MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016024	GCG	2	6	164528	164533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753859
3502	NC_016024	CCT	2	6	164599	164604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753859
3503	NC_016024	GCG	2	6	164669	164674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016024	TGG	2	6	164689	164694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016024	GCA	2	6	164730	164735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_016024	CA	3	6	164734	164739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_016024	ATC	2	6	164823	164828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753860
3508	NC_016024	GAA	2	6	164880	164885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753860
3509	NC_016024	CAT	2	6	164922	164927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753860
3510	NC_016024	CGG	2	6	164943	164948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753860
3511	NC_016024	ACT	2	6	164950	164955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753860
3512	NC_016024	C	7	7	164959	164965	0 %	0 %	0 %	100 %	347753860
3513	NC_016024	AAC	2	6	165010	165015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753860
3514	NC_016024	CCA	2	6	165035	165040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753860
3515	NC_016024	CAC	2	6	165120	165125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_016024	AAC	2	6	165192	165197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753861
3517	NC_016024	TGA	2	6	165224	165229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753861
3518	NC_016024	GTT	2	6	165354	165359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753861
3519	NC_016024	GGC	2	6	165400	165405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753861
3520	NC_016024	TGGT	2	8	165433	165440	0 %	50 %	50 %	0 %	347753861
3521	NC_016024	CCGG	2	8	165491	165498	0 %	0 %	50 %	50 %	347753862
3522	NC_016024	TCC	2	6	165579	165584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753862
3523	NC_016024	GACG	2	8	165600	165607	25 %	0 %	50 %	25 %	347753862
3524	NC_016024	CCG	2	6	165608	165613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753862
3525	NC_016024	GTC	2	6	165669	165674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753862
3526	NC_016024	AGT	2	6	165689	165694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753862
3527	NC_016024	G	7	7	165748	165754	0 %	0 %	100 %	0 %	347753862
3528	NC_016024	TTG	2	6	165783	165788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753862
3529	NC_016024	CGC	2	6	165804	165809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753862
3530	NC_016024	CTG	2	6	165819	165824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753862
3531	NC_016024	AGG	2	6	165851	165856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753862
3532	NC_016024	AG	3	6	165870	165875	50 %	0 %	50 %	0 %	347753862
3533	NC_016024	GCGT	2	8	165993	166000	0 %	25 %	50 %	25 %	347753862
3534	NC_016024	CGG	2	6	166087	166092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_016024	T	7	7	166205	166211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016024	GAG	2	6	166237	166242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016024	TG	3	6	166302	166307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016024	AGGT	2	8	166317	166324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016024	GAC	2	6	166418	166423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_016024	CGT	2	6	166439	166444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_016024	ATG	2	6	166455	166460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_016024	A	6	6	166527	166532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016024	CGCC	2	8	166602	166609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3544	NC_016024	CGCCAG	2	12	166624	166635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_016024	GTC	2	6	166773	166778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753863
3546	NC_016024	GTT	3	9	166797	166805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753863
3547	NC_016024	ACCGG	2	10	166851	166860	20 %	0 %	40 %	40 %	347753863
3548	NC_016024	CGG	2	6	166959	166964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753863
3549	NC_016024	G	6	6	167043	167048	0 %	0 %	100 %	0 %	347753863
3550	NC_016024	G	6	6	167063	167068	0 %	0 %	100 %	0 %	347753863
3551	NC_016024	TCCGC	2	10	167108	167117	0 %	20 %	20 %	60 %	347753863
3552	NC_016024	CAA	2	6	167168	167173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753863
3553	NC_016024	CAA	2	6	167180	167185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753863
3554	NC_016024	TGA	2	6	167258	167263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753863
3555	NC_016024	GCT	2	6	167339	167344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753863
3556	NC_016024	GAGCGG	2	12	167442	167453	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347753863
3557	NC_016024	GAG	2	6	167580	167585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753863
3558	NC_016024	CGC	2	6	167709	167714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753863
3559	NC_016024	GAA	2	6	167918	167923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753863
3560	NC_016024	ATC	2	6	167943	167948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753863
3561	NC_016024	CTT	2	6	168020	168025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753863
3562	NC_016024	GGT	2	6	168062	168067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753863
3563	NC_016024	TCG	2	6	168091	168096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753863
