MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 22465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016025	TCA	2	6	250742	250747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756160
5502	NC_016025	CTG	2	6	250750	250755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756160
5503	NC_016025	GGC	2	6	250785	250790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756160
5504	NC_016025	CAT	2	6	250822	250827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756160
5505	NC_016025	CAC	2	6	250852	250857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347756160
5506	NC_016025	GC	3	6	250993	250998	0 %	0 %	50 %	50 %	347756160
5507	NC_016025	GTC	2	6	251034	251039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756160
5508	NC_016025	AGG	2	6	251084	251089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756160
5509	NC_016025	CAT	2	6	251095	251100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756160
5510	NC_016025	CGA	2	6	251103	251108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756160
5511	NC_016025	CGC	2	6	251185	251190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756160
5512	NC_016025	AAC	2	6	251198	251203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756160
5513	NC_016025	GGA	2	6	251256	251261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756160
5514	NC_016025	A	6	6	251309	251314	100 %	0 %	0 %	0 %	347756160
5515	NC_016025	GGA	2	6	251343	251348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756160
5516	NC_016025	CT	3	6	251458	251463	0 %	50 %	0 %	50 %	347756160
5517	NC_016025	GTG	3	9	251498	251506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756160
5518	NC_016025	TGG	2	6	251547	251552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756161
5519	NC_016025	ACGC	2	8	251614	251621	25 %	0 %	25 %	50 %	347756161
5520	NC_016025	ACCA	2	8	251860	251867	50 %	0 %	0 %	50 %	347756161
5521	NC_016025	GCG	2	6	252046	252051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5522	NC_016025	GAC	2	6	252145	252150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5523	NC_016025	CCG	2	6	252210	252215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5524	NC_016025	CGC	2	6	252222	252227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5525	NC_016025	CCG	2	6	252239	252244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5526	NC_016025	GAC	2	6	252325	252330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5527	NC_016025	CCG	2	6	252345	252350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5528	NC_016025	AAGCCA	2	12	252377	252388	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347756162
5529	NC_016025	GAA	2	6	252406	252411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756162
5530	NC_016025	CGT	2	6	252447	252452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5531	NC_016025	GCG	3	9	252563	252571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5532	NC_016025	GGC	2	6	252588	252593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5533	NC_016025	GGCTG	2	10	252596	252605	0 %	20 %	60 %	20 %	347756162
5534	NC_016025	G	6	6	252653	252658	0 %	0 %	100 %	0 %	347756162
5535	NC_016025	CAT	2	6	252666	252671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756162
5536	NC_016025	GCC	2	6	252724	252729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5537	NC_016025	GGCT	2	8	252832	252839	0 %	25 %	50 %	25 %	347756162
5538	NC_016025	CGCC	2	8	252888	252895	0 %	0 %	25 %	75 %	347756162
5539	NC_016025	GTG	2	6	252941	252946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756162
5540	NC_016025	GCC	2	6	252967	252972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756162
5541	NC_016025	GCG	2	6	253052	253057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5542	NC_016025	GAC	2	6	253132	253137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5543	NC_016025	CCGC	2	8	253201	253208	0 %	0 %	25 %	75 %	347756162
5544	NC_016025	CTT	2	6	253224	253229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347756162
5545	NC_016025	CCGA	2	8	253237	253244	25 %	0 %	25 %	50 %	347756162
5546	NC_016025	GAGCGC	2	12	253255	253266	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347756162
5547	NC_016025	GC	3	6	253297	253302	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5548	NC_016025	CG	3	6	253373	253378	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5549	NC_016025	CAT	2	6	253393	253398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756162
5550	NC_016025	GTT	2	6	253416	253421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347756162
5551	NC_016025	T	6	6	253586	253591	0 %	100 %	0 %	0 %	347756162
5552	NC_016025	TTC	2	6	253633	253638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347756162
5553	NC_016025	ATC	2	6	253697	253702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756162
5554	NC_016025	ACCC	2	8	253733	253740	25 %	0 %	0 %	75 %	347756162
5555	NC_016025	ACGCCG	2	12	253742	253753	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347756162
5556	NC_016025	TTC	2	6	253777	253782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347756162
5557	NC_016025	GAA	2	6	253797	253802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756162
5558	NC_016025	TGG	2	6	253889	253894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756162
5559	NC_016025	GCG	2	6	254002	254007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5560	NC_016025	GGC	2	6	254019	254024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5561	NC_016025	GGC	2	6	254068	254073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5562	NC_016025	GC	3	6	254109	254114	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5563	NC_016025	TGC	2	6	254192	254197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5564	NC_016025	GAAC	2	8	254202	254209	50 %	0 %	25 %	25 %	347756162
