MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 109861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016627	GTAT	2	8	230450	230457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016627	CGG	2	6	230458	230463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_016627	TCC	2	6	230476	230481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_016627	TGGG	2	8	230569	230576	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016627	GAA	2	6	230593	230598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_016627	GAT	2	6	230631	230636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_016627	AG	3	6	230668	230673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_016627	TCA	2	6	230703	230708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294697
5509	NC_016627	T	6	6	230713	230718	0 %	100 %	0 %	0 %	374294697
5510	NC_016627	ATG	2	6	230738	230743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294697
5511	NC_016627	A	6	6	230783	230788	100 %	0 %	0 %	0 %	374294697
5512	NC_016627	CAG	2	6	230796	230801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294697
5513	NC_016627	ATC	2	6	230849	230854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294697
5514	NC_016627	TTTCT	2	10	230875	230884	0 %	80 %	0 %	20 %	374294697
5515	NC_016627	ATGG	2	8	230935	230942	25 %	25 %	50 %	0 %	374294697
5516	NC_016627	TAA	2	6	230968	230973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294697
5517	NC_016627	TGG	2	6	231077	231082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294697
5518	NC_016627	T	6	6	231146	231151	0 %	100 %	0 %	0 %	374294697
5519	NC_016627	ATT	2	6	231248	231253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294697
5520	NC_016627	TTA	3	9	231254	231262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294697
5521	NC_016627	ATG	2	6	231328	231333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294697
5522	NC_016627	AAAGGG	2	12	231384	231395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016627	GAA	2	6	231423	231428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294698
5524	NC_016627	AGA	2	6	231576	231581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5525	NC_016627	A	7	7	231586	231592	100 %	0 %	0 %	0 %	374294699
5526	NC_016627	AGA	3	9	231699	231707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5527	NC_016627	GAA	2	6	231712	231717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5528	NC_016627	GGCA	2	8	231806	231813	25 %	0 %	50 %	25 %	374294699
5529	NC_016627	ACA	2	6	231860	231865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294699
5530	NC_016627	TTA	2	6	231881	231886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294699
5531	NC_016627	ACT	2	6	231924	231929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294699
5532	NC_016627	GGA	2	6	231943	231948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294699
5533	NC_016627	GAA	2	6	231984	231989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5534	NC_016627	AGA	2	6	232086	232091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5535	NC_016627	TCA	2	6	232162	232167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294699
5536	NC_016627	CTG	2	6	232169	232174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294699
5537	NC_016627	GAA	2	6	232240	232245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294699
5538	NC_016627	ACAG	2	8	232249	232256	50 %	0 %	25 %	25 %	374294699
5539	NC_016627	CAT	2	6	232279	232284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294699
5540	NC_016627	GAT	2	6	232300	232305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294699
5541	NC_016627	TA	3	6	232485	232490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016627	TATG	2	8	232541	232548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016627	GAAA	2	8	232575	232582	75 %	0 %	25 %	0 %	374294700
5544	NC_016627	A	6	6	232580	232585	100 %	0 %	0 %	0 %	374294700
5545	NC_016627	AAG	2	6	232633	232638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294700
5546	NC_016627	TTG	3	9	232673	232681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294700
5547	NC_016627	GAC	2	6	232741	232746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294700
5548	NC_016627	CAG	2	6	232793	232798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294700
5549	NC_016627	GAA	2	6	232807	232812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294700
5550	NC_016627	AAG	2	6	232820	232825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294700
5551	NC_016627	ATT	2	6	232876	232881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294700
5552	NC_016627	GTGAAA	2	12	232947	232958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374294700
5553	NC_016627	TAA	3	9	232971	232979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016627	A	6	6	232978	232983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_016627	CAT	2	6	232984	232989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016627	TAAG	2	8	233058	233065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_016627	TAA	2	6	233107	233112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_016627	T	6	6	233144	233149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_016627	CAA	2	6	233217	233222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_016627	TGA	2	6	233247	233252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016627	AAAG	2	8	233278	233285	75 %	0 %	25 %	0 %	374294701
