MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 58934

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_016024	GCG	2	6	70245	70250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1503	NC_016024	TCA	2	6	70268	70273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753787
1504	NC_016024	CG	3	6	70280	70285	0 %	0 %	50 %	50 %	347753787
1505	NC_016024	CCGG	2	8	70326	70333	0 %	0 %	50 %	50 %	347753787
1506	NC_016024	GCG	2	6	70344	70349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1507	NC_016024	CCG	2	6	70442	70447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753787
1508	NC_016024	ACG	2	6	70526	70531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753787
1509	NC_016024	CG	3	6	70535	70540	0 %	0 %	50 %	50 %	347753787
1510	NC_016024	TCGG	2	8	70571	70578	0 %	25 %	50 %	25 %	347753787
1511	NC_016024	CGG	2	6	70612	70617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1512	NC_016024	CAC	2	6	70671	70676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753787
1513	NC_016024	TGG	2	6	70760	70765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753787
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1515	NC_016024	CCG	2	6	70973	70978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753787
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1518	NC_016024	GGC	2	6	71122	71127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1519	NC_016024	CGG	2	6	71163	71168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1520	NC_016024	GGCC	2	8	71202	71209	0 %	0 %	50 %	50 %	347753787
1521	NC_016024	CG	3	6	71210	71215	0 %	0 %	50 %	50 %	347753787
1522	NC_016024	GCC	2	6	71257	71262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753787
1523	NC_016024	TGGG	2	8	71378	71385	0 %	25 %	75 %	0 %	347753787
1524	NC_016024	GCC	2	6	71428	71433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753787
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1527	NC_016024	CGG	2	6	71473	71478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753787
1528	NC_016024	GCTCC	2	10	71714	71723	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1529	NC_016024	ACCG	2	8	71740	71747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_016024	CTCC	2	8	71748	71755	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1531	NC_016024	GTC	2	6	71784	71789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_016024	ACG	2	6	71840	71845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_016024	ACC	2	6	71858	71863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_016024	GCG	2	6	71891	71896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016024	CCA	2	6	71958	71963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_016024	GGT	2	6	72064	72069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753788
1537	NC_016024	GC	3	6	72104	72109	0 %	0 %	50 %	50 %	347753788
1538	NC_016024	CCG	3	9	72192	72200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753788
1539	NC_016024	CGA	2	6	72240	72245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753788
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1541	NC_016024	CCACCC	2	12	72323	72334	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	347753788
1542	NC_016024	TCT	2	6	72359	72364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753788
1543	NC_016024	GCG	2	6	72370	72375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753788
1544	NC_016024	CAAA	2	8	72427	72434	75 %	0 %	0 %	25 %	347753788
1545	NC_016024	CTG	2	6	72470	72475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753788
1546	NC_016024	CAAC	2	8	72548	72555	50 %	0 %	0 %	50 %	347753788
1547	NC_016024	AGA	2	6	72575	72580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016024	CGG	2	6	72597	72602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016024	GTC	2	6	72605	72610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016024	AGG	2	6	72615	72620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016024	GCT	2	6	72674	72679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753789
1552	NC_016024	CTT	2	6	72687	72692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753789
1553	NC_016024	GT	3	6	72724	72729	0 %	50 %	50 %	0 %	347753789
1554	NC_016024	GGA	2	6	72737	72742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753789
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1556	NC_016024	CTG	2	6	72761	72766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753789
1557	NC_016024	GTCAT	2	10	72780	72789	20 %	40 %	20 %	20 %	347753789
1558	NC_016024	GAG	2	6	72884	72889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347753789
1559	NC_016024	GCC	2	6	72901	72906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753789
1560	NC_016024	TGG	2	6	72927	72932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753789
1561	NC_016024	GGC	2	6	73030	73035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753789
1562	NC_016024	TCG	2	6	73059	73064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753789
1563	NC_016024	CCA	2	6	73119	73124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753789
1564	NC_016024	TGG	2	6	73140	73145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753789
1565	NC_016024	CGA	2	6	73153	73158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753789
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1569	NC_016024	CTG	2	6	73331	73336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753789
1570	NC_016024	CTG	2	6	73454	73459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753789
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1573	NC_016024	ACC	3	9	73594	73602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753789
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1583	NC_016024	CG	3	6	74013	74018	0 %	0 %	50 %	50 %	347753790
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1600	NC_016024	GC	3	6	74763	74768	0 %	0 %	50 %	50 %	347753790
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1608	NC_016024	AAG	2	6	75069	75074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_016024	ACG	2	6	75092	75097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753791
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1611	NC_016024	GCC	3	9	75231	75239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753791
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1623	NC_016024	GAAGC	2	10	75670	75679	40 %	0 %	40 %	20 %	347753792
1624	NC_016024	T	6	6	75694	75699	0 %	100 %	0 %	0 %	347753792
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1882	NC_016024	GGC	2	6	87566	87571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753803
1883	NC_016024	GC	3	6	87570	87575	0 %	0 %	50 %	50 %	347753803
1884	NC_016024	GCCA	2	8	87604	87611	25 %	0 %	25 %	50 %	347753803
1885	NC_016024	GCCC	2	8	87652	87659	0 %	0 %	25 %	75 %	347753803
1886	NC_016024	CAT	2	6	87677	87682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753803
1887	NC_016024	GC	3	6	87704	87709	0 %	0 %	50 %	50 %	347753803
1888	NC_016024	CAG	2	6	87794	87799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753803
1889	NC_016024	TGA	2	6	87838	87843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753803
1890	NC_016024	ACCACA	2	12	87900	87911	50 %	0 %	0 %	50 %	347753803
1891	NC_016024	CGA	3	9	87982	87990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753803
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1893	NC_016024	CAAGC	2	10	88004	88013	40 %	0 %	20 %	40 %	347753803
1894	NC_016024	GGC	2	6	88019	88024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753803
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1901	NC_016024	ATC	2	6	88521	88526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753804
1902	NC_016024	TGA	2	6	88544	88549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753804
1903	NC_016024	GC	4	8	88617	88624	0 %	0 %	50 %	50 %	347753804
1904	NC_016024	CGC	2	6	88670	88675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753804
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1908	NC_016024	GGC	2	6	88764	88769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753804
1909	NC_016024	CATC	2	8	88772	88779	25 %	25 %	0 %	50 %	347753804
1910	NC_016024	GC	3	6	88853	88858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1911	NC_016024	CGG	2	6	89002	89007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753805
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1913	NC_016024	TTG	2	6	89056	89061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347753805
1914	NC_016024	CGC	2	6	89085	89090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753805
1915	NC_016024	GTCGG	2	10	89151	89160	0 %	20 %	60 %	20 %	347753805
1916	NC_016024	GCGG	2	8	89297	89304	0 %	0 %	75 %	25 %	347753805
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1920	NC_016024	CG	3	6	89565	89570	0 %	0 %	50 %	50 %	347753805
1921	NC_016024	CGG	3	9	89592	89600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753805
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1989	NC_016024	GCG	2	6	92244	92249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753806
1990	NC_016024	CG	4	8	92304	92311	0 %	0 %	50 %	50 %	347753807
1991	NC_016024	TCA	2	6	92355	92360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753807
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1998	NC_016024	AACC	2	8	92584	92591	50 %	0 %	0 %	50 %	347753807
1999	NC_016024	TGG	2	6	92603	92608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753807
2000	NC_016024	CAT	2	6	92659	92664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753807

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