3564	NC_016024	GTT	2	6	168171	168176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753863
3565	NC_016024	CAA	2	6	168296	168301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753863
3566	NC_016024	GTG	2	6	168343	168348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753863
3567	NC_016024	GTAC	2	8	168396	168403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_016024	CAG	2	6	168411	168416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_016024	CAT	2	6	168507	168512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_016024	CG	3	6	168584	168589	0 %	0 %	50 %	50 %	347753864
3571	NC_016024	CTTT	2	8	168653	168660	0 %	75 %	0 %	25 %	347753864
3572	NC_016024	TGT	2	6	168670	168675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753864
3573	NC_016024	CGG	2	6	168773	168778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753864
3574	NC_016024	GCGTCC	2	12	168802	168813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347753864
3575	NC_016024	CGA	2	6	168878	168883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3576	NC_016024	TGG	2	6	168961	168966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753864
3577	NC_016024	GCA	2	6	168974	168979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3578	NC_016024	GCT	2	6	168984	168989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3579	NC_016024	GTC	2	6	169014	169019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3580	NC_016024	GGC	2	6	169049	169054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753864
3581	NC_016024	GGC	2	6	169058	169063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753864
3582	NC_016024	GCC	2	6	169100	169105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753864
3583	NC_016024	GCATCT	2	12	169115	169126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347753864
3584	NC_016024	GCCT	2	8	169135	169142	0 %	25 %	25 %	50 %	347753864
3585	NC_016024	GC	3	6	169197	169202	0 %	0 %	50 %	50 %	347753864
3586	NC_016024	CCT	2	6	169237	169242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753864
3587	NC_016024	CA	4	8	169274	169281	50 %	0 %	0 %	50 %	347753864
3588	NC_016024	GCC	2	6	169284	169289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753864
3589	NC_016024	CGGC	2	8	169306	169313	0 %	0 %	50 %	50 %	347753864
3590	NC_016024	GTC	2	6	169315	169320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3591	NC_016024	GT	3	6	169411	169416	0 %	50 %	50 %	0 %	347753864
3592	NC_016024	GCC	2	6	169434	169439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753864
3593	NC_016024	CA	3	6	169495	169500	50 %	0 %	0 %	50 %	347753864
3594	NC_016024	GCA	2	6	169514	169519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3595	NC_016024	GGC	2	6	169523	169528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753864
3596	NC_016024	ATG	2	6	169563	169568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753864
3597	NC_016024	GCG	2	6	169587	169592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753864
3598	NC_016024	TGGTG	2	10	169604	169613	0 %	40 %	60 %	0 %	347753864
3599	NC_016024	CTG	2	6	169656	169661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753864
3600	NC_016024	CG	3	6	169685	169690	0 %	0 %	50 %	50 %	347753864
3601	NC_016024	GAA	2	6	169722	169727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753864
3602	NC_016024	GGCA	2	8	169732	169739	25 %	0 %	50 %	25 %	347753864
3603	NC_016024	GCA	2	6	169779	169784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_016024	AGC	2	6	169868	169873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_016024	CAC	2	6	169917	169922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_016024	TGCG	2	8	170051	170058	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_016024	GCGG	2	8	170094	170101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_016024	TGT	2	6	170161	170166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016024	TTGG	2	8	170232	170239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016024	TTG	2	6	170274	170279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016024	TGGG	2	8	170289	170296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016024	GTT	2	6	170456	170461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016024	GCA	3	9	170681	170689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_016024	AT	3	6	170772	170777	50 %	50 %	0 %	0 %	347753865
3615	NC_016024	TGC	2	6	170806	170811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753865
3616	NC_016024	TTA	2	6	170814	170819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347753865
3617	NC_016024	CTCTCC	2	12	170841	170852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753865
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3619	NC_016024	TTCG	2	8	170871	170878	0 %	50 %	25 %	25 %	347753865
3620	NC_016024	T	6	6	170894	170899	0 %	100 %	0 %	0 %	347753865
3621	NC_016024	GCT	2	6	170935	170940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753865
3622	NC_016024	TGGC	2	8	170941	170948	0 %	25 %	50 %	25 %	347753865
3623	NC_016024	ACT	2	6	170988	170993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3625	NC_016024	TC	3	6	171315	171320	0 %	50 %	0 %	50 %	347753866
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3837	NC_016024	GCCG	2	8	179663	179670	0 %	0 %	50 %	50 %	347753873
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3857	NC_016024	CG	3	6	180232	180237	0 %	0 %	50 %	50 %	347753873
3858	NC_016024	GTA	2	6	180318	180323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753873
