MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 22465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016025	GCTG	2	8	41682	41689	0 %	25 %	50 %	25 %	347755992
1002	NC_016025	GCC	2	6	41744	41749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755992
1003	NC_016025	TCCG	2	8	41767	41774	0 %	25 %	25 %	50 %	347755992
1004	NC_016025	GCT	2	6	41786	41791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1005	NC_016025	CAC	2	6	41846	41851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347755992
1006	NC_016025	CGG	2	6	42004	42009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1007	NC_016025	GAT	2	6	42030	42035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755992
1008	NC_016025	GTC	2	6	42036	42041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1009	NC_016025	CTG	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1010	NC_016025	GCA	2	6	42079	42084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1011	NC_016025	GCC	2	6	42104	42109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755992
1012	NC_016025	GCG	2	6	42154	42159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1013	NC_016025	GCG	2	6	42335	42340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1014	NC_016025	GCT	2	6	42353	42358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1015	NC_016025	AAC	2	6	42445	42450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755992
1016	NC_016025	ACGCC	2	10	42493	42502	20 %	0 %	20 %	60 %	347755992
1017	NC_016025	GC	4	8	42509	42516	0 %	0 %	50 %	50 %	347755992
1018	NC_016025	TGG	2	6	42606	42611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755992
1019	NC_016025	TGT	2	6	42659	42664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347755992
1020	NC_016025	GC	3	6	42689	42694	0 %	0 %	50 %	50 %	347755992
1021	NC_016025	ATC	2	6	42756	42761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755992
1022	NC_016025	CTT	2	6	42764	42769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347755992
1023	NC_016025	GGCG	2	8	42774	42781	0 %	0 %	75 %	25 %	347755992
1024	NC_016025	GCC	2	6	42858	42863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755992
1025	NC_016025	GCA	2	6	42899	42904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1026	NC_016025	ACG	2	6	42955	42960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1027	NC_016025	GC	3	6	42974	42979	0 %	0 %	50 %	50 %	347755992
1028	NC_016025	GGC	2	6	42984	42989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1029	NC_016025	GGC	2	6	42994	42999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1030	NC_016025	GCTGGC	2	12	43007	43018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347755992
1031	NC_016025	GATG	2	8	43073	43080	25 %	25 %	50 %	0 %	347755992
1032	NC_016025	CGG	2	6	43115	43120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755992
1033	NC_016025	CGGG	2	8	43154	43161	0 %	0 %	75 %	25 %	347755992
1034	NC_016025	GAA	2	6	43185	43190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347755992
1035	NC_016025	CGC	2	6	43215	43220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755992
1036	NC_016025	TCG	3	9	43312	43320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1037	NC_016025	CAACGG	2	12	43322	43333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755992
1038	NC_016025	ATG	2	6	43536	43541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755993
1039	NC_016025	CAA	2	6	43615	43620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755993
1040	NC_016025	CCGGC	2	10	43634	43643	0 %	0 %	40 %	60 %	347755993
1041	NC_016025	CGG	2	6	43664	43669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1042	NC_016025	TCG	2	6	43798	43803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1043	NC_016025	CGA	2	6	43865	43870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1044	NC_016025	CA	3	6	43919	43924	50 %	0 %	0 %	50 %	347755993
1045	NC_016025	GCT	2	6	43955	43960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1046	NC_016025	TCGAAG	2	12	43963	43974	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347755993
1047	NC_016025	CGG	2	6	43988	43993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1048	NC_016025	TCG	2	6	44077	44082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1049	NC_016025	CAAC	2	8	44101	44108	50 %	0 %	0 %	50 %	347755993
1050	NC_016025	CGC	2	6	44129	44134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1051	NC_016025	GGT	2	6	44150	44155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755993
1052	NC_016025	GACG	2	8	44205	44212	25 %	0 %	50 %	25 %	347755993
1053	NC_016025	GGAC	2	8	44216	44223	25 %	0 %	50 %	25 %	347755993
1054	NC_016025	GC	3	6	44231	44236	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
1055	NC_016025	CGT	2	6	44249	44254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1056	NC_016025	GAC	2	6	44282	44287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1057	NC_016025	GCG	2	6	44319	44324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1058	NC_016025	GCA	2	6	44337	44342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1059	NC_016025	GCC	2	6	44361	44366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1060	NC_016025	GCC	2	6	44454	44459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1061	NC_016025	CTG	2	6	44466	44471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1062	NC_016025	G	6	6	44527	44532	0 %	0 %	100 %	0 %	347755993
1063	NC_016025	ATC	2	6	44569	44574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755993
1064	NC_016025	CTGG	2	8	44612	44619	0 %	25 %	50 %	25 %	347755993
1065	NC_016025	GCC	3	9	44634	44642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1066	NC_016025	GCA	2	6	44672	44677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1067	NC_016025	GCTG	2	8	44707	44714	0 %	25 %	50 %	25 %	347755993
1068	NC_016025	CAT	2	6	44765	44770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755993
