MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	GTCGC	2	10	5383	5392	0 %	20 %	40 %	40 %	347753736
2	NC_016024	CAACC	2	10	7757	7766	40 %	0 %	0 %	60 %	347753739
3	NC_016024	CGGCC	2	10	11454	11463	0 %	0 %	40 %	60 %	347753743
4	NC_016024	TGCTT	2	10	12396	12405	0 %	60 %	20 %	20 %	347753744
5	NC_016024	CCACG	2	10	13148	13157	20 %	0 %	20 %	60 %	347753744
6	NC_016024	TCATT	2	10	13931	13940	20 %	60 %	0 %	20 %	347753745
7	NC_016024	TTCCG	2	10	15201	15210	0 %	40 %	20 %	40 %	347753747
8	NC_016024	GGCGC	2	10	18048	18057	0 %	0 %	60 %	40 %	347753748
9	NC_016024	ATGTC	2	10	18955	18964	20 %	40 %	20 %	20 %	347753748
10	NC_016024	CTGGC	2	10	21129	21138	0 %	20 %	40 %	40 %	347753752
11	NC_016024	CTCGG	2	10	22995	23004	0 %	20 %	40 %	40 %	347753753
12	NC_016024	TGCCC	2	10	24627	24636	0 %	20 %	20 %	60 %	347753754
13	NC_016024	CGACC	2	10	26449	26458	20 %	0 %	20 %	60 %	347753756
14	NC_016024	GCCCG	2	10	29743	29752	0 %	0 %	40 %	60 %	347753758
15	NC_016024	GCAGC	2	10	30172	30181	20 %	0 %	40 %	40 %	347753758
16	NC_016024	TGGAC	2	10	32281	32290	20 %	20 %	40 %	20 %	347753760
17	NC_016024	CGGTG	2	10	33039	33048	0 %	20 %	60 %	20 %	347753761
18	NC_016024	GGTGT	2	10	34270	34279	0 %	40 %	60 %	0 %	347753761
19	NC_016024	GTTGG	2	10	35325	35334	0 %	40 %	60 %	0 %	347753763
20	NC_016024	TTGGA	2	10	37030	37039	20 %	40 %	40 %	0 %	347753763
21	NC_016024	TTGCC	2	10	37828	37837	0 %	40 %	20 %	40 %	347753765
22	NC_016024	ACTGC	2	10	39157	39166	20 %	20 %	20 %	40 %	347753766
23	NC_016024	GCCTC	2	10	41396	41405	0 %	20 %	20 %	60 %	347753766
24	NC_016024	CGGGC	2	10	41565	41574	0 %	0 %	60 %	40 %	347753766
25	NC_016024	CCACA	2	10	45040	45049	40 %	0 %	0 %	60 %	347753768
26	NC_016024	GTTGG	2	10	46152	46161	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016024	TGCCC	2	10	47840	47849	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016024	CGCGG	2	10	51558	51567	0 %	0 %	60 %	40 %	347753773
29	NC_016024	GCCTT	2	10	54050	54059	0 %	40 %	20 %	40 %	347753776
30	NC_016024	GGTCG	2	10	55827	55836	0 %	20 %	60 %	20 %	347753777
31	NC_016024	ACCAT	2	10	56722	56731	40 %	20 %	0 %	40 %	347753778
32	NC_016024	GGGAA	2	10	58832	58841	40 %	0 %	60 %	0 %	347753778
33	NC_016024	GCGCC	2	10	60922	60931	0 %	0 %	40 %	60 %	347753781
34	NC_016024	ATGGA	2	10	62558	62567	40 %	20 %	40 %	0 %	347753782
35	NC_016024	GAAGA	2	10	63433	63442	60 %	0 %	40 %	0 %	347753782
36	NC_016024	CAAGC	2	10	63683	63692	40 %	0 %	20 %	40 %	347753783
37	NC_016024	GCTCC	2	10	71714	71723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016024	GGGAC	2	10	72743	72752	20 %	0 %	60 %	20 %	347753789
39	NC_016024	GTCAT	2	10	72780	72789	20 %	40 %	20 %	20 %	347753789
40	NC_016024	CGGGC	2	10	73294	73303	0 %	0 %	60 %	40 %	347753789
41	NC_016024	AACCA	2	10	73844	73853	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016024	TGCTT	2	10	74954	74963	0 %	60 %	20 %	20 %	347753790
43	NC_016024	GAAGC	2	10	75670	75679	40 %	0 %	40 %	20 %	347753792