5565	NC_016025	GGC	2	6	254214	254219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5566	NC_016025	GCA	2	6	254220	254225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5567	NC_016025	GC	3	6	254228	254233	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5568	NC_016025	GCG	2	6	254272	254277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5569	NC_016025	CA	4	8	254301	254308	50 %	0 %	0 %	50 %	347756162
5570	NC_016025	CGG	2	6	254310	254315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5571	NC_016025	GAG	2	6	254317	254322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756162
5572	NC_016025	GAC	2	6	254325	254330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5573	NC_016025	G	6	6	254354	254359	0 %	0 %	100 %	0 %	347756162
5574	NC_016025	GGC	2	6	254391	254396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5575	NC_016025	GC	4	8	254507	254514	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5576	NC_016025	GGC	2	6	254675	254680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
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5578	NC_016025	GTT	2	6	254725	254730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347756162
5579	NC_016025	CTG	3	9	254776	254784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5580	NC_016025	GC	3	6	254806	254811	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5581	NC_016025	AGC	2	6	254822	254827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756162
5582	NC_016025	GGC	2	6	254838	254843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756162
5583	NC_016025	CG	3	6	254856	254861	0 %	0 %	50 %	50 %	347756162
5584	NC_016025	GAA	2	6	254865	254870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347756162
5585	NC_016025	CCG	2	6	254910	254915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756163
5586	NC_016025	TTC	2	6	254919	254924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347756163
5587	NC_016025	CTG	2	6	254953	254958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756163
5588	NC_016025	GC	4	8	254972	254979	0 %	0 %	50 %	50 %	347756163
5589	NC_016025	GTT	2	6	255015	255020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347756163
5590	NC_016025	GGA	2	6	255042	255047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756163
5591	NC_016025	GC	4	8	255147	255154	0 %	0 %	50 %	50 %	347756163
5592	NC_016025	GCT	2	6	255168	255173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756163
5593	NC_016025	CCG	2	6	255189	255194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756163
5594	NC_016025	TCA	2	6	255281	255286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756163
5595	NC_016025	GGA	2	6	255372	255377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347756163
5596	NC_016025	GGC	2	6	255432	255437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756163
5597	NC_016025	GCA	2	6	255447	255452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756163
5598	NC_016025	CGG	2	6	255460	255465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756163
5599	NC_016025	TGC	2	6	255536	255541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756163
5600	NC_016025	TGG	2	6	255573	255578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_016025	AGGG	2	8	255581	255588	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_016025	ATG	2	6	255796	255801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_016025	C	8	8	255843	255850	0 %	0 %	0 %	100 %	347756164
5604	NC_016025	GCCA	2	8	255866	255873	25 %	0 %	25 %	50 %	347756164
5605	NC_016025	CGC	2	6	255884	255889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756164
5606	NC_016025	CAAA	2	8	255891	255898	75 %	0 %	0 %	25 %	347756164
5607	NC_016025	ATC	2	6	255914	255919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756164
5608	NC_016025	AGC	2	6	255932	255937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5609	NC_016025	ACA	2	6	255942	255947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756164
5610	NC_016025	CGG	2	6	256000	256005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756164
5611	NC_016025	CGT	2	6	256051	256056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5612	NC_016025	GCCC	2	8	256089	256096	0 %	0 %	25 %	75 %	347756164
5613	NC_016025	ATC	2	6	256103	256108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756164
5614	NC_016025	C	7	7	256180	256186	0 %	0 %	0 %	100 %	347756164
5615	NC_016025	TGA	2	6	256209	256214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756164
5616	NC_016025	CGT	2	6	256222	256227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5617	NC_016025	CGT	2	6	256237	256242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5618	NC_016025	CGC	4	12	256255	256266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756164
5619	NC_016025	GCC	2	6	256286	256291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756164
5620	NC_016025	CAGC	2	8	256329	256336	25 %	0 %	25 %	50 %	347756164
5621	NC_016025	GTC	2	6	256337	256342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5622	NC_016025	GCC	2	6	256349	256354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756164
5623	NC_016025	GAT	2	6	256498	256503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756164
5624	NC_016025	CAG	2	6	256618	256623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756164
5625	NC_016025	CAG	2	6	256660	256665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756164
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5627	NC_016025	GCCG	2	8	256702	256709	0 %	0 %	50 %	50 %	347756164
5628	NC_016025	GAT	2	6	256795	256800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756164
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5631	NC_016025	GCC	2	6	256852	256857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756164