1069	NC_016025	CCTGG	2	10	44771	44780	0 %	20 %	40 %	40 %	347755993
1070	NC_016025	CCGG	2	8	44822	44829	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
1071	NC_016025	CCG	2	6	44830	44835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1072	NC_016025	GAG	2	6	44880	44885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347755993
1073	NC_016025	GCC	2	6	44913	44918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755993
1074	NC_016025	CGG	2	6	44955	44960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1075	NC_016025	CAG	2	6	45024	45029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1076	NC_016025	TAC	2	6	45081	45086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755993
1077	NC_016025	AAC	2	6	45099	45104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755993
1078	NC_016025	ACG	2	6	45115	45120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1079	NC_016025	CAA	2	6	45137	45142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347755993
1080	NC_016025	CGG	3	9	45143	45151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1081	NC_016025	GC	3	6	45164	45169	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
1082	NC_016025	CGA	2	6	45221	45226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1083	NC_016025	ACG	2	6	45313	45318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1084	NC_016025	GC	3	6	45329	45334	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
1085	NC_016025	GTT	2	6	45380	45385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347755993
1086	NC_016025	GCG	2	6	45397	45402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1087	NC_016025	GCG	3	9	45418	45426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755993
1088	NC_016025	GAT	2	6	45476	45481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755993
1089	NC_016025	GTC	2	6	45618	45623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755993
1090	NC_016025	GCCG	2	8	45629	45636	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
1091	NC_016025	TGCC	2	8	45693	45700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1092	NC_016025	CG	3	6	45740	45745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_016025	GCA	2	6	45791	45796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755994
1094	NC_016025	AGT	2	6	45826	45831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755994
1095	NC_016025	TCA	2	6	45889	45894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755994
1096	NC_016025	GGC	2	6	45905	45910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755994
1097	NC_016025	CTG	2	6	45923	45928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755994
1098	NC_016025	AGC	2	6	45966	45971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755994
1099	NC_016025	GAA	2	6	45987	45992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347755994
1100	NC_016025	CG	3	6	46013	46018	0 %	0 %	50 %	50 %	347755994
1101	NC_016025	TCA	2	6	46060	46065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755994
1102	NC_016025	CGGC	2	8	46087	46094	0 %	0 %	50 %	50 %	347755994
1103	NC_016025	CGG	2	6	46105	46110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755994
1104	NC_016025	TCG	2	6	46111	46116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755994
1105	NC_016025	CGC	2	6	46287	46292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755994
1106	NC_016025	TTCA	2	8	46295	46302	25 %	50 %	0 %	25 %	347755994
1107	NC_016025	CGC	2	6	46308	46313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755994
1108	NC_016025	GAT	3	9	46340	46348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755994
1109	NC_016025	TCA	2	6	46507	46512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347755994
1110	NC_016025	CTCC	2	8	46513	46520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1111	NC_016025	AGT	2	6	46731	46736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755995
1112	NC_016025	GCCGGT	2	12	46777	46788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347755995
1113	NC_016025	CGT	2	6	46812	46817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755995
1114	NC_016025	TGG	2	6	46823	46828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347755995
1115	NC_016025	CGC	2	6	46875	46880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755995
1116	NC_016025	CAG	2	6	46894	46899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755995
1117	NC_016025	GCC	2	6	46981	46986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755995
1118	NC_016025	ATG	2	6	47027	47032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755995
1119	NC_016025	CAG	2	6	47123	47128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755995
1120	NC_016025	TGA	2	6	47151	47156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347755995
1121	NC_016025	GCC	2	6	47329	47334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755995
1122	NC_016025	GGC	2	6	47379	47384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755995
1123	NC_016025	TCG	2	6	47399	47404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347755995
1124	NC_016025	GAC	2	6	47434	47439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347755995
1125	NC_016025	A	6	6	47462	47467	100 %	0 %	0 %	0 %	347755995
1126	NC_016025	GCC	2	6	47491	47496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347755995
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1238	NC_016025	GCGG	2	8	51953	51960	0 %	0 %	75 %	25 %	347755998
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1242	NC_016025	GC	4	8	52170	52177	0 %	0 %	50 %	50 %	347755998
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1248	NC_016025	GGC	2	6	52294	52299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347755998
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1250	NC_016025	A	6	6	52374	52379	100 %	0 %	0 %	0 %	347755998
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