44	NC_016024	CATTC	2	10	76131	76140	20 %	40 %	0 %	40 %	347753792
45	NC_016024	GGTCG	2	10	76782	76791	0 %	20 %	60 %	20 %	347753793
46	NC_016024	CGGGA	2	10	77730	77739	20 %	0 %	60 %	20 %	347753794
47	NC_016024	GCCGC	2	10	79041	79050	0 %	0 %	40 %	60 %	347753794
48	NC_016024	AGTCT	2	10	79717	79726	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016024	CAGCC	2	10	81360	81369	20 %	0 %	20 %	60 %	347753797
50	NC_016024	GCAGC	2	10	82497	82506	20 %	0 %	40 %	40 %	347753798
51	NC_016024	GTCGG	2	10	84833	84842	0 %	20 %	60 %	20 %	347753800
52	NC_016024	ATCGC	2	10	85218	85227	20 %	20 %	20 %	40 %	347753801
53	NC_016024	CCGCG	2	10	85864	85873	0 %	0 %	40 %	60 %	347753801
54	NC_016024	AGGGA	2	10	87492	87501	40 %	0 %	60 %	0 %	347753803
55	NC_016024	CAAGC	2	10	88004	88013	40 %	0 %	20 %	40 %	347753803
56	NC_016024	GTCGG	2	10	89151	89160	0 %	20 %	60 %	20 %	347753805
57	NC_016024	CCAGA	2	10	92927	92936	40 %	0 %	20 %	40 %	347753808
58	NC_016024	TGACC	2	10	96060	96069	20 %	20 %	20 %	40 %	347753810
59	NC_016024	CTCAT	2	10	98151	98160	20 %	40 %	0 %	40 %	347753811
60	NC_016024	GGAGG	2	10	98402	98411	20 %	0 %	80 %	0 %	347753811
61	NC_016024	GTGGG	2	10	98432	98441	0 %	20 %	80 %	0 %	347753811
62	NC_016024	TCGGC	2	10	98644	98653	0 %	20 %	40 %	40 %	347753811
63	NC_016024	CTCAT	2	10	99958	99967	20 %	40 %	0 %	40 %	347753812
64	NC_016024	GGAGG	2	10	100209	100218	20 %	0 %	80 %	0 %	347753812
65	NC_016024	GTGGG	2	10	100239	100248	0 %	20 %	80 %	0 %	347753812
66	NC_016024	GTTTG	2	10	100674	100683	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016024	CTGCG	2	10	100687	100696	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016024	ACCTG	2	10	101056	101065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016024	GTGGC	2	10	101435	101444	0 %	20 %	60 %	20 %	347753813
70	NC_016024	TCGTG	2	10	104140	104149	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016024	GGATG	2	10	111058	111067	20 %	20 %	60 %	0 %	347753817
72	NC_016024	TTTGT	2	10	112308	112317	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016024	GAGAT	2	10	113163	113172	40 %	20 %	40 %	0 %	347753819
74	NC_016024	TTGCT	2	10	113998	114007	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016024	CGGCG	2	10	114296	114305	0 %	0 %	60 %	40 %	347753820
76	NC_016024	CGACA	2	10	114774	114783	40 %	0 %	20 %	40 %	347753820
77	NC_016024	CGGTG	2	10	115314	115323	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016024	TGGTC	2	10	116210	116219	0 %	40 %	40 %	20 %	347753821
79	NC_016024	CGGCC	2	10	120105	120114	0 %	0 %	40 %	60 %	347753823
80	NC_016024	GAAGA	2	10	120453	120462	60 %	0 %	40 %	0 %	347753823
81	NC_016024	GGCCT	2	10	121267	121276	0 %	20 %	40 %	40 %	347753824
82	NC_016024	CACGC	2	10	124003	124012	20 %	0 %	20 %	60 %	347753826
83	NC_016024	GCAAA	2	10	124597	124606	60 %	0 %	20 %	20 %	347753826
84	NC_016024	TGGTG	2	10	124934	124943	0 %	40 %	60 %	0 %	347753826
85	NC_016024	CCTTC	2	10	126259	126268	0 %	40 %	0 %	60 %	347753827
