MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016024	CGG	2	6	116738	116743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753822
2502	NC_016024	GGC	2	6	116750	116755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753822
2503	NC_016024	GCC	2	6	116769	116774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753822
2504	NC_016024	CGG	2	6	116813	116818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753822
2505	NC_016024	GTG	2	6	116877	116882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753822
2506	NC_016024	TAC	2	6	116886	116891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753822
2507	NC_016024	TGGC	2	8	116892	116899	0 %	25 %	50 %	25 %	347753822
2508	NC_016024	GC	3	6	116935	116940	0 %	0 %	50 %	50 %	347753822
2509	NC_016024	CCG	2	6	116942	116947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753822
2510	NC_016024	TGG	2	6	116965	116970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753822
2511	NC_016024	CGC	2	6	117010	117015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753822
2512	NC_016024	GCT	2	6	117050	117055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753822
2513	NC_016024	GGC	2	6	117056	117061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753822
2514	NC_016024	G	6	6	117087	117092	0 %	0 %	100 %	0 %	347753822
2515	NC_016024	TGG	2	6	117172	117177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753822
2516	NC_016024	TTC	2	6	117227	117232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753822
2517	NC_016024	TGC	2	6	117241	117246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753822
2518	NC_016024	CAT	2	6	117281	117286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753822
2519	NC_016024	GTT	2	6	117350	117355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753822
2520	NC_016024	CTG	2	6	117363	117368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753822
2521	NC_016024	TGGG	2	8	117385	117392	0 %	25 %	75 %	0 %	347753822
2522	NC_016024	GGC	2	6	117458	117463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_016024	T	6	6	117469	117474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_016024	GTG	2	6	117475	117480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_016024	GCAG	2	8	117490	117497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2526	NC_016024	AAT	2	6	117575	117580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_016024	TGG	2	6	117649	117654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_016024	AGG	2	6	117706	117711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_016024	GAT	2	6	117749	117754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753823
2530	NC_016024	GAG	2	6	117768	117773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753823
2531	NC_016024	TTC	2	6	117786	117791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753823
2532	NC_016024	CTG	2	6	117802	117807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2533	NC_016024	CTG	2	6	117823	117828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2534	NC_016024	CTG	2	6	117844	117849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2535	NC_016024	ACT	2	6	118054	118059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753823
2536	NC_016024	GTG	2	6	118117	118122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753823
2537	NC_016024	TGA	2	6	118127	118132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753823
2538	NC_016024	GCCA	2	8	118140	118147	25 %	0 %	25 %	50 %	347753823
2539	NC_016024	TCG	2	6	118168	118173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2540	NC_016024	CG	4	8	118195	118202	0 %	0 %	50 %	50 %	347753823
2541	NC_016024	GCT	2	6	118253	118258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2542	NC_016024	CAA	2	6	118259	118264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753823
2543	NC_016024	CGA	2	6	118283	118288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2544	NC_016024	GAC	2	6	118316	118321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2545	NC_016024	GAC	2	6	118376	118381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2546	NC_016024	CCA	2	6	118393	118398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753823
2547	NC_016024	ACG	2	6	118419	118424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2548	NC_016024	GCAAGA	2	12	118457	118468	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347753823
2549	NC_016024	A	7	7	118477	118483	100 %	0 %	0 %	0 %	347753823
2550	NC_016024	GTG	2	6	118520	118525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753823
2551	NC_016024	GA	3	6	118526	118531	50 %	0 %	50 %	0 %	347753823
2552	NC_016024	TGG	2	6	118551	118556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753823
2553	NC_016024	AAG	2	6	118593	118598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753823
2554	NC_016024	TGA	2	6	118660	118665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753823
2555	NC_016024	ACC	2	6	118862	118867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753823
2556	NC_016024	CCAT	2	8	118962	118969	25 %	25 %	0 %	50 %	347753823
2557	NC_016024	GAC	2	6	119004	119009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2558	NC_016024	GGC	2	6	119049	119054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753823
2559	NC_016024	GCT	2	6	119082	119087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2560	NC_016024	TTG	2	6	119110	119115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753823
2561	NC_016024	CT	4	8	119128	119135	0 %	50 %	0 %	50 %	347753823
2562	NC_016024	GAG	2	6	119160	119165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753823
2563	NC_016024	AAG	2	6	119178	119183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753823
2564	NC_016024	CGAG	2	8	119261	119268	25 %	0 %	50 %	25 %	347753823
2565	NC_016024	GCG	2	6	119374	119379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753823
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2567	NC_016024	ACG	2	6	119488	119493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2568	NC_016024	TCCG	2	8	119530	119537	0 %	25 %	25 %	50 %	347753823
2569	NC_016024	CTC	2	6	119544	119549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753823
2570	NC_016024	CGG	2	6	119567	119572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753823
2571	NC_016024	ACG	2	6	119575	119580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2572	NC_016024	CG	3	6	119629	119634	0 %	0 %	50 %	50 %	347753823
2573	NC_016024	GGCT	2	8	119675	119682	0 %	25 %	50 %	25 %	347753823
2574	NC_016024	ACC	2	6	119701	119706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753823
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2577	NC_016024	TGT	2	6	119777	119782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753823