5562	NC_016627	GAA	2	6	233429	233434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294701
5563	NC_016627	CAT	2	6	233456	233461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294701
5564	NC_016627	GTT	2	6	233467	233472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294701
5565	NC_016627	CAG	2	6	233484	233489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294701
5566	NC_016627	TAA	2	6	233502	233507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294701
5567	NC_016627	AGA	2	6	233554	233559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294701
5568	NC_016627	GGA	2	6	233635	233640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294701
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5570	NC_016627	TAAT	2	8	233686	233693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_016627	TAAA	2	8	233695	233702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016627	T	6	6	233734	233739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_016627	T	7	7	233741	233747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_016627	A	6	6	233776	233781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016627	TAT	2	6	233788	233793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016627	TA	3	6	233797	233802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_016627	TA	3	6	233813	233818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_016627	T	6	6	233917	233922	0 %	100 %	0 %	0 %	374294702
5579	NC_016627	TGA	2	6	233935	233940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294702
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5581	NC_016627	A	6	6	233975	233980	100 %	0 %	0 %	0 %	374294702
5582	NC_016627	TG	3	6	233997	234002	0 %	50 %	50 %	0 %	374294702
5583	NC_016627	ATA	2	6	234156	234161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294702
5584	NC_016627	AT	3	6	234260	234265	50 %	50 %	0 %	0 %	374294703
5585	NC_016627	CTT	2	6	234334	234339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294703
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5588	NC_016627	AGA	2	6	234491	234496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294703
5589	NC_016627	TCCTC	2	10	234646	234655	0 %	40 %	0 %	60 %	374294703
5590	NC_016627	TAT	2	6	234677	234682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294703
5591	NC_016627	TGT	3	9	234720	234728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294703
5592	NC_016627	GGA	2	6	234751	234756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294703
5593	NC_016627	TTGA	2	8	234760	234767	25 %	50 %	25 %	0 %	374294703
5594	NC_016627	GGC	2	6	234936	234941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294703
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5597	NC_016627	AT	3	6	235046	235051	50 %	50 %	0 %	0 %	374294703
5598	NC_016627	ATG	2	6	235120	235125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294703
5599	NC_016627	GTA	2	6	235171	235176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294703
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5601	NC_016627	ATT	4	12	235222	235233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294703
5602	NC_016627	AT	3	6	235257	235262	50 %	50 %	0 %	0 %	374294703
5603	NC_016627	ATTC	2	8	235280	235287	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_016627	ATG	2	6	235292	235297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016627	ATA	2	6	235355	235360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_016627	A	6	6	235365	235370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016627	ATTG	2	8	235372	235379	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_016627	GAG	2	6	235382	235387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_016627	TAT	2	6	235392	235397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294704
5610	NC_016627	TGT	2	6	235423	235428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294704
5611	NC_016627	A	6	6	235435	235440	100 %	0 %	0 %	0 %	374294704
5612	NC_016627	AG	3	6	235456	235461	50 %	0 %	50 %	0 %	374294704
5613	NC_016627	GTA	2	6	235555	235560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294704
5614	NC_016627	A	6	6	235609	235614	100 %	0 %	0 %	0 %	374294704
5615	NC_016627	AGG	2	6	235627	235632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_016627	TAT	2	6	235637	235642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294705
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5619	NC_016627	AGAAA	2	10	235718	235727	80 %	0 %	20 %	0 %	374294705
5620	NC_016627	A	7	7	235725	235731	100 %	0 %	0 %	0 %	374294705
5621	NC_016627	TAA	2	6	235732	235737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294705
5622	NC_016627	GGA	2	6	235787	235792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294705
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5624	NC_016627	GTT	2	6	235851	235856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294705
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