86	NC_016024	TTCCA	2	10	127431	127440	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016024	GTTCA	2	10	128018	128027	20 %	40 %	20 %	20 %	347753828
88	NC_016024	TTCGA	2	10	130745	130754	20 %	40 %	20 %	20 %	347753831
89	NC_016024	ACACC	2	10	132337	132346	40 %	0 %	0 %	60 %	347753833
90	NC_016024	TCGGT	2	10	132772	132781	0 %	40 %	40 %	20 %	347753833
91	NC_016024	GCCCG	2	10	134108	134117	0 %	0 %	40 %	60 %	347753834
92	NC_016024	CATGC	2	10	135112	135121	20 %	20 %	20 %	40 %	347753835
93	NC_016024	GGTGT	2	10	135377	135386	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016024	ATGGT	2	10	137804	137813	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016024	GCCGC	2	10	138818	138827	0 %	0 %	40 %	60 %	347753838
96	NC_016024	CGCGC	2	10	141393	141402	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
97	NC_016024	GTCAG	2	10	142597	142606	20 %	20 %	40 %	20 %	347753841
98	NC_016024	CCTGG	2	10	146251	146260	0 %	20 %	40 %	40 %	347753844
99	NC_016024	GATTC	2	10	157255	157264	20 %	40 %	20 %	20 %	347753852
100	NC_016024	CGGTG	2	10	157404	157413	0 %	20 %	60 %	20 %	347753852
101	NC_016024	GTGAT	2	10	161008	161017	20 %	40 %	40 %	0 %	347753855
102	NC_016024	CGCGC	2	10	163755	163764	0 %	0 %	40 %	60 %	347753859
103	NC_016024	ACCGG	2	10	166851	166860	20 %	0 %	40 %	40 %	347753863
104	NC_016024	TCCGC	2	10	167108	167117	0 %	20 %	20 %	60 %	347753863
105	NC_016024	TGGTG	2	10	169604	169613	0 %	40 %	60 %	0 %	347753864
106	NC_016024	AGGTA	2	10	172154	172163	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016024	GTTCG	2	10	174914	174923	0 %	40 %	40 %	20 %	347753869
108	NC_016024	AGGCG	2	10	176046	176055	20 %	0 %	60 %	20 %	347753870
109	NC_016024	GGCTG	2	10	177064	177073	0 %	20 %	60 %	20 %	347753871
110	NC_016024	CGGCG	2	10	177758	177767	0 %	0 %	60 %	40 %	347753872
111	NC_016024	AATGG	2	10	179182	179191	40 %	20 %	40 %	0 %	347753873
112	NC_016024	TGCAA	2	10	180521	180530	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016024	ATGGC	2	10	181218	181227	20 %	20 %	40 %	20 %	347753874
114	NC_016024	GGGCT	2	10	181787	181796	0 %	20 %	60 %	20 %	347753874
115	NC_016024	GCCGG	2	10	182191	182200	0 %	0 %	60 %	40 %	347753874
116	NC_016024	ACTCG	2	10	183590	183599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016024	GCAAT	2	10	184329	184338	40 %	20 %	20 %	20 %	347753876
118	NC_016024	AGGGC	2	10	186917	186926	20 %	0 %	60 %	20 %	347753880
119	NC_016024	CAGCG	2	10	187095	187104	20 %	0 %	40 %	40 %	347753880
120	NC_016024	CACCT	2	10	187299	187308	20 %	20 %	0 %	60 %	347753880
121	NC_016024	CGCGC	2	10	187390	187399	0 %	0 %	40 %	60 %	347753880
122	NC_016024	GCCGG	2	10	188162	188171	0 %	0 %	60 %	40 %	347753880
123	NC_016024	CGCAA	2	10	188514	188523	40 %	0 %	20 %	40 %	347753881
124	NC_016024	GACGC	2	10	188849	188858	20 %	0 %	40 %	40 %	347753881
125	NC_016024	CAGGA	2	10	190738	190747	40 %	0 %	40 %	20 %	347753882
126	NC_016024	GCGGA	2	10	192000	192009	20 %	0 %	60 %	20 %	347753883