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5634	NC_016025	GCT	2	6	257114	257119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5635	NC_016025	AACTG	2	10	257137	257146	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5636	NC_016025	TCG	2	6	257178	257183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756165
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5643	NC_016025	GCCGG	2	10	257336	257345	0 %	0 %	60 %	40 %	347756165
5644	NC_016025	TCA	2	6	257361	257366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756165
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5653	NC_016025	TCG	2	6	257685	257690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756165
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5657	NC_016025	GGGCT	2	10	257789	257798	0 %	20 %	60 %	20 %	347756165
5658	NC_016025	CCCA	2	8	257836	257843	25 %	0 %	0 %	75 %	347756165
5659	NC_016025	CAT	2	6	257878	257883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756165
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5668	NC_016025	GCC	2	6	258323	258328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756165
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5674	NC_016025	CCGG	2	8	258624	258631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5675	NC_016025	ACC	2	6	258744	258749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347756166
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5682	NC_016025	T	8	8	259047	259054	0 %	100 %	0 %	0 %	347756166
5683	NC_016025	AGGCC	2	10	259057	259066	20 %	0 %	40 %	40 %	347756166
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5739	NC_016025	ATTTC	2	10	262126	262135	20 %	60 %	0 %	20 %	347756168
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5742	NC_016025	GCCG	2	8	262229	262236	0 %	0 %	50 %	50 %	347756168
5743	NC_016025	TGG	2	6	262282	262287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756168
5744	NC_016025	GGTGCT	2	12	262331	262342	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347756168
5745	NC_016025	TCG	2	6	262369	262374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756168
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5747	NC_016025	GCG	2	6	262432	262437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756168
5748	NC_016025	GCT	2	6	262451	262456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756168
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5763	NC_016025	CCGG	2	8	263028	263035	0 %	0 %	50 %	50 %	347756168
5764	NC_016025	GCG	2	6	263084	263089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756168
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5768	NC_016025	CCG	2	6	263303	263308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5774	NC_016025	GCTG	2	8	263459	263466	0 %	25 %	50 %	25 %	347756169
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5786	NC_016025	A	7	7	263885	263891	100 %	0 %	0 %	0 %	347756169
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5816	NC_016025	CTG	2	6	265396	265401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756171
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5853	NC_016025	ACG	2	6	267150	267155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756173
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5863	NC_016025	CAT	2	6	267605	267610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347756173
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5865	NC_016025	GTC	3	9	267627	267635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756173
5866	NC_016025	GC	3	6	267664	267669	0 %	0 %	50 %	50 %	347756173
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5967	NC_016025	GCT	3	9	272278	272286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756178
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5971	NC_016025	TGA	2	6	272577	272582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347756178
5972	NC_016025	CG	3	6	272596	272601	0 %	0 %	50 %	50 %	347756178
5973	NC_016025	GAC	2	6	272658	272663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756178
5974	NC_016025	GC	3	6	272666	272671	0 %	0 %	50 %	50 %	347756178
5975	NC_016025	CCGC	2	8	272733	272740	0 %	0 %	25 %	75 %	347756178
5976	NC_016025	TGG	2	6	272757	272762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5981	NC_016025	G	6	6	272929	272934	0 %	0 %	100 %	0 %	347756179
5982	NC_016025	GCG	2	6	273056	273061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756179
5983	NC_016025	GGT	2	6	273071	273076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347756179
5984	NC_016025	GGC	2	6	273077	273082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756179
5985	NC_016025	GCC	2	6	273101	273106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756179
5986	NC_016025	TCC	2	6	273148	273153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347756179
5987	NC_016025	GCC	2	6	273174	273179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347756179
5988	NC_016025	AGC	3	9	273192	273200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347756179
5989	NC_016025	CTG	2	6	273243	273248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756179
5990	NC_016025	GGC	2	6	273251	273256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756179
5991	NC_016025	AC	3	6	273277	273282	50 %	0 %	0 %	50 %	347756179
5992	NC_016025	GTCT	2	8	273297	273304	0 %	50 %	25 %	25 %	347756179
5993	NC_016025	ACA	2	6	273328	273333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347756179
5994	NC_016025	TCG	2	6	273361	273366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756179
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5999	NC_016025	GGC	3	9	273512	273520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347756179
6000	NC_016025	TCG	2	6	273537	273542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347756179

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