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2579	NC_016024	GCT	2	6	119867	119872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2580	NC_016024	CG	3	6	119884	119889	0 %	0 %	50 %	50 %	347753823
2581	NC_016024	CGC	2	6	119894	119899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753823
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2584	NC_016024	CGGCC	2	10	120105	120114	0 %	0 %	40 %	60 %	347753823
2585	NC_016024	GCT	2	6	120126	120131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
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2587	NC_016024	CGA	2	6	120244	120249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2588	NC_016024	GCT	2	6	120320	120325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
2589	NC_016024	AGGA	2	8	120373	120380	50 %	0 %	50 %	0 %	347753823
2590	NC_016024	GGC	2	6	120445	120450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753823
2591	NC_016024	GAAGA	2	10	120453	120462	60 %	0 %	40 %	0 %	347753823
2592	NC_016024	GC	3	6	120554	120559	0 %	0 %	50 %	50 %	347753823
2593	NC_016024	GCT	2	6	120613	120618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753823
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2598	NC_016024	AGG	2	6	120884	120889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753824
2599	NC_016024	CAC	2	6	120911	120916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753824
2600	NC_016024	GGCA	2	8	120926	120933	25 %	0 %	50 %	25 %	347753824
2601	NC_016024	GTT	2	6	120957	120962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753824
2602	NC_016024	CTT	2	6	121006	121011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753824
2603	NC_016024	GCG	2	6	121016	121021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753824
2604	NC_016024	GCA	2	6	121045	121050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753824
2605	NC_016024	GAA	2	6	121056	121061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753824
2606	NC_016024	AGA	2	6	121097	121102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753824
2607	NC_016024	CTC	2	6	121123	121128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753824
2608	NC_016024	ACA	2	6	121199	121204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347753824
2609	NC_016024	GTCA	2	8	121208	121215	25 %	25 %	25 %	25 %	347753824
2610	NC_016024	GGCCT	2	10	121267	121276	0 %	20 %	40 %	40 %	347753824
2611	NC_016024	GCG	2	6	121286	121291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753824
2612	NC_016024	GC	4	8	121318	121325	0 %	0 %	50 %	50 %	347753824
2613	NC_016024	CTT	2	6	121390	121395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753824
2614	NC_016024	CCGA	2	8	121422	121429	25 %	0 %	25 %	50 %	347753824
2615	NC_016024	GCCT	2	8	121500	121507	0 %	25 %	25 %	50 %	347753824
2616	NC_016024	TCC	2	6	121559	121564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753824
2617	NC_016024	GCAA	2	8	121724	121731	50 %	0 %	25 %	25 %	347753824
2618	NC_016024	GC	3	6	121742	121747	0 %	0 %	50 %	50 %	347753824
2619	NC_016024	CG	3	6	121903	121908	0 %	0 %	50 %	50 %	347753824
2620	NC_016024	GTT	2	6	121989	121994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753824
2621	NC_016024	GCTC	2	8	122025	122032	0 %	25 %	25 %	50 %	347753824
2622	NC_016024	C	6	6	122052	122057	0 %	0 %	0 %	100 %	347753824
2623	NC_016024	GAC	2	6	122133	122138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753824
2624	NC_016024	CTC	2	6	122239	122244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347753824
2625	NC_016024	GAA	2	6	122245	122250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753824
2626	NC_016024	CGA	2	6	122306	122311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753824
2627	NC_016024	CGA	2	6	122346	122351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753824
2628	NC_016024	GTT	3	9	122352	122360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753824
2629	NC_016024	GGA	2	6	122396	122401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753824
2630	NC_016024	AGG	2	6	122435	122440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753824
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2637	NC_016024	CTG	2	6	122913	122918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753825
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2640	NC_016024	TCG	2	6	123060	123065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753825
2641	NC_016024	TCG	2	6	123111	123116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753825
2642	NC_016024	GGC	2	6	123232	123237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753825
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2652	NC_016024	AGGC	2	8	123801	123808	25 %	0 %	50 %	25 %	347753825
2653	NC_016024	TCT	2	6	123834	123839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753825
2654	NC_016024	CAGC	2	8	123885	123892	25 %	0 %	25 %	50 %	347753825
2655	NC_016024	GAC	2	6	123929	123934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753825
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2661	NC_016024	GC	3	6	124090	124095	0 %	0 %	50 %	50 %	347753826
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2664	NC_016024	TTGG	2	8	124247	124254	0 %	50 %	50 %	0 %	347753826
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2671	NC_016024	GCAAA	2	10	124597	124606	60 %	0 %	20 %	20 %	347753826
2672	NC_016024	GC	3	6	124619	124624	0 %	0 %	50 %	50 %	347753826
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2684	NC_016024	GCT	2	6	125599	125604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2723	NC_016024	CCA	2	6	127417	127422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2724	NC_016024	TTCCA	2	10	127431	127440	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2725	NC_016024	TCG	2	6	127485	127490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753828
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2729	NC_016024	ACC	2	6	127592	127597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753828
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2731	NC_016024	CGGG	2	8	127648	127655	0 %	0 %	75 %	25 %	347753828
2732	NC_016024	TTC	2	6	127673	127678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753828
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2738	NC_016024	CATT	2	8	127920	127927	25 %	50 %	0 %	25 %	347753828
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2743	NC_016024	GGTT	2	8	128139	128146	0 %	50 %	50 %	0 %	347753828
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2745	NC_016024	GGC	3	9	128189	128197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753828
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2852	NC_016024	CCA	2	6	133207	133212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753833
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2989	NC_016024	GCA	2	6	140503	140508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753839
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