127	NC_016024	GCGAA	2	10	193402	193411	40 %	0 %	40 %	20 %	347753883
128	NC_016024	ACCCA	2	10	193782	193791	40 %	0 %	0 %	60 %	347753883
129	NC_016024	GAACG	2	10	194117	194126	40 %	0 %	40 %	20 %	347753884
130	NC_016024	TGGTT	2	10	195555	195564	0 %	60 %	40 %	0 %	347753886
131	NC_016024	CGGCG	2	10	198092	198101	0 %	0 %	60 %	40 %	347753888
132	NC_016024	GAGGC	2	10	200618	200627	20 %	0 %	60 %	20 %	347753890
133	NC_016024	CGGCC	2	10	201322	201331	0 %	0 %	40 %	60 %	347753892
134	NC_016024	GCCGT	2	10	201961	201970	0 %	20 %	40 %	40 %	347753892
135	NC_016024	CAGCA	2	10	203714	203723	40 %	0 %	20 %	40 %	347753894
136	NC_016024	GCGAC	2	10	204260	204269	20 %	0 %	40 %	40 %	347753894
137	NC_016024	GCCGG	2	10	204798	204807	0 %	0 %	60 %	40 %	347753895
138	NC_016024	CAGTC	2	10	204890	204899	20 %	20 %	20 %	40 %	347753895
139	NC_016024	GCCGG	2	10	204901	204910	0 %	0 %	60 %	40 %	347753895
140	NC_016024	TTGCC	2	10	207220	207229	0 %	40 %	20 %	40 %	347753898
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148	NC_016024	GGAAT	2	10	215029	215038	40 %	20 %	40 %	0 %	347753903
149	NC_016024	CGCTG	2	10	217328	217337	0 %	20 %	40 %	40 %	347753904
150	NC_016024	TTACG	2	10	218077	218086	20 %	40 %	20 %	20 %	347753904
151	NC_016024	ACCCG	2	10	218143	218152	20 %	0 %	20 %	60 %	347753904
152	NC_016024	GGCGC	2	10	218179	218188	0 %	0 %	60 %	40 %	347753904
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154	NC_016024	GCGCG	2	10	226034	226043	0 %	0 %	60 %	40 %	347753911
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158	NC_016024	CACGA	2	10	235951	235960	40 %	0 %	20 %	40 %	347753917
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165	NC_016024	GCAAC	2	10	241179	241188	40 %	0 %	20 %	40 %	347753919
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167	NC_016024	CGCGT	2	10	241787	241796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
168	NC_016024	CGCGT	2	10	242036	242045	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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235	NC_016024	GCCCT	2	10	329100	329109	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
236	NC_016024	GGGCT	2	10	331477	331486	0 %	20 %	60 %	20 %	347753990
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239	NC_016024	CAGGG	2	10	333767	333776	20 %	0 %	60 %	20 %	347753992
240	NC_016024	TCAGG	2	10	333928	333937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
241	NC_016024	ACGTC	2	10	335062	335071	20 %	20 %	20 %	40 %	347753993
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243	NC_016024	TTGTG	2	10	340556	340565	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
244	NC_016024	CGGCG	2	10	340676	340685	0 %	0 %	60 %	40 %	347754001
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249	NC_016024	GCCAC	2	10	345102	345111	20 %	0 %	20 %	60 %	347754004
250	NC_016024	TGGTG	2	10	345222	345231	0 %	40 %	60 %	0 %	347754004
251	NC_016024	GCAGA	2	10	345625	345634	40 %	0 %	40 %	20 %	347754004
