294538
1515	NC_016627	CCT	2	6	59128	59133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294539
1516	NC_016627	T	7	7	59253	59259	0 %	100 %	0 %	0 %	374294539
1517	NC_016627	TC	3	6	59274	59279	0 %	50 %	0 %	50 %	374294539
1518	NC_016627	GTA	2	6	59299	59304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294539
1519	NC_016627	CGG	2	6	59316	59321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294539
1520	NC_016627	T	6	6	59383	59388	0 %	100 %	0 %	0 %	374294539
1521	NC_016627	CCT	2	6	59435	59440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294539
1522	NC_016627	TCA	2	6	59480	59485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294539
1523	NC_016627	TTC	2	6	59524	59529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294539
1524	NC_016627	TAT	2	6	59571	59576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294539
1525	NC_016627	CCT	2	6	59624	59629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294539
1526	NC_016627	TCG	2	6	59681	59686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294539
1527	NC_016627	TGTA	2	8	59699	59706	25 %	50 %	25 %	0 %	374294539
1528	NC_016627	GAG	2	6	59714	59719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294539
1529	NC_016627	TAT	2	6	59758	59763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294539
1530	NC_016627	AAT	2	6	59770	59775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294539
1531	NC_016627	CCA	2	6	59814	59819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294539
1532	NC_016627	TATC	2	8	59835	59842	25 %	50 %	0 %	25 %	374294539
1533	NC_016627	CCTT	2	8	59861	59868	0 %	50 %	0 %	50 %	374294539
1534	NC_016627	ATA	2	6	59943	59948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294539
1535	NC_016627	TTCT	2	8	60003	60010	0 %	75 %	0 %	25 %	374294539
1536	NC_016627	T	9	9	60010	60018	0 %	100 %	0 %	0 %	374294539
1537	NC_016627	CAG	2	6	60041	60046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294539
1538	NC_016627	GCA	2	6	60054	60059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294539
1539	NC_016627	TCC	2	6	60114	60119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_016627	TAG	2	6	60154	60159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294540
1541	NC_016627	CAA	2	6	60186	60191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294540
1542	NC_016627	TA	3	6	60228	60233	50 %	50 %	0 %	0 %	374294540
1543	NC_016627	T	6	6	60263	60268	0 %	100 %	0 %	0 %	374294540
1544	NC_016627	T	6	6	60341	60346	0 %	100 %	0 %	0 %	374294540
1545	NC_016627	TTC	2	6	60366	60371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294540
1546	NC_016627	GGTA	2	8	60395	60402	25 %	25 %	50 %	0 %	374294540
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1550	NC_016627	TTGA	2	8	60557	60564	25 %	50 %	25 %	0 %	374294540
1551	NC_016627	CT	3	6	60663	60668	0 %	50 %	0 %	50 %	374294540
1552	NC_016627	GCAG	2	8	60889	60896	25 %	0 %	50 %	25 %	374294540
1553	NC_016627	T	6	6	61030	61035	0 %	100 %	0 %	0 %	374294540
1554	NC_016627	A	6	6	61044	61049	100 %	0 %	0 %	0 %	374294540
1555	NC_016627	AT	3	6	61053	61058	50 %	50 %	0 %	0 %	374294540
1556	NC_016627	TAA	2	6	61059	61064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294540
1557	NC_016627	T	7	7	61115	61121	0 %	100 %	0 %	0 %	374294541
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1559	NC_016627	AAGT	2	8	61147	61154	50 %	25 %	25 %	0 %	374294541
1560	NC_016627	T	7	7	61442	61448	0 %	100 %	0 %	0 %	374294541
1561	NC_016627	TCA	2	6	61453	61458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294541
1562	NC_016627	TA	3	6	61532	61537	50 %	50 %	0 %	0 %	374294541
1563	NC_016627	TCT	2	6	61578	61583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294541
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1573	NC_016627	TAT	2	6	62101	62106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294542
1574	NC_016627	TA	3	6	62155	62160	50 %	50 %	0 %	0 %	374294542
1575	NC_016627	TCA	2	6	62165	62170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294542
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1581	NC_016627	A	6	6	62637	62642	100 %	0 %	0 %	0 %	374294542
1582	NC_016627	TTC	2	6	62644	62649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294542
1583	NC_016627	T	7	7	62685	62691	0 %	100 %	0 %	0 %	374294542
1584	NC_016627	CTTT	2	8	62723	62730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_016627	TAT	2	6	62768	62773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294543
1586	NC_016627	CAT	2	6	62857	62862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294543
1587	NC_016627	TAA	2	6	62914	62919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294543
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1589	NC_016627	AT	3	6	62955	62960	50 %	50 %	0 %	0 %	374294543
1590	NC_016627	GAT	2	6	62961	62966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294543
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1592	NC_016627	TTC	2	6	63101	63106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294543
1593	NC_016627	TAT	2	6	63122	63127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294543
1594	NC_016627	TCTT	2	8	63131	63138	0 %	75 %	0 %	25 %	374294543
1595	NC_016627	TTTAA	2	10	63162	63171	40 %	60 %	0 %	0 %	374294543
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1598	NC_016627	T	6	6	63274	63279	0 %	100 %	0 %	0 %	374294543
1599	NC_016627	CAAG	2	8	63313	63320	50 %	0 %	25 %	25 %	374294543
1600	NC_016627	TAT	2	6	63395	63400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294543
1601	NC_016627	T	6	6	63412	63417	0 %	100 %	0 %	0 %	374294543
1602	NC_016627	AT	3	6	63439	63444	50 %	50 %	0 %	0 %	374294543
1603	NC_016627	GCC	2	6	63563	63568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294543
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1608	NC_016627	ATA	2	6	63686	63691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016627	CTC	2	6	63693	63698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_016627	T	6	6	63717	63722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016627	ATAAA	2	10	63724	63733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016627	T	7	7	63734	63740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016627	CTT	2	6	63845	63850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_016627	A	6	6	63878	63883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016627	TTA	2	6	63896	63901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_016627	TAT	2	6	64042	64047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016627	TA	4	8	64077	64084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_016627	A	6	6	64084	64089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_016627	G	6	6	64207	64212	0 %	0 %	100 %	0 %	374294544
1620	NC_016627	T	7	7	64234	64240	0 %	100 %	0 %	0 %	374294544
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1623	NC_016627	CTG	2	6	64267	64272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294544
1624	NC_016627	CTC	2	6	64304	64309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294544
1625	NC_016627	ATT	2	6	64418	64423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294544
1626	NC_016627	T	6	6	64506	64511	0 %	100 %	0 %	0 %	374294544
1627	NC_016627	ACA	2	6	64518	64523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294544
1628	NC_016627	T	7	7	64568	64574	0 %	100 %	0 %	0 %	374294544
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