3859	NC_016024	GCC	2	6	180325	180330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753873
3860	NC_016024	GGC	2	6	180348	180353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753873
3861	NC_016024	CGTC	2	8	180408	180415	0 %	25 %	25 %	50 %	347753873
3862	NC_016024	TGGCCG	2	12	180418	180429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347753873
3863	NC_016024	AAC	2	6	180448	180453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753873
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3865	NC_016024	TGA	2	6	180593	180598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3866	NC_016024	TCCA	2	8	180685	180692	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3867	NC_016024	TGG	2	6	180762	180767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753874
3868	NC_016024	ATG	2	6	180770	180775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753874
3869	NC_016024	CGG	2	6	180800	180805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753874
3870	NC_016024	GGGC	2	8	180826	180833	0 %	0 %	75 %	25 %	347753874
3871	NC_016024	GCC	2	6	180842	180847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753874
3872	NC_016024	GCCTTT	2	12	180926	180937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347753874
3873	NC_016024	GGC	2	6	180952	180957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753874
3874	NC_016024	CTG	2	6	180968	180973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753874
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3876	NC_016024	CTG	2	6	181025	181030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753874
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3879	NC_016024	ATGGC	2	10	181218	181227	20 %	20 %	40 %	20 %	347753874
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3889	NC_016024	TCG	2	6	181659	181664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753874
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3891	NC_016024	GAC	2	6	181754	181759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753874
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3897	NC_016024	TAC	3	9	181964	181972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753874
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3900	NC_016024	CTGG	2	8	182114	182121	0 %	25 %	50 %	25 %	347753874
3901	NC_016024	CCGG	2	8	182147	182154	0 %	0 %	50 %	50 %	347753874
3902	NC_016024	GCCGG	2	10	182191	182200	0 %	0 %	60 %	40 %	347753874
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3932	NC_016024	C	6	6	183383	183388	0 %	0 %	0 %	100 %	347753875
3933	NC_016024	GT	3	6	183532	183537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3934	NC_016024	ACTCG	2	10	183590	183599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3936	NC_016024	GAAG	2	8	183639	183646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3937	NC_016024	TGCT	2	8	183651	183658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3938	NC_016024	CAA	2	6	183670	183675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3939	NC_016024	CTC	2	6	183683	183688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3941	NC_016024	TCC	2	6	183736	183741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3942	NC_016024	GGAA	2	8	183757	183764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3943	NC_016024	TGCT	2	8	183770	183777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3944	NC_016024	CAA	2	6	183789	183794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3945	NC_016024	CTC	2	6	183802	183807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3975	NC_016024	GAC	2	6	185104	185109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753876
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3977	NC_016024	ATC	2	6	185165	185170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753876
3978	NC_016024	AGC	2	6	185195	185200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753876
3979	NC_016024	G	6	6	185303	185308	0 %	0 %	100 %	0 %	347753877
3980	NC_016024	GCG	2	6	185476	185481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753877
3981	NC_016024	TCC	2	6	185545	185550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3982	NC_016024	GC	3	6	185662	185667	0 %	0 %	50 %	50 %	347753878
3983	NC_016024	CGA	2	6	185682	185687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753878
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3989	NC_016024	CCG	2	6	186048	186053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753879
3990	NC_016024	TGA	2	6	186113	186118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753879
3991	NC_016024	GCT	2	6	186152	186157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753879
3992	NC_016024	CGG	2	6	186222	186227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753879
3993	NC_016024	ACC	2	6	186309	186314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753879
3994	NC_016024	CGA	2	6	186325	186330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753879
3995	NC_016024	GCT	2	6	186404	186409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753879
3996	NC_016024	CCG	2	6	186478	186483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753879
3997	NC_016024	CGC	2	6	186525	186530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753879
3998	NC_016024	CGG	2	6	186587	186592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753879
3999	NC_016024	GCC	3	9	186611	186619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753879
4000	NC_016024	ACC	2	6	186625	186630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753879

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