252	NC_016024	AGTCG	2	10	346998	347007	20 %	20 %	40 %	20 %	347754006
253	NC_016024	GGTCT	2	10	348576	348585	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
254	NC_016024	AGGCG	2	10	349211	349220	20 %	0 %	60 %	20 %	347754009
255	NC_016024	AGGCG	2	10	352295	352304	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
256	NC_016024	CGTTA	2	10	357537	357546	20 %	40 %	20 %	20 %	347754018
257	NC_016024	GGGGT	2	10	357565	357574	0 %	20 %	80 %	0 %	347754018
258	NC_016024	CGGCG	2	10	358724	358733	0 %	0 %	60 %	40 %	347754020
259	NC_016024	CGACT	2	10	359507	359516	20 %	20 %	20 %	40 %	347754020
260	NC_016024	CATTT	2	10	360057	360066	20 %	60 %	0 %	20 %	347754021
261	NC_016024	CACAG	2	10	362631	362640	40 %	0 %	20 %	40 %	347754023
262	NC_016024	TTGGC	2	10	363128	363137	0 %	40 %	40 %	20 %	347754023
263	NC_016024	GCCGC	2	10	368085	368094	0 %	0 %	40 %	60 %	347754026
264	NC_016024	AGGTC	2	10	369746	369755	20 %	20 %	40 %	20 %	347754026
265	NC_016024	CGTCC	2	10	369837	369846	0 %	20 %	20 %	60 %	347754026
266	NC_016024	TGAAC	2	10	370183	370192	40 %	20 %	20 %	20 %	347754026
267	NC_016024	ACGGC	2	10	371670	371679	20 %	0 %	40 %	40 %	347754027
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347	NC_016024	GCATG	2	10	452315	452324	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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350	NC_016024	ACCGA	2	10	453545	453554	40 %	0 %	20 %	40 %	347754094
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389	NC_016024	TCGCT	2	10	506219	506228	0 %	40 %	20 %	40 %	347754142
390	NC_016024	GGCGC	2	10	506459	506468	0 %	0 %	60 %	40 %	347754143
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392	NC_016024	GACCA	2	10	508408	508417	40 %	0 %	20 %	40 %	347754144
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394	NC_016024	GCCAG	2	10	512041	512050	20 %	0 %	40 %	40 %	347754147
395	NC_016024	TGTGG	2	10	513225	513234	0 %	40 %	60 %	0 %	347754148
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398	NC_016024	TGAAG	2	10	514912	514921	40 %	20 %	40 %	0 %	347754150
399	NC_016024	GCCAA	2	10	514944	514953	40 %	0 %	20 %	40 %	347754150
400	NC_016024	CCGGC	2	10	516357	516366	0 %	0 %	40 %	60 %	347754152
401	NC_016024	GCCGC	2	10	517347	517356	0 %	0 %	40 %	60 %	347754153
402	NC_016024	TGGTG	2	10	517737	517746	0 %	40 %	60 %	0 %	347754153
403	NC_016024	GTGCA	2	10	518550	518559	20 %	20 %	40 %	20 %	347754155
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432	NC_016024	TGCAG	2	10	554624	554633	20 %	20 %	40 %	20 %	347754188
433	NC_016024	CTGGG	2	10	555896	555905	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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444	NC_016024	GCCGG	2	10	563444	563453	0 %	0 %	60 %	40 %	347754192
445	NC_016024	GTGAG	2	10	563936	563945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_016024	TGGAC	2	10	648789	648798	20 %	20 %	40 %	20 